许多蛋白质家族由多种高度同源蛋白组成,无论它们是由不同基因编码还是来自相同基因组位置的编码。某些同工型的优势与各种病理状况(例如癌症)有关。研究中蛋白质同工型的检测和相对定量通常是通过免疫印迹,免疫组织化学或免疫荧光来完成的,其中使用针对特定家族成员的同工型特异性表位的抗体。但是,同工型特异性抗体并非总是可用的,因此无法破译同工型特异性蛋白表达模式。在这里,我们描述了多功能11氨基酸标签的插入到感兴趣蛋白质的基因组位置中。此标签是开发的,由Promega(美国威斯康星州Fitchburg)发行。本协议描述了高度同源蛋白的精确蛋白质表达分析,通过hibit标签的表达,当缺失特定抗体时,可以实现蛋白质表达定量。可以通过传统方法(例如蛋白质印迹或免疫荧光)以及在荧光素酶二元报道器系统中分析蛋白质表达,从而可以使用板读取器进行可靠且快速的相对表达定量。
全球大流行很可能是通过人畜共患病传播到人类的,其中呼吸道病毒感染与粘膜系统相关的气道。在已知的大流行中,五个是由包括当前正在进行的冠状病毒2019(Covid-19)在内的呼吸道病毒引发的。在疫苗开发和治疗剂中的惊人进步有助于改善传染剂的死亡率和发病率。然而,生物体复制和病毒通过粘膜组织传播,不能由肠胃外疫苗直接控制。需要一种新型的缓解策略,以引起强大的粘膜保护并广泛中和活动以阻碍病毒进入机制并抑制传播。本综述着重于口腔粘膜,这是病毒传播的关键部位,也是引起无菌免疫力的有希望的靶标。除了审查人畜共患病毒病毒和口腔粘膜组织发起的历史大流传学外,我们还讨论了口服免疫反应的独特特征。我们解决了与开发新型治疗剂有关以在粘膜水平引起保护性免疫的障碍和新的前景,以最终控制传播。
在水稻培养中,半枯萎和粘性质地的特征分别是优化产量潜力和晶粒质量的关键。Xiangdaowan(XDW)大米以其出色的芳香特性而闻名,由于其高的身材和高淀粉糖含量而面临挑战,导致住宿耐药性不佳和次优烹饪属性。为了解决这些问题,我们采用了CRISPR/CAS9技术来精确地编辑XDW大米中的SD1和WX基因,从而发展具有所需半昏迷和麸质特征的稳定的遗传纯合线。SD1-WX突变型线表现出降低的gibberellin含量,植物高度和淀粉糖含量,同时保持了几乎不会改变发芽率和其他关键的农艺性状。重要的是,我们的研究表明,外源性GA 3的应用通过补偿内源性Gibberellin的缺乏有效地促进了生长。基于此,开发了半昏昏欲睡的精英大米(Oryza sativa L.)线,对大多数农艺性状没有太大影响。此外,比较转录组分析揭示了差异表达的基因(DEG)主要与膜的锚定成分,过氧化氢分解代谢酶分解代谢酶活性,过氧化物酶活性,萜烯合酶活性和寄生虫相关。此外,将二萜类化合物的生物合成催化为gibberellins的生物合成富集并显着下调。这项全面的研究提供了一种有效的方法,可以同时提高水稻植物的身高和质量,为耐药和高质量的水稻品种的发展铺平了道路。
疫苗是最有价值的人类健康技术之一。从18世纪的爱德华·詹纳(Edward Jenner)对Cowpox进行的Variolation实验,再到乔纳斯·萨克(Jonas Salk)开发脊髓灰质炎的整个病原体疫苗的努力,疫苗研究产生了一些历史上最重要的医疗突破。疫苗刺激针对特定病原体的免疫反应,它必须包含与该病原体有关的抗原。第一代疫苗通常由活或灭活的整个病原体组成。尽管其历史上的成功并广泛采用,但整个病原体疫苗在包含无关紧要的和潜在有害的病原体成分时仍引起了安全问题。他们也可以复制或恢复为致病形式(1)。亚基疫苗仅包含刺激免疫反应所需的病原体的最小成分,例如重组蛋白。这些技术改善了疫苗的安全性(2)。然而,在刺激免疫反应时,亚基疫苗本质上比整个病原体疫苗的效力较低。由于这种限制,它们通常包含额外的免疫刺激分子(称为佐剂)来发展保护性免疫(2)。其他最近的疫苗技术包括病毒载体和基于核酸的疫苗,该疫苗编码致病性抗原
三十多年来,农杆菌介导的转化技术一直用于树果作物的基因工程。尽管在草本植物和一年生植物的水平上利用这项技术仍然存在许多障碍,但该领域已经取得了很大进展(Song 等人,2019 年)。在本研究主题的第二卷中,有论文描述了不同研究小组正在采取的方法,以促进难处理的树种的遗传转化,并在更基本的层面上了解 T-DNA 插入宿主细胞基因组的机制。在一项优雅的研究中,Gelvin 等人研究了 T 环的形成作为理解 T-DNA 整合的代理。在这项工作中,从转基因植物本氏烟或拟南芥中形成的 T 环中详细描述了与 LB-RB 连接相关的区域。结果表明,T 环中的 RB-LB 连接类似于 T-DNA 和发生整合的植物 DNA 之间的连接。相似之处包括:与 RB 相比,LB 处的缺失频率更高且序列变化更为广泛;连接位点存在微同源性;存在来自农杆菌或植物基因组的填充 DNA;多个 T-DNA 拷贝的多联体组织,其中 RB-RB 和 LB-LB 连接比 RB-LB 连接更常见。此外,作者还表明,T 环的形成即使在农杆菌 VirD2 基因中没有 Ku80 和 w 突变的情况下也能进行,其影响与对 T-DNA 整合的影响相似。根据他们的数据,作者提出 T 环的形成可用于研究 T-DNA 整合到宿主基因组的所有方面。大多数关于柑橘转化的已发表研究都仅使用了少数相对容易转化的品种的材料(Song 等人,2021 年)。 TAMU 的 Mandadi 团队(Dominguez 等人)开发了一种方法,可以促进 14 种柑橘品种的转化。他们通过在转化方案中使用的培养基中添加亚精胺和硫辛酸等补充剂,并使用含有额外 VirG 和 VirE 基因拷贝的辅助质粒 pCH32 来实现这一点。
