已经研究了几类在细胞功能中具有复杂作用的RNA-RNA相互作用(RRI),例如miRNA-target和lncRNA。因此,在过去十年中提出的RRI生物信息学工具是针对这些特定类别的。有趣的是,在文献中具有一些潜在的生物学作用的文献中有些未引起的mRNA-mRNA相互作用。因此,需要在更全面的设置中使用高通量通用RRI生物信息学工具。在这项工作中,我们重新访问了两个RRI分区函数算法,PIRNA和RIP。这些是对RRI实施最全面和计算中最密集的热力学模型的等效方法。我们提出了更简单的模型,这些模型被证明保留了更复杂模型捕获的绝大多数热力学信息。具体来说,我们通过忽略系统的熵并显示其与基本对计数模型的等效性来简化能量模型。我们允许碱基对的不同权重以最大化与完整热力学模型的相关性。我们新开发的算法Bppart比Pirna快225×,并且由于其简单性和数量级减少了动态编程表的数量,因此更易于表达和易于分析。仍然,基于我们对真实和随机生成的数据的分析,其分数与37°C处的PIRNA的相关性为0.855。最后,我们说明了这样简单模型的一个用例,以生成有关特定RNA在各种疾病中的作用的假设。我们已公开使用工具,并相信这种更快,更具表现力的模型将使物理指导的信息在复杂的RRI分析和预测模型中更容易访问。
简介。近年来,根据纠缠模式对量子态进行分类和研究的重要性已被揭示。一类重要的量子态是那些可以通过最小割方法计算纠缠熵的量子态。该方法假设状态可以用辅助“块”结构表示,通常是张量网络或——在全息对偶 [1] 中——块几何。最小割方法将区域 X 的纠缠熵等同于块割的权重,它将 X 与 ¯ X (X 的补集)分开。该方法适用于大键维度的所有随机张量网络状态 [2],并且——在全息对偶中——对 Ryu-Takayanagi 提案 [3 – 6] 中的主导面积项有效。本文关注最小割方法所暗示的纠缠熵约束。由于应用于全息对偶,此类约束通常被称为“全息熵不等式”。 “在假设的熵分配给区域的向量空间(熵空间)中,每个全息不等式的饱和点都是一个超平面。因此,所有全息不等式允许的熵集称为“全息熵锥” [7] 。进一步遵循全息命名法,我们将割线权重称为“区域”。最简单的全息不等式,称为互信息一夫一妻制 [8] ,是
1 A*STAR 量子创新中心 (Q.Inc)、材料研究与工程研究所 (IMRE)、新加坡科学技术研究局 (A*STAR)、2 Fusionopolis Way, 08-03 Innovis,新加坡 138634,新加坡 2 冲绳科学技术研究生院量子机器部门,冲绳恩纳 904-0495,日本 3 澳大利亚国立大学量子计算与通信技术中心量子科学与技术系,澳大利亚首都领地 2601,澳大利亚 4 澳大利亚国立大学量子科学与技术系,澳大利亚首都领地 2601,澳大利亚 5 新加坡国立大学量子技术中心,3 Science Drive 2,新加坡 117543,新加坡 6 Horizon Quantum Computing,05-22 Alice@Mediapolis,29 Media Circle,新加坡 138565,新加坡 7 高性能计算研究所,科学技术局新加坡科技研究局 (A*STAR) 新加坡 138634 新加坡 8 南洋量子中心,南洋理工大学物理与数学科学学院,21 Nanyang Link,新加坡 639673,新加坡 9 MajuLab,CNRS-UNS-NUS-NTU 国际联合研究单位,UMI 3654,新加坡 117543,新加坡
我们使用顺序分析和空间置换熵来区分眼睛睁开和闭眼的静息脑状态。为此,我们分析了来自109名健康受试者的64个电极记录的脑电图数据,在两个一分钟的基线运行下:一只眼睛睁开,另一个闭着眼睛。我们使用空间序数分析来区分这些状态,其中评估了置换熵,考虑到每次时电极的空间分布。我们分析了仅考虑Alpha波段频率(8 - 12 Hz)的原始和后处理数据,这对于大脑中的静息状态很重要。我们得出的结论是,空间序数分析捕获了有关不同电极中时间序列之间相关性的信息。这允许在原始数据和过滤数据中闭上眼睛和眼睛打开静止状态。过滤数据仅放大状态之间的区别。重要的是,我们的方法不需要EEG信号预处理,这对于实时应用来说是一个优势,例如大脑计算机接口。
摘要:信息切换和交换似乎是量子通讯协议的基本要素。另一个关键问题是纠缠及其在检查量子系统中的水平。在本文中,介绍了交换局部量子信息及其存在证明的正式定义,以及通过熵概念的棱镜分析的一些基本特性。作为局部信息交换用法的一个示例,我们演示了量子开关的某个实现。纠缠水平是根据von Neumann熵,光谱分解和Schmidt分解来计算的。数值实验的结果,在此期间估计了正在考虑的系统中有和没有扭曲的系统的纠缠水平。噪声是由dzyaloshinskii-moriya相互作用产生的,固有的脱谐性是由米尔本方程建模的。这项工作包含以电路形式实现的开关实现 - 由基本量子门制成,以及估计开关操作过程中纠缠水平的电路方案。
