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2brad-M揭示了癌性卵巢组织和良性卵巢组织之间微生物分布的差异
卵巢癌的发展与各种因素，例如环境，遗传和微生物学因素密切相关。在先前的研究中，通过16S rRNA测序在人类肿瘤中鉴定出细菌。但是，肿瘤组织中的微生物生物量太低，无法通过16S rRNA测序准确地识别。在我们的研究中，我们采用了2 brad测序对微生物组（2brad-M），这是一种新的测序技术，能够准确地表征低生物质微生物组（细菌，真菌和古细菌）在物种分辨率上。在这里，我们调查了20个卵巢样品，包括10个卵巢癌样品和10个良性卵巢样品。测序结果表明，两组中总共确定了373种微生物物种，其中两组共有90种。元数据表明，卵巢癌组织中增加了chlamydophila_abortus和cag-873_sp900550395 corynebacterium_ kefirresidentii，corynebacterium_sp000478175，brevibacillus_d_fluminis，ralstonia_sp000620465和ralstonia_mannitolilytica在良性卵巢组织中更丰富。这是首次使用2Brad-M技术来提供重要的提示，以更好地理解卵巢癌微生物组。
微生物群对牙周组织炎症性疾病发生发展的影响
口腔器官和组织功能的一个重要特征是，其中发生的所有过程都是在各种微生物的不断存在下进行的，这些微生物会导致体内病理过程的发展或与之相关。在慢性全身性牙周炎的发病机制中，牙菌斑穿透牙龈沟底部，渗透到上皮下方进入结缔组织基质，引起其炎症。细菌会产生多种对周围组织有毒性作用的毒性物质。大多数细菌会产生链状脂肪酸，抑制白细胞和吞噬细胞的趋化作用。厌氧菌和螺旋体会分泌多种对大多数组织具有极大毒性的物质（丙酸和吲哚）。牙周组织中的炎症是由牙菌斑生物膜的微生物群引起的。随着牙周炎的发展，牙龈卟啉单胞菌、中间卟啉单胞菌和福赛丝菌的数量增加了100多倍。因此，给出的数据证明，在牙周组织炎症过程的发展和过程中，涉及复杂的菌群失调和组织-细胞相互作用，其动态平衡取决于其结果。
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Testis Epididymis Vas deferens Samples 117 103 84 Expressed genes 20,222 20,376 19,063 eQTL 15,642 4,768 4,211 eGenes 11,164 4,347 3,889 eGenes with >1 eQTL 3,647 402 310 eVariants 3,687,265 925,916 673,696个剪接基因14,243 13,558 12,332 SQTL 11,450 3,165 1,920 Sgenes 7,000 2,662 1,718
使用双堆积毛细管电泳-质谱法定量分析异质组织中的药物分布
图 2 LDMS 预浓缩/分离过程机理以及 LDMS-CE-TOF/MS 和 TQ/MS 的分析结果。 (a) 通过扫描和 AFMC 对样品溶液中的 DXd 进行预浓缩。 由于双堆积机制，DXd 被精确聚焦并与生物基质分离。 (b) 普通 CE-TQ/MS（未经任何预浓缩，1 μ M DXd）和 LDMS-CE-TQ/MS（1 nM）的提取离子电泳图；灵敏度提高了 1000 倍。 (c) 对与小鼠肝匀浆混合的 10 nM DXd 和 10 nM MMAE 进行 LDMS-CE-TOF/MS 分析。 DXd 和 MMAE 成功聚焦并与代谢物分离。 (d) LDMS-CE-TQ/MS 分析后的峰面积校准曲线。 R 2 超过 0.999，LOQ 为 420 fM（420 zmol，S/N = 10）。（e）2 pM DXd 与 100 pM DXd- d 5 和小鼠肝匀浆混合的 LDMS-CE-TQ/MS 分析。成功检测到 DXd，峰面积 RSD 为 7.1%，定量准确度为 110%。
体液中的重金属汞与组织和糖尿病之间的关联：系统评价和荟萃分析
