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评估DNA修复缺陷的突变积累...
李斯特氏病是由细菌单核细胞增生菌引起的，是一种严重的食源性疾病，具有很大的公共卫生影响，尤其是由于其在高危人群中的严重结果。弱势群体 - 包括老年人，孕妇，新生儿和免疫功能低下的个体 - 特别容易受到这种疾病的侵入性形式，例如菌血症和脑膜炎。这些条件与高病态率率有关，强调了良好的食品安全和监视系统的重要性，即通过迅速识别受污染的食物来源来迅速检测和管理暴发。欧洲疾病预防与控制中心（ECDC）的最新数据表明，欧洲李斯特菌病病例的增加，强调了这种感染对公共卫生的持续挑战（欧洲预防疾病预防与控制中心，2023年）。在奥地利，自2014年以来，从人，食物和环境来源的单核细胞增生菌菌分离出来。自2016年以来，这些分离株已通过全基因组测序（WGS）和核心基因组多焦点序列（CGMLST）常规分析（Cabal等，2019; Pietzka等，2019）。NRL在中央数据库中管理WGS数据，应用CGMLST跟踪簇和跟踪潜在的污染源。这种系统的监测与欧盟范围内的计划保持一致，该计划授权了侵入性李斯特菌病病例的通知，并使用基于WGS的监视作为早期爆发检测和控制的基石。在李斯特菌爆发调查中，CGMLST是一种具有高歧视性的技术。在李斯特菌爆发调查中，CGMLST是一种具有高歧视性的技术。通过分析单核细胞增生乳杆菌基因组中的保守基因来鉴定遗传相关的克隆。Ruppitsch等人（欧洲疾病预防与控制中心，2020年），用于单核细胞增生李斯特菌的键入。 具有1,701个靶基因以及Moura等人的巴斯德方案的方案（Ruppitsch等，2015）。 具有1,748个目标基因是常用的CGMLST方案，在整个欧盟成员国的监视工作协调方面起着至关重要的作用（Ruppitsch等，2015; Moura等，2016; 2016; 2016;欧洲疾病预防与控制中心，2020年）。 CGMLST在李斯特菌爆发检测中的一个基本方面是应用簇阈值（通常为7-10个等位基因差异）将与爆发相关的病例与零星的病例分开。 该阈值基于研究表明，从同一暴发中分离出来的分离率通常差异少于7-10个等位基因（Ruppitsch等，2015；欧洲疾病预防与控制中心，2022年）。 通过应用此限制，调查人员可以有效地确定何时开始爆发调查并优化食物追溯工作。 将分子数据与流行病学证据的整合，包括患者的食物史，在几项爆发研究中证明至关重要，从而可以鉴定受污染的食物来源以及快速实施控制措施，例如食品产品召回。 例如，从2014年到2019年，涉及22例欧盟成员国的22例单核细胞增生疫苗爆发与使用CGMLST污染的鲑鱼产品有关（欧洲疾病中心用于单核细胞增生李斯特菌的键入。具有1,701个靶基因以及Moura等人的巴斯德方案的方案（Ruppitsch等，2015）。 具有1,748个目标基因是常用的CGMLST方案，在整个欧盟成员国的监视工作协调方面起着至关重要的作用（Ruppitsch等，2015; Moura等，2016; 2016; 2016;欧洲疾病预防与控制中心，2020年）。 CGMLST在李斯特菌爆发检测中的一个基本方面是应用簇阈值（通常为7-10个等位基因差异）将与爆发相关的病例与零星的病例分开。 该阈值基于研究表明，从同一暴发中分离出来的分离率通常差异少于7-10个等位基因（Ruppitsch等，2015；欧洲疾病预防与控制中心，2022年）。 通过应用此限制，调查人员可以有效地确定何时开始爆发调查并优化食物追溯工作。 将分子数据与流行病学证据的整合，包括患者的食物史，在几项爆发研究中证明至关重要，从而可以鉴定受污染的食物来源以及快速实施控制措施，例如食品产品召回。 例如，从2014年到2019年，涉及22例欧盟成员国的22例单核细胞增生疫苗爆发与使用CGMLST污染的鲑鱼产品有关（欧洲疾病中心具有1,701个靶基因以及Moura等人的巴斯德方案的方案（Ruppitsch等，2015）。