XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemhomologous
与线粒体DNA同源的核DNA片段是检测甜菜中异质质的障碍（beta vulgaris l.）
异质性是细胞中多个线粒体DNA（mtDNA）序列的共存，在植物中有充分的文献证明。下一代测序技术（NGS）使得整个基因组对整个基因组进行了可行。因此，NGS具有检测异质的潜力。但是，异质检测中的方法和陷阱尚未得到充分投资和确定。异质检测的一个障碍是线粒体，塑料和核DNA之间的序列同源性，其中核DNA片段与mtDNA同源（NOMT）的影响需要最小化。为了检测异质，我们首先排除了从糖甜菜mtDNA序列中排除甜菜甜菜（Beta fulgaris）系EL10的核DNA序列。ngs读数是从甜菜线NK-195BRMM-O和NK-291BRMM-O的单个植物中获得的，并映射到未分解的mtDNA区域。通过基因组浏览分析检测到的1000多个位点表现出个体内部多态性。我们专注于一个309 bp的区域，其中12个个体内多形态位点彼此紧密相关。尽管通过NK-195BRMM-O和NK-291BRMM-O的PCR扩增在12个位点存在变异等位基因的DNA分子的存在，但这些变体并不总是由六个变体呼叫程序调用，这表明这些程序不适合内部个体个人个性化的多种形式检测。当我们更改核DNA参考时，发现EL10缺乏的数字包括309 bp区域。NK-195BRMM-O X NK-291BRMM-O的F 2种群的遗传分离支持了变体等位基因的NOMT起源。使用四个参考文献，我们发现NUMT检测表现出参考依赖性，而甜菜线中存在NOMT的极端多态性。EL10中没有发现的numts之一与NK-195mm-O中的另一个个体内多态位点有关。我们的数据表明，在甜菜中，糖的多态性意外高，导致对杂质的真实程度的混乱。
靶向卵巢癌的同源重组缺乏症：parp抑制剂：影响整体生存的合成致命策略
简单的摘要：癌症治疗的合成致死性方法涉及将事件结合起来引起癌细胞死亡。使用这种策略，在治疗同源重组修复（HRR）途径缺陷的卵巢癌的女性方面已经取得了重大进展。由于HRR途径有缺陷，由于基因（例如BRCA1或BRCA2）的突变或表观遗传变化，细胞无法再精确地修复双链断裂（DSB）。利用这种弱点，对修复单链断裂（SSB）的聚（ADP-核糖）聚合酶（PARP）的药理抑制作用会导致HRR有缺陷的细胞中的合成致死性。PARP抑制剂（PARPIS），包括Olaparib，Niraparib和Rucaparib，被批准用于卵巢癌女性的临床管理。理解和克服对PARPIS的抵抗力的问题，扩展了这些策略，以使更多的患者受益，并将PARPI与其他药物（包括免疫疗法）相结合，在当今的领域中是很高的优先事项。
使用合成的同源供体构建体进行 CRISPR 介导的同源重组，为果蝇基因标记提供扩展工具包
摘要 之前，我们描述了大量果蝇菌株，每个菌株都携带一个人工外显子，其中包含一个基于 CRISPR 介导的同源重组插入目标基因内含子中的 T2AGAL4 盒。这些等位基因可用于多种应用，并且已被证明非常有用。最初，基于同源重组的供体构建体具有较长的同源臂（>500 bps），以促进大型构建体（>5 kb）的精确整合。最近，我们表明，供体构建体的体内线性化使得能够使用短同源臂（100-200 bps）将大型人工外显子插入内含子中。较短的同源臂使得商业合成同源供体成为可能，并最大限度地减少了供体构建体生成的克隆步骤。不幸的是，大约 58% 的果蝇基因缺乏适合所有注释异构体中人工外显子的编码内含子整合。在这里，我们报告了新构建体的开发，这些构建体允许用 KozakGAL4 盒替换缺乏合适内含子的基因的编码区，从而产生与目标基因类似地表达 GAL4 的敲除/敲入等位基因。我们还开发了定制载体骨架，以进一步促进和改善转基因。在包含目标基因 sgRNA 的定制质粒骨架中合成同源供体构建体，无需注射单独的 sgRNA 质粒，并显著提高了转基因效率。这些升级将使几乎所有果蝇基因都能靶向，无论外显子-内含子结构如何，成功率为 70-80%。
利什曼原虫中 RAD51 相关基因的条件性敲除揭示了同源重组在基因组复制过程中的关键作用
同源重组 (HR) 与基因组复制有着密切的关系，无论是在修复可能阻止 DNA 合成的 DNA 损伤期间，还是在解决复制叉停滞时。最近的研究让我们想知道 HR 是否在复制真核寄生虫利什曼原虫的基因组中发挥着更为核心的作用。关于 HR 基因是否必需，出现了相互矛盾的证据，而全基因组图谱为 DNA 复制起始位点（称为起源）的非正统组织提供了证据。为了回答这个问题，我们采用了 CRISPR/Cas9 和 DiCre 的组合方法来快速生成和评估利什曼原虫中 RAD51 和三种 RAD51 相关蛋白的条件性消融的影响。使用这种方法，我们证明任何这些 HR 因子的丧失都不会立即致命，但在每种情况下，生长都会随着时间的推移而减慢，并导致 DNA 损伤和具有异常 DNA 含量的细胞的积累。尽管存在这些相似之处，但我们表明，只有 RAD51 或 RAD51-3 的缺失才会损害 DNA 合成并导致全基因组突变水平升高。此外，我们还表明这两个 HR 因子的作用方式不同，因为 RAD51 的消融（而不是 RAD51-3）对 DNA 复制有重大影响，导致主要起点处的起始丧失和亚端粒处 DNA 合成增加。我们的工作澄清了有关 HR 对利什曼原虫生存的重要性的问题，并揭示了 RAD51 在微生物真核生物基因组复制程序中意想不到的核心作用。
