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World File Search SystemncRNA
环状 RNA：特征、生物发生、机制和在肝癌中的功能
摘要背景：肝细胞癌（HCC）是全球最常见的恶性肿瘤之一。尽管有积极的多模式治疗方案，HCC患者的总体生存率仍然很低。主要内容：环状RNA（circRNA）是真核生物中具有共价闭合结构和组织或器官特异性表达模式的非编码RNA（ncRNA）。它们高度稳定并具有重要的生物学功能，包括充当microRNA海绵、蛋白质支架、转录调节剂、翻译模板和与RNA结合蛋白相互作用。最近的进展表明，circRNA在HCC组织中存在异常表达，并且它们的失调会导致HCC的发生和进展。此外，研究人员还发现一些circRNA可能在临床环境中用作诊断生物标志物或药物靶点。在本综述中，我们系统地评估了HCC中circRNA的特征、生物发生、机制和功能，并进一步讨论了肝癌相关circRNA的当前不足和前瞻性研究的潜在方向。结论：circRNA 是一类新型的 ncRNA，在肝癌的发生发展中发挥重要作用，但其内在机制和临床应用仍需进一步研究。关键词：circRNA，特征，生物发生，功能，机制，肝癌
a-t-i RNA编辑
作为后生动物后期的重要调节机制，作用于RNA上的腺苷脱氨酶（ADAR）诱导的A-to-I RNA编辑修饰，对双链RNA的RNA进行了修改，已被广泛检测到并报告了。编辑可能会导致非同义氨基酸突变，RNA二级结构改变，前MRNA处理变化和microRNA-MRNA重定向，从而影响多个细胞过程和功能。近年来，研究人员成功地开发了几种生物信息学软件工具和管道来识别RNA编辑站点。但是，由于平行优化和RNA高seq协议和程序的种类繁多，仍然没有广泛接受的编辑站点标准。由于高DNA突变速率，通过肿瘤样品中正常方案进行识别RNA编辑也很具有挑战性。据报道，许多RNA编辑位点位于非编码区域，可能会影响NCRNA的生物合成，包括miRNA和圆形RNA。预测位于非编码区域和NCRNA中的RNA编辑位点的功能非常困难。在这篇综述中，我们旨在更好地了解人类癌症的生物信息学策略A至I-I RNA编辑识别和Brie-fl Y讨论相关领域的最新进展，例如RNA编辑的致癌和肿瘤抑制作用。
小非编码 RNA CjNC110 影响空肠弯曲菌的运动性、1 自凝集、AI-2 定位和鸡 2 定植 3
小的非编码RNA参与27种病原微生物的许多重要生理功能。先前的研究已经确定了主要人畜共患病原体空肠弯曲菌中存在非编码RNA 28 ，但迄今为止，很少有非编码RNA在功能上得到表征。CjNC110是空肠弯曲菌中保守的ncRNA，位于30 luxS基因下游，该基因负责产生群体感应分子自诱导物-2 31 (AI-2)。在本研究中，我们利用链特异性高通量RNA测序来识别空肠弯曲菌羊流产克隆中CjNC110的潜在32靶标或相互作用伙伴。这些数据被用于进一步表型评估 CjNC110 在空肠弯曲菌的生长、运动、34 自体凝集、群体感应和鸡定植中的作用。与野生型相比，35 CjNC110 ncRNA 的失活导致自体凝集能力显著下降，同时 36 运动能力增强。37 ∆CjNC110 中细胞外 AI-2 检测降低，然而，细胞内 AI-2 积累显著增加，同时 LuxS 表达增加，这表明 CjNC110 在调节 39 AI-2 运输方面发挥着关键作用。值得注意的是，∆CjNC110 还显示出定植鸡的能力存在显著缺陷。CjNC110 的补充将所有表型变化恢复到野生型 41 水平。我们数据中观察到的表型和转录组变化的总体结果 42 为 C. jejuni 羊流产克隆的病理生物学提供了宝贵的见解，并强烈 43 表明 CjNC110 在调节能量趋向性、鞭毛 44 糖基化、通过群体感应的细胞通讯和鸡定植中起着重要作用。 45 重要的人畜共患病原体。46