具有1,748个目标基因是常用的CGMLST方案，在整个欧盟成员国的监视工作协调方面起着至关重要的作用（Ruppitsch等，2015; Moura等，2016; 2016; 2016;欧洲疾病预防与控制中心，2020年）。CGMLST在李斯特菌爆发检测中的一个基本方面是应用簇阈值（通常为7-10个等位基因差异）将与爆发相关的病例与零星的病例分开。该阈值基于研究表明，从同一暴发中分离出来的分离率通常差异少于7-10个等位基因（Ruppitsch等，2015；欧洲疾病预防与控制中心，2022年）。通过应用此限制，调查人员可以有效地确定何时开始爆发调查并优化食物追溯工作。将分子数据与流行病学证据的整合，包括患者的食物史，在几项爆发研究中证明至关重要，从而可以鉴定受污染的食物来源以及快速实施控制措施，例如食品产品召回。例如，从2014年到2019年，涉及22例欧盟成员国的22例单核细胞增生疫苗爆发与使用CGMLST污染的鲑鱼产品有关（欧洲疾病中心
通过增强基因组来强化突变育种...
传统上，电离辐射（例如X射线、伽马射线、β粒子以及快中子和热中子）被用于诱发这些作物的突变。然而，电子束、质子束和重离子束等新能源正日益为突变育种增添新的视角。虽然单独诱发突变或与常规育种相结合有可能产生变异，但基因组资源的可用性深刻影响着加速遗传作物改良的步伐。下一代测序 (NGS) 技术的出现导致了广泛分子资源的开发，包括转录组序列数据、遗传和物理图谱以及分子标记，使性状定位和标记辅助育种更快、更可靠。为了快速跟踪豆类作物改良，必须使用辐射来扩大变异并同时开发详尽的基因组资源。
诱变育种的最新进展和成果...
Tanmoy Sarkar 和 Tanmoy Mondal DOI：https://doi.org/10.33545/2664844X.2024.v6.i2c.220 摘要 遗传变异对于作物育种至关重要。在传统的植物育种计划中，这种变异是通过杂交产生的，并从由此产生的分离世代中进行选择。诱发诱变可以补充或取代杂交作为变异源。引入变异的突变是新形式、品种或物种进化的基础。诱发突变和自发突变都对各种果树作物改良品种的开发做出了重大贡献，补充了传统的育种方法。虽然诱发突变在果树育种应用中有明确的局限性，但可以通过使用体外突变技术来扩大其潜力。 关键词：遗传变异、突变育种、果树作物、杂交 介绍 突变育种已经成为现代农业中一种变革性和有效的工具，特别是在果树作物改良领域。通过诱发突变（改变植物的遗传物质），育种者可以产生新的遗传变异，从而培育出具有理想性状的果树品种，如提高产量、增强抗病性、提高果实品质和增强对环境压力的耐受性。传统上，植物育种依靠杂交和选择来改良果树。然而，这些方法往往有局限性，特别是在克服遗传瓶颈、自交不亲和或某些果树品种的幼年期较长等问题时。突变育种通过创造更广泛的遗传多样性库提供了一种解决方案，使其成为传统育种方法的宝贵补充。过去几十年来，突变育种在果树中的应用经历了长足的发展。技术进步，特别是体外培养系统的进步，提高了突变诱导的精确度和效率。现代分子工具和基因组技术的结合，如新一代测序、标记辅助选择和基于 CRISPR 的基因组编辑，进一步完善了突变育种，使水果基因组的改变更具针对性和可控性。因此，现在的水果作物育种比以往任何时候都更快速、更准确、更可持续。本文深入探讨了突变育种的历史、方法和最新进展，强调了其在水果作物改良中的作用、特定水果品种的主要成就以及该领域的光明未来（Ahloowalia 等人，2004 年）[1]。突变育种在水果作物改良中的作用任何育种计划的主要目的都是增加作物种群的遗传多样性，以选择对农民和消费者都有益的性状。在水果作物中，果实大小、颜色、风味、抗病虫害能力以及对干旱、盐度和极端温度等非生物胁迫的耐受性等理想特性对于提高生产力、适销性和可持续性至关重要。然而，通过传统育种方法实现这些特性通常速度慢、成本高且效率低，尤其是对于需要几年才能成熟的果树等多年生作物。这就是诱变育种发挥作用的地方。诱变育种涉及使用物理（例如辐射）或化学（例如 EMS、叠氮化钠）诱变剂在植物中诱发突变，从而诱导随机遗传
SF3B1突变介导的H3B-8800 ...
