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哺乳动物精子的MTT减少模式
mtt在生物学中被广泛用作细胞活力的探针，因为它能够在强烈的氧化还原酶活性部位产生不溶性甲贡祖的沉积物。这种反应通常以反映线粒体氧化还原活性；但是，在某些细胞类型中也记录了线粒体MTT减少。鉴于这种背景，我们着手确定哺乳动物精子中甲唑沉积的主要地点。在小鼠中，大多数MTT还原发生在广泛的线粒体回旋中，精子头上有一个次要的formazan沉积部位。相比之下，人类精子通常显示出小小的混乱的中件，表现出适度的MTT减少活动，并在精子头的各个位置从脖子到前杂质体的精子头部的各个位置伴随着主要的金属软骨外甲氮杂沉积物。马精子呈现了这两种模式的组合，在线粒体中的主要formazan沉积伴随着大约20％的细胞中的线粒体外甲米唑沉积物。人类精子的功能与一种甲米甲酸甲珠外颗粒的存在正相关。随后的研究表明，存在二苯基碘，锌，2-脱氧葡萄糖，共酶Q，一种模拟和NADPH氧化酶抑制剂的二苯基碘，锌，2-脱氧葡萄糖，锌，锌，2-脱氧葡萄糖，抑制这种线粒体的活性。我们得出的结论是，精子的MTT将MTT降低为特定于物种，并传达了有关线粒体与线粒体外氧化还原活性的相对重要性的重要信息，从而定义了这些细胞的功能质量。繁殖（2020）160 431–443
刺激哺乳动物胚胎发育的信号
胚胎发育受到钙（Ca 2+）信号的刺激，这些信号是通过受精的精子在卵细胞质中产生的。通过卵子形成卵。他们经过一个称为减数分裂的细胞分裂，在此过程中，它们的二倍体染色体数量减半，并通过越过新的遗传组合创建新的遗传组合。在形成过程中，卵还获得了产生Ca 2+信号所必需的细胞成分，并支持新形成的胚胎的发展。离子化钙是细胞在许多生物过程中使用的通用二信使，卵会形成“工具包”，这是信号传导所需的一组分子。 减数分裂停止了两次，这些逮捕由调节蛋白的复杂相互作用控制。 第一次减数分裂持续时间持续到青春期后，当时黄体激素激素刺激了减数分裂的恢复。 细胞周期在排卵前的第二个减数分裂分裂的中间再次停止。 男配子的结合发生在输卵管中。 配子融合后，精子从卵子的细胞内存储中释放了Ca 2+，在哺乳动物中，在哺乳动物的细胞内释放，然后是重复的Ca 2+尖峰，称为Ca 2+的振荡，在持续使用几个小时的细胞质中。 下游传感器蛋白有助于解码信号并刺激其他分子，这些分子的作用是正确发育所必需的，包括那些有助于防止其他精子细胞融合到卵中的分子，以及那些有助于从第二次减数分裂骤停，结束减数分裂并进入第一个有丝分裂细胞分裂的卵子的分子。离子化钙是细胞在许多生物过程中使用的通用二信使，卵会形成“工具包”，这是信号传导所需的一组分子。减数分裂停止了两次，这些逮捕由调节蛋白的复杂相互作用控制。第一次减数分裂持续时间持续到青春期后，当时黄体激素激素刺激了减数分裂的恢复。细胞周期在排卵前的第二个减数分裂分裂的中间再次停止。男配子的结合发生在输卵管中。配子融合后，精子从卵子的细胞内存储中释放了Ca 2+，在哺乳动物中，在哺乳动物的细胞内释放，然后是重复的Ca 2+尖峰，称为Ca 2+的振荡，在持续使用几个小时的细胞质中。下游传感器蛋白有助于解码信号并刺激其他分子，这些分子的作用是正确发育所必需的，包括那些有助于防止其他精子细胞融合到卵中的分子，以及那些有助于从第二次减数分裂骤停，结束减数分裂并进入第一个有丝分裂细胞分裂的卵子的分子。在这里我回顾了鸡蛋形成的主要步骤，讨论生成Ca 2+
哺乳动物心脏再生中的心肌细胞迁移
Abstract .................................................................................................................................................................. 1
寻找并切割转移 (FiCAT) 哺乳动物基因组工程
虽然存在多种用于小等位基因基因组编辑的技术，但仍然缺乏用于在哺乳动物基因组中靶向整合大 DNA 片段的强大技术。在这里，我们开发了一种基因传递工具 (FiCAT)，它结合了 CRISPR-Cas9（发现模块）的精确度和工程化 piggyBac 转座酶（切割和转移模块）的有效载荷转移效率。FiCAT 结合了 Cas9 DNA 扫描和靶向 DNA 的功能以及 piggyBac 供体 DNA 处理和转移能力。PiggyBac 功能域经过工程设计，可提高靶向整合率，同时减少脱靶事件。我们展示了在细胞（人类（Hek293T、K-562）和小鼠（C2C12））和小鼠肝脏体内有效传递和可编程插入小型和大型有效载荷。最后，我们通过生成 394,000 个变体的靶向多样性并进行 4 轮进化，开发出更高效的 FiCAT 版本。在这项工作中，我们开发了一种在哺乳动物基因组中精确、有效地靶向插入多千碱基 DNA 片段的方法。
