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健康筛查结肠镜检查后的自由生活食物摄入量和肠道菌群的再现
1目标：微生物组的作用已与各种医学2条件有关。结肠镜检查后，已知发生结肠微生物负荷的重生，3然而，肠4制剂后尚未研究自然重生的质量和时机。此外，尚无研究记录详细的自由生活饮食摄入量，并在骨镜后同时使用肠道微生物组重生。在这里，我们试图确定相对于饮食摄入的6个早期重生模式。方法：健康的成年人（n = 15 [4雌性/11雄性]，BMI = 27.2±3.9 kg/m 2，年龄51.4±7.2 y）计划在密苏里州大学的胃肠病学诊所招募筛查8结肠镜检查。9在结肠镜检查（基线）的两周内，受试者完成了3天的详细食物记录10。后骨镜检查，受试者吃的自由饮食和详细的食物记录在第0、1、2、4、7、10和13天收集了11个。粪便样品是在骨内镜检查前的，并在第12天的第3、5、8、11和14天获得。肠道微生物组组成。结果：在手术后的5天内，受试者报告了14个相对于基线消耗的总能量更多的总能量，大概是为了弥补肠prep期间发生的低15能量摄入量。在基线时，纤维摄入量（21.0±9.1 g/d）比结肠镜检查当天高16，第0天（16.1±11.2，p = 0.0159）。此后，每日纤维17摄入量与基线相同。使用加权和未加权差异的主坐标分析观察到了18个标志性的微生物组β多样性（p = 0.0001，19 f = 15.23，单向Permanova）。精选的分类单群被枯竭后骨内镜检查（例如，杆菌中的20个）。具体而言，在21天和第3天的粪便样品之间观察到时间的显着影响（成对P = 0.0013，F = 2.9）。这些变化趋向于第5天返回22返回基线，随后的样本，使用加权差异分析（Bray-Curtis）测试23时，分类单元与基线相似。结论：这些结果定量24证明了微生物相对丰度和25种多样性的显着变化的幅度。手术后的26纤维摄入量的变化对齐的时间安排。这些数据突出了27次筛查结肠镜检查后在重建健康微生物组后的营养重要性。28 29关键字：结肠镜检查；结肠准备；微生物变异性；食物摄入；微生物30组成；微生物重生。
微生物群会影响Hydra中的干细胞决策
Hydra三个干细胞谱系的分子特征，每个谱系都有轨迹，并反映了从干细胞到末端分化的细胞类型的分化路径（图2a）。由于上皮细胞，而不是间质细胞或神经细胞，是Hydra的发育特征的大多数（如果不是全部）的主要决定因素（Sugiyama and Fujisawa 1978），我们专注于皮肤皮肤和内胚层上皮细胞的特征。比较单元205
将网络药理学，代谢组学和肠道菌群分析整合到
Lihao Xiao b,c,# , Tingyu Zhang a,# , Yun Liu a , Chayanis Sutcharitchan a , Qingyuan Liu a ,
依赖饮食的宿主代谢产物形成肠道菌群以防止自身免疫性
此预印本的版权持有人（该版本发布于2024年5月13日。; https：//doi.org/10.1101/2023.11.02.565382 doi：biorxiv Preprint
口腔微生物群和阿尔茨海默氏病 tiago高度冗余机器人用于抓握操作的姿势优化 克罗地亚白葡萄品种Maraština dynare复制“世俗停滞模型 通过传统和生物技术方法提高了果树种类的营养质量 治疗brafv600e杂交转移性结直肠癌的患者进展为encorafenib和cetuximab：来自现实世界中的全国数据集的数据 神经炎症：正常衰老和与年龄相关的神经退行性疾病之间的紧密线 恐怖行为和行人行为
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医学中的人工智能
