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肿瘤衍生的小细胞囊泡充当治疗性纳米粒子递送的障碍
纳米颗粒有望用于药物输送应用，并具有多种临床批准的产品。但是，在实体瘤中获得高纳米颗粒的积累仍然具有挑战性。在这里我们表明，肿瘤细胞衍生的小细胞外囊泡（SEV）将纳米颗粒递送到肿瘤，揭示了基于纳米颗粒的肿瘤疗法的另一个障碍。肿瘤细胞在肿瘤微环境中分泌大量的SEV，然后结合进入肿瘤组织的纳米颗粒并将其传递到肝库普弗细胞中以降解。敲低Rab27a是一种控制SEV分泌的基因，可降低SEV水平并改善肿瘤组织中纳米颗粒的积累。与Rab27a在脂质纳米颗粒中共同包裹的抑制肿瘤和炎性蛋白质的信使RNA的治疗功效大大提高。一起，我们的结果表明，肿瘤细胞衍生的SEV是针对纳米颗粒肿瘤递送的防御系统，并且该系统可能是改善基于纳米颗粒的肿瘤疗法的潜在靶标。
表征用于再生医学的细胞外基质水凝胶的脱细胞心包的表征：动物到动物变异性的见解
在过去的几年中，用于再生医学目的的脱细胞外基质（DECM）衍生的水凝胶显着增加。内在的生物活性和免疫调节特性表明这些材料是治疗应用的有前途的候选物。迄今为止，诸如动物到动物变异之类的限制仍然阻碍了临床翻译。此外，组织源，脱细胞和溶解方案的选择会导致DECM衍生水凝胶的差异。在这种情况下，应进行水凝胶的化学，物理和生物学特性的详细表征，并注意这些特性如何受动物到动物的变异的影响。在此，我们报告了源自牛心包（DBP）的脱细胞外基质的水凝胶的详细表征。蛋白质含量，流变特性，注射性，表面微结构，体外稳定性和细胞相容性，尤其要注意动物到动物的变异性。凝胶化过程显示为热响应，并且获得的DBP水凝胶在水性培养基中是可注射的，多孔的，稳定的2周，在酶促环境中迅速降解，并且能够维持人间质间质细胞中的细胞生存能力。蛋白质组学分析的结果证明，除结构蛋白（如胶原蛋白）外，DBP水凝胶具有高度丰富的成分，保留生物活性蛋白聚糖和糖蛋白。共同完成这些结果表明，DBP水凝胶是用于再生医学应用的出色候选物。在化学成分方面，显示了动物对动物的变异性，但生物学特性不受影响，在不同批次中保持一致。
细胞外囊泡是否具有特定的靶细胞？
细胞外囊泡（EV）是细胞间通信的使者，但是受体细胞解释EV消息的确切机制仍未完全理解。在这项研究中，我们探讨了电动汽车的起源，它们的蛋白质货物的起源以及受体细胞类型如何影响胚胎植入模型中对EV的细胞反应。我们使用定量聚合酶链（QPCR）对受体细胞中锌纤维蛋白81（ZNF81）基因表达的两种类型的EV进行了处理。还分析了EV货物的蛋白质组学含量。结果表明，Znf81基因的下调是接受性子宫内膜上皮细胞对滋养细胞衍生的EV的特定细胞反应。蛋白质货物分析表明，电动汽车的蛋白质组学因素取决于其原产细胞，因此可能会影响受体细胞对EV的反应。Furthermore, trophoblastic EVs were found to be speci fi cally enriched with transcription factors such as CTNNB1 (catenin beta- 1), HDAC2 (histone deacetylase 2), and NOTCH1 (neurogenic locus notch homolog protein 1), which are known regulators of ZNF81 gene expression.当前的研究提供了支持EV特异性存在的令人信服的证据，在这种情况下，电动汽车和受体细胞类型的特征共同有助于调节EV目标特定。此外，EV蛋白货物分析表明，转录因子与滋养细胞EV的特定功能之间存在潜在的关联。这种体外胚胎植入模型和ZNF81读出提供了一个独特的平台来研究自然细胞 - 细胞通信中的EV特定功能。
含线粒体的小鼠与人脑内皮细胞的细胞外囊泡用于缺血性中风疗法
*通讯作者：Devika S Manickam 600 Forbes Avenue，453 Mellon Hall，匹兹堡，宾夕法尼亚州15282。电子邮件：soundaramanickd@duq.edu x/twitter：@manickam_lab电话：+1（412）396-4722
开发猪脱细胞外基质（DECM）生物学
摘要本研究旨在提出从猪半月板中提取DECM的易于扩展，具有成本效益的过程，该过程致力于生物互联制剂和3D生物打印。由于其软骨（例如结构和机械鲁棒性），弯月面是一种非常苛刻的组织，用于提取和脱落ECM。它的处理构成了很大的困难，并使以前针对软组织开发的方法无用。结合了均质化，水解，超临界二氧化碳（SCCO2）提取和冻干的过程，以应对这一挑战。该方案允许保留其天然化合物和生物相容性，同时提供良好的可打印性，并为细胞增殖和分化为半月板样表型提供刺激性环境。此外，此过程在经济和生态上很友好，因为它不需要使用大量溶剂，洗涤剂或昂贵的酶（DNase）。已经对脱细胞过程进行了精心研究，证明了DNA含量的大幅降低，但仍超过公认的阈值。这项研究进一步探讨了DECM的生物相容性，表明在扩展体外培养过程中，残留的DNA对细胞存活没有不利影响，表明出色的生物相容性。这些发现仅基于DNA含量，挑战了当前对脱细胞化有效性的定义，提出了对生物学作用的更广泛评估。