剪接因子3b亚基1（SF3B1）参与了MRNA分支部位识别，是抗肿瘤抑制剂的靶标。在15％的慢性淋巴细胞性白血病（CLL）患者中观察到SF3B1中的突变，并且与预后不良有关，但它们的致病机制仍然很少了解。使用来自298个CLL肿瘤样品的深度RNA序列数据，以及等源性SF3B1 WT和K700E突变的CLL细胞系，我们表征了与SF3B1突变的sf3b1突变相关的靶标和前MRNA序列特征，包括在Map3K7 Gene Gene Resignal Resciental nf-nf-bectional sf3b1突变中的剪接位点。Using the H3B-8800 splicing modulator, we show, for the fi rst time in CLL, cytotoxic effects in vitro in primary CLL samples and in SF3B1 -mutated isogenic CLL cell lines, accompanied by major splicing changes and delayed leukemic in fi ltration in a CLL xenotransplant mouse model.H3B -8800表现出对SF3B1突变细胞的优先致死性，并与Bcl2抑制剂venetoclax保持了协同作用，从而支持SF3B1抑制剂作为CLL中新型治疗策略的潜在使用。
MEFV 突变与 ANCA 之间的关联
家族性地中海热 (FMF) 传统上与 MEFV 基因的双等位基因突变有关；然而，杂合突变也可能导致疾病表型。我们报告了一名 42 岁女性的病例，该女性患有杂合 p.Met694Ile MEFV 突变，表现为抗中性粒细胞胞浆抗体 (ANCA) 相关性血管炎，涉及中枢神经系统和肺部。她的临床病程以免疫失调、自身免疫和炎症表现为特征，包括荨麻疹性中性粒细胞性皮肤病和 IgM 缺乏症。该病例强调了杂合 MEFV 突变在 ANCA 相关性血管炎中的潜在致病作用，扩大了 FMF 相关炎症疾病的临床范围。对于具有重叠的自身免疫和自身炎症特征的患者，基因研究至关重要，以指导适当的诊断和治疗。
HER2 PET作为指导曲妥珠单抗Deruxtecan在乳腺癌患者中使用的预测生物标志物的临床潜力
癌蛋白 - 靶向宠物示踪剂，并评估其转化能力用于非小细胞肺癌（NSCLC）和结直肠癌（CRC）患者的KRAS G12C突变非侵入性成像。方法：[18 f] PfPMD是根据AMG510（Sotorasib）合成的，通过将聚乙二醇链连接到喹唑啉酮结构中。通过细胞摄取，内在化和阻断（H358：KRAS G12C突变； A549：非KRAS G12C突变）研究，通过细胞摄取，内在化和阻断来检验[18 F] PFPMD的结合选择性和成像潜力。招募了五名健康志愿者，以评估[18 F] PFPMD的安全性，生物分布和剂量测定法。随后，有或没有KRAS G12C突变的14例NSCLC或CRC患者进行了[18 F] PFPMD和[18 F] FDG PET/CT成像。测量了[18 f] pfpmd的肿瘤摄取的SUV最大，并在有KRAS G12C突变的患者中进行了比较。结果：[18 F] PFPMD以较高的放射化学产率，放射化学纯度和稳定性获得。蛋白质结合测定法显示[18 F] PFPMD选择性地结合了KRAS G12C蛋白。[18 F] PFPMD在H358中的摄取量明显高于A549，并且通过AMG510进行预处理（H358 vs. A549：3.22％6 0.28％vs. 2.50％vs. 2.50％6 0.25％6 0.25％，p，0.05; block：2.06％6 0.13％，0.13％，p，p，0.22％，pfpmd。在PET成像的承重小鼠中观察到了相似的结果（H358 vs. A549：3.93％6 0.24％vs. 2.47％6 0.26％注射剂量/G，P，0.01; Block：2.89％6 0.29％0.29％注射剂量/G; P，0.05）。全身有效剂量与[18 F] FDG的剂量相当。[18 f] pFPMD在人类中是安全的，主要由胆囊和肠道排出。[18 F] PFPMD在KRAS G12C突变肿瘤中的积累显着高于非KRAS G12C突变肿瘤（SUV最大：3.73 6 0.58 vs. 2.39 6 0.22，P，0.01）在NSCLC和CRC患者中。结论：[18 F] PFPMD是NSCLC和CRC患者中KRAS G12C突变状态无创筛查的安全且有前途的宠物示踪剂。
利用 CRISPR/ 实现高效突变的策略...