摘要在本研究中，细菌和真菌多样性以及挥发性概况，即即食葡萄牙止痛药，ibérico发酵香肠，由Beja（生产商A）和Evora（生产者B）的两个手工生产商制造。为此，将不同的选择性生长培养基和元时间分析与顶空相固相微型提取气相色谱/质谱法（HS-SPME-GC/MS）相结合。微生物可行计数的结果表明，乳酸细菌的活性微生物种群（最多8 log cfu g -1），凝结酶阴性球菌（最多6 log cfu g -1）和Eumyycetes（最多6 log cfu g -1）。细菌种群的特征是Latilactobacillus Sakei（高达72％）与Weissella和weissella和葡萄球菌相对相对频率。Mycobiota主要由Hansenii Debaryomyces（高达相对频率的55％）和kurtzmaniella Zeylanoides（高达相对频率的24％）主导。也检测到了wickerhamomyces子细胞和Zygosacchomyces rouxii的意外物种。HS-SPME-GC/MS分析允许识别复杂的挥发性曲线，显示超过160个挥发性有机化合物（VOC）。VOC属于十二类，例如醛，酮和内酯，酯和醋酸酯，醇，萜类化合物，硫酸化合物，硫酸化合物，脂肪族烃，芳香族烃，氮，氮化合物，酸，酸味，富氏和pyrans和pyrans和Partyls和Partyls和Plactors。对VOC组成的分析提供了证据，表明两个生产者（A和B）的样本不同，如主要成分分析所证实。因此，尽管两个生产商的生产过程可能是用于制造Painho型香肠的生产商，但环境条件，所使用的原材料以及与屠夫的经验实践相关的变化，对最终产品产生了强烈影响。本研究中获得的结果代表了关于葡萄牙发酵香肠的生物多样性和VOC组成的知识的进一步发展。为了更好地了解自动微生物与painho de porcoibérico发酵香肠中的肉糊之间发生的相互作用，必须在整个生产过程中进一步加深微生物和VOC动态。关键字：latilactobacillus sakei，hansenii，metataxonomic Analysis，生物多样性，Mycobiota，VolatiLome
一种新型的逐步整合分析管道揭示了不同的微生物群相互作用，并与肠易激综合征的症状联系起来
尽管未完全理解，但假定肠易激综合征（IBS）的微生物群 - 宿主相互作用改变了。因此，我们旨在开发针对微生物群 - 宿主相互作用和症状关联的整合分析而定制的新分析管道，并证明其在飞行员队列中的效用。开发了多层逐步整合分析管道，以可视化复杂的变量关联。在IBS患者和健康对照组的数据集（HC）的数据集中，使用R软件包来分析结肠宿主mRNA和粘膜菌群（16S rRNA基因测序）以及胃肠道（GI）和心理症状。总共包括42名IBS患者（57％女性，平均年龄33.6（范围18-58））和20 HC（女性60％，平均年龄26.8（范围23-41））。仅在IBS患者中，Toll样受体4的mRNA表达以及与屏障功能（PAR2，OCLN，TJP1）相关的基因紧密相关，表明潜在的功能关系。这个基于宿主基因的“渗透性簇”与粘膜粘膜和宽叶氏菌有关，此外，与饱腹感以及焦虑，抑郁和疲劳有关。在IBS患者和HC中，铬烷蛋白，泌尿素蛋白和TLR聚集在一起。 在IBS患者中，该基于宿主基因的“免疫 - 肠内分泌簇”与Firmicutes的特定成员有关，并且与抑郁症和疲劳有关，而在HC中，与微生物群没有明显的关联。 该分析管道可能有助于促进对健康和疾病中复杂可变关联的理解。在IBS患者和HC中，铬烷蛋白，泌尿素蛋白和TLR聚集在一起。在IBS患者中，该基于宿主基因的“免疫 - 肠内分泌簇”与Firmicutes的特定成员有关，并且与抑郁症和疲劳有关，而在HC中，与微生物群没有明显的关联。 该分析管道可能有助于促进对健康和疾病中复杂可变关联的理解。在IBS患者中，该基于宿主基因的“免疫 - 肠内分泌簇”与Firmicutes的特定成员有关，并且与抑郁症和疲劳有关，而在HC中，与微生物群没有明显的关联。该分析管道可能有助于促进对健康和疾病中复杂可变关联的理解。我们已经开发了逐步的整合分析管道，该管道允许鉴定独特的宿主 - 微生物互相关模式以及与IBS患者症状的关联。
