图19。筛选病毒感染期间的内向功能丧失...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................利用原位HA标签的NSP15病毒...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................Interactions Between Nsp15 and RTC Co-factor Nsp8 were Not Disrupted by the E3K Mutation ........................................................................................................... 64 Figure 22.MHV-A59 NSP15六聚体结构的模型突出了L2和E3的氢键网络。 .................................................................... 65 Figure 23. NTD Mutations Do Not Attenuate Viral Replication in Non-interferon Responsive BMDMs ...................................................................................................... 66 Figure 24. MHV NTD突变病毒在BMDMS感染期间积累了类似WT的NSP15蛋白水平。 MHV NTD Mutants are Attenuated in BMDMs and Induce a Robust Interferon Response ....................................................................................................................... 68 Figure 26. Disruption of the Nsp15 NTD Leads to an Early, Robust Activation of OAS/RNaseL Signaling .................................................................................................. 69 Figure 27. SARS-COV-2 NSP15 NTD的突变减弱了IAT2中的病毒复制。 ............................................................................................................................. 70 Figure 28.MHV-A59 NSP15六聚体结构的模型突出了L2和E3的氢键网络。.................................................................... 65 Figure 23.NTD Mutations Do Not Attenuate Viral Replication in Non-interferon Responsive BMDMs ...................................................................................................... 66 Figure 24.MHV NTD突变病毒在BMDMS感染期间积累了类似WT的NSP15蛋白水平。MHV NTD Mutants are Attenuated in BMDMs and Induce a Robust Interferon Response ....................................................................................................................... 68 Figure 26.Disruption of the Nsp15 NTD Leads to an Early, Robust Activation of OAS/RNaseL Signaling .................................................................................................. 69 Figure 27.SARS-COV-2 NSP15 NTD的突变减弱了IAT2中的病毒复制。 ............................................................................................................................. 