蛋白质是各种细胞过程的关键参与者。作为细胞过程的最终执行者,它们在连接基因型和表型方面发挥着至关重要的作用。蛋白质表达和翻译后修饰(PTM)异常与癌症的发生和发展密切相关,它们携带着基因组学和转录组学无法获得的生物学信息1。蛋白质组学补充了基因组和转录组数据,从而能够全面分析癌症的发病机制并加速生物医学研究2。由于蛋白质定量仪器和方法的局限性,蛋白质组学的发展大大落后于基因组学和转录组学。幸运的是,基于质谱的蛋白质组学技术的最新进展大大增加了可定量的蛋白质数量(高分辨率)和可在合理时间范围内分析的样本数量(高通量)3。因此,现在可以大规模地进行全蛋白质组定量,从而能够以更高的统计意义进行蛋白质组表征、鉴定蛋白质组亚型以及发现潜在药物。我们指的是高分辨率、高通量
1 俄勒冈健康与科学大学皮肤病学系,美国俄勒冈州波特兰 97239;2 俄勒冈健康与科学大学 Knight 癌症研究所医学信息学和临床流行病学系生物信息学和计算生物学分部,美国俄勒冈州波特兰 97239;3 俄勒冈健康与科学大学俄勒冈临床和转化研究所,美国俄勒冈州波特兰 97339;4 俄勒冈健康与科学大学 Knight 癌症研究所细胞、发育和癌症生物学系,美国俄勒冈州波特兰 97239;5 俄勒冈健康与科学大学耳鼻喉科系,美国俄勒冈州波特兰 97239;6 退伍军人事务医疗中心手术护理分部,美国俄勒冈州波特兰 97239;7 俄勒冈健康与科学大学 Knight 癌症研究所血液学和医学肿瘤学分部,美国俄勒冈州波特兰 97239
在这里,我们报告了一名64岁有吸烟史的患者的案例,他们的投诉呼吸困难和慢性咳嗽六个月。肺功能测试证实了慢性阻塞性肺疾病(COPD)的诊断,并开始使用iPratropium的支气管扩张剂治疗。四个月后,随访时,患者报告说咳嗽和新发嘶哑的情况恶化。颈部的CT扫描显示左声带上有病变,柔性鼻咽镜检查证实了左声带肿瘤。进行了活检和选择性气管切开术,病理表明侵入性,中等分化的鳞状细胞癌。正电子发射断层扫描(PET-CT)扫描显示声带病变和双侧宫颈淋巴结中强烈的荧光脱氧葡萄糖(FDG)摄取,从而诊断为IV期淋巴结癌(T3N2CM0)。
摘要:口服鳞状细胞癌(OSCC)的进展和转移受到癌症干细胞(CSC)的高度影响,因为它们的独特自我更新和可塑性。在这项研究中,从GEO数据库中的单细胞RNA序列数据集(GSE172577)获得数据,并对1344 CSCS相关基因进行了Lasso-Cox回归分析,以建立一个六基因的预后签名(6-GPS),由AMP,POLR1D,PTGH1,PTH11,PT35A,p41,p41,pth5a,p4。高风险得分与不利的生存结果显着相关,这些特征在ICGC中得到了彻底验证。nom图,校准图和ROC曲线的结果证实了OSCC 6-GP的良好预后准确性。此外,ADM或POLR1D基因的敲低可能会显着抑制OSCC细胞通过JAK/HIF-1途径的增殖,迁移和侵袭。此外,通过压缩细胞周期蛋白D1,在G1阶段发生细胞周期停滞。总而言之,6-GP在OSCC的发生和开发中可能起着至关重要的作用,并且有可能作为OSCC的诊断,治疗和预后工具进一步发展。
液体活检是一种微创手术,它使用体液采样来检测和表征癌症指纹。这在肿瘤学上具有很大的潜力,但是与适当处理液体活检样本的挑战相关,需要解决以在患者护理中实施此类分析。因此,在这项研究中,我们对手术治疗的HNSCC患者(n = 152)和健康志愿者(n = 56)进行了对分析前条件的优化和CFDNA分数(浓度,长度,完整性评分)的详细表征。与健康对照组相比,我们观察到患者的CFDNA浓度明显更高(P <0.0001)和肿瘤切除后CFDNA浓度的时间依赖性降低。我们的结果还显示,健康志愿者(p = 0.04)和HNSCC患者(p = 0.000002),CFDNA浓度随着年龄的增长而显着增加。此外,考虑到HNSCC位置的众多位置,我们表明CFDNA浓度缺乏差异,具体取决于解剖位置。此外,我们在随访期间出现了更高的CFDNA长度(范围35-10380和500–10380 bp)的趋势。总而言之,我们的研究提供了HNSCC患者和健康对照组中CFDNA分数的广泛表征。这些发现指出在临床实践中实施液体活检时需要考虑的几个方面,包括:(i)上皮再生所需的时间,以避免虚假升高的CFDNA水平,而不是因活性癌而产生的CFDNA水平,(ii)与核酸相关的年龄相关的核酸积累,而在CFDNA和III较高的(III)中的较小范围内,核酸的较小范围伴随着(III)较高的患者(III)较高(III)较高的时间(III)。肿瘤坏死。
