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催化无活性 CRISPR 的新兴应用-...
摘要 rRNA、tRNA、mRNA和非编码RNA等不同类型RNA的转录后调控广泛参与生理和疾病的发生发展。mRNA作为基因与蛋白质之间的中间产物，其可变剪接、可变多聚腺苷酸化和修饰等转录后调控影响其编码蛋白的表达和功能。然而，由于缺乏合适的RNA工程平台，RNA转录后调控的功能意义和治疗潜力尚未得到充分研究。2015年一种特异性靶向RNA模板的新型CRISPR-Cas系统CRISPR-Cas13的发现，赋予了CRISPR以高特异性靶向和编辑RNA的新作用，在一定程度上开启了RNA操作的新时代。本综述将总结催化无活性的CRISPR-Cas13系统（CRISPR-dCas13）在mRNA工程中的新兴应用，并强调CRISPR-dCas13系统在其他RNA修饰调控中的前景及其治疗潜力。
阿特拉托滑龟（Trachemys medemi，陆龟科）的完整线粒体基因组和系统发育分析
首次对 3 只巴西龟的线粒体基因组进行了测序和注释。线粒体基因组是一个环状 DNA 分子，大小为 16,711–16,810 bp，AT 含量为 60.9%。它包括 13 个蛋白质编码基因、2 个 rRNA 基因、22 个 tRNA 基因和非编码控制区。基因组组成以正 AT 偏斜（0.123）和负 GC 偏斜（-0.342）为特征。基于完整线粒体基因组（缺少一些巴西龟物种）的系统发育分析将 T. medemi 列为 T. venusta 的姐妹。来自同一数据集的系统发育分析，但包括大多数巴西龟物种可用的较短线粒体 DNA 信息，恢复出 T. medemi 是 T. dorbigni 的姐妹，而该进化枝是 T. venusta 、 T. yaquia 和 T. ornata 的姐妹。新获得的数据对于未来对巴西龟的线粒体基因组学研究很有价值。此外，我们的结果强调了分类单元抽样不完整的影响。
毒素 - 抗毒素基因在大肠杆菌中的大肠杆菌中差异表达，并在氮，脂肪酸或碳饥饿条件下培养的斑点突变
营养物质的可用性是调节细胞整个代谢的关键因素。因此，养分的缺乏激活了特定的适应机制。严格的反应是控制和调节细菌应力条件适应的基本机制之一。严格的响应效应子是特定的核苷酸，四磷酸鸟苷和五磷酸鸟苷，统称为（p）PPGPP。These nucleotides, in E. coli , are synthesized by RelA and SpoT proteins using two different pathways, where RelA produces (p)ppGpp in response to the presence of uncharged tRNA in the ribosomal A-site, during amino acid starvation, or in response to pyruvate depletion during fatty acid starvation ( Kushwaha et al., 2019 ; Sinha et al., 2019 ).另一方面，斑点负责响应葡萄糖或脂肪酸饥饿以及其他几种压力条件（Potrykus and Cashel，2008年），负责（P）PPGPP的积累。此外，斑点也充当A（P）PPGPP水解酶（Potrykus and Cashel，2008年）。
医学生物学口语考试题目清单
1 医学生物学作为一门科学，是生物学和遗传学史上的标志 2 细胞和人体的化学组成。生物分子中的化学键 3 生物聚合物、一般结构、脂质、多糖 4 蛋白质结构 5 蛋白质功能 6 原核细胞和真核细胞的结构 7 生物膜（结构、功能） 8 膜蛋白和膜转运 9 细胞器（概述、结构、功能） 10 细胞骨架系统 - 概述、中间丝 11 细胞骨架系统 - 微管、微丝 12 导致发现 DNA 作为遗传信息载体的实验 13 核酸结构 14 原核生物和真核生物基因组（特征和差异） 15 人类基因组的结构（组蛋白、核小体、染色质） 16 线粒体基因组 17 DNA 复制 18 原核生物和真核生物中 DNA 复制的比较 19 DNA 损伤的类型及其原因 20 DNA 修复机制（NER、BER、错配修复 21 DNA 双链断裂修复 22 染色体不稳定性和非整倍性 23 分子生物学的中心法则，原核和真核基因 24 RNA 分子的类型和转录的一般特征 25 原核生物的转录 26 真核生物的转录 27 真核生物的转录后修饰 28 RNA 编辑和逆转录 29 遗传密码 30 tRNA 和氨酰基-tRNA 合成酶，核糖体结构 31 翻译 32 翻译后修饰 33 蛋白质折叠和蛋白质降解，蛋白质分选 34 原核生物基因表达调控-操纵子模型，示例 35 真核生物基因表达调控（概述） 36 转录水平的调控，转录因子 37 转录后水平的表达调控（从细胞核输出，mRNA退化，非
改善MSC的治疗特征：细胞因子...
