XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systempeptides
RHAMM 靶肽作为分子成像探针对表达 RHAMM 的癌细胞进行成像
摘要 ：全球癌症发病率呈逐年上升趋势，开发新的癌症早期诊断方法势在必行。本研究致力于研究RHAMM靶肽在癌症分子诊断中的应用潜力。采用丙氨酸扫描法鉴定RHAMM靶肽的关键氨基酸，采用竞争性HA取代法，ELISA法评价肽与RHAMM-CT结合的特异性。通过基因工程方法获得RHAMM-CT，并用亲和层析法分离RHAMM-CT。用共聚焦显微镜评价RHAMM靶肽与肿瘤细胞表面受体的相互作用。结果表明，肽组成中的EEGEEZ片段是与RHAMM-CT结合所必需的。结果表明，RHAMM靶肽能特异性地与RHAMM-CT结合，并竞争性取代RHAMM上的HA。研究发现，聚集蛋白聚糖无法取代RHAMM-CT上HA结合位点的肽。研究结果表明，FITC肽能特异性地与前列腺癌细胞表面的RHAMM结合，因此，RHAMM靶向肽具有用于癌症早期分子诊断的潜力。
量子缺陷作为工具箱，用于与肽和蛋白质的碳纳米管共价功能化
摘要：单壁碳纳米管（SWCNT）是1D纳米材料，显示近红外（NIR，> 800 nm）中的荧光。过去，在损害NIR发射时，探索了共价化学以使SWCNT功能化。然而，碳晶格中的某些SP 3缺陷（量子缺陷）已经出现，可以保留NIR荧光，甚至引入了新的红移发射峰。在这里，我们报告了使用轻驱动重氮化学物质引入的量子缺陷，这些缺陷是肽和蛋白质的锚点。我们表明，马来酰亚胺锚允许含有半胱氨酸的蛋白（例如GFP结合纳米机）结合。此外，FMOC保护的苯丙氨酸缺陷是可见的荧光团结合以创建多色SWCNT和直接在纳米管上的原位肽合成的起点。因此，这些量子缺陷是一个多功能平台，可量身定制纳米ubeqs光合物理特性及其表面化学。
靶向RNA M6A甲基化的肽会影响癌细胞的生存能力
在各种细胞应激下mRNA变化的核苷酸修饰水平。[9] mRNA核苷酸修饰水平的这种变化也与许多人类疾病和疾病有关。例如，在肺癌，胶质母细胞瘤，乳腺癌和从糖尿病患者中提取的肺癌，胶质母细胞瘤，乳腺癌和β细胞的n6-甲基腺苷水平（M 6 A）降低，而在结直肠癌，胰腺癌和急性骨髓性白血病中，观察到M 6 A水平升高。与M 6 A水平的变化平行，M 6 A甲基转移酶（作者）和去甲基酶（橡皮擦）的表达水平也适当地在测试的癌细胞系中变化。[10–12] RNA中的N6-麦克测lations也被M 6 A读取器蛋白识别，从而导致细胞蛋白水平的调节。[13]我们发现靶向M 6 A修饰mRNA是一种可抑制甲基读取器和橡皮擦结合的可行方法，从而改变了
双环肽作为肿瘤过度表达蛋白质成像和靶向的新方法
使用针对肿瘤相关靶蛋白的特异性探针对癌症进行分子成像，为提供有关靶向治疗选择、患者分层和治疗反应的信息提供了强大的解决方案。在这里，我们展示了双环肽作为靶向探针的强大功能，以肿瘤过表达的基质金属蛋白酶 MT1-MMP 为靶标。鉴定出一种对 MT1-MMP 具有亚纳摩尔亲和力的双环肽，其放射性结合物在 HT1080 异种移植小鼠模型中显示出选择性肿瘤摄取。通过化学修饰对肽进行蛋白水解稳定化显著增强了体内肿瘤信号[注射后 (pi) 1 小时从 2.5%ID/g 增加到 12%ID/g]。使用具有不同细胞系的小鼠异种移植模型的研究表明，肿瘤信号与体内 MT1-MMP 表达水平之间存在很强的相关性。双环脂肪酸改性
噬菌体肽通过聚焦靶向窗口介导精准碱基编辑
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它是在预印本（未经同行评审认证）下提供的，作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。此版本的版权持有者于 2020 年 11 月 2 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.11.02.364430 doi：bioRxiv 预印本
