* 通讯作者 Sunil J. Advani,加利福尼亚大学圣地亚哥分校摩尔斯癌症中心放射医学与应用科学系,3855 Health Sciences Drive, MC 0843,拉霍亚,CA 92093-0843,电话:858-822-6046,传真:858-822-5568,sjadvani@ucsd.edu。#contributed 同等贡献 作者声明 Dina V. Hingorani:调查、可视化、撰写 - 原始草稿。Jessica L. Crisp:调查、可视化。Matthew K. Doan:调查。Maria F. Camargo:调查。Maryam A. Quraishi:调查。Joseph Aguilera:调查。Mara Gilardi:调查。Larry A. Gross:方法论、调查。Tao Jiang:方法论、调查。Wei T. Li:调查。Weg M. Ongkeko:数据管理。 Ezra EW Cohen:资源、写作-评论和编辑。J. Silvio Gutkind:资源、写作-评论和编辑。Stephen R. Adams:方法论、资源、写作-评论和编辑。Sunil J. Advani:概念化、写作-原始草稿、监督、资金获取。
fi g u r e 1表征,蛋白质组学分析以及对ANEV和BEV的差分分析。(a)来自代表性循环BEV和ANEV的透射电子显微镜图像。比例尺:200 nm。图像描绘了来自两个样本的代表性电动汽车。(b)通过NTA分析了每个实验条件的七种不同的EV制剂。代表性的NTA直方图显示BEV和ANEVS的平均粒径为200 nm。(c)Anevs的特征是Western blot。面板显示三名代表性患者的免疫印迹。真正的EV标记,例如CD63,TSG101,Syntenin-1和CD9。(d)通过基于质谱的定量蛋白质组学获得的蛮数据的维恩图代表了BEV和ANEVS中检测到的蛋白质之间的相交。(e)火山图显示了所有鉴定的蛋白质。在ANEVS(右侧)和BEVS(左侧)中的统计学上显着差异(p> .05)以蓝色出现。访问数字(uniprot)显示了感兴趣的蛋白质(cdc42,ficolin-2,s100a9)。主成分分析(F)和血浆衍生EV的无监督分层聚类(G)
摘要:建立CRISPR/CAS9(群集的定期间隔短的短文重复序列/CRISPR相关蛋白9)用于真核基因编辑的技术,不仅为分析基因功能开辟了新的途径,还为治疗干预提供了新的途径。虽然最初的方法允许靶向基因破坏,但最新的技术进步产生了各种各样的工具,以各种方式修改基因和基因表达。目前,这项技术的临床应用不超过期望,这主要是由于将CRISPR/CAS9组件的有效且安全地交付给生物体。靶向的治疗核酸和蛋白质的靶向体内递送在技术上仍然具有挑战性,例如,通过不必要的脱靶效应,免疫反应,毒性或快速降解转移车辆的进一步局限性。一种可能克服这些限制的方法采用细胞外囊泡作为细胞间递送装置。在这篇综述中,我们首先介绍了CRISPR/CAS9系统及其最新进步,概述主要应用程序,并使用外泌体或微泡列出将CRISPR/CAS9成分运送到真核生物细胞中的当前最先进的技术状态。
图1方案说明了EV的研究概念和隔离。 在获得货物生物活性之前,(a)EV被细胞吸收,将其封装在其水泡室(即内体)[I] [I],然后与内体膜融合,以将葡萄球菌释放到细胞质[II]中。 (b)使用纳米脂肪系统对电动汽车的总摄取和膜融合进行定量。 在这项研究中,EV的“细胞摄取”被定义为包括内体[I]中的EV和与内体膜融合的EV [II]。 (c)隔离SEV和LEV。 evs,细胞外囊泡; Sevs,小的细胞外囊泡; LEV,大型细胞外囊泡。1方案说明了EV的研究概念和隔离。在获得货物生物活性之前,(a)EV被细胞吸收,将其封装在其水泡室(即内体)[I] [I],然后与内体膜融合,以将葡萄球菌释放到细胞质[II]中。(b)使用纳米脂肪系统对电动汽车的总摄取和膜融合进行定量。在这项研究中,EV的“细胞摄取”被定义为包括内体[I]中的EV和与内体膜融合的EV [II]。(c)隔离SEV和LEV。evs,细胞外囊泡; Sevs,小的细胞外囊泡; LEV,大型细胞外囊泡。
