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伊朗流通的RVA VP7和VP4抗原表位与Rotarix和RotaTeq疫苗的比较分析
326 个氨基酸，含有 9 个可变区，其中 4 个作为抗原表位，具体标识为 7-1a、7-1b 和 7-2。VP4 蛋白跨越 776 个氨基酸，激活需要将其水解成两个不同的片段：VP8 和 VP5，每个片段分别含有 4 个（8-1-8-4）和 5 个（5-1-5-5）抗原表位 [4]。由于这些蛋白质内免疫原性基序的多样性，已定义多个谱系和亚谱系。根据 Motamedi-Rad 等人的研究，在主要的 G 型中，
天然古细菌伴侣中细胞内和细胞内DNA甲基化的相互作用
抽象的DNA甲基化在所有生命领域都具有多种功能。在这项研究中，我们研究了三方二烷基卤代联盟中的古细菌甲基团。该联盟包括Haloferax Lucertense SVX82，Halorhabdus sp。svx81，以及一个来自dpann superphylum的纳米尺寸的纳米大小的古scultus svxnc。我们利用PACBIO SMRT和Illumina cDNA测序来分析来自不同组成的甲基甲基组学和转录组学的样品。内源性C TAG甲基化（典型的Haloferax）伴随着甲基化在其他四个基序中，包括GDG C HC甲基化，这是外尾疗特定的。我们对甲基化和未甲基化基序的分布的分析表明，自phat甲基化可能会影响基因调节。Graga A G甲基化的频率在高度表达的基因中增加，而C C TTG和GTCG A GG甲基化可以与限制性修饰（RM）活性有关。一般而言，在该古代的演变过程中，RM活性可能已经降低，以平衡细胞免受入侵者的保护，在压力环境中自限制引起的DNA损伤的减少以及在极端条件下DNA交换的益处。我们的甲基甲基菌群（Cryo-ET）数据表明，我们的甲基甲基分析酶导出了其甲基转移酶，以甲基化Haloferax基因组，揭示了共生体与宿主之间的相互作用的新方面。
立方卤化物钙钛矿的多晶性质
许多常见的晶体结构可以用单个（或极少数）重复的结构模式（“单态结构”）来描述，例如立方卤化物钙钛矿中的八面体。有趣的是，最近积累的证据表明，基于这种从 X 射线衍射获得的宏观平均单态立方（Pm-3m）卤化物钙钛矿的电子结构计算与实验结果存在有趣的偏差。这些偏差包括系统性地太小的带隙、由电子主导的介电常数、合金的负混合焓以及与测量的对分布函数的显著偏差。我们在此表明，通过密度泛函理论最小化系统 T = 0 内部能量会揭示不同低对称局部模式的分布，包括倾斜、旋转和 B 原子位移（“多态网络”）。只有当允许大于最小晶胞尺寸且不几何排除低对称模式时，才会发现这种情况。随着（超）晶胞尺寸的增加，能量相对于单晶胞会降低，在包含约 32 个公式单位（⩾ 160 个原子）后稳定下来。作为无熵内部能量的非热能最小化的结果，这组相关的位移必须代表底层化学键合（孤对键合）所偏好的固有几何形状，因此其起源与分子动力学建模的正常动态热无序不同。事实上，多晶网络，而不是单晶拟设，是高温热扰动发展的核心结构。新出现的物理图像是多晶网络具有高对称性的平均结构，但局部结构基序具有低对称性。我们发现，与单晶网络相比，多晶网络的预测总能量明显较低、带隙较大、介电常数以离子为主，并且与观察到的对分布函数更为吻合。类似的多态情况见于一些立方氧化物钙钛矿的顺电相中，其中局部极化在卤化物钙钛矿中起局部位移的作用；也见于一些 3 d 氧化物的顺磁相中，其中局部自旋配置起着作用。
中期CME 2024 NE003.CDR
Mangalagiri从印度安得拉邦编织，以其高质量，耐用的棉质面料而闻名，具有简单而优雅的设计。这些手织机纺织品在边界上具有未修饰的身体和部落图案，扎里在苍白球上工作。通过染色，翘曲和编织的过程制作的传统坑笼罩着，这种数百年历史的传统代表了安得拉邦丰富的文化遗产，并且是印度手织机行业的重要贡献者，提供了永恒和多才多艺的服装。