一些好的肽：基于 MHC I 类的癌症免疫监视和免疫逃避
尽管我们一生中患癌症的风险约为 40%，但令人惊讶的是这个数字并没有更高。我们体内的 10 13 个有核细胞每细胞分裂约复制 3 × 10 9 个碱基对，内在突变率约为每碱基对 10 –4.5 个，而每天的化学致癌物和辐射还会产生额外的突变。DNA 质量控制途径修复了大部分损伤，但越来越明显的是，免疫系统在限制癌变方面发挥着重要作用——这就是免疫监视的概念。事实上，肿瘤进化出了无数机制来逃避免疫，这一过程称为免疫编辑 1 。Boon 等人 2 首次通过展示 CD8 + T 细胞对自身肽的耐受性可以被癌细胞突变打破，从而产生氨基酸取代，使肽具有免疫原性，从而定义了癌症免疫监视的分子性质。在接下来的十年里，越来越多的实验室开展研究，证实癌症特异性肽由多种机制产生，而且免疫系统在控制肿瘤发生方面起着至关重要的作用。限制 T 细胞活化和功能的免疫检查点分子（如细胞毒性 T 淋巴细胞抗原 4 (CTLA4) 和程序性细胞死亡蛋白 1 (PD1)）的发现导致了免疫检查点抑制剂的开发，这些抑制剂已证明细胞免疫在根除人类癌症方面具有巨大潜力 3 。然而，大多数癌症对检查点抑制剂和其他免疫疗法的抵抗力
横跨陆地节肢动物的分散，生命史和热壁细分市场的一致协变
建立肽序列与原纤维形成之间的基本关系对于理解蛋白质错误折叠过程和指导生物材料设计至关重要。在这里，我们将全原子分子动力学（MD）模拟与人工intel-ligence（AI）相结合，以研究短肽序列排列的细微变化如何影响其形成原纤维的倾向。我们的结果表明，疏水残基的分布和电荷簇的分布很小，可以显着影响成核速率和跨β结构的稳定性。为了快速扩展此分析，我们开发了一个主动学习 - 增强的框架 - 用于分子动力学的机器学习（ML4MD），从而根据MD衍生的聚合数据迭代地完善了其预测。ML4MD有效筛选了许多肽排列，并指导发现先前未识别的原纤维式序列，从而在接收器操作特征（ROC）曲线（AUC）下达到0.939的接收器下方。总体而言，ML4MD通过将详细的原子模拟与快速和高敏锐的ML预测整合在一起，简化了淀粉样蛋白样肽的合理设计。
回顾具有潜在应用在水产养殖中的光合海洋生物的抗菌肽
摘要：水产养殖产量处于创纪录的水平，估计在未来几年中会增加。但是，这种产量可能会受到病毒，细菌和寄生虫产生的传染病的负面影响，从而导致鱼类死亡率和经济损失。抗菌肽（AMP）是很小的植物，可能有望替代抗生素，因为它们是动物对各种病原体的第一道防线，并且没有负面影响。它们还显示了其他抗氧化剂或免疫调节功能等其他功能，这使它们成为水产养殖的强大替代品。此外，AMP在天然来源中高度可用，并且已经用于牲畜农业和食品行业。光合海洋生物可以在各种环境条件下以及在极具竞争性的环境下生存，这要归功于它们的柔性代谢。出于这个原因，这些生物代表了一种强大的生物活性分子来源，即包括AMP在内的营养素和药物。因此，在这项研究中，我们回顾了来自光合海洋生物体的AMP的当前知识，并分析了它们是否适合在水产养殖中使用。
天然存在的螺旋抗菌肽的脂化作为药物设计的有前途的策略
摘要：在本文中，我们描述了抗菌特性的化学合成，初步评估和一组新型脂化衍生物的作用机制，这些衍生物是三种天然α-螺旋α-螺旋抗菌肽的作用，ll-i（ll-i ATRA-1（KRFKKFFKKLK-NH 2）。获得的结果表明，最终化合物的生物学特性均由脂肪酸的长度以及初始肽的结构和物理化学特性来定义。我们将C 8 –C 12的长度视为抗菌活性改善的最佳。然而，最活跃的类似物对角质形成细胞的细胞毒性相对较高，除了ATRA-1衍生物，对微生物细胞具有更高的选择性。ATRA-1衍生物对健康人角质形成细胞的细胞毒性相对较低，但针对人类乳腺癌细胞的细胞毒性高。考虑到ATRA-1类似物具有最高的正净电荷，可以假定此功能有助于细胞选择性。正如预期的那样，研究的脂蛋白肽表现出强烈的趋势，即自组装成纤维和/或细长和球形胶束，具有最少的细胞毒性ATRA-1衍生物，形成较小的组装。研究结果还证实了细菌细胞膜是研究化合物的靶标。