糖尿病是一种代谢疾病，其特征是慢性高血糖，胰岛素分泌不足或对胰岛素受体不敏感。国际糖尿病联合会（IDF）于2021年12月6日在其网站上发布了其“ IDF糖尿病图集”的第10版，统计数据显示，2021年，全球约有5.37亿成年人，大约有20至79岁的成年人，或者有10人中的一人可能患有糖尿病（1）。到2023年，糖尿病患者的总数预计将达到6.43亿，到2045年（1）将达到7.83亿。糖尿病风险因素的探索和干预是减少糖尿病发生率的关键。糖尿病的已知危险因素包括遗传易感性，老年，肥胖，缺乏体育锻炼，环境化学物质等。（2）。最近，环境化学物质正在受到越来越多的关注（2-4）。人类因环境污染而暴露于多种金属物质。他们在行业，家庭，农业，医学和技术中的多个应用导致了它们在环境中的广泛分布（5,6）。大多数国家都限制了随着工业化的发展，环境中有危险的重金属水平；但是，不可避免的是，人们会通过食物，饮用水和周围的空气暴露于他们（7-9）。
用于模拟心脏病的工程人体心脏组织
心脏病是全球范围内死亡率和发病率都很高的主要致命疾病之一。人们已经使用了多种模型系统（例如原代细胞和动物）来了解心脏病和建立适当的治疗方法。然而，它们在重现疾病病理生理学和评估药物反应方面的准确性和可重复性存在局限性。近年来，利用组织工程技术和人体细胞制作的三维 (3D) 心脏组织模型的表现优于传统模型。特别是，细胞重编程技术与生物工程平台（例如微流体、支架、生物打印和生物物理刺激）的整合促进了心脏芯片、心脏球体/类器官和工程心脏组织 (EHT) 的发展，以重现天然人类心脏的结构和功能特征。这些心脏模型改进了心脏病建模和毒理学评估。在本文中，我们总结了用于制作心脏组织模型的细胞类型，介绍了各种 3D 人体心脏组织模型，并讨论了提高其复杂性和成熟度的策略。最后，回顾了各种心脏疾病建模的最新研究。[BMB Reports 2023; 56(1): 32-42]
硫化氢在哺乳动物细胞，组织和器官中的生理作用
H 2 S现在被认为是多种哺乳动物细胞和组织中的内源性生理调节剂。Produced, in a regulated and cell type-dependent manner, by three major enzyme systems, cystathionine c -lyase (CSE), cystathio- nine b -synthase (CBS), and 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase (3-MST), H 2 S is present intra- and extracellularly and interacts with proteins, DNA, and other members of the reactive species interactome （例如，氧和氮衍生的氧化剂和自由基）并在各种目标和途径上发挥作用。H 2 S的生理作用在基因转录和翻译，细胞生物能学和代谢，血管张力和免疫功能中的调节中得到充分认识，在中枢神经系统和周围神经系统的各种功能以及与生理学家和临床医生相关的许多其他领域的调节中。本综述对H 2 S在哺乳动物细胞和器官中的生理调节作用进行了全面概述。在生理状况下对这些作用的理解以及对H 2 S稳态的扰动的日益了解（例如，血管疾病，血管疾病，代谢性疾病，各种形式的中枢神经系统疾病，各种形式的中枢神经系统疾病，对跨性别疾病的疾病，其他机构的疾病以及其他机理疗法的诊断和诊断的新机会。在这种情况下，基于H 2 s的替换（通过H 2 s-释放的小分子）的新型实验治疗方法已经出现，并正在转化为临床竞技场。在本综述中突出显示，由于生物合成和/或降解增加，在某些疾病中，H 2 S水平在病理上降低了（例如，再灌注损伤，动脉粥样硬化，动脉粥样硬化以及许多其他形式的血管疾病，以及衰减）。在其他疾病（例如，各种形式的炎症，唐氏综合症和癌症）中，H 2 S水平增加，并且抑制H 2 S产生酶正在作为一种实验性治疗方法出现。进一步了解H 2 S的生理调节作用，再加上旨在调节H 2 S稳态的小分子的药理学和翻译科学的进步，预计将来会产生新颖的诊断和临床疗法方法。
