Cenarchaeum symbiosum DNA 聚合酶 II 大亚基 (polC) 是古菌 Cenarchaeum symbiosum 中 DNA 复制过程中的关键酶。其主要功能包括在细胞分裂和基因组维持过程中合成 DNA 链。其研究领域包括揭示其在基因组稳定性中的作用以及探索其在研究古细菌遗传学中的应用。在分子生物学和古细菌遗传学中,polC 是理解 DNA 复制机制的关键焦点。该酶的重要性在于提供对基本生物过程的洞察,促进古细菌分子生物学的进步。
1. 美洲大学(UDLA)研究总局研究实验室,安提瓜 Vía a Nayón S/N,基多 EC 170124,厄瓜多尔; 2. 美洲大学(UDLA)工程与应用科学学院生物技术工程项目,安提瓜 Vía a Nayón S/N,基多 EC 170124,厄瓜多尔; 3. 厄瓜多尔基多美洲大学(UDLA)健康科学学院兽医学项目,Antigua Vía a Nayón S/N,基多 EC 170124,厄瓜多尔; 4. 农业产业与环境科学学院。农业生涯。卡尔奇州立理工大学 (UPEC)。 Antisana S/N 和 University Avenue,图尔坎 EC 040102,厄瓜多尔; 5. 罗萨里奥国立大学(UNR)兽医学院。奥维迪奥拉各斯大道和 33 号公路卡西尔达 – 圣达菲 – 阿根廷; 6. 厄瓜多尔中央大学兽医学与畜牧学院,厄瓜多尔基多,Gatto Sobral 和 Jerónimo Leiton,基多 EC 170521,厄瓜多尔; 7. 美洲大学(UDLA)教学兽医诊所,Shuara 街 N40-55 和 De Los Granados 大道,基多,EC 170503,厄瓜多尔; 8. 美洲大学(UDLA)“一个健康研究小组”,安提瓜 Via a Nayón S/N,基多 EC 170124,厄瓜多尔。通讯作者:Luis Nuñez,电子邮件:fabiann7@yahoo.es 共同作者:ALG:a.abel.loor.giler@gmail.com,SCR:sara.castillo.reyes@udla.edu.ec,SSP:silvanahsp@yahoo.com,MC:rolando.campos@upec.edu.ec,RMP:rpmena@uce.edu.ec,SPC:sdpch2021@gmail.com 收稿日期:2024 年 5 月 8 日,接受日期:2024 年 9 月 11 日,在线发表日期:2024 年 10 月 17 日
图1。三个小聚合酶核酶基序的发现和进化。(a)选择构造的格式用于初始选择回合(回合1至3或1至5),库是通过柔性链接器链接到杂交标签的六聚体标签的。生物素化引物可以捕获活性连接酶(在图中进行了详细描述S1-S2)。(b)在后期回合中使用的选择构建体的格式(3至11或5至11),需要三磷酸化的三核苷酸(Triplet)底物的聚合。在选择过程中,三胞胎(xxx)的序列(xxx)和由模板(x'x'x')编码的三重态数(y)在选择过程中变化(表S1中的详细信息)。(c)序列和预测从显示迭代三重三重连接的库中发现的三个核酶的二级结构,即三重酶聚合酶活性。在绿色中,源自随机库部分的核苷酸。在灰色的核苷酸中,源自恒定区域(接头和引物结合位点)。(d)在(b)中显示的(c)中显示的核酶的迭代三重聚会聚合,带有xxx = gcg和x'x'x'= cgc,y = 3。反应条件:50 nm核酶 - 基底,50 nm引物BCY3P10GA,50 nm模板T6FP10GAGCG3,5μMPPPGCG三胞胎,0.05%Tween 20,200 mm Kcl,50 mm Kcl,50 mm mgcl 2,50 mm mgcl 2,50 mm ches-koh,ph 9,3天,3天,以-77°°°°°°°°核酶与模板杂交。(E)序列和预测源自1-40克隆的QT51核酶的二级结构。黑色圆圈表示从1-40个祖先序列突变的6个残基;三角形表示2-核苷酸缺失。(f)60核苷酸序列的合成,该序列由CGU三重态的20个重复组成。Reaction conditions: 0.25 μM primer F10, 0.25 μM template tP10CGU20, 0.25 μM ribozyme, 10 μM pppCGU triplet, QT51 in 0.05% Tween 20, 50 mM MgCl 2 , 50 mM CHES-KOH, pH 9, 5TU+t1.5 in 200 mM MgCl 2 , 50 mM Tris-Cl, pH 8.3, 2 weeks在-7°C冷冻。核酶未与模板杂交。
噬菌体(噬菌体)是感染细菌的病毒。其中许多产生了称为解聚酶的特定酶,以分解外部多糖结构。由于其固有的序列多样性,这些解聚酶的准确注释和域的识别是具有挑战性的。因此,我们提出了Deposcope,这是一种机器学习工具,将微调的ESM-2模型与卷积神经网络相结合,以精确地识别分解序列及其酶促域。为了实现这一目标,我们从Inphared Phage基因组数据库中策划了一个数据集,创建了一个多糖 - 脱落域数据库,并应用了顺序过滤器来构建一个高质量的数据集,该数据集随后用于训练解镜。我们的工作是与氨基酸级预测进行序列级预测的第一种方法,以进行准确的去聚合物ASE检测和功能域鉴定。以这种方式,我们认为Deposcope可以极大地增强我们对噬菌体宿主相互作用的理解。