70 Figure 28.SARS-COV-2 NSP15 NTD的突变减弱了IAT2中的病毒复制。............................................................................................................................. 70 Figure 28.SARS-COV-2 NSP15 NTD突变体在IAT2中诱导早期,稳健的ISG表达。............................................................................................................................. 71 Figure 29.丧失内向活性的丧失会引起感染BMDMS的转录组轮廓的急剧变化。............................................................................................ 72 Figure 30.NSP15突变病毒在BMDM感染过程中诱导了几种IFN和DSRNA传感器基因的表达。......................................................................... 73 Figure 31.在NSP15突变病毒感染期间,参与坏死途径的基因被上调。................................................................................................... 73 Figure 32.NSP15突变病毒诱导ZBP1依赖性坏死性................................................................................................................................................................................... 74图33。Nsp15 Mutant Viruses Induce ZBP1-independent Apoptosis and Necroptosis ....................................................................................................................................... 76 Figure 34.C57BL/6 Mice Infected with Nsp15 NTD Mutant Viruses Do Not Lose Weight ....................................................................................................................................... 77
基于 mRNA 的疗法不同于小分子和其他生物制剂,它们代表着重大的分析挑战。为了在竞争激烈的市场中竞争并符合监管标准,需要对临床前/临床测试和批次放行进行 mRNA 表征。更快、更可靠的结果需要创新的解决方案来应对这些分析挑战。核酸浓度测定是通过测定 260 nm 分析波长下的紫外 (UV) 吸光度来测量的。这些吸光度测量允许科学家根据已知的 RNA 消光系数来测量核酸浓度。它们在 260 nm 处的最大吸光度峰的光谱特征与核酸浓度成正比。这种紫外核酸定量方法的优点是简单、直接,并且只需要少量样品即可进行测量。然而,分析实验室遇到的一个挑战是其特异性的局限性,因为吸收相似波长的基质成分会导致随后的核酸浓度测定不准确。我们观察到,当前传统的基于比色皿的 UV 解决方案中使用 1 cm 比色皿和/或较小固定光程长度的标准固定光程长度 UV 仍然无法解决给定测量的质量问题,并且需要数小时的调查时间。使用稀释因子(这会增加制备时间和变异性)和固定光程长度测量来确定溶液中 UV 发色团的浓度,并不能提供一种可在公司或流程内平台化的易于转移且可靠的方法。如今,研究人员可以在存在化学和核酸杂质(尤其是 DNA 和 dsRNA)的情况下选择性地量化核酸吸光度。分析软件使用全光谱数据和高级算法来识别核酸杂质并提供校正的核酸浓度。
- 细胞生物学技术(动态质量重新分布,Flex Station II,BRET钙动员测定法)。- DSRNA的合成用于RNA干扰和基因静音 - 质粒载体的构造,克隆过程以及在细菌和细胞系中重新组合的蛋白质的表达。•生物分子和细胞科学硕士学位(LM6)Ferrara大学,于2014年7月16日获得。参加国会和研讨会•2018年(7月)欧洲昆虫学大会(ECE 2018) - 那不勒斯(意大利)。贡献了三张海报:“斑点果蝇(果蝇果蝇)的章鱼胺/泰兰受体受体的克隆,分子表征和组织表达。” “开采基因在lobesia botrana(Denis和Schiffermüller)的脱氧基因抗性中的挖掘基因通过从头转录组组装和差异表达分析进行的。” “梨psylla cacopsylla pyri的垫子行为和双模式通信。” •2019年(7月)国际分子昆虫科学专题讨论会 - 西班牙(西班牙)。