有缺陷的同源重组和基因组不稳定性预测胰腺癌中对碳离子放射疗法的反应性提高。
Defective Homologous Recombination and Genomic Instability Predict Increased Responsiveness to Carbon Ion Radiotherapy in Pancreatic Cancer Brock J. Sishc 1 , Janapriya Saha 1 , Elizabeth Polsdofer 1 , Lianghao Ding 1 , Huiming Lu 1 , Shih-Ya Wang 1 , Katy L. Swancutt 1 , James H. Nicholson 1 , Angelica Facoetti 2 , Arnold Pompos 1，Mario Ciocca 2，Todd A. Aguilera 1，Michael D.故事1，＃，$和Anthony J. Davis 1，＃
Radboud University的生物正交化学
抽象的重建外科医生在考虑治疗糖尿病足溃疡（DFUS）的肢体打捞方法时面临挑战。在本文中，我们介绍了自体脂肪嫁接作为可行的替代方案的经验。我们遇到了一名78岁的女性患者，患有多种合并症，包括肾衰竭和严重的外围动脉疾病。在最初的多学科会议上，由于广泛的坏死和骨髓炎，建议进行截肢。然而，患者对挽救程序表示强烈的偏爱并拒绝截肢。仔细考虑后，我们选择使用三维生物涂层自体微压操纵同源脂肪组织来重建患者的脚。Amhatwas植入了很好的植入，没有并发症，例如自溶，移植失败或感染。手术后，具有部分骨骼暴露的大缺陷被健康的肉芽组织覆盖。伤口的大小减少到其原始手术后6周的一半，并在手术12周后降至不到25％。AMHAT可能是糖尿病足患者的一种吸引人的治疗选择，这些患者因合并症而不适合经过AP重建。
利用基于 CRISPR/Cas9 的基因编辑技术同时突变玉米花粉发育和雄性育性所需的多个同源基因
1 北京科技大学顺德研究生院中植国际农业生物科学研究院，北京 100024，中国；b20180388@xs.ustb.edu.cn (XL)；b20200413@xs.ustb.edu.cn (SZ)；b20190393@xs.ustb.edu.cn (YJ)；b20190395@xs.ustb.edu.cn (TY)；b20190392@xs.ustb.edu.cn (CF)；houquancan@ustb.edu.cn (QH)；suoweiwu@ustb.edu.cn (SW)； xieke@ustb.edu.cn (KX) 2 北京主要作物生物技术育种工程实验室，北京国际生物技术育种科技合作基地，北京固得威科技有限公司，北京 100192，中国 * 通讯地址：xuelian@ustb.edu.cn (XA); wanxiangyuan@ustb.edu.cn (XW); 电话：+86-137-1768-5330 (XA); +86-186-0056-1850 (XW) † 这些作者对本文贡献相同。
通过1 NHEJ缺乏而不是Populus中的HDR因子过表达高效的CRIS介导的同源重组2 3 Ali Movahedi1§
Highly efficient CRISPR-mediated homologous recombination via 1 NHEJ deficiency rather than HDR factors overexpression in Populus 2 3 Ali Movahedi 1§* , Hui Wei 1§ , Zhong-Hua Chen 2 , Weibo Sun 1 , Jiaxin Zhang 3 , Dawei Li 1 , Liming 4 Yang 1* , and Qiang Zhuge 1* 5 6 1 College of Biology and the Environment,中国南部7号的可持续林业共同创新中心，森林遗传学与生物技术主要实验室，教育部，南京林业大学8号，南京210037，210037，9 2霍克斯伯里环境学院，霍克斯伯里环境学院，西悉尼悉尼大学，10佩里斯大学，新南威尔士州佩里斯2751，新南威尔士州2751，澳大利亚11 3 n and NANJ and