哺乳动物前脑中多个时间尺度的层次梯度
皮质回路的许多解剖和生理特征，从突触的生物物理特性到不同神经元类型之间的连接模式，都表现出从感觉区域到联想区域的层级轴的一致变化。值得注意的是，静息状态下神经活动的时间相关性尺度（称为内在时间尺度）在灵长类动物和啮齿动物中都沿着这一层级系统地增加，类似于空间受体场的规模和复杂性不断增加。然而，任务相关活动的时间尺度如何在大脑区域间变化，以及它们的层级组织是否在不同哺乳动物物种中一致出现仍未得到探索。在这里，我们表明，内在时间尺度和任务相关活动的时间尺度在猴子、大鼠和小鼠的皮质中都遵循类似的层级梯度。我们还发现，这些时间尺度在皮层和基底神经节中以类似的方式共同变化，而丘脑活动的时间尺度比皮层时间尺度短，并且不符合其皮层投影预测的层次顺序。这些结果表明，皮层时间尺度的层次梯度可能是哺乳动物大脑皮层内回路的普遍特征。
DNA指导的哺乳动物RNA聚合酶II
。cc-by 4.0未经同行评审获得的未获得的国际许可证是作者/筹款人，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（该版本发布于2024年6月1日。; https：//doi.org/10.1101/2024.06.01.596947 doi：biorxiv Preprint
重新利用哺乳动物的RNA结合蛋白musashi
摘要RNA识别基序（RRM）是自然界中最常见的RNA结合蛋白结构域。然而，含RRM的蛋白质仅在真核门中普遍存在，它们在其中扮演中心的调节作用。在这里，我们设计了一种与哺乳动物RNA结合蛋白Musashi-1的大肠菌中基因表达的正交后转录控制系统，该系统是具有神经发育作用的干细胞标记物，其中包含两个规范的RRM。在电路中，由于与Messenger RNA的N末端编码区域的特定相互作用及其对脂肪酸的反应，因此在转录中受到转录调节，并作为变构翻译阻遏物。我们通过评估一系列RNA突变体的体外结合动力学和体内功能，完全表征了种群和单细胞水平的遗传系统和单细胞水平，显示了报告基因表达的显着折叠变化以及潜在的分子机制。通过自下而上的数学模型很好地概括了系统的动态响应。此外，我们应用了用Musashi-1设计的转录后机制来特异性调节操纵子内的基因，实施组合调节并减少蛋白质表达噪声。这项工作说明了如何将基于RRM的调节适应简单的生物，从而在原核生物中添加了用于翻译控制的新调节层。
气候变化和美国ESG的政治化
尽管进行了数十年的比较研究，但哺乳动物大脑和体重之间关系的令人困惑的方面仍在不断地令人满意的解释。在这里，我们表明，通常将对数的线性模型拟合到数据：大脑和体重的相关演变实际上是对数 - 外呈围栏形成的。同时提出了多种生物学解释的几种现象，在整个进化枝的缩放系数方面尤其是可变性，较大物种中的脑脑较低以及所谓的分类单元级问题。我们的模型意味着需要重新审视有关相对脑质量的先前发现。考虑到真正的缩放关系，我们记录了整个哺乳动物系统发育的相对脑质量进化速率的巨大变化，我们解决了一个问题，即脑质量是否有整体趋势随着时间的推移增加。我们发现只有三个哺乳动物秩序的趋势，这是迄今为止灵长类动物中最强的趋势，为独特的快速定向增长奠定了基础，最终会产生人脑的计算能力。
可编程的哺乳动物翻译调节剂通过CRISPR相关蛋白
摘要合成遗传回路的复杂性依赖于具有高正交性的生物电路的曲目。尽管依赖RNA结合蛋白（RBP）的转录后电路符合曲目的资格，但监管设备的有限库阻碍了网络网络模块化和可扩展性。在这里，我们建议将墨盒（CAS响应转化调节可集成到多样化的基因组工程中）以将CRISPR相关（CAS）蛋白作为转化调节剂重新利用。我们证明了一组CAS蛋白能够抑制（OFF）或激活（ON）5'-UTR中包含CAS结合RNA基序的mRNA翻译。我们设计了81种不同类型的翻译，并在开关上验证了它们的功能特征。其中许多功能充当有效的翻译调节剂，并在哺乳动物细胞中显示正交性。通过互连这些开关，我们设计和构建了人工电路，包括60个翻译和大门。此外，我们表明，可以重新使用各种与CRISPR相关的技术，包括抗Crispr和Split-Cas9平台，以控制翻译。我们的CAS介导的翻译调节与CAS蛋白的转录调节兼容，并增加了元素较少的合成回路的复杂性。弹药筒比以往任何时候都更加构建蛋白质响应的mRNA开关，并导致CAS介导的基因组编辑和翻译调节技术的发展。