摘要:先前已使用基于CRISPR的诱变方法获得了厌氧甲基菌质细菌中的靶向突变。在这项研究中,将来自Callanderi的RELB家庭毒素放置在甲型苯乙烯敏感启动子的控制之下,形成可诱导的反选择系统。该诱导系统与非复制性整合诱变载体相结合,以在limosum b2的Eubacterium B2中创建精确的基因缺失。这项研究中针对的基因是编码组氨酸生物合成基因HISI,甲醇甲醇转移酶和类cor我蛋白MTAA和MTAC的基因,以及编码MTTB-氨基甲基转移酶的MTCB,先前显示出MTTB-FAMILY甲基转移酶。HISI内的有针对性的缺失带来了预期的组氨酸成可营养,MTAA和MTAC的缺失都废除了甲醇的自养生长。MTCB的缺失被证明是消除了Limosum在L-肉碱上的生长。 在隔离转化菌落的初始选择步骤之后,仅需要一个单个诱导步骤才能获得所需靶标的突变菌落。 可诱导的反选择标记和非复制综合质粒的组合可以快速地编辑大肠杆菌。MTCB的缺失被证明是消除了Limosum在L-肉碱上的生长。在隔离转化菌落的初始选择步骤之后,仅需要一个单个诱导步骤才能获得所需靶标的突变菌落。可诱导的反选择标记和非复制综合质粒的组合可以快速地编辑大肠杆菌。
霉菌毒素是真菌的有害毒性代谢产物,以污染物形式存在于许多食品、乳制品和农产品中,对健康构成潜在危害。因此,降低其生物利用度的新型净化方法对提高人类安全具有重要意义。近年来,已经开发出生物方法来控制霉菌毒素污染。利用微生物降解霉菌毒素(尤其是黄曲霉毒素 (AF),由曲霉属物种产生,主要是寄生黄曲霉、黄曲霉和黄曲霉)是一种重要的生物基方法,可降低食品中的霉菌毒素含量,且不会产生有害中间体和副产物。许多研究报告称,解毒是通过将霉菌毒素与微生物的细胞壁结构结合而发生的。解毒过程涉及多种因素,包括微生物菌株、毒素类型、微生物浓度、微生物活力和接触时间。本综述主要讨论了益生菌对霉菌毒素进行生物净化的现有文献,描述了此类过程中涉及的解毒机制以及影响相互作用稳定性的因素。还报告了该领域的未来前景。根据目前的数据,人们应该能够选择最有效的微生物来降解浓度范围广泛的霉菌毒素。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年2月27日发布。 https://doi.org/10.1101/2022.08.08.503143 doi:Biorxiv Preprint
摘要:在纳米药物递送载体的进化过程中,主动靶向已成为一个重要里程碑,它超越了现有的被动靶向能力,提高了药物在组织和细胞类型中的选择性积累。在各种主动靶向部分中,蝎子提取的肽氯毒素表现出良好的肿瘤细胞积累和选择能力。肺癌是男性和女性癌症相关死亡的主要原因之一,因此出现了利用纳米技术进行药物递送的新型治疗方法。鉴于氯毒素具有良好的生物活性,我们探索了其对抗肺癌的潜力及其对这种癌症肿瘤细胞的主动靶向作用。我们的分析表明,尽管氯毒素对胶质母细胞瘤的研究非常广泛,但使用该分子治疗肺癌的研究仍然有限,尽管早期取得了一些令人鼓舞的成果。
总合成的简短历史。当弗里德里希·沃勒(FriedrichWöhler)首先偶然地发现了一种在1828年不使用生物体中的过程而合成尿素的方法时,化学领域永远改变。1通过反驳生命力理论,该理论是由JönsJacob Berzelius在1809年创建的,并指出,只能通过在生物中使用“生命力”来创建有机化合物,科学家现在有动力发现新的方法可以在先前在自然界中发现的实验室中创建各种化学品。2来自19世纪的一个值得注意的例子是赫尔曼·科尔贝(Hermann Kolbe)的乙酸的合成。从二硫化碳中的这种看似简单的分子的合成标志着合成化学史上的重要时刻。虽然尿素是一种简单的含碳的分子,但乙酸的产生首先证明了产生碳碳键的生存能力。3在同一世纪,可能合成的化合物的复杂性进一步扩展,最著名的是Fischer在1890年的葡萄糖合成。4