可以观察到每种合金的特定元素是指相的形态,而微观结构的一般外观是树突状的。因此,在x = 1和x = 0.6的情况下,树突的外观相对圆形,而对于x = 0.8的accicular地层,则观察到以不同方向定向的accicular地层。在较高的放大功能下,突出显示了每种合金的特定特性。因此,在x = 1的情况下,微结构由在金属基质中整齐排列的相组成,周围是直线晶界。x = 0.8样品的微观结构显示出形成的卵形相的趋势,晶界的范围更宽。在x = 0.6样本的情况下,微结构与x = 0.8的微观结构相似,这两个阶段的存在更好地突出显示。
1996 年,安德鲁·斯特罗明格和卡姆伦·瓦法对极端 Reissner-Nordstr¨om 黑洞的微观状态计数已被证明是弦理论的核心成果。本文以哲学读者为中心,在当代背景下介绍该论证,并分析其相当复杂的概念结构。特别是,我们将确定它所依赖的各种理论间关系,例如对偶性和链接关系。我们进一步旨在阐明为什么该论证立即被认为是对该黑洞熵的成功解释,以及它如何引发旨在加强黑洞弦理论分析的后续工作。我们将简要讨论它与 AdS/CFT 猜想公式的关系,并给出在 AdS/CFT 对应关系背景下对熵计算的熟悉重新解释。最后,我们讨论了 Strominger 和 Vafa 的黑洞熵微观解释对黑洞信息悖论的启发作用。配套论文分析了 Strominger-Vafa 黑洞状态的本体论、黑洞从 D 膜集合中出现的问题以及对应原理在弦理论黑洞背景下的作用。
其中 D reg ð E k F Þ ≔ lim n → ∞ ð 1 =n Þ D ð E ⊗ nk F ⊗ n Þ 。语句 (5) 意味着第一个不等式可以是严格的。根据摊销通道相对熵 (7) 的定义,这直接意味着 (6)。因此还需证明 (5)。为此,我们构造一个满足 (5) 的量子位上的两个迹保持完全正映射 E 和 F 的示例。考虑广义振幅阻尼通道 A γ ; β ð ρ Þ = P 4 i = 1 A i ρ A † i,其中 γ ; β ∈ ½ 0; 1 使用 Kraus 运算符 A 1 ¼ ffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffi 1 − β p ðj 0 ih 0 j þ ffiffiffiffiffiffiffiffiffiffi 1 − γ pj 1 ih 1 jÞ , A 2 ¼ ffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffiffi γ ð 1 − β Þ pj 0 ih 1 j , A 3 ¼ ffiffiffi β p ð ffiffiffiffiffiffiffiffiffiffi 1 − γ pj 0 ih 0 jþ j 1 ih 1 jÞ 和 A 4 = ffiffiffiffiffi γβ pj 1 ih 0 j 。对于两个通道 E = A 0.3;0 和 F = A 0.5;0.9,它们对应的 Choi 矩阵根据计算基础由下式给出
低碳能量转化是世界能源发展的主要趋势,减轻碳排放的措施在所需能量方面可能有很大差异。评估能源利用中能源使用的一种常见方法是能源投资回报率(EROI)。对Eroi的批评之一是对计算的输入和输出因素的不确定性。为了清楚这个问题,我们用熵来解释Eroi,这是物理学中最基本的概念。我们将能源利用系统视为一种耗散结构,并为能源资源开发系统构建了基本的熵分析框架。然后,我们得出EROI和熵变化之间的关系。EROI理论与耗散结构的基本要求一致,即总熵变化必须为负。eroi是一种使用熵理论评估能源资源开发的方法。将所有因子量化为能量单位是多维因素是多维的,而能量是一维标准是不合适的。EROI方法的未来发展应以熵理论为指导。一系列相关的指标将增加其应用和政策意义。
1994 年,Susskind 和 Uglum 提出,有可能从弦理论中推导出贝肯斯坦-霍金熵 A / 4 GN。在本文中,我们解释了这一论点的概念基础,同时阐明了它与诱导引力和 ER = EPR 的关系。根据 Tseytlin 的离壳计算,我们明确地从 α ′ 的领先阶球面图中推导出经典闭弦有效作用。然后,我们展示了如何利用这一点从圆锥流形上的 NLSM 的 RG 流中获得黑洞熵。 (我们还简要讨论了 Susskind 和 Uglum 提出的更成问题的“开弦图景”,其中弦在视界结束。)然后,我们将这些离壳结果与使用壳上 C / ZN 背景的竞争对手“轨道折叠复制技巧”进行比较,后者不考虑领先阶贝肯斯坦-霍金熵——除非允许快子在轨道折叠上凝聚。探讨了与 ER = EPR 猜想的可能联系。最后,我们讨论了各种扩展的前景,包括在 AdS 本体中推导出全息纠缠熵的前景。