计算机断层扫描测量治疗前细胞外体积分数对腹部神经母细胞瘤原发病灶对术前化疗反应的影响
目的：回顾性研究治疗前计算机断层扫描（CT）测量的细胞外体积分数（ECV）对腹部神经母细胞瘤原发灶对术前化疗反应的影响。方法：回顾性纳入75例腹部神经母细胞瘤患者。治疗前在平扫和平衡期CT图像上确定原发灶和主动脉的感兴趣区域，并测量其平均CT值。根据患者血细胞比容和平均CT值计算ECV。检查ECV与原发灶体积减少之间的相关性。生成受试者工作特征曲线以评估ECV对原发灶非常好的部分反应的预测性能。结果：原发病灶体积缩小与 ECV 呈负相关（r = -0.351，p = 0.002），部分反应极好的原发病灶 ECV 较低（p < 0.001）。ECV 预测原发病灶部分反应极好的曲线下面积为 0.742（p < 0.001），95% 置信区间为 0.628 至 0.836。最佳截断值为 0.28，灵敏度和特异性分别为 62.07% 和 84.78%。结论：CT 图像上治疗前 ECV 的测量与腹部神经母细胞瘤原发病灶对术前化疗的反应具有显著相关性。
尿苷磷酸化酶1通过改变肺的免疫和细胞外基质景观来支持乳腺癌的转移
了解促进转移播种早期事件的机制是开发减少转移的治疗方法的关键，这是与癌症相关死亡的主要原因。使用全动物筛查在癌症的基因工程小鼠模型中，我们已经确定了与转移相关的循环代谢产物。具体来说，我们将嘧啶尿嘧啶作为突出的转移相关代谢物。尿嘧啶是由表达尿苷磷酸酶-1（UPP1）的中性粒细胞产生的，癌症中嗜中性粒细胞的特异性UPP1表达增加。改变的UPP1活性会影响中性粒细胞表面上的粘附分子的表达，从而导致嗜中性肺前肺中性粒细胞运动降低。此外，我们发现表达UPP1的中性粒细胞抑制T细胞增殖，UPP1产物尿嘧啶可以增加细胞外微环境中的纤连蛋白沉积。始终如一，具有乳腺肿瘤的小鼠中UPP1的敲除或抑制会增加T细胞的数量，并减少肺中的纤连蛋白含量，并降低发展肺转移的小鼠比例。这些数据表明UPP1在肺中影响中性粒细胞的行为和细胞外基质沉积，并表明该途径的药理靶向可能是减少转移的有效策略。
探索下一代再生疗法的神经细胞外基质的特性和潜力
科学与创新部，格兰特。 Ramon和Cajal RYC2019-0 Mike Lane奖学金免费拥有Gracia别墅，赠款/奖励号：CVG2 AFM-TEMELON TRAMPOLINE，赠款/奖励号：23648； EURONONOME委员会第三届加泰罗尼亚政府，赠款 /奖励号：2021 SGR机构或加泰罗尼亚研究与高级研究，赠款 /奖励编号：Engel2022；格兰特，格兰特。 IDIBELL_NEWSCIENCE计划-Neuropulse 2022;赠款/奖励：赠款/奖项：ID，ID，
Physiofit：量化细胞生长参数和细胞外通量的软件
摘要摘要：生长参数和细胞外摄取和生产通量的量化是系统和合成生物学的核心。通量，通过拟合细胞和细胞外底物和产物的浓度的时间顺序测量。非计算生物学家可以使用一种工具来计算细胞外通量，但几乎无法互操作，并且仅限于单个硬编码的生长模型。我们介绍了我们的开源通量计算软件Physiofit，可以与任何增长模型一起使用，并且可以通过设计可互操作。Physiofit包括一些最常见的增长模型，高级用户可以实施其他模型来计算遵循替代动力学的代谢系统或实验设置的细胞外通量和其他增长参数。Physiofit可用作Python库，并提供图形用户界面，以直观使用最终用户和命令行界面，以简化现有管道中的集成。可用性和实现：Physiofit在Python 3中实现，并在Windows，Unix和MacOS平台上进行了测试。Physiofit也可以在https://workflow4metabolomics.org上在线免费获得。源代码，数据和文档是在https://github.com/metasys-lisbp/physiofit/和https://physiofit.readthedocs.io/上自由分布的。
羊水干细胞细胞外囊泡通过TGF-beta调节促进肺发育，以少血离hydramnios的胎儿大鼠模型
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2024年6月22日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.06.18.599591 doi：biorxiv Preprint