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基于结构的药物设计，以发现TRIM71蛋白的潜在HIT分子，以防止先天性脑积水Veer Bhatia 1和Divya ra
trim71是在人类中大量表达的基因，在早期的胚胎发生和神经分化中起着至关重要的作用，通过与靶MRNA结合，触发翻译抑制或mRNA降解。3 Qiuying Liu等人，研究人员使用交联的免疫沉淀和测序（CLIP-SEQ）技术探索了小鼠中CH相关的突变。这项研究很重要，因为蛋白质对人类表现出相似的反应。4研究表明，突变的TRIM71蛋白与不同的靶标mRNA结合，表明“功能的获取”。具体而言，小鼠中的R595H-TRIM71与CTNNB1基因中的mRNA结合，该基因编码了β-catenin蛋白，这对于干细胞分化至关重要。5抑制其翻译可阻止神经发育必需蛋白质的产生。相反，R783H-TRIM71与LSD1 mRNA结合，抑制其翻译并导致干细胞分化的缺陷。5
Leishmania Donovani中的凋亡蛋白 - 寄生虫
摘要 - 内脏利什曼病是一种威胁生命的载体传播疾病，对儿童和老年人免疫功能低下的人的影响不成比例，是一种主要的热带忽视疾病。在利什曼尼亚·多诺瓦尼（Leishmania Donovani）尚未报道过凋亡的伴侣蛋白质，而它们的识别可能会导致有关寄生虫细胞死亡和建立替代治疗剂的知识。我们搜索了哺乳动物的Bcl-2家族蛋白直系同源物，并在多诺瓦尼乳杆菌中发现了一种抗凋亡和两个促凋亡的直系同源物。。 进行了进行分子对接和分子动力学模拟，以评估已识别的凋亡蛋白与模拟哺乳动物固有的凋亡途径之间的蛋白质蛋白相互作用。 恢复表明，两种促凋亡蛋白都与抗凋亡直系同源物的疏水袋相互作用，形成稳定的复合物。 这种相互作用可能代表L. Donovani的凋亡途径中的关键事件。 为了进一步表征它，我们使用了CRISPR-CAS9方法来靶向识别蛋白。 纯敲门的种群突变体，并暴露于凋亡刺激中。 末端脱氧核苷酸转移酶Dutp nick末端标记（TUNEL）测定和定量表达促进表明，这些蛋白质与寄生虫的凋亡有关，并可能在其生存中起作用。。进行分子对接和分子动力学模拟，以评估已识别的凋亡蛋白与模拟哺乳动物固有的凋亡途径之间的蛋白质蛋白相互作用。恢复表明，两种促凋亡蛋白都与抗凋亡直系同源物的疏水袋相互作用，形成稳定的复合物。这种相互作用可能代表L. Donovani的凋亡途径中的关键事件。为了进一步表征它，我们使用了CRISPR-CAS9方法来靶向识别蛋白。纯敲门的种群突变体，并暴露于凋亡刺激中。末端脱氧核苷酸转移酶Dutp nick末端标记（TUNEL）测定和定量表达促进表明，这些蛋白质与寄生虫的凋亡有关，并可能在其生存中起作用。
关于 microRNA 引导基因调控特异性的新视角及其对转录因子和 RNA 结合蛋白的潜在推广
过去 20 年来，我们对基因调控特异性的认识发生了深刻变化。以前，人们认为调控因子控制着少数基因，通过“钥匙和锁”机制以精确的特异性识别。但最近，对调控因子结合位点占有率（无论是在 DNA 还是 RNA 靶标上）的全基因组探索揭示了每个研究调控因子的大量分子靶标列表。如此差的生化特异性表明每个调控因子控制许多基因，共同影响生物表型。在这里，我提出了第三种模型，即调控因子的生物特异性仅部分归因于“钥匙和锁”生物化学。相反，调控因子在微观尺度上影响许多基因，但大多数相互作用的生物学后果在中观尺度上被减弱：只有少数调控事件从微观传播到宏观尺度，其他调控事件因稳态机制而变得无关紧要。该模型得到了 microRNA 文献的充分支持，数据表明它扩展到其他调控因子。它一方面调和了来自生物化学和比较基因组学的矛盾观察结果，另一方面又调和了来自体内遗传学的矛盾观察结果，但这种概念上的统一却被常见的误解和违反直觉的图形显示模式所掩盖。要深刻理解基因调控，需要澄清概念，以及更适合的统计分析和图形表示。