抗病毒逆转录酶的从头基因合成
摘要：细菌使用多种免疫系统来抵御病毒感染，其中许多免疫系统可以感知和靶向外来核酸。防御相关逆转录酶 (DRT) 系统通过利用 DNA 合成为这种免疫策略提供了一个有趣的对照点，但其 DNA 产物的身份和功能仍然很大程度上未知。我们在此展示了 DRT2 系统执行一种前所未有的免疫机制，该机制涉及通过非编码 RNA (ncRNA) 的滚环逆转录进行从头基因合成。对 DRT2 表达细胞中 RT 相关 RNA 和 DNA 配体的无偏分析表明，逆转录通过程序化模板跳跃到 ncRNA 上产生串联的 cDNA 重复序列。然后噬菌体的存在会触发第二链 cDNA 合成，从而产生长双链 DNA。值得注意的是，这种 DNA 产物被高效转录，生成信使 RNA，该 RNA 编码无终止密码子的、永无止境的 ORF（neo），其翻译会导致强大的生长停滞。系统发育分析和对各种 DRT2 同源物的筛选进一步揭示了滚环逆转录和 Neo 蛋白功能的广泛保守性。我们的工作突出了通过 RNA 模板基因创建优雅地扩展了基因组编码潜力，并挑战了沿基因组 DNA 一维轴编码遗传信息的传统范式。
外泌体非编码RNA
结直肠癌 (CRC) 是世界第三大癌症，转移性 CRC 大大增加了全球癌症相关的死亡人数。转移涉及许多在分子水平上受到严格控制的复杂机制，而转移是 CRC 患者死亡的主要原因。最近，人们已经清楚，外泌体（由非肿瘤细胞和肿瘤细胞释放的细胞外小囊泡）在肿瘤微环境 (TME) 中起着关键的通讯介质作用。为了促进 TME 和癌细胞之间的通讯，非编码 RNA (ncRNA) 起着至关重要的作用，被认为是基因表达和细胞过程（如转移和耐药性）的有效调节剂。NcRNA 现在被认为是基因表达和许多癌症标志（包括转移）的有效调节剂。外泌体 ncRNA，如 miRNA、circRNA 和 lncRNA，已被证明会影响多种导致 CRC 转移的细胞机制。然而，将外泌体 ncRNA 与 CRC 转移联系起来的分子机制尚不清楚。本综述重点介绍了外泌体 ncRNA 在 CRC 转移性疾病进展中发挥的重要作用，并探讨了 CRC 转移患者可以选择的治疗方案。然而，外泌体 ncRNA 治疗策略开发仍处于早期阶段；因此，需要进一步研究以改进给药方法并找到新的治疗靶点，以及在临床前和临床环境中确认这些疗法的有效性和安全性。
miR-155和CTBP1-AS2的循环水平是一种有前途的生物标志物，用于早期检测糖尿病性肾病
最受欢迎的传统临床生物标志物评估肾脏功能和糖尿病肾脏疾病（DKD）的鉴定，包括血清肌酐（SCR），肾小球滤过率（EGFR），尿白蛋白肌酐比率（UACR）和白蛋白尿尿症检测[7，8]。即使存在这些传统标记，及时，精确的DN诊断也存在重大障碍。最近的研究表明，大约30％的DN患者没有蛋白尿[9]。此外，在DN患者中，特别是在T2D中，在没有蛋白尿的情况下，GFR的降低。相反，这些患者以严重降低的GFR降低了慢性肾脏疾病（CKD），而没有从微藻尿症过渡到明显的蛋白尿[10]。并非特定于DKD的存在，也可能发生在其他疾病中[11]。由于DN的早期诊断对于防止该疾病的发展至关重要，因此近年来已经努力引入新的DN诊断标记。最近的研究表明，非编码RNA（NCRNA），尤其是microRNA（miRNA）和长期编码RNA（LNCRNA）参与DN的发作和进展[12-14]。LNCRNA和miRNA之间的相互作用，称为miRNA海绵或竞争性内源性RNA（CERNA），可以减少miRNA对mRNA的抑制作用，从而防止靶基因抑制[15]。此外，NCRNA可以作为一种新型敏感和无创的诊断生物标志物来预测DN进展，因为它们在体液，组织和组织和细胞特异性表达曲线上的稳定性很高[16，17]。