用两张海报做出的贡献:“山地植物可以调节苏木果果蝇(DSTAR1)中的1型酪氨酸受体:新型生物农药的分子和药理方面。” “来自棕色的臭臭虫Halyomorfha Halys的1型酪氨酸受体(TAR1):表征生物农药的新靶标。” •2019年(12月)欧洲博士网络“昆虫科学”,X年度会议 - 热那亚(意大利)。贡献“登革热载体中的章鱼和泰氨带受体,埃及埃及”的贡献。 •2022年(11月)美国昆虫学学会 - 温哥华(加拿大)。prothuto con una thra raale orale:“植物性昆虫卤素形halys的1型酪胺受体(TAR1)的分子表征和药理特征。” •2022(6月)昆虫生物技术会议 - 加拿大湖上的尼亚加拉。contruto con una restrazione orale:“泰拉米蛋白能信号通路参与调节chagas疾病矢量rohodnius prolixus中的卵产量”,监督di Studenti di Studenti di 8 tesi da corlelatore:
引言1型糖尿病(T1D)是T细胞介导的自身免疫性疾病,导致胰腺β细胞破坏(1)。提出了遗传学,环境和免疫系统的协同作用来诱导T1d(2-5)。单子双胞胎的T1D具有约30%–50%的一致性,这表明环境在T1D发育中起着重要作用(6,7)。与T1D相关的一个环境因素是Coxsackievivirus B(CVB)感染(8,9)。CVB病毒RNA和/或病毒颗粒已在最近发作T1D的患者的血液,粪便和胰岛中检测到(9-11)。在非肥胖糖尿病(NOD)小鼠模型中,CVB感染通过诱导炎症性胰腺抗病毒反应加速T1D,导致β细胞破坏(12,13)。由IFIH1基因编码的先天病毒传感器分化相关蛋白5(MDA5)检测到DSRNA病毒复制中间体并启动抗病毒信号传导(14,15)。MDA5结合其配体后的关键反应之一是I型IFN的合成,例如IFN-α和IFN-β,以促进巨噬细胞,树突状细胞和T细胞的病毒清除和激活(16-20)。尽管I型IFN对抗病毒反应至关重要,但它们也与早期T1D发育有关(21,22)。在转基因CD1小鼠中,其中β细胞组成型表达IFN-α,T1D发作发生在10周龄的60%小鼠中(23)。相反,在NOD雌性小鼠中,IFN -α和-β受体亚基1(IFNAR1)表达的丧失导致T1D发育显着延迟(24)。在T1D患者中,在自身抗体发育之前在血液中检测到I型IFN基因特征(21、22),而GWAS发现与I型IFN合成和信号传导有关的T1D基因,例如IFIH1(例如IFIH1)(25,26)。IFIH1中的多个单核苷酸多态性(SNP)与人类T1D发育有关。A946T SNP(rs1990760)在氨基酸946时导致丙氨酸对硫代的变化,与T1D风险相关,并导致IFN-α /β和IFN刺激的基因产生< / div>的增加
植物免疫中的RNA沉默:超越武器竞赛?Sara Lopez-Gomollon,David C Baulcombe *植物科学系,剑桥大学,唐宁街,剑桥CB2 CB2 CB2 3EA UK *通信D.C.B.:dcb40@cam.ac.uk摘要RNA沉默已被很好地确定为植物中的一种抗病毒系统,在该植物中,小(S)RNA指导防御靶标对病毒RNA或DNA中的靶标的Argonaute蛋白效应子。病毒编码的沉默抑制剂抵消了这种防御系统。本综述总结了有关抗病毒RNA沉默的最新发现,包括RNA通过plasmodesmata的运动以及植物如何区分自我与病毒RNA。我们还描述了新兴的图片,即除抗病毒防御外,RNA沉默在针对非病毒病原体的植物免疫力中发挥作用。通过囊泡和其他结构以及通过这些生物体编码的沉默抑制器的作用,RNA向感染的植物细胞向感染的植物细胞的反式运动介导了这种对一般免疫力的影响。也存在RNA沉默对一般免疫力的影响,因为宿主编码的SRNA,包括微(MI)RNA,调节植物先天免疫系统中的类似点状受体和防御信号通路。这些RNA沉默途径构成了一个过程网络,对植物的免疫状态具有正面和负面影响。引言植物中的RNA沉默首先被确定为转基因和病毒感染的转录后机制1,2。它是由病毒或转基因RNA触发的,关键的中间分子是双链(DS)或DICER的发夹RNA底物(植物中的DCL)。在某些系统中,DSRNA由作用于单个链分子的RNA依赖性RNA聚合酶(RDR)产生,而21-24NT RNA DCL衍生的片段通常称为小(S)RNA(Box 1)。这些片段的单链衍生物与Argonaute(AGO)蛋白形成核蛋白,它们通过Watson-Crick Base配对引导它们以靶向RNA。agos是核酸酶,在规范的RNA沉默中(图1A),靶RNA被裂解SRNA的相反位置10,尽管存在如下所述的变体机制。该系统在抗病毒防御中有效,因为特异性是由源自病毒基因组的SRNA赋予的。由于每个双链RNA的DICER裂解成多个SRNA(Box 1),它也具有扩增属性。此外,SRNA在细胞之间是可移动的,因此它们可以在感染前部或前方或前方的病毒RNA和Prime Agos之前移动或前进(图1B)。与其他防御系统一样,带有RNA沉默,并且与宿主病原体相互作用的“武器竞赛”概念一致,病毒编码了抑制器,这些抑制器抵消了RNA沉默3-5的防御作用(Box 2和图2)。包括蠕虫,昆虫和哺乳动物在内的动物在感染细胞中产生病毒SRNA 2,6,7,对病毒的保护很可能是RNA的保守而古老的作用