人类序列特异性转录因子的位置依赖性功能
转录活性模式通过调节元素（例如启动子或增强子）在我们的基因组中编码，这些元素矛盾地含有相似的序列特异性转录因子（TF）结合位点1-3的类似分类。了解这些序列基序如何编码多个，通常重叠的基因表达程序对于理解基因调节以及非编码DNA中的突变如何在疾病4,5中表现出来至关重要。在这里，通过使用自然遗传变异，内源性TF蛋白水平的扰动以及对自然和合成调节元件的大量平行分析，从单个转录起始位点（TSS）的角度研究基因调节，我们显示TF结合对转录起始的影响取决于位置。分析与TSS相对于TSS的TF结合位点的发生，我们确定了具有高度优先定位的几个基序。我们表明，这些模式是TF独特的功能曲线的组合 - 许多TF，包括诸如NRF1，NFY和SP1之类的规范激活剂，激活或抑制转录启动，这取决于其相对于TSS的精确位置。因此，TFS及其间距共同指导转录启动的位点和频率。更广泛地，这些发现揭示了TF结合位点的类似分类如何根据其空间构型产生不同的基因调节结果，以及DNA序列多态性如何促进转录变异和疾病，并强调TSS在解码我们基因组的调节性信息中的关键作用。
CTCF-DNA复合物的结构，包括所有11个锌指
CCCTC结合因子（CTCF）结合了其11个串联锌（ZF）DNA结合域的哺乳动物ChR量型的增强子和启动子的数十含量。除了12-15 bp的核序列外，某些CTCF结合位点还包含上游和 /或3'下游motifs。在这里，我们分别描述了人类CTCF重叠部分的两个结构，包括ZF1 – ZF7和ZF3 – ZF11与DNA的复合体中的ZF1-ZF7和ZF3 – ZF11，它们将核心序列与3'下游或5'上游基序一起结合在一起。像常规的串联ZF阵列蛋白一样，ZF1 – ZF7 fol-DNA的右手扭曲，每个填充物均占据并识别一个在DNA Major Grove中的三个碱基对的三重态。Zf8 pla ys独特的作用，充当跨DNA或gro的间隔物，并定位ZF9 – ZF11，使其与DNA进行交叉接触。我们将ZF1 – ZF7和ZF8 – ZF11的TW O子分组之间的差异归因于每个纤维内两个位置-6和-5处的残基，而ZF1-ZF7的残基和ZF8 – ZF8 – ZF8 – ZF8-ZF8 – ZF8 – ZF8的ZF1 – ZF7的残基和较小的残基。ZF8也富含碱性氨基酸，该氨基酸使盐桥允许在较小的含量中添加到DNA磷酸盐。较高的特异性Ar ginine-鸟氨酸和谷氨酰胺 - 腺嘌呤相互作用，用于ZFS的常规碱基相互作用位置在常规的碱基相互作用位置上进行补充，也适用于ZF9 – ZF11所采用的跨链相互作用。ZF1 – ZF7和ZF8-ZF11之间的差异可以比例化结构，并且可以促进高实用性CTCF结合位点的识别。
大型数据库的跨膜β桶的一般特征
大数据集为典范以前研究的主题提供了新的见解。我们使用共同进化数据创建了跨膜β桶（TMBB）的大型高质量数据库。通过在生成的进化接触图上应用简单的特征检测，我们的方法（Isitabarrel）在区分蛋白质类别时可以达到95.88％的平衡精度。此外，与Isitabarrel的比较表明，在先前的TMBB算法中，假阳性率很高。除了比以前的数据集更准确之外，我们的数据库（在线可用）还包含来自38个门的1,938,936个细菌TMBB蛋白，比以前的Sets TMBB-DB和OMPDB大17和2.2倍。我们预计，由于其质量和大小，该数据库将作为需要高质量TMBB序列数据的有用资源。我们发现TMBB可以分为11种类型，其中三种尚未报告。我们发现，含TMBB的生物的蛋白质组百分比的巨大差异，其中一些使用其蛋白质组的6.79％用于TMBB，而另一些则使用其蛋白质组的0.27％。TMBBS长度的分布暗示了先前假设的重复事件。此外，我们发现C末端β-信号在不同类别的细菌之间会有所不同，尽管最常见的是LGLGYRF。但是，该β-信号仅是原型TMBB的特征。九种非原型枪管类型具有其他C末端基序，并且这些替代基序是否有助于TMBB插入或执行任何其他信号传导函数，尚待确定。