nanj andial andical Instriciting andical Sciention and nan Junan Junlan andical Instriciting Synormitics Squartring Synormitics Squarnion，NAN NAN NAN NAN NAN SACEITIC 210046，中国13 14 15 *应将信件发送给Qiang Zhuge，Ali Movahedi和Liming Yang：生物学与环境学院16，南部17中国可持续林业中心共同创新中心，中国森林遗传学与生物技术的主要实验室，教育部，Nanjing 18 Forestry University，Nanjing 18 Forestry University，Nanjing University，Nanjing University，Nanjing 210037。电子邮件：qzhuge@njfu.edu.cn; 19 ali_movahedi@njfu.edu.cn; yangliming@njfu.edu.cn;传真：+86 25 85428701 20 21§这些作者同样作为第一作者22 23 22 23 24跑步标题：高效通过XRCC4 Poplar中的XRCC4缺乏效率25 26 26 27 27 27 27 28 29 28 29 30 31 32 33 33 34 35 33 35 36 37 37 38 39 39 38 39 38 39 39 38 39 38 39 38 39 38 39电子邮件：qzhuge@njfu.edu.cn; 19 ali_movahedi@njfu.edu.cn; yangliming@njfu.edu.cn;传真：+86 25 85428701 20 21§这些作者同样作为第一作者22 23 22 23 24跑步标题：高效通过XRCC4 Poplar中的XRCC4缺乏效率25 26 26 27 27 27 27 28 29 28 29 30 31 32 33 33 34 35 33 35 36 37 37 38 39 39 38 39 38 39 39 38 39 38 39 38 39 38 39
同源 Ad26.COV2.S 疫苗接种会导致混合免疫中体液反应增强减弱，但无论之前是否感染，都会引发类似强度的抗体
1 南非约翰内斯堡威特沃特斯兰德大学病理学院 SA MRC 抗体免疫研究组，2 南非约翰内斯堡国家卫生实验室服务国家传染病研究所 HIV 和 STI 中心，3 开普敦大学传染病和分子医学研究所，南非天文台，4 开普敦大学病理学系医学病毒学分部，南非天文台，5 开普敦大学医学系及 Groote Schuur 医院，南非天文台，6 开普敦大学健康科学学院开普心脏研究所；南非天文台，7 南非医学研究委员会非传染性疾病与传染病交叉研究外部单位，开普敦大学，开普敦，南非，8 南非医学研究委员会，开普敦，南非，9 南非艾滋病研究中心，德班，南非，10 夸祖鲁纳塔尔大学公共卫生医学学科，德班，南非，11 德斯蒙德图图艾滋病毒中心，开普敦，南非，12 开普敦大学惠康非洲传染病研究中心，天文台，南非
异源载体 - 基于MRNA的SARS-COV-2疫苗接种策略似乎优于同源载体 - 在德国医疗保健工人中基于疫苗的疫苗接种方案，涉及体液SARS-COV-2反应，这表明mRNA疫苗
摘要：背景：纵向体液SARS-COV-2（严重的急性呼吸综合征 - 炎症2型）免疫，由于疫苗接种，疫苗接种策略的效率，最高15个月调查。方法：在这项研究中，招募了103个针对SARS-COV-2接种疫苗的个体，以检查其抗SARS-COV-COV-2抗N-和抗RBD/S1-Ig水平。前瞻性地获得了肝素管中的415个血液样本，并进行了有关病史，疫苗类型和疫苗接种反应的结构化调查。结果：所有参与者均表现出体液免疫反应，其中没有值降低了阳性截止。第三次疫苗接种后五到六个月，三名参与者显示抗RBD/S1抗体小于1000 U/ml。与第二次疫苗接种后，基于纯载体的疫苗接种相比，我们观察到异源mRNA/载体组合的水平更高，这是在两个同类中与mRNA-vaccine进行第三次疫苗接种后的谐波。高度暴露的队列中疫苗突破的发生率为60.3％。结论：观察到持续的长期体液免疫力，表明与基于纯载体的疫苗接种相比，基于异源mRNA/载体的组合具有优势。抗RBD/S1抗体的寿命至少为4个，最多7个月，而没有外部刺激。总体而言，没有观察到体液疫苗接种反应与疫苗接种副作用之间的相关性。关于疫苗接种反应，与载体 - 矢量队列相比，在注射部位疼痛时，局部症状随着注射部位的疼痛增加而增加，随后的疫苗接种时间点不良事件的总体下降。尽管疫苗突破的流行率很高，但这些疫苗的突破率很高，仅在研究的后期过程中发生，而当存在更多与温和疗程相关的传染性变体。这些结果提供了对疫苗相关血清学反应的见解，并且应将研究在未来使用其他疫苗剂量和新型变体扩展。