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合成基因组
DNA合成技术已经发展到现在合成整个基因组是实际的。已经进行了多种方法，首先是为了合成单个基因，但最终是从划痕整个基因组中大量编辑或写入的。合成基因组本质上可以是天然序列的克隆，但是这种方法并没有教会我们许多新的生物学。具有新型特性的赋予基因组的能力为您提供了特殊的希望，可以使问题不容易通过常规的基因 - AT-AT-AT-AT-AT-ATI-ATIPED方法接近。这些包括有关进化的问题以及基因组在从根本上进行信息，代谢和遗传上的有线方式。在这里回顾了与如何在基因组量表上设计，建造和交付大型DNA有关的技术和技术。对这些原则的更深入的理解可能有一天会导致从头开始设计基因组的能力。
茜草科叶绿体基因组
在茜草科系统发育学中，标记的数量常常是一个限制因素，作者无法提供族和属水平上得到良好支持的树。稳健的系统发育是研究不同分类水平上性状进化模式的先决条件。下一代测序技术的进步彻底改变了生物学，它以较低的成本为越来越多的物种提供了大量数据。由于叶绿体 DNA 序列具有高度保守的结构、通常无重组且大多是单亲遗传，因此长期以来一直被用作植物系统发育重建的选择标记。本研究的主要目的是：1) 通过有效的质体基因组从头组装方法深入了解茜草科 (Ixoroideae) 叶绿体基因组的进化； 2）基于咖啡参考基因组测试挖掘Ixoroideae核基因组中的SNP的效率，以生成支持良好的核树。我们使用下一代序列组装了茜草科Ixoroideae亚科27个物种的整个叶绿体基因组序列。对质体基因组结构的分析表明，基因内容和顺序相对保守。一般而言，在边界区域，分类单元之间的变异较小，但某些分类单元的大单拷贝和短单拷贝连接处均存在倒置重复序列。在咖啡属中确定的SNP平均有79％可转移到Ixoroideae，变异范围为35％至96％。总体而言，质体和核基因组系统发育彼此一致。它们得到很好的解决，并具有很好的支持分支。一般而言，这些族群形成易于识别的进化枝，但 Sherbournieae 族群被证明是多系的。本文结合所用方法和茜草科的叶绿体基因组特征讨论了结果，并与以前的茜草科系统发育进行了比较。
结构和功能的基因组
美国能源部（DOE）生物学和环境研究（BER）计划的目标是实现对复杂的生物，地球和环境系统的预测理解，目的是促进国家的能源和基础设施安全。（https://www.energy.gov/science/ ber/birogical-and-environmental-research）。为了实现这一目标，在导致多学科项目的各种研究领域的专家之间的合作是必不可少的。DOE用户设施的作用，为此类研究项目提供了独特而强大的资源，并且对设施的期望正在增加。响应用户的需求，联合基因组研究所（JGI）和环境分子科学实验室（EMSL）在2014年启动了整合用户科学协作（FICUS）计划的设施。这项合作已发展为一个受欢迎且成功的计划，迄今为止推进了100多个多学科项目。同样，在基本能源科学（BES）计划的同步器和中子设施中，JGI，EMSL和用户资源之间的新的间隔合作对尖端的跨学科科学至关重要。
揭开基因组的奥秘
本文深入研究了复杂的基因组学世界，重点是解释封装在基因组中的生命的蓝图。基因组包括生物体的整个遗传物质，是了解生命复杂性的关键，从管理发展和功能的分子机制到塑造生物多样性的进化过程。此探索从DNA测序的早期到当前的高通量技术和大数据分析的时代，可以追溯基因组学的演变。通过揭开基因组中编码的奥秘，科学家旨在释放有关健康和疾病，物种多样性和生物学基本原理的新见解。基因组是生命的蓝图，其中包含有机体开发，功能和调节所必需的一组遗传指示集。揭示这些复杂的蓝图的旅程始于詹姆斯·沃森（James Watson），弗朗西斯·克里克（Francis Crick）和罗莎琳德·富兰克林（Rosalind Franklin）等科学家的开创性工作，后者阐明了1950年代DNA的双螺旋结构。这一发现为现代基因组学奠定了基础，提供了一个分子框架，以了解如何存储和传播遗传信息。在随后的几十年中，DNA测序技术的进步彻底改变了基因组学领域，使科学家能够以前所未有的速度和精确度破译了不同生物体的遗传密码。地标项目的完成，例如人类基因组项目，标志着基因组学的主要里程碑，为人类基因组提供参考序列，并为随后的研究努力奠定了基础。
大规模扰动以理解基因组 2
11:30 12:00 利用干细胞研究人类遗传学 – 从 CRISPR 筛选到基因、增强子和糖尿病风险变异 Danwei Huangfu，美国纪念斯隆凯特琳癌症中心
微生物基因组的三种视图
