成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/CRISPR 相关蛋白 9 (Cas9) 系统已成为一种成功且有前途的基因编辑技术。为了促进其有效应用,已经开发了各种计算工具。这些工具可以通过预测切割效率和特异性并排除不良靶标来帮助研究人员进行向导 RNA (gRNA) 设计过程。然而,虽然有许多工具可用,但对其应用场景和性能基准的评估却有限。此外,最近已经探索了用于 gRNA 效率预测的新深度学习工具,但尚未进行系统评估。在这里,我们讨论了与靶标活性问题有关的方法,主要关注它们利用的特征和计算方法。此外,我们在独立数据集上评估了这些工具并给出了一些使用建议。最后,我们总结了 CRISPR-Cas9 向导设计未来方向的一些挑战和观点。
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