基于核糖核酸 (RNA) 的疗法是治疗发展的一个新兴领域,有可能为包括几种罕见病在内的一系列疾病产生新的治疗方法。这些产品利用基因靶向技术 (GTT),包括任何由用于改变疾病途径的非复制核酸组成的产品。基于 RNA 的疗法包括利用 RNA 干扰 (RNAi) 和许多反义寡核苷酸 (ASO) 疗法(可减少不需要的蛋白质的产生)的产品,以及引入新型治疗蛋白质的信使 RNA (mRNA) 疗法。在美国,至少有 21 种美国食品药品监督管理局 (FDA) 批准上市的基于 RNA 的疗法,以及大量处于临床开发阶段的产品。截至 2024 年 1 月 31 日,至少有 131 种基于 RNA 的疗法正在临床试验中进行研究,还有更多疗法处于临床前开发阶段。利用 RNAi 和 mRNA 的产品占 RNA 治疗产品线的最大份额,分别占 40% 和 37%,但更广泛的产品线还包括寡核苷酸、双链 RNA (dsRNA) 和微 RNA (miRNA) 产品。总的来说,这些疗法涵盖 15 个不同的治疗领域,并有可能为罕见疾病和其他治疗选择有限的疾病引入新的治疗选择。其中一些疗法有可能每年给药一次或两次,为患者提供差异化选择。虽然绝大多数 (80%) 的产品处于早期开发阶段(即 I 期或 II 期),但 29 种疗法处于后期开发阶段,表明未来几年可能会有新的 RNA 疗法获得批准。基于 RNA 的疗法有时可以被视为基因疗法,这是一种利用 RNA 或脱氧核糖核酸 (DNA) 的创新疗法的更广泛分类。并非所有更广泛的基因疗法分类中的产品都受到 FDA 的相同监管。例如,一些基于 RNA 的疗法,例如使用 RNAi 的产品,根据新药申请 (NDA) 作为小分子药物进行监管,而其他疗法,例如利用病毒载体递送系统和 mRNA 疫苗的基因疗法,则根据生物制品许可申请 (BLA) 作为生物药物进行监管。虽然这些类型的疗法在产品开发和资源投入方面的复杂性通常可能相当,但由于排他性和竞争途径,FDA 监管分类的差异可能会在审批期间和上市期间造成重要区别。此外,小分子药物和生物药物产品受到《通货膨胀削减法案》(IRA) 医疗保险药品价格谈判计划等政策的不同影响,该计划认为生物药物在上市 11 年后才有资格被选中进行谈判,相比之下,小分子药物上市时间仅为 7 年。与某些基因疗法或 mRNA 产品相比,根据 NDA 审查的 RNA 疗法的差别待遇可能会给市场带来新的激励,随着时间的推移,这可能会影响投资决策和产品线战略。鉴于这些不断变化的激励措施,以及随着 RNA 疗法的不断开发和批准,利益相关者应该
(www.pichia.com),在这种酵母中成功表达了5000多种不同的蛋白质(Schwarzhans等,2017)。在P. p. p. p. p. p. p. p. p. p. opterer工程中的典型策略包括启动子工程(Nong等,2020; Lai等,2024; Zhou等,2023),信号肽修改(Lie等,2015),拷贝数的增加(Liu等,2020年; putteas et ease; wang al。 2019年),以及伴侣因子的引入(Zheng等,2019;Raschmanová等,2021)。 但是,基因组中的直接基因敲除可以导致P. P. P. P. P. p. p. pastoris代谢途径内的特定功能的丧失,从而破坏其整体代谢网络。 相比之下,利用合成生物学工具调节基因表达可能比传统的敲除或过表达方法更有效。 基因表达调节是许多细胞过程的基础(De Nadal等,2011; Nielsen和Keasling,2016年)。 当前,微生物中基因调节的主要工具是定期间隔短的短质体重复序列(CRISPR)系统的。 但是,使用CRISPR进行基因激活或抑制通常需要在CRISPR系统中蛋白质失活,添加激活或抑制域,以及仔细选择合适的SGRNA靶位点。 因此,CRISPR系统相对复杂且耗时。 此外,CRISPR的应用还受到宿主细胞接受度,异物蛋白质表达效率和目标位点选择准确性等因素的影响,这使得优化过程更加繁琐。在P. p. p. p. p. p. p. p. p. p. opterer工程中的典型策略包括启动子工程(Nong等,2020; Lai等,2024; Zhou等,2023),信号肽修改(Lie等,2015),拷贝数的增加(Liu等,2020年; putteas et ease; wang al。 2019年),以及伴侣因子的引入(Zheng等,2019;Raschmanová等,2021)。但是,基因组中的直接基因敲除可以导致P. P. P. P. P. p. p. pastoris代谢途径内的特定功能的丧失,从而破坏其整体代谢网络。相比之下,利用合成生物学工具调节基因表达可能比传统的敲除或过表达方法更有效。基因表达调节是许多细胞过程的基础(De Nadal等,2011; Nielsen和Keasling,2016年)。当前,微生物中基因调节的主要工具是定期间隔短的短质体重复序列(CRISPR)系统的。但是,使用CRISPR进行基因激活或抑制通常需要在CRISPR系统中蛋白质失活,添加激活或抑制域,以及仔细选择合适的SGRNA靶位点。因此,CRISPR系统相对复杂且耗时。此外,CRISPR的应用还受到宿主细胞接受度,异物蛋白质表达效率和目标位点选择准确性等因素的影响,这使得优化过程更加繁琐。在基因激活中,需要引入其他转录激活剂,而在基因抑制中,抑制因子必须进行精确设计和交付,以确保特定的调节。因此,尽管具有强大的基因调控能力,但CRISPR系统的操作复杂性和时间成本很高(Casas-Mollano等,2020; Chen等,2020)。相比,RNA干扰(RNAi)直接靶向RNA,影响蛋白质翻译,并为基因调节提供了更简单的方法。