人类卫星 3 DNA 编码兆碱基规模的转录因子结合平台
真核生物基因组中经常散布着大量串联重复序列，称为卫星 DNA，这些序列是组成性异染色质的基础，常位于着丝粒区域周围。虽然某些卫星 DNA 类型在着丝粒生物学中具有明确的作用，但其他丰富的卫星 DNA 的功能尚不明确。例如，人类卫星 3 (HSat3) 约占人类基因组的 2%，形成高达数十兆碱基的巨大阵列，但这些阵列在着丝粒功能中没有已知的作用，直到最近才几乎完全被排除在基因组组装之外。因此，这些巨大的基因组区域仍然相对研究不足，而 HSat3 的潜在功能作用在很大程度上仍然未知。为了解决这个问题，我们对新的 HSat3 结合因子进行了系统筛选。我们的工作表明，HSat3 阵列含有高密度的转录因子 (TF) 基序，这些基序与与多个高度保守的信号通路相关的因子结合。出乎意料的是，HSat3 中最富集的 TF 属于 Hippo 通路转录效应子家族 TEAD。我们发现 TEAD 以细胞状态特异性的方式将辅激活因子 YAP 募集到 HSat3 区域。利用 RNA 聚合酶-I 报告基因检测、HSat3 的靶向抑制、YAP 的诱导降解和超分辨率显微镜，我们表明 HSat3 阵列可以将 YAP/TEAD 定位在核仁内，YAP 在那里调节 RNA 聚合酶-I 活性。除了揭示 Hippo 通路与核糖体 DNA 调控之间的直接关系外，这项研究还表明卫星 DNA 可以编码多个转录因子结合基序，为这些巨大的基因组元素定义了新的作用。
WRKY66基因家族的进化及其由CRISPR/Cas9系统产生的突变增加了拟南芥对盐胁迫的敏感性
摘要：III类WRKY转录因子在植物应对多种非生物胁迫和次生代谢中起着至关重要的作用，但WRKY66的进化和功能尚不清楚。本研究对WRKY66同源物进行追溯，发现其经历了基序的获得与丢失以及纯化选择。系统发育分析表明145个WRKY66基因可分为三个主要进化枝（A~C进化枝）。替代率检验表明WRKY66谱系与其他谱系有显著差异。序列分析显示WRKY66同源物具有保守的WRKY和C2HC基序，且平均丰度中关键氨基酸残基的比例更高。AtWRKY66是一个核蛋白，可受盐和脱落酸诱导的转录激活因子。同时，在盐胁迫和脱落酸处理下，由成簇的、规律间隔的、短回文重复序列/CRISPR-相关9（CRISPR/Cas9）系统产生的Atwrky66敲低植物的超氧化物歧化酶（SOD）、过氧化物酶（POD）和过氧化氢酶（CAT）活性以及种子发芽率均低于野生型（WT）植物，但相对电解质渗漏（REL）较高，表明敲低植物对盐胁迫和脱落酸处理的敏感性增加。此外，RNA-seq和qRT-PCR分析表明，敲低植物中参与应激反应的脱落酸介导的信号通路中的几个调控基因受到显著调控，表现为基因表达更温和。因此，AtWRKY66可能在盐胁迫反应中起正调控作用，可能参与脱落酸介导的信号通路。
AR/VR 新兴技术，例如增强...
曼尼普尔邦在印度手工织布区中占有独特的地位。然而，手工织布产品并不为该邦以外的许多人所知。一些村庄，如旺克黑、巴蒙坎普、孔巴、孔曼、乌特鲁等，因其编织精美丝绸制品的技艺而闻名。该邦的其他村庄生产不同种类的织物。具有异国情调设计和图案的部落披肩是该邦山区的产品。AR/VR 技术可用于进一步提高产品的设计和质量。通过新兴技术，这些独特的产品可能会被推广到不同的成功水平。