摘要 当细菌细胞接触时,通常会通过毒素传递介导拮抗作用。此类接触对受体细胞产生长期有益影响的可能性尚未得到研究。在这里,我们研究了 DddA 中毒的影响,DddA 是一种胞嘧啶脱氨酶,通过伯克霍尔德菌的 VI 型分泌系统 (T6SS) 传递。尽管 DddA 具有杀灭潜力,但我们观察到几种细菌对 DddA 有抵抗力,反而会积累突变。这些突变可导致获得抗生素耐药性,这表明即使在没有杀灭的情况下,细菌间拮抗作用也会对目标群体产生深远影响。对脱氨酶超家族中其他毒素的研究表明,诱变活性是这些蛋白质的共同特征,包括我们展示的代表性毒素,它以单链 DNA 为目标,并显示出明显不同的结构。我们的研究结果表明,细菌间拮抗相互作用的一个令人惊讶的结果可能是通过直接诱变毒素的作用促进适应。
摘要伤寒毒素是伤寒沙门氏菌(人类伤寒的病因)的重要毒力因子。这种毒素具有不寻常的生物学特性,因为它仅在宿主细胞内时才由伤寒沙门氏菌产生。一旦合成,毒素就会分泌到含有沙门氏菌的液泡腔中,然后通过囊泡载体中间体将其运输到细胞外空间。在这里,我们报告了伤寒毒素分选受体和细胞机制成分的鉴定,这些细胞机制将毒素包装到囊泡载体中并将其输出到细胞外空间。我们发现阳离子非依赖性甘露糖-6-磷酸受体充当伤寒毒素分选受体,并且外壳蛋白 COPII 和 GTPase Sar1 介导其包装到囊泡载体中。伤寒毒素携带者的形成需要伤寒沙门氏菌所含液泡的特定环境,而该环境由其 III 型蛋白分泌系统的特定效应物的活动决定。我们还发现 Rab11B 及其相互作用蛋白 Rip11 控制伤寒毒素携带者的细胞内运输,以及 SNARE 蛋白 VAMP7、SNAP23 和 Syntaxin 4 控制其与质膜的融合。伤寒毒素选择特定的细胞机制将其运输到细胞外空间,这说明了外毒素在细胞内病原体环境中发挥其功能的显著适应性。
蓝藻是唯一能够进行产氧光合作用的原核生物,是重要的初级生产者,在农业、水生生态和环境保护领域发挥着关键作用。它们多功能的代谢使它们成为各种生物技术应用的有趣候选者。最近,通过基于 CRISPR 的方法的发展,它们的基因操作领域取得了巨大进展。然而,大多数可用的质粒都很难操作,这使得它们的使用具有挑战性。在本研究中,我们使用 CcdB 毒素作为选择标记来改进用于蓝藻基因组编辑的基于 Cpf1 的质粒。我们的结果表明,这种选择提高了质粒构建的成功率,从而提高了基因组编辑的成功率。
摘要:赭曲霉毒素 A (OTA) 是一种众所周知的霉菌毒素,广泛分布于食品和饲料中。真菌基因组测序对于识别已知和新化合物的次级代谢物基因簇非常有用。对 A. steynii、A. westerdijkiae、A. niger、A. carbonarius 和 P. nordicum 中 OTA 生物合成簇的比较分析表明,在五个结构基因 (otaA、otaB、ota、otaR1 和 otaD) 中,OTA 簇的组织具有高度的同源性。此外,最近对黑曲霉 OTA 产生菌进行的详细比较基因组分析发现了一个环化酶基因 otaY,它位于 otaA 和 otaB 基因之间的 OTA 簇中,编码的预测蛋白质与 SnoaL 的结构域高度相似。这些蛋白质已被证明能催化链霉菌中产生的聚酮抗生素生物合成中的闭环步骤。在本研究中,我们证明了在 OTA 允许条件下 A. carbonarius 中环化酶基因的上调,这与其他 OTA 簇基因的表达趋势及其在 OTA 生物合成中的作用一致,即通过完全基因缺失。我们的研究结果首次指出了环化酶基因参与了 OTA 生物合成途径。它们代表着对 A. carbonarius 中 OTA 生物合成分子基础的理解向前迈出了一步。