在混合程序后，杂种左心脏综合征的神经发育和功能结果作为阶段I
作为各种细胞分泌的磷脂外囊泡（EV），外泌体包含非编码RNA（NCRNA），mRNA，DNA片段，脂质和蛋白质，这对于细胞间通信至关重要。几种类型的细胞可以分泌有助于癌症开始和进展的外泌体。癌细胞和免疫微环境相互作用并相互限制。肿瘤衍生的外泌体（TDE）已成为这种平衡中必不可少的参与者，因为它们从原始的癌细胞中携带信息并表达MHC I/II类表位和共刺激分子的复合物。在本研究中，我们旨在通过检查源自癌细胞的外泌体的特定表达和机制来鉴定外泌体治疗的潜在靶标。我们引入了TDE，并探索了它们在不同肿瘤免疫微环境（TIME）中的作用，并特别强调了胃肠道癌症，然后再描述癌症免疫相关治疗中外泌体的治疗策略。
催化无活性 CRISPR 的新兴应用-...
摘要 rRNA、tRNA、mRNA和非编码RNA等不同类型RNA的转录后调控广泛参与生理和疾病的发生发展。mRNA作为基因与蛋白质之间的中间产物，其可变剪接、可变多聚腺苷酸化和修饰等转录后调控影响其编码蛋白的表达和功能。然而，由于缺乏合适的RNA工程平台，RNA转录后调控的功能意义和治疗潜力尚未得到充分研究。2015年一种特异性靶向RNA模板的新型CRISPR-Cas系统CRISPR-Cas13的发现，赋予了CRISPR以高特异性靶向和编辑RNA的新作用，在一定程度上开启了RNA操作的新时代。本综述将总结催化无活性的CRISPR-Cas13系统（CRISPR-dCas13）在mRNA工程中的新兴应用，并强调CRISPR-dCas13系统在其他RNA修饰调控中的前景及其治疗潜力。
环状RNA及其应用研究进展
环状RNA（circRNA）是一种新型的内源性非编码RNA（ncRNA），与microRNA（miRNA）一样，是一个迅速兴起的RNA研究课题。与传统的线性RNA（具有5'和3'端）不同，circRNA具有不受RNA外切酶影响的闭环结构。因此，circRNA具有持续表达并且对降解不太敏感。由于circRNA具有许多miRNA结合位点，因此消除其对靶基因的抑制作用可以大大增强其表达。circRNA通过特定的circRNA-miRNA相互作用在疾病的发生和进展中发挥重要调控作用。我们在本综述中总结了目前在阐明circRNA机制和生物合成方面的进展。特别是，circRNA主要可以作为miRNA海绵发挥作用，调节宿主基因表达和蛋白质运输。最后，我们讨论了基于circRNA的疗法的应用前景和重大挑战。
用反向移动欺骗噬菌体
逆转录酶（RTS），使用RNA模板合成DNA的酶，广泛分布在生命的所有领域中。这些酶在多种过程中具有作用，包括在逆转和移动遗传元素以及端粒生物学的生命周期中。在细菌中，RT对抗爆抗防御特别重要，并且被多种遗传系统使用，其作用是保护细菌免受噬菌体的影响。例如，一些CRISPR-CAS系统使用逆转录对RNA噬菌体（3）的核酸（“间隔者”）的新免疫盒（“垫片”）。rts也用于称为回试的反出发遗传系统中，该遗传系统由三个编码RT，NCRNA和“效应子”毒素的基因组成。通过反向转化的过程，反式反应产生嵌合核酸链，其中DNA和RNA共价链接。该嵌合DNA-RNA分子的作用尚不清楚，但已显示为