局部重复是在小区域内发生的对称元素的出现（以100 bp为单位）。所有四种局部重复都可以参与特殊的DNA结构的形成 - 最著名的是十字形，可以通过倒重复序列形成。镜面重复序列可以形成非常不同的结构：分子内三链DNA，也称为triplex DNA和H-DNA [8]。加上三链部分，Triplex DNA还由一个单链部分组成，可以与另一个DNA混合；这被认为是同性重组的可能机制[21]。也存在与直接重复序列相关的特殊DNA结构，并且也存在重复的重复。直接重复可以形成所谓的滑动链DNA（S-DNA），这可能会导致框架移动muta-
APE基因组的完整测序
第二，Solar 2，Antipov 2，11，Riley J. Mangan 12，13，14，头盔3，Gracela Mofort 15，16，Laura Carrel 23，Agnes P. Chan 24，Juyun Crawford 19，26，26，26，26，27，Gage H. Gage H. Garcia H. Garcia Gabrielle A. Alexandra P. Lewis 1，Juan F. I.25 25 Szpiech 11，Christian D. Huber 11，Tobias L. Lenz 9，Miriam K. Conchel 41,42，Soojin V. Yi 55，Stefan 26 Canzar 48，Corey T. Watson 57，Erik Garrison 30，Craig B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. Lowe 8 8，Mario Ventur 4，Rachel J. O'Neill 10,17，58，Sergey Corren25 25 Szpiech 11，Christian D. Huber 11，Tobias L. Lenz 9，Miriam K. Conchel 41,42，Soojin V. Yi 55，Stefan 26 Canzar 48，Corey T. Watson 57，Erik Garrison 30，Craig B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B. B.Lowe 8 8，Mario Ventur 4，Rachel J. O'Neill 10,17，58，Sergey Corren16 Martinez 6 , Patrick Masterson 32 , Rajiv C. McCoy 18 , Barbara McGrath 11 , Sean Mckinney 15 , Britta 17 S. Meyer 9 , Karen H. M. MATT 18 PENNELL 47 , Pavel A. PEvzner 31 , David Porusky 1 , Tamara Potapova 15 , Francisca R. Ringeling 48 , 19 Joana L. Rocha 49 , Oliver A. Ryder 35 , swalti 29 , swarms 1 32 , Edmundo 22 Torres-González 11 , Mihir Trivedi 1, 59 , Wenjie Wei 51, 52 , Julie Wertz 1 , Muyu yang 44 , Panpan 23 Zhang 2 Zhhang Zhang 31 , Sarah A. Zhao 12 , Yixin Zhu 47 , 24 Erich D. Jarvis 37, 53，詹妮弗·L·格顿15，伊克·里瓦斯·冈萨雷斯54，扎卡里·A。16 Martinez 6 , Patrick Masterson 32 , Rajiv C. McCoy 18 , Barbara McGrath 11 , Sean Mckinney 15 , Britta 17 S. Meyer 9 , Karen H. M. MATT 18 PENNELL 47 , Pavel A. PEvzner 31 , David Porusky 1 , Tamara Potapova 15 , Francisca R. Ringeling 48 , 19 Joana L. Rocha 49 , Oliver A. Ryder 35 , swalti 29 , swarms 1 32 , Edmundo 22 Torres-González 11 , Mihir Trivedi 1, 59 , Wenjie Wei 51, 52 , Julie Wertz 1 , Muyu yang 44 , Panpan 23 Zhang 2 Zhhang Zhang 31 , Sarah A. Zhao 12 , Yixin Zhu 47 , 24 Erich D. Jarvis 37, 53，詹妮弗·L·格顿15，伊克·里瓦斯·冈萨雷斯54，扎卡里·A。