启动在马铃薯领域种植鸡蛋蛋白
分子农民Maya Sapir-Mir（左）和Raya Liberman-Aloni正在接受全球烹饪的最爱，并将其转变为低成本生物反应器以生产卵子蛋白。他们在2022年建立了Polopo，以设计土豆植物以生产蛋清蛋白质，而无需昂贵的生物反应器。该公司位于以色列的内斯Ziona，已开始首次实地试验，种植了富含蛋白质的块茎。Ovalbumin是蛋清中的主要蛋白质，是食品制造商作为成分所追捧的，因为它有助于提高营养价值并延长包装产品的保质期。团队通过将整个卵蛋白DNA序列插入叶片，从而设计了马铃薯，因此，该序列包含了产生功能齐全的蛋白质的指令，该蛋白质在营养和化学上与鸡蛋中的蛋白质相同。将养分从叶子移到块茎的韧皮部运输了工程化的椭圆蛋白产品。遗传改性的polopo马铃薯看起来与原始的polopo相同，具有其优势，并将蛋白质储存在块茎中，实际上像迷你抗反应器一样有效地发挥作用。这些植物的生长快且廉价地培养，并且由于它们在遗传上与第一个
病毒蛋白 Nef 为癌症的现成 CAR-T 细胞疗法迈出了一步
显然，获胜者是一种名为 Nef 的蛋白质，HIV 病毒利用这种蛋白质逃避免疫系统的检测。它通过两种方式发挥作用：首先，它减少了 CAR-T 细胞表面一种名为 HLA-I 的蛋白质。HLA-I 通常充当免疫系统的红旗，发出信号表明存在问题并引发攻击——减少 HLA-I 有助于细胞不被发现。此外，Nef 有助于防止 CAR-T 细胞发生一种名为凋亡的细胞自杀形式。
2025; 15（7）：3143-3158。 doi：10.7150/thno.104722研究论文同种异体非蛋白质生成氨基酸BMAA疫苗破坏了免疫TOR
免疫疗法的基本问题是大多数类型的肿瘤中缺乏肿瘤特异性抗原，从而导致免疫耐受性。对于大约85％的微卫星稳定患者（MSS）结直肠癌（CRC），缺乏肿瘤新抗原会导致免疫疗法功效不佳。我们先前的研究表明，非蛋白酶脯氨酸（PRO）类似物氮氮杂氨酸-2-羧酸（AZE）的掺杂可能会产生突变的蛋白质，从而显着增强肿瘤细胞抗原性和抗肿瘤免疫反应。方法：为了激活更特异性的抗肿瘤免疫反应，副作用较少，我们利用了非蛋白质生成丝氨酸（SER）类似物β-N-甲基氨基氨基 - L-丙氨酸（BMAA），可以通过适当的速率将其用作Seryl TRNA合成酶将其掺入蛋白质中。BMAA掺入的新抗原，并在鼠CRC模型中选择了具有高抗原性的癌细胞富集肽，以制备基于BMAA的自组装纳米颗粒（SAN）。单细胞测序，以分析由SAN疫苗接种诱导的免疫反应，并结合Toll样受体7激动剂（TLRA）辅助和BMAA治疗。结果：San-TlrA接种BMAA治疗诱导了抗肿瘤免疫微环境。这种组合刺激了特定CD8 + T细胞的产生和靶向BMAA的IgG衰老的Neopitopes，最终促进了CRC鼠模型中的免疫激活，抑制肿瘤和延长生存率。这种方法为CRC免疫疗法提供了新的途径。此外，BMAA与SAN疫苗相结合，显着增强了免疫检查点抑制剂抗PD-1抗体的功效。结论：我们的发现提供了一种有前途的策略，用于使用BMAA人为地引入新抗原，这可以破坏免疫耐受性而不会破坏全身免疫平衡。
果蝇CRISPR/CAS9突变体作为分析人类FLNC变体的心脏丝蛋白功能和致病性的工具