成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关系统彻底改变了传统的基因编辑工具，是改善基因缺陷的重要工具。CRISPR/Cas 系统具有高靶向特异性、非凡效率和成本效益的特点，在几乎所有生物体和细胞类型中都显示出巨大的遗传操作潜力。然而，尽管 CRISPR/Cas 系统具有众多优势，但也存在一些固有的局限性，例如脱靶效应、传递效率不令人满意以及不良副作用，因此人们渴望探索解决这些问题的方法。本综述全面介绍了提高 CRISPR/Cas 诱导突变效率的策略，例如减少脱靶效应、改进 sgRNA 的设计和修改、优化编辑时间和温度、选择传递系统以及富集 sgRNA。此外，文中还详细讨论了几种新兴的方法，包括使用Cas变体、抗CRISPR蛋白和突变体富集等。此外，作者还深入分析了目前CRISPR/Cas系统应用面临的挑战以及CRISPR/Cas系统在未来各种场景中的应用。本综述不仅为提高CRISPR/Cas系统的成熟度提供了参考，也为扩大该技术的适用性提供了实践指导。
AccuCRISPR™ 突变检测试剂盒 (T7E1)
(T7E1)] 可以检测靶向基因组编辑并评估其效率。该方法具有能够快速简单地进行分析的优点。在 T7E1 检测中，通过 PCR 扩增目标基因组区域，并将 PCR 产物变性并重新退火以产生异源双链 DNA。T7E1 识别异源双链 DNA 并在错配 5´ 处的第一、第二或第三个磷酸二酯键处切割。结果可以通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。这是一种通过凝胶带的强度来测量基因组编辑效率并获得一致数据的可靠方法。应用
练习 2 - 探索随机突变和选择
并在其环境中繁殖？突变对于进化过程至关重要，因为它是基因型变异的最终来源——这种变异随后可以通过表型表现出来。Avidian 基因组中指令的改变会影响其执行某些功能的能力，甚至影响其繁殖能力（Avidians 的表型）。在本练习中，我们使用 Avida-ED 探索随机突变产生表型变异的后果，而这种表型变异可能会在环境中受到选择。Avida-ED 提供了一种方法来测试突变是随机发生还是为了响应环境中的自然选择而定向发生。从某种意义上说，我们正在直接测试 Salvador Luria 和 Max Delbrück (1943) 在他们获得诺贝尔奖的优雅实验 1 中所做的事情。我们还考虑了时间对进化过程至关重要的一个原因；如果突变不能产生表型，那么该性状就无法在种群中进化。 1 Luria SE, Delbrück M. 1943.“细菌从病毒敏感性到病毒抗性的突变。”
遗传突变抑制炎症反应 - ...
“类风湿关节炎是一种常见的健康状况，可以干扰日常生活的许多方面，并且基于当前治疗的有限效力，需要新颖的方法。“在这项研究中，我们发现了一个发现，这可能为风湿关节炎和其他炎症性疾病的更有效治疗铺平道路。”