结核病(TB)是由结核分枝杆菌引起的疾病,对全球健康是严重威胁。可用于检测和鉴定引起TB的细菌的方法是定量聚合酶链反应(QPCR)。在这种方法中,变性和延长温度是需要优化成功的决定因素之一。这项研究旨在优化DNA M.结核病的扩增中的变性和延长温度。使用准实验设计的研究。最优化的温度为93、94、95、96和97°C,用于扩展为58、59、60、61和62°C。测试样品是从结核分枝杆菌的患者收集的痰液样本,对异念珠菌具有抗性。优化是使用七个测试引物,即S315T,S315N,S315I,S315R,S315G,S315G,S315L和R463B,具有KATG基因的靶标。优化数据通过MS Excel处理最低的CT值。结果表明,使用的每个引物的最佳变性温度各不相同。主要的S315T,S315R和S315G在96°C的变性温度下最佳,最佳S315N在94°C时,主要S315i和R463B在93°C下最佳的R463B,最佳的S315L引物在95°C,最佳的S315L引物,最佳使用的温度为96°C. 96°C. 在58°C下的最佳延伸温度,用于原代S315N,S315N,S315I和R463B,初级S315R和S315G在60°C下,初级S315L在61°C下为61°C。 可以得出结论,变性研究的最佳温度为96°C,延伸为58°C。。在58°C下的最佳延伸温度,用于原代S315N,S315N,S315I和R463B,初级S315R和S315G在60°C下,初级S315L在61°C下为61°C。可以得出结论,变性研究的最佳温度为96°C,延伸为58°C。
增强子是其他基于DNA的过程的关键调节因子,因为它们以高度调节的方式产生核小体耗尽区域的独特能力。增强子通过RNA聚合酶III(POL III)调节TRNA基因的细胞类型特异性转录。他们还负责原点复制复合复合物(ORC)与DNA复制起源的结合,从而调节原点利用,复制时机和依赖复制的染色体断裂。此外,增强剂通过增加重组激活基因(RAG)重组酶对靶位点的访问以及通过产生由RAG2 PHD域识别的三甲基化组蛋白H3-K4的局部区域来调节V(d)J重组。因此,增强子代表了解码基因组的第一步,因此它们调节生物学过程,这些过程与RNA聚合酶II(POL II)转录不同,没有专用的调节蛋白。
冠状病毒家族[1]。病毒基因组(约29 kb)包含11个开放式阅读框,它们编码四个结构蛋白和7种非结构性(NS)蛋白质。FCOV根据其致病性分为两种生物型:猫肠病毒(FECV)和猫感染性骨膜炎病毒(FIPV)[2]。FECV感染主要限于肠道,导致轻度,自限制的胃肠道疾病。FIPV会导致致命的多系统,免疫介导的疾病,该疾病是大坝老化的各种组织和器官,腹膜炎甚至死亡是损害的最典型迹象[2,3]。fipv被认为是FECV的突变体,导致病毒致病性和向性欲的变化。然而,可以解释FECV和FIPV的不同致病性的遗传差异仍然不清楚[1,4,5]。根据病毒抗原>
yi Liu,1,7 Anthony Flamier,1,5,6,7 George W. Bell,1 Annette Jun Dioo,2 Troy W. W. W. Whitfield,1 Hao-Che Wang,1 Yizhe Wu,1 Fabian Schulte,1 Max Friesen,1 Maxi friesen,1 Ruisi Guo,1 Maisi Guo,1 MaisaMitalipipova,1 shawn liu sen liu v。理查德A.Young,1,2和Rudolf Jaenisch 1,2,8, * 1 Whitehead生物医学研究所,剑桥,马萨诸塞州剑桥,马萨诸塞州02142,美国2,美国马萨诸塞州生物学系,马萨诸塞州剑桥,马萨诸塞州02142马萨诸塞州理工学院,剑桥,马萨诸塞州02142,美国5现在的地址:神经科学系,蒙特利尔大学,蒙特利尔大学,QC H3C 3J7,加拿大6的地址:Chu Sainte-Justine Center:Chu Sainte-Justine Research Center,Montreal,Montreal,Montreal,Montreal,QC H3T 1C5,QC H3T 1C5,加拿大7. superally 8 Leads nequime nesumit.sumit.mit.mit.sumit.mit.mit.mit.mit.imit.mit.mit.imit.mit.mit.mmitimit.mit.mmitimit.mit.mmitimit.mit.mit.mmitimit.mit.mmitimit.mit.mmitimit。 https://doi.org/10.1016/j.neuron.2024.04.007
特性 ALzyme-HSTaq 是一种重组耐热酶,在 dNTP 和引物存在下可催化 5'→3' 单链基质 DNA 合成。它具有 5'→3' 外切酶活性,但没有校正活性。ALzyme-HSTaq 可有效扩增长达 5 bp 的 DNA 片段。特定突变使该酶对血液、土壤、植物组织等中所含的某些抑制剂具有抗性。此外,ALzyme-HSTaq 具有脱氧核苷酸转移酶活性,因此相当一部分扩增的 DNA 分子在 3' 端带有突出的脱氧腺苷 (dA) 残基。热启动技术。该酶在 PCR 混合物混合条件下无活性,在初始变性步骤后被激活。ALzyme-HSTaq 浓度为 5 单位/µl。 100 微升酶(ZHSTaq-100)含有 500 单位,500 微升(ZHSTaq-500)含有 2500 单位。ALzyme-HSTaq-B 反应缓冲液为 ALzyme-HSTaq DNA 聚合酶提供最佳条件。