我们研究的目的是检验以下假设：再生胰岛衍生的蛋白3α（Reg3α）的给药，一种被描述为具有保护氧化应激和抗炎性活性的蛋白质，可以参与葡萄糖稳态的控制，并可能是对2型二世纪型糖尿病治疗的新目标。到此为止，重组人Reg3α蛋白在喂养高脂饮食的胰岛素耐药小鼠中施用一个月。我们进行了葡萄糖和胰岛素耐受性测试，测定了血浆中的循环趋化因子，并测量了胰岛素敏感组织中的葡萄糖摄取。我们证明了在ALF-5755处理的小鼠与对照中口服葡萄糖耐量测试期间胰岛素敏感性的提高，并降低了促炎性细胞因子C-X-C-C-X-C型趋化因子配体5（CXCL5）。我们还证明了骨骼肌中葡萄糖摄取的增加。最后，使用人和小鼠肌肉活检的相关研究显示肌内reg3αmRNA表达（或其鼠同工型Reg3γ）与胰岛素抵抗之间的负相关。因此，我们已经建立了概念证明，即reg3α可以通过通过骨骼肌效应提高胰岛素敏感性来治疗T2D的新分子。
化脓性链球菌 Cas9 核糖核蛋白递送，用于在锥虫和利什曼原虫中进行高效、快速和无标记的基因编辑
图 1 布氏锥虫 PCF 中的 GFP 失活。（a）对组成性表达胞浆 eGFP 的布氏锥虫进行荧光流式细胞术分析。在用 20 μ g（无 Cas9、Cas9/gRNA GFP1、Cas9/gRNA GFP2、Cas9/gRNA GFP3）或 60 μ g（Cas9/gRNA GFP2）来自 IDT 的 RNP 复合物转染后 24 至 72 小时随时间监测 GFP 荧光，条形图显示用不同向导转染后 72 小时 GFP 阴性细胞的百分比（n = 3）。采用 Prism 软件进行统计分析，采用 t 检验（非配对、正态分布、参数检验和双尾）。显着性水平（p 值）用星号表示。 （b）上图显示了允许 e Sp Cas9 在大肠杆菌中表达的质粒的示意图。蓝色框表示蛋白质 N 端和 C 端的两个多组氨酸序列，红色框表示 TEV 和肠激酶 (EK) 蛋白酶的切割位点，灰色框表示三个核定位信号 (NLS)，黑色框表示 FLAG 表位的三个重复，橙色框表示 e Sp Cas9 编码序列。下图显示了在用来自 IDT 或实验室纯化 (Lab) 的 RNPs 复合物 (无 Cas9、20 μ g Cas9/gRNA GFP2、40 μ g Cas9/gRNA GFP2、40、60 和 80 μ g Cas9/gRNA GFP2) 转染后 72 小时监测的表达 GFP 的 T. brucei 的荧光流式细胞术分析。（c）不再表达 GFP 的克隆中 GFP 基因的一部分的序列比较。该序列仅显示 GFP2 向导 RNA 所针对的区域。灰色框（H1 和 H2）突出显示可能用于 MMEJ 修复的同源区域。由实验室纯化的 Cas9 失活产生的序列和来自商业 Cas9 的序列分别标记为 Lab 和 IDT。下面显示了 Dc6 和 Ba10 克隆的相应色谱图（置信区间 95%— p 值样式：0.1234 (ns)；0.0332 (*)；0.0021 (**)；0.0002 (***)；< 0.0001 (****)）。
认知时间的大脑信号箭头
在发育中的人脑皮质中，神经发生的发生率特别缓慢，部分原因是皮质神经祖细胞在相对较长的时间内保存其祖细胞状态，同时产生神经元。对祖细胞和神经源性状态之间的这种平衡受到调节，以及它是否有助于物种特定的大脑时间模式，对此有鲜为人知的理解。在这里，我们表明，人类神经祖细胞（NPC）在祖细胞状态下生成神经元的特征潜力长时间需要淀粉样蛋白前体蛋白（APP）。相比之下，小鼠NPC中的APP是可分配的，该APP以更快的速度进行神经发生。从机械上讲，APP细胞自治通过抑制后尿激活蛋白的抑制作用，从而有助于神经发生 - 1转录因子和规范WNT信号传导的促进。我们建议，自我更新和差异之间的良好平衡受APP调节，这可能有助于神经发生的人类特定的时间模式。