CRPC: castration-resistant prostate cancer, ESCC: esophageal squamous cell carcinoma, ES-SCLC: extensive-stage small cell lung cancer, NSCLC: non-small cell lung cancer, OVC: ovarian cancer, RCC: renal cell carcinoma, SCLC: small cell lung cancer, sqNSCLC: squamous non-small cell lung cancer,
图 1 RACGAP1 在 ESCC 中高度上调。(A、B)与健康组织相比,ESCC 组织中 RACGAP1 的 mRNA 表达显著上调,这由来自 GEO 的三个微阵列数据集(A)以及来自 TCGA 数据的 RNA-seq 数据(B)表明。(C)进行 QPCR 检测以验证 ESCC 组织(n=96)与邻近健康组织(n=20)相比 RACGAP1 mRNA 水平的上调。(D)Kaplan-Meier 曲线显示高 RACGAP1 表达组的总生存期 (OS) 时间明显较短。P 值由对数秩检验确定。(E)左图:Western blotting 检测显示 ESCC 组织中的 RACGAP1 蛋白水平高于匹配的邻近健康组织。右图:灰度分析的统计结果。P 值由配对 t 检验确定。***,P<0.001。
摘要非黑色素瘤皮肤癌 (NMSC)、基底细胞癌 (BCC) 和皮肤鳞状细胞癌 (cSCC) 是全世界最常见的恶性肿瘤,其患病率达到流行病的水平,全球发病率不断上升,同时发病率增加且治疗经济负担沉重。尽管 NMSC 是可治疗的癌症,转移率和死亡率较低,但一小部分患者会达到无法治愈的状态,成为晚期、无法切除或转移性癌症。直到最近几年,患有这些疾病的患者才被考虑接受姑息放射治疗和/或经典化学疗法,这些疗法的临床益处不大。基于对这些癌症发病机制的更好理解,新的靶向治疗方法已经开发出来。我们回顾了治疗侵袭性 BCC 和 cSCC 的新型系统方法,特别强调已获批准的靶向分子疗法和免疫疗法。
抽象目标:人乳头瘤病毒(HPV)是头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的危险因素,该癌症目前正在全球范围内增加。与45岁患者相比,HNSCC患者的HPV DNA和P16表达的患病率<45岁。方法:自2005年以来在贝斯卡孙大学医院出席的39名患者在这项回顾性研究中包括了HNSCC。HPV DNA,并使用石蜡嵌入的组织通过免疫组织化学确定p16表达。包括来自贝斯卡恩大学医院的38名45岁患者的匹配组。结果:HPV感染的总体患病率为11.7%。HPV16是4/39和5/38例患者中唯一检测到的基因型,而P16分别在6/39和4/38岁的患者中表达了<45岁和45岁。HPV16是4/39和5/38例患者中唯一检测到的基因型,而P16分别在6/39和4/38岁的患者中表达了<45岁和45岁。
口服鳞状细胞癌(OSCC)是最常见的头部和颈部肿瘤,占口腔恶性肿瘤的四分之二以上。全球发病率很普遍,每年报告450,000例和230,000例死亡,预后不良(1,2)。手术一直是OSCC的一线治疗,无论是早期还是晚期。但是,由于医疗资源有限,一些患者仍无法及时接受外科治疗(3)。OSCC的非手术治疗主要包括放疗,化学放疗和免疫疗法。尽管在OSCC的治疗中取得了重大进展,但大多数仍处于局部晚期阶段,预后较差,而5年的平均存活率小于50%至60%(4)。造成这种结果的主要原因之一是OSCC细胞逐渐抗当前可用的化学治疗药物(5)。因此,迫切需要新的治疗方法。