疟疾是由疟原虫在患者中的快速增殖而引起的,疾病的严重程度与循环中感染的红细胞数量相关。红细胞内的寄生虫乘以分数称为精神分裂,并通过非典型多核细胞分裂模式发生。调节单个祖细胞产生的子细胞数量的机制知之甚少。,我们使用超分辨率的延时显微镜来量化恶性疟原虫和诺尔斯氏菌中的核繁殖动力学,研究了基本的调节原则。这证实了子细胞的数量与一个模型一致,在该模型中,反机制调节乘法但与计时器机制不相容。p。核分裂开始时恶性细胞体积与最终的子细胞数量相关。随着精神分析的进行,核细胞质体的体积比(迄今为止都被发现在所有真核生物中都恒定,显着增加,可能是为了适应指数的多层核。通过稀释培养基来耗尽营养,导致寄生虫产生较少的植物,减少增殖,但在精神分裂症结束时不会影响细胞体积或总核体积。我们的发现表明,与疟原虫寄生虫增殖有关的反机制整合了细胞外资源状态,以修改血液阶段感染期间的后代数量。
摘要:细胞外囊泡的分泌,EVS,是原核生物和真核细胞的常见过程,用于细胞间交流,生存和发病机理。先前的研究表明,来自细菌纯培养物的上清液中的EV存在,包括革兰氏阳性和革兰氏阴性的聚糖降解肠道分子。但是,复杂微生物群落分泌的电动汽车的隔离和表征尚未清楚地报告。在最近的一篇论文中,我们表明,木材衍生的复杂β -mannan与常规饮食纤维具有结构性相似,可用于调节猪肠道肠道菌群的组成和活性。在本文中,我们研究了24小时在复合β -Mannan富集后,猪粪便菌群分泌的EV的产生,大小,组成和蛋白质组。使用透射电子显微镜和纳米颗粒跟踪分析,我们以165 nm的平均大小识别电动汽车。我们利用猪蛋白的基于质谱的元蛋白质蛋白基于猪蛋白的数据库,并从猪群中鉴定出355个元基因组组装的基因组(MAG),从而鉴定出303蛋白。对于从β -mannan生长的培养物中分离出来的EV,大多数蛋白质映射到两个MAGS MAG53和MAG272,分别属于梭菌和细菌。此外,具有第三次蛋白质的MAG为MAG 343,属于肠杆菌阶。在β -Mannan EV蛋白质组中检测到的最丰富的蛋白质参与了翻译,能量产生,氨基酸和碳水化合物转运以及代谢。总体而言,这项概念验证研究表明,从复杂的微生物群落中释放出的电动汽车的成功隔离。此外,电动汽车的蛋白质含量反映了特定微生物对可用碳水化合物源的响应。
心血管疾病 (CVD) 的患病率正在迅速上升,预计到 2030 年,每年将有超过 2360 万人死于 CVD,到 2035 年,美国大约一半的成年人口将患有某种形式的 CVD。仅在美国,每年仅 CVD 的管理和治疗费用就超过 3500 亿美元,其中大部分支出用于缺血性心脏病和高血压健康服务。全球 CVD 负担日益加重,凸显了加强和持续全球预防工作以及大规模药物发现方法的必要性,这些方法可以充分满足临床未满足的需求。细胞骨架组,我们将其定义为完整的细胞骨架蛋白组,例如细丝和微管,以及其他相关材料,包括支持其结构的底层细胞外基质 (ECM),为 CVD 药物靶标发现提供了相对较新且尚未得到充分探索的途径。
过去 20 年,小细胞外囊泡 (EV) 被证明具有作为潜在的新型药物输送系统、生物标志物和治疗靶点的良好特性。此外,EV 还参与了肿瘤发展和进展的最重要步骤,包括耐药性。癌细胞获得或固有的抵抗化疗的能力是改善许多患者预后的最大障碍之一。EV 参与了这一机制,它将药物输出到细胞外,并将药物流出泵和 miRNA 转移到受体细胞中,进而诱导耐药性。在这篇小型评论中,我们描述了 EV 参与耐药性的主要机制,为读者提供了该领域的快速清晰概述。
摘要:细胞外基质(ECM)是一个三维的细胞网络,该网络由嵌入凝胶蛋白酶糖果糖果和蛋白聚糖组成的凝胶状地面物质中。ECM发挥的作用可根据其所处组织而变化。在心肌中,ECM充当基于胶原蛋白的支架,介导收缩信号的传播,提供了旁分泌信号传导的手段,并具有营养和免疫学稳态。鉴于此范围,毫不奇怪的是,在心脏病理学的背景下,已经发现ECM的组成和作用是调制的。心肌梗塞(MI)提供了一个熟悉的例子; ECM以一种疗效后疗法的渐进阶段的特征方式变化。近年来,这种参与梗塞病理生理学的参与促使人们寻求治疗靶标:如果ECM成分有助于愈合,那么它们的操作可能会加速恢复,甚至反向预先存在的损害。这种可能性已成为众多努力的主题,涉及直接从生物学来源或生物工程来源衍生成心肌疾病模型的基于ECM的疗法的整合。在本文中,我们对发表的有关ECM用作缺血性心脏病的新疗法的文献进行了详尽的综述,并着重于整个ECM及其组件的生物学衍生模型。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年4月22日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.04.30.535834 doi:Biorxiv Preprint