大豆六种组织中可及染色质区域的鉴定
可及染色质区域 (ACR) 与基因组中的基因表达紧密相关。保守的非编码顺式调控元件，如转录因子结合基序，通常存在于 ACR 中，表明 ACR 在植物基因组结构中起着重要的调控作用。然而，关于大豆 ACR 的研究很少，尤其是针对特定组织的研究。因此，在本研究中，我们利用便捷的 ATAC-seq，鉴定了六种大豆组织中的 ACR，包括根、叶芽、花、花芽、发育中的种子和豆荚。总的来说，ACR 约占整个大豆基因组的 3.3%。通过整合 RNA 测序和转录因子 (TF) ChIP-seq 的结果，发现 ACR 与大豆中的基因表达和 TF 结合能力紧密相关。总之，这些数据提供了对大豆 ACR 基因组特征的全面了解。作为重要基因组资源的集合，这些处理后的数据可在 datahub.wildsoydb.org 上获取。
利福昔明调节雄性大鼠大脑和外周组织中 TRH 和 TRH 样肽的表达
摘要背景：背迷走神经复合体神经元内的 TRH/TRH-R1 受体信号通路是脑肠轴的重要介质。心理健康和对各种神经病变（如自闭症、注意力缺陷多动障碍、阿尔茨海默病和帕金森病、重度抑郁症、偏头痛和癫痫）的预防都受到肠道微生物群的影响，并由迷走神经介导。抗生素利福昔明 (RF) 不会穿过肠血屏障。它改变了肠道微生物群的组成，从而对旅行者腹泻、肝性脑病和前列腺炎具有治疗作用。 TRH 和 TRH 样肽的结构为 pGlu-X-Pro-NH 2 ，其中“X”可以是任何氨基酸残基，具有增强生殖、限制热量、抗衰老、胰腺 β 细胞、心血管和神经保护作用。TRH 和 TRH 样肽不仅存在于整个中枢神经系统，还存在于外周组织中。为了阐明 TRH 样肽在脑-肠-生殖系统相互作用中的作用，将 16 只雄性 Sprague–Dawley 大鼠（203 ± 6 克）分成 4 组（n = 4/组）：对照组（CON）继续随意进食 Purina 啮齿动物饲料和水 10 天直至断头；急性组（AC）连续 24 小时接受 150 毫克 RF/kg 粉状啮齿动物饲料，为 200 克大鼠提供 150 毫克 RF/kg 体重；慢性组（CHR）动物接受 RF 10 天；戒断组（WD）大鼠接受 RF 8 天，然后接受正常饲料 2 天。结果：响应 RF，整个大脑和外周组织中的 TRH 和 TRH 样肽水平发生显著变化。 RF 治疗导致脑内 TRH 和 TRH 样肽水平发生显著变化的部位数量，按降序排列为：延髓 (16)、梨状皮质 (8)、伏隔核 (7)、额叶皮质 (5)、纹状体 (3)、杏仁核 (3)、内嗅皮质 (3)、前扣带回 (2) 和后扣带回 (2)、海马 (1)、下丘脑 (0) 和小脑 (0)。外周组织相应的排序为：前列腺 (6)、肾上腺 (4)、胰腺 (3)、肝脏 (2)、睾丸 (1)、心脏 (0)。结论：TRH 和 TRH 样肽表达对 RF 治疗的敏感性，特别是在延髓和前列腺中，与这些肽参与 RF 的治疗作用一致。关键词：TRH、利福昔明、延髓、皮质、前列腺、肾上腺
在具有可逆开口顶部的微流控芯片中生成和培养心脏微组织可实现电起搏、动态药物给药和内皮细胞共培养
心血管疾病的发病率在世界范围内不断上升。器官芯片和人类多能干细胞 (hPSC) 技术有助于克服心脏体外模型中的一些局限性。本文介绍了一种双室单片心脏芯片装置，该装置可在单个制造步骤中实现多孔膜集成。此外，该装置包括开放式隔间，可轻松将 hPSC 衍生的心肌细胞和人成体心脏成纤维细胞共培养成几何定义的心脏微组织。该装置可以用玻璃密封或带有完全定制的 3D 打印热解碳电极的盖子可逆地关闭，从而可以对心脏微组织进行电刺激。下方的微流体通道允许对心脏微组织进行局部和动态药物给药，如对异丙肾上腺素的变时性反应所示。此外，微流体通道还可以填充人类诱导多能干细胞衍生的内皮细胞，从而允许在一个装置中共培养异型心脏细胞。总体而言，这项研究展示了一种新型心脏芯片模型，该系统将开放式顶部装置与 3D 打印碳电极系统地集成在一起，用于电起搏和心脏组织培养，同时实现主动灌注和动态药物给药。人类心脏芯片模型工程方面的进步代表着将器官芯片技术作为临床前心脏药物开发的常规方面迈出了重要一步。