犬肠道微生物群的宏基因组解剖
作者的完整列表：Alessandri，Giulia；帕尔马大学，兽医医学系米兰，莱昂纳多克里斯蒂安·曼卡贝利；帕尔马大学，生命科学Mangifesta，Marta；帕尔马大学，生命科学Lugli，Gabriele Andrea；帕尔马大学，化学，生命科学与环境可持续性系Alice，Alice；帕尔马大学，Genprobio Srl Duranti，Sabrina Turroni，Francesca Ossiprandi，Maria；帕尔马大学，医学兽医科学系，杜威（Douwe）；爱尔兰国立大学，Marco微生物学系；帕尔马大学生命科学
剖析菌群和宿主遗传学在Card9 - / - 小鼠对结肠炎的敏感性中的作用
抽象背景炎症性肠病（IBD）的病因尚不清楚，但涉及遗传学和环境因素，包括肠道菌群。的确，胃肠道免疫系统向肠道微生物群的加剧激活发生在遗传易感的宿主中，并在环境的影响下发生。例如，大多数IBD易感性基因座都位于与免疫反应有关的基因中，例如caspase招募域成员9（Card9）。然而，在Card9缺乏症的背景下，基因型与微生物群对结肠炎的相对影响仍然未知。结果Card9基因直接有助于从硫酸葡萄糖钠（DSS）诱导的结肠炎中恢复，通过诱导细胞因子IL-22的结肠表达和抗菌肽REG3β和REG3γ和Reg3γ，独立于微生物群。另一方面，调节生产AHR配体的微生物群的能力是必需的，这导致结肠中产生IL-22，从而促进结肠炎后的恢复。此外，交叉促进实验表明，断奶后5周，断奶前从护理母亲传播的微生物群对幼犬的色氨酸代谢具有比幼犬自己的基因型更强烈的影响。结论这些结果表明，Card9及其效应IL-22在介导微生物群依赖性和微生物群依赖性的指导中介导DSS诱导的结肠炎的恢复中的作用。card9基因型可调节产生AHR配体的微生物群代谢能力，但是在断奶前植入WT或“健康”微生物群可以覆盖这种作用。它突出了免疫系统和微生物群之间发生断奶反应的重要性，对宿主代谢和免疫功能一生。更好地理解遗传学对微生物群代谢的影响是为患有复杂炎症性疾病的患者发展有效的治疗策略的关键。关键词肠道菌群，遗传学，代谢，card9，IL-22，TRP代谢，AHR配体，乳酸杆菌
Rickettsia物种与tick菌群的差异相互作用。 Sanguineus和Rh。 turanicus 更改白虾对谷物vannamei的肠道细菌群体喂了绿色海藻 地球生命的天体生物学
tick传播的立克斯曲霉是由立克属的革兰氏阴性细菌引起的，构成了日益增长的全球威胁，各种节肢动物载体为它们的传播做出了贡献。了解壁虱微生物群中的复杂相互作用，包括立克氏症的作用，对于阐明立克疾病的动力学至关重要。在这里，我们研究了RH的Rickettsia的分类学概况和共发生网络。sanguineus sensus lato（s.l.）和RH。turanicus tick虫，揭示了立克群体的社区组成和局部连通性的显着差异。虽然这两个壁虱物种的微生物群都有共同的分类单元，但相对丰度和网络拓扑的明显差异表明了独特的生态壁ches。此外，鲁棒性分析表明对扰动的韧性有所不同，这表明网络组织的策略不同。我们的发现还强调了tick物种之间的代谢差异，这表明对立克相互作用的潜在影响。总体而言，这项研究提供了有关壁虱中复杂的微生物景观的见解，从而阐明了与立克相关的功能冗余和代谢途径，从而促进了我们对tick传播疾病的理解。