结果：我们的结果揭示了包括miRNA，PIRNA和TRNA在内的组中331个已知和441个新型SRNA的显着差异表达。值得注意的是，鉴定出SRNA表达模式的不同簇，特异性miRNA在HTLV-1和HTLV-2感染中显示出明显的上调或下调。基因本体分析表明，靶基因在转录调控和RNA结合过程中的显着参与，而KEGG途径分析突出了与癌症相关途径的富集以及Foxo，Ras和Mapk等信号级联的富集。网络分析确定关键miRNA，例如HSA-MIR-20B-5P和HSA-LET-7E-5P，是具有广泛相互作用的中央调节剂，这表明它们在HTLV感染的发病机理和免疫反应中的潜在作用。
宿主细胞残留 DNA 的提取和定量
为准备实验，将 100 μL 测试样品溶液加入 96 深孔板的孔中。加入 10 μL 稀释的 CHO DNA，使最终 DNA 含量分别为 100 pg、10 pg 和 1 pg。然后将 60 μL 蛋白酶 K 缓冲液和 10 μL 蛋白酶 K 加入孔中。为了将样品的盐浓度调整为 ~0.5 M NaCl，向每个样品中加入 10 μL 5 M NaCl。然后将板放入仪器中，在 56˚C 下放置 30 分钟，以允许蛋白酶 K 反应进行。经过蛋白酶 K 处理后，将板从仪器中取出。将裂解液（含有酵母 tRNA 和糖原）、磁性颗粒和结合溶液加入孔中。将板放回仪器中，自动进行 DNA 捕获、清洗和洗脱。用 200 μL 洗脱缓冲液洗脱 DNA。
反义寡核苷酸
核酸有两种形式：脱氧核糖核酸 (DNA) 和核糖核酸 (RNA)。RNA 的结构多种多样，可分为信使 RNA（mRNA，编码蛋白质）、非编码 RNA、转移 RNA (tRNA)、核糖体 RNA (rRNA) 和长链非编码 RNA (lncRNA) – DNA 是一种更稳定的分子 [1]。DNA 中的遗传信息编码为 RNA，即转录，然后翻译成蛋白质。由于蛋白质的作用机制和化学特性，大多数现有药物（如小分子和抗体）主要针对蛋白质。近年来，可结合信使 RNA (mRNA) 的化合物的使用引起了越来越多的兴趣，因为抑制蛋白质表达有助于控制炎症和肿瘤疾病的病程。该领域的两种主要治疗方法是抑制 mRNA 翻译的反义寡核苷酸 (ASO) 和通过 RNA 干扰 (RNAi) 途径发挥作用的寡核苷酸 [2]。
Lepidocephalichthys berdmorei 的完整线粒体基因组及其在鲡科（鲤形目）中的系统发育地位
本研究首次采用引物步移序列法测定了Lepidocephalichthys berdmorei的线粒体全基因组。该基因组全长16,574 bp，包括13个蛋白质编码基因（PCG），22个转移RNA（tRNA）基因，2个核糖体RNA（rRNA）基因和一个控制区（D-loop）。基因排列模式与其他硬骨鱼类相同。整体碱基组成为29.9％A，28.5％T，25.5％C和16.1％G，A+T偏向为58.4％。进一步，基于18种鲂科鱼线粒体基因组中的13个PCG，采用3种不同的方法（邻接法、最大似然法和贝叶斯推断）进行系统发育分析。所有方法一致表明鳞头鱼属的四个物种形成一个单系群。本研究将为鳞头鱼物种提供有效的分子信息，并为物种鉴定研究提供新的遗传标记。
野生葡萄藤的质体基因组学（Vitis Vinifera subsp。...
种类葡萄葡萄（常见的葡萄）分为两个子种：Vitis Vinifera subsp。vinifera（培养的葡萄）和Vitis Vinifera subsp。sylvestris（野葡萄）。Vitis Vinifera subsp。Vinifera广泛用于餐桌水果，并作为生产与葡萄相关饮料的主要来源，包括葡萄酒和醋。野葡萄（Vitis Vinifera subsp。sylvestris）引起了人们的极大兴趣，因为它们被认为是培养品种的祖细胞，并且是一般理解葡萄树驯化过程的关键。为了解锁葡萄藤驯化的分子机制，基于基因组的研究被广泛进行。在这项研究中，两个格鲁吉亚野生葡萄树样品的完整叶绿体基因组受到光照射测序和计算机基因组组装，然后进行基因注释。根据结果，每个分析的叶绿体基因组的长度为160.928 bp，共有128个基因（83个蛋白质编码，37个tRNA，8 rRNA），属于遗传上独特的“ rkatsiteli'rkatsiteli'haplotype（AAA）。一项比较基因组研究揭示了叶绿体基因组中某些插入和SNP的存在。
一种遗传的mtDNA突变重塑巨噬细胞和体内炎症细胞因子反应
巨噬细胞中线粒体生物能的受损可能会驱动高炎性细胞因子反应1-6，但是是否也可能是由遗传的mtDNA突变引起的。在这里，我们使用一种多摩变方法来解决这个问题，该方法将超分辨率成像和代谢分析整合到来自丙氨酸7的线粒体trNA中异质质突变（M.5019a> g）的线粒体疾病的小鼠模型中的巨噬细胞。这些M.5019a> G巨噬细胞在呼吸链复合物中表现出缺陷，并且由于中骨内部翻译减少而导致氧化磷酸化（OXPHOS）。以适应这种代谢应激，线粒体融合，还原性谷氨酰胺代谢和有氧糖酵解均增加。在炎症激活后，I型干扰素（IFN-I）释放得到增强，而在M.5019a> G巨噬细胞中限制了促炎性细胞因子和黄磷脂的产生。最后，使用M.5019a> G小鼠的体内内毒素性模型显示IFN-I水平和疾病行为升高。总而言之，我们的研究确定了响应致病性mtDNA突变的先天免疫信号传导的意外失衡，对MTDNA疾病患者的病理发展具有重要意义。8。