RNAi是一种由双链RNA(DSRNA)激活的基因沉默途径(Drinnenberg等,2009),由核糖核酸酶III(RNAseIII)酶处理,该酶加工成小型小型干扰RNA(sirnas)。dicer是一种酶,可将双链RNA裂解成小siRNA片段。这些siRNA随后引导参与RNA裂解的Argonaute蛋白靶向和裂解转录本,有效地沉降基因表达(Wang等,2019)。RNAi系统及其基本组件(dicer,argonaute和sirnas)通过简单的质粒转化步骤提供了一种更直接和灵活的方法来沉默基因。这减少了时间和精力,从而促进了各种菌株基因抑制策略的快速发展(Crook等,2014)。本报告详细介绍了P. P. P. P. P. rnai系统的第一个建立。可以创建这样的系统的假设是基于观察结果,即引入Argonaute蛋白和siRNA到P. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. apastoris。基因修饰的P. p. p. p. p. p. press这表明在P. Pastoris基因组中编码丁香样蛋白的基因的潜在存在。这项研究成功地证明了通过引入Hairpin RNA通过RNAi系统抑制单基因(增强的绿色荧光蛋白(EGFP))和双基因(EGFP /组氨酸(His))。
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1。犹他州犹他州盐湖城肿瘤科学系。2。犹他州盐湖城犹他大学亨斯曼癌症研究所。3。德克萨斯大学医学博士安德森癌症中心遗传学系,德克萨斯州休斯敦4。Deciphera Pharmaceuticals LLC,堪萨斯州劳伦斯市643 ST。5犹他州盐湖城病理学系。 6。 犹他州盐湖城医学肿瘤学部内科学系。 7。 犹他州盐湖城皮肤科系皮肤科系。 *通讯作者马丁·麦克马洪(Martin McMahon),博士 俄罗斯大学,犹他大学,2000年希望圈,HCI-RS-2725盐湖城,盐湖城,UT 84112(801)213 5790电子邮件:martin.mcmahon@hci.utah.utah.utah.utah.utah.uta.edu作者贡献:PCG,PCG,PCG,MM,MM,MM,MB,BDS和DLF设计了实验者; PCG和MM分析了数据; PCG执行了大多数实验。 KTO协助免疫印迹;太太进行了体外协同作用测定; SSB和MTS协助体内动物研究; ELS进行了组织病理学分析; PCG和MM写了手稿;所有作者均审查并编辑了手稿。 相互竞争的利益声明:此处描述的研究得到了犹他大学和Deciphera Pharmaceuticals,LLC的赞助研究协议的支持,并授予MM和CGK。 关键字:KRAS,ULK,LKB1,TP53,自噬,KRAS G12C的基因工程小鼠模型 - 驱动的肺癌5犹他州盐湖城病理学系。6。犹他州盐湖城医学肿瘤学部内科学系。7。犹他州盐湖城皮肤科系皮肤科系。*通讯作者马丁·麦克马洪(Martin McMahon),博士俄罗斯大学,犹他大学,2000年希望圈,HCI-RS-2725盐湖城,盐湖城,UT 84112(801)213 5790电子邮件:martin.mcmahon@hci.utah.utah.utah.utah.utah.uta.edu作者贡献:PCG,PCG,PCG,MM,MM,MM,MB,BDS和DLF设计了实验者; PCG和MM分析了数据; PCG执行了大多数实验。 KTO协助免疫印迹;太太进行了体外协同作用测定; SSB和MTS协助体内动物研究; ELS进行了组织病理学分析; PCG和MM写了手稿;所有作者均审查并编辑了手稿。相互竞争的利益声明:此处描述的研究得到了犹他大学和Deciphera Pharmaceuticals,LLC的赞助研究协议的支持,并授予MM和CGK。关键字:KRAS,ULK,LKB1,TP53,自噬,KRAS G12C的基因工程小鼠模型 - 驱动的肺癌
摘要在EGFR-酪氨酸激酶抑制剂(TKI)失败之后,基于免疫疗法的方案在表皮生长因子受体(EGFR)中的持续益处是突变的非小细胞肺癌(NSCLC)。Checkmate-722和Keynote-789均未达到预先指定的临床益处统计水平,但是Orient-31和ATTLAS试验表明,将VEGF抑制剂添加到免疫疗法加化学疗法中可以显着延长生存率。然而,缺乏该患者人群中免疫疗法以及化学疗法与化学疗法的免疫疗法的疗效与化学疗法的疗效的正面比较。此外,谁将从基于免疫疗法的方案中受益的关键问题尚不清楚。我们使用化学疗法作为常见比较者进行了间接比较荟萃分析,以对两种基于免疫疗法的方案的相对疗效进行分类。间接比较表明,与免疫疗法加化学疗法相比,免疫疗法和贝伐单抗加化学疗法的无进展生存期(PFS)明显好得多(HR IO+BEV+BEV+Chemo/IO+Chemo = 0.71,95%CI 0.55至0.91)。发现EGFR突变类型和T790M突变与基于免疫疗法的PFS显着相关。与对应物相比,L858R(HR 0.52,95%CI 0.37至0.72)患者没有T790M突变(HR 0.50,95%CI 0.35至0.71)往往会使来自免疫疗法的治疗方案受益更多。总而言之,我们的发现支持,将VEGF抑制剂添加到免疫疗法和化学疗法中可能是抗TKI耐TKI,EGFR氧化EGFR氧化NSCLC的首选选择,并且可以将L858R突变和T790M负面性鉴定为基于免疫疗法的效率相关因素。