DNA甲基化提供了将遗传变异与环境影响联系起来的关键表观遗传标记。我们已经分析了160个人视网膜的基于阵列的DNA甲基化蛋白纤维,具有共同测量的RNA-SEQ和> 800万个遗传变异,在CIS中揭示了遗传调节的位点,在CIS中(37,453个甲基化的定量性状定量特征和12,505表达定量的特性特征)和13,747 DNA甲基化的属性。视网膜特定的三分之一。甲基化和表达定量性状基因座表现出与突触,线粒体和分解代谢有关的生物过程的非随机分布和富集。基于数据的Mendelian ran统治和共定位分析确定了87个靶基因,其中甲基化和基因表达变化可能介导基因型对年龄相关的黄斑变性的影响。综合途径分析揭示了免疫反应和代谢的表观遗传调节,包括谷胱甘肽途径和糖酵解。我们的研究定义了驱动甲基化变化的遗传变异的关键作用,优先考虑基因表达的表观遗传控制,并提出了通过基因型 - 视网膜环境相互作用来调节黄斑变性病理学的框架。
预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年2月17日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.11.29.626080 doi:Biorxiv Preprint
抽象目标对人膝关节软骨组织的单细胞和空间转录组学分析,呈现全面的转录组景观和骨关节炎(OA) - 关键细胞群体。方法单细胞RNA测序和空间分辨的转录组技术已应用于表征从8个OA供体收集的人膝关节关节软骨的细胞异质性,以及3个非OA控制供体,总共有19个样本。新型的软骨细胞种群和感兴趣的标记基因通过免疫组织化学染色,定量实时PCR等验证。通过对公共可用的大量RNA测序数据和大规模基因组关联研究的综合分析来验证OA关键细胞群体。结果我们确定了33个细胞种群特异性标记基因,这些基因定义了11个软骨细胞种群,包括9个已知种群和2个新人群,即炎性软骨细胞种群(PERINFC)和炎性软骨细胞种群(INFC)。使其成为文献重要补充的新颖发现包括:(1)新型INFC激活介体MIF-CD74; (2)胸部软骨细胞(PREHTC)和肥厚软骨细胞(HTC)是潜在的OA关键细胞群体; (3)大多数与OA相关的差异表达基因都存在于关节表面和表面区域; (4)前纤维球软骨细胞(PERFC)种群是OA患者分层的主要原因,导致炎症相关的亚型和非炎症相关的亚型。结论我们的结果突出了INFC,PREHTC,PERFC和HTC作为靶向治疗的潜在细胞群。此外,我们得出的结论是,患者中这些细胞群体的分析可能用于对患者种群进行分层,以定义临床试验和精密医学的同类群体。
386名参与者的结果为199名(52%),平均年龄为68(8)岁。血浆P-TAU217的CB患者的阳性AβPET结果(平均[SD],0.57 [0.43] pg/ml)或FTP PET(平均[SD],0.75 [0.30] pg/ml)的浓度与AD(平均[0.72 [SD],0.72 [0.37],no no nome),FTP PET(平均[0.30] pg/ml),here(0.75 [0.30] pg/ml),here and n no no nof and nof [0.37], 控制。在CBS中,P-TAU217具有出色的诊断性能,在接收器操作特征曲线(AUC)下,AβPET为0.87(95%CI,0.76-0.98; P <.001)和0.93(95%CI,0.83-1.00; P <.001)。在基线时,CBS-AD(n = 12)的个体由PET验证的血浆P-TAU217截止值0.25 pg/ml或更高,与CBS-FTLD的个体相比,基线时颞眼萎缩增加了(n = 39),而较长的人(n = 39),具有CBS-cbs-fterl faster faster fasters afstall faster afters aftast。与CBS-AD的人(平均[SD],3.5 [0.5] vs 0.8 [0.8]分/年/年相比,具有CBS-FTLD的个体在修改后的PSP评级量表上的进展也更快。
视网膜色素变性 (RP) 是一组罕见的遗传性退行性眼病,影响着全球多达 150 万人。RP 是由影响视网膜的多个基因突变引起的,导致视力逐渐丧失,最终失明,症状通常在儿童时期显现,目前无法治愈。RP 的特征是双侧视杆感光细胞丧失,随后视锥感光细胞继发丧失,视网膜色素上皮 (RPE) 变性。RHO 介导的常染色体显性 RP 是由编码视紫红质的基因突变引起的,视紫红质是一种光敏 G 蛋白偶联受体,可启动视杆感光细胞中的光转导级联 (Zhen 等人,2023 年)。USH2A 基因突变是常染色体隐性 RP 和 Usher 综合征的主要原因。 USH2A 编码 usherin,这是一种跨膜蛋白,主要在视网膜的感光层、耳蜗的毛细胞和许多组织的基底膜中产生(Li et al. 2022)。
