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World File Search SystemgRNA
工程的PEGRNA提高了Prime编辑效率
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改进的 gRNA 二级结构允许编辑抵抗 CRISPR-Cas9 切割的靶位
CRISPR-Cas9 介导的基因组编辑的第一步是切割与 CRISPR 向导 RNA (gRNA) 中所谓的间隔序列互补的目标 DNA 序列。然而，一些 DNA 序列对 CRISPR-Cas9 切割具有抵抗性，这至少部分是由于 gRNA 折叠错误造成的。为了解决这个问题，我们设计了 gRNA，使其恒定部分具有高度稳定的发夹结构，并通过化学修饰进一步增强了它们的稳定性。“基因组编辑优化锁定设计”(GOLD)-gRNA 将基因组编辑效率提高了约 1000 倍（从 0.08% 到 80.5%），其他不同靶标的平均效率提高了 7.4 倍。我们预计，无论间隔序列组成如何，这种改进的 gRNA 都将实现高效编辑，并且在所需的基因组位点难以编辑时将特别有用。
改进的 gRNA 二级结构允许编辑抵抗 CRISPR-Cas9 切割的靶位
CRISPR-Cas9 介导的基因组编辑的第一步是切割与 CRISPR 向导 RNA (gRNA) 中所谓的间隔序列互补的目标 DNA 序列。然而，一些 DNA 序列对 CRISPR-Cas9 切割具有抵抗性，这至少部分是由于 gRNA 折叠错误造成的。为了解决这个问题，我们设计了 gRNA，使其恒定部分具有高度稳定的发夹结构，并通过化学修饰进一步增强了它们的稳定性。“基因组编辑优化锁定设计”(GOLD)-gRNA 将基因组编辑效率提高了约 1000 倍（从 0.08% 到 80.5%），其他不同靶标的平均效率提高了 7.4 倍。我们预计，无论间隔序列组成如何，这种改进的 gRNA 都将实现高效编辑，并且在所需的基因组位点难以编辑时将特别有用。
CRISPRSCORE：CRISPR grnas
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通过裂域 CRISPR-Cas12a gRNA 开关进行序列独立的 RNA 传感和 DNA 靶向
CRISPR 技术越来越需要对核酸酶活性进行时空和剂量控制。一种有前途的策略是将核酸酶活性与细胞的转录状态联系起来，通过设计引导 RNA (gRNA) 使其仅在与“触发”RNA 复合后发挥作用。然而，标准的 gRNA 开关设计不允许独立选择触发和引导序列，从而限制了 gRNA 开关的应用。在这里，我们展示了 Cas12a gRNA 开关的模块化设计，它可以将这些序列的选择分离。Cas12a gRNA 的 5' 端融合到两个不同且不重叠的结构域：一个与 gRNA 重复碱基配对，阻止 Cas12a 识别所需的发夹结构的形成；另一个与 RNA 触发物杂交，刺激 gRNA 重复的重新折叠和随后的 gRNA 依赖性的 Cas12a 活性。使用无细胞转录翻译系统和大肠杆菌，我们表明设计的 gRNA 开关可以响应不同的触发因素并靶向不同的 DNA 序列。调节传感域的长度和组成会改变 gRNA 开关的性能。最后，gRNA 开关可以设计为感知仅在特定生长条件下表达的内源性 RNA，从而使 Cas12a 靶向活性依赖于细胞代谢和压力。因此，我们的设计框架进一步使 CRISPR 活性与细胞状态挂钩。
通过病毒样颗粒（''nanoblades''）在永生和原代细胞中递送Cas9/sgrna核糖核蛋白复合物
Philippe E Mangeot，Laura Guiguettaz，Thibault J M Sohier，Emiliano P Ricci。通过病毒样颗粒（“纳米薄片”）在永生和原代细胞中递送Cas9/sgrna核糖核蛋白复合物。可视化实验杂志：Jove，2021，169，10.3791/62245。hal-04892096
小分子调控的 sgRNA 能够通过 Cas9 控制大肠杆菌中的基因组编辑
CRISPR-Cas9 已为广泛应用的基因编辑带来了巨大进步。为了进一步发挥 Cas9 的效用，人们一直在努力实现对其核酸酶活性的时间控制。虽然不同的方法都侧重于调节哺乳动物细胞中的 CRISPR 干扰或编辑，但所有报道的方法都无法控制细菌中的核酸酶活性。在这里，我们开发了 RNA 接头，将茶碱和 3-甲基黄嘌呤 (3MX) 结合适体与 sgRNA 结合起来，从而实现大肠杆菌中的小分子依赖性编辑。这些可激活的向导 RNA 能够实现对体内基因编辑的时间和转录后控制。此外，它们还减少了因基因组切割而导致的宿主细胞死亡，这是 CRISPR 介导的细菌重组的主要限制。
GMP sgRNA 合成服务
深耕核酸领域 25 余年，兆维科技现提供高纯度 GMP 级别 sgRNA ， 通过前沿的技术，先进的生产设施以及严格的质量控制， 助力您的治疗项目迈向新的里程碑。
在CRISPR/CAS9应用的单个分析中，SGRNA和Cas9 mRNA的高分辨率表征
RNA疫苗和CRISPR（簇簇的定期间隔短的短粒子重复重复序列）制造商通常会挑战制造商，以准确表征和量化不同尺寸的RNA分子，杂质和降解的RNA物种，以及疫苗或个性化药物产品中的降解RNA物种。1,2为了帮助克服这些挑战，在本技术说明中，我们提出了一种基于分析套件的解决方案，用于表征最终产品中的RNA完整性和RNA片段化。使用多毛细管电泳平台，我们展示了有效且延时的工作流程，以评估潜在的mRNA疫苗和CRISPR试剂的各种关键质量属性（CQA）（图1）。对于CRISPR/CAS9基因编辑系统的主要产物的纯度含量获得了出色的可重复性，CV <2％。这些结果证明了RNA 9000纯度和完整性套件在50至9,000个碱基范围内将单链RNA产物分离的能力。
Pegrna Infographic
Prime编辑是一种“搜索和替换”基因编辑技术，可提供更精确的编辑，而无需产生双链断裂，从而降低了脱靶效应的风险，并使其成为基因和细胞疗法的CRISPR/CAS9的潜在更安全的替代品。