摘要 - 关于相对较差的预后和急性视力障碍,分析与年龄相关的黄斑变性或AMD是视网膜疾病分析中最重要的任务之一。尤其是,构建分析和预测湿AMD的方法,其特征是由于新血管形成而导致新科学家造成的快速RPE损害,数十年来一直是许多眼科医生的一项艰巨任务。最近,随着ML/DL框架和计算机视觉AI的进步,这些先前的努力现在导致了AMD预测和机制分析的急剧增强。具体来说,使用基于注意机制的CNN或XAI方法的使用在预测AMD状态和可靠解释方面会导致更高的性能。在最先进技术的使用中,这项研究实施了一种新型的潜在因果表示学习框架,以进一步增强基于AI的模型,以了解仅访问视网膜底面图像的复杂因果AMD机制,同时构建了更可靠的AMD预测模型。结果表明,基于有效的卷积VAE和GAE的显式潜在因果建模可以导致基本AMD机制的成功因果关系,同时返回基本的因果因素,这些因素可以可靠地可靠地区分正常的基础和AMD底层图像,例如诊断预测。
1 IRCCS Fondazione Santa Lucia,00143 罗马,意大利;eugenia.landolfo@uniroma1.it(EL);davide.decandia91@gmail.com(DD);a.nobili@hsantalucia.it(AN);mt.viscomi@hsantalucia.it(MTV);livia.labarbera@gmail.com(LLB);p.debartolo@unimarconi.it(PDB);m.damelio@hsantalucia.it(MD);laura.petrosini@uniroma1.it(LP)2 罗马大学“Sapienza”心理学系,00185 罗马,意大利;stefano.sacchetti@uniroma1.it(SS); annacarmencurci@gmail.com (AC) 3 意大利罗马市“Campus Biomedico”大学医学和外科科学系,邮编 00128 4 意大利罗马市天主教圣心大学生命科学系和公共卫生组织学与胚胎学专业,邮编 00168 5 意大利罗马市古列尔莫·马可尼大学人文科学系,邮编 00193 6 意大利罗马市 CNR 生物化学和细胞生物学研究所,邮编 00015 蒙特罗通多;stefano.fariolivecchioli@cnr.it * 通讯地址:debora_cutuli@yahoo.it;电话:+ 39-06501703077 † 行为神经科学博士课程。
数据削减:15nov2023。Luna第14周的Aflibercept水平绘制了30名个人参与者中的26个。4个样品中的2e11和6e11剂量的含水平水平(ELISA ASSAY BLOQ:<25 ng/ml)。,其中2个没有注射,2至少在26周进行1或2个补充注射。Luna修订以停止收集AH样本。*参与者接受了第36、52、64、68、76、80、88、92、100、130、143、156的第36、52、64、68、76、76、88、88、88、88、88、88、88、88、88、88、88、88、88、88、156。ixo-VEC后3年的年度反VEGF注射量为58%,而IXO-VEC前12个月。**参与者在第24、64、72、80和156周收到了补充的Afibibercept注射。ixo-VEC 3年后,年度抗VEGF注射年度为81%,而IXO-VEC前12个月。在三个时间点(未在图上指示),Aflibercept级别为Bloq。
顾问:Alimera,Allergan,Bitter,Annex,Bausch,Bausch,Bausch,Bausch,Cure,Cure / You,Crinetics,Eyepoint,Eyepoint,Genentech,Harrow,Kodiak,Neurotech,Neurotech,Novartis,Novartis,Ocular therapeutix,Ocular Therapeutix,Eye,Ocuphire,Opthea,Opthea,Opthea,Opthea,Outebook,RecensmmedIce; Regeneron,Regenxbio,Revive,Retinai,Roche,Samsara,Stealth,Tilack div div div div div
来自 1 澳大利亚维多利亚州墨尔本莫纳什大学中央临床学院神经科学系;2 澳大利亚维多利亚州克莱顿莫纳什大学莫纳什生物医学成像系;3 澳大利亚维多利亚州克莱顿莫纳什大学心理科学学院特纳大脑与心理健康研究所;4 意大利 Bosisio Parini IRCCS Eugenio Medea 科学研究所神经影像科;5 奥地利因斯布鲁克医科大学神经病学系;6 意大利那不勒斯费德里科二世大学高级生物医学科学系;7 澳大利亚维多利亚州帕克维尔默多克儿童研究所 Bruce Lefroy 中心;8 澳大利亚维多利亚州帕克维尔墨尔本大学;9 德国哈勒 (萨勒) 大学医院放射医学系大学诊所和放射科门诊; 10 德国埃森杜伊斯堡-埃森大学埃森大学医院神经内科;11 意大利博洛尼亚大学电气、电子和信息工程系“Guglielmo Marconi”;12 德国亚琛工业大学神经内科;13 JARA-BRAIN 分子