无义介导的 mRNA 衰变 (NMD) 是一种真核 RNA 衰变途径,在细胞应激反应、分化和病毒防御中发挥作用。它在基因表达的质量控制和转录后调控中发挥作用。NMD 也已成为癌症进展的调节剂,尽管现有证据支持其既是肿瘤抑制因子又是促肿瘤发生因子,具体取决于模型。为了进一步研究 NMD 在癌症中的作用,我们在 HT1080 人纤维肌瘤细胞系中敲除了 NMD 因子 SMG7,从而抑制了 NMD 功能。然后,我们比较了亲本细胞系、SMG7 敲除细胞系和我们重新引入 SMG7 两种亚型的拯救细胞系的致癌特性。我们还测试了一种抑制 NMD 因子 SMG1 的药物的效果,以区分 NMD 依赖性效应和假定的 NMD 非依赖性 SMG7 功能。使用基于细胞的分析和小鼠异种移植肿瘤模型,我们发现抑制 NMD 功能会严重损害致癌表型。分子通路分析表明,抑制 NMD 会大大降低基质金属蛋白酶 9 (MMP9) 的表达,而 MMP9 的重新表达会部分挽救致癌表型。由于 MMP9 促进癌细胞迁移和侵袭、转移和血管生成,其下调可能有助于降低 NMD 抑制细胞的致瘤性。总之,我们的结果凸显了 NMD 抑制作为一种治疗方法的潜在价值。
众所周知,宿主对CMV感染的免疫反应主要由细胞介导的免疫(CMI)介导,并且CMI会限制CMV感染重新激活的风险。对CMV的免疫缺陷或该生物的原发性感染或继发感染是导致先兆子痫中CMV感染的发育或重新激活的原因,目前尚不清楚。Quantiferon -CMV(QF -CMV)测试是一种识别CMV特异性CD8+ T细胞患者的体外方法。在该测定中,评估了主要由CMV抗原刺激的CD8+ T细胞产生的特定干扰素− -Gamma(IFN -γ)。[13,14]值得注意的是,此方法对CMI监测的准确性和功效已被证实。[15,16]据我们所知,这项调查是评估CMV相关的CMI和先兆子痫之间的关联的首次尝试。然而,调查调查调查CMV感染与先兆子痫之间的关系导致数据矛盾。
文章标题:综述:真菌细胞中的 CRISPR/Cas12 介导的基因组编辑:植物真菌病理学的进展、机制和未来方向 作者:Chiti Agarwal[1] 所属机构:华盛顿州立大学 [1] Orcid ids:0000-0003-4125-2880[1] 联系电子邮件:chiti.agarwal@gmail.com 许可信息:本作品已根据知识共享署名许可 http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ 以开放获取的方式发表,允许在任何媒体中不受限制地使用、分发和复制,只要对原始作品进行适当的引用。条件、使用条款和出版政策可在 https://www.scienceopen.com/ 上找到。预印本声明:本文为预印本,尚未经过同行评审,正在考虑并已提交给 ScienceOpen Preprints 进行开放同行评审。 DOI:10.14293/PR2199.000129.v2 预印本首次在线发布时间:2023 年 6 月 8 日 关键词:CRISPR、CRISPR/Cas12、真菌病原体、植物病原体
抽象的碳酸酐酶12被认为是癌细胞中的致癌和酸性微环境因子。为了验证组胺信号作为抗癌信号的作用,我们确定了CA12及其相关的碳酸氢盐转运蛋白的作用。在这项研究中,组胺刺激介导了CA12在肺癌细胞中的错误定位。组胺受体激活介导的Ca12内吞作用和pH值通过CAMKII抑制恢复。CA12相关的AE2表达增强了,而NBCN1表达及其活性通过组胺刺激降低。组胺受体激活介导的酸化是通过内部化的CA12和NBCN1诱导的,同时通过增强的AE2表达来增加碳酸氢盐外排。抑制bafilomycin对蛋白质运输的抑制作用恢复了Ca12和AE2局部性,并减少了细胞酸中毒。因此,我们验证了组胺刺激诱导的酸性场景 - 揭示了CA12及其相关的碳酸氢盐转运蛋白在肺癌细胞中的运输及其相关的碳酸氢盐转运蛋白及其失调的pH调节可能与组胺信号信号介导的介导的抗癌抗癌过程有关。
结果和讨论:在总共617个共培养Calli中,21(3.4%)再生芽表现出三种不同的表型:白化,嵌合和浅绿色;与野生型非转化的再生芽相比。在白化芽中,总叶绿素含量大大降低,并且在嵌合芽中显着降低。在六个CAS9基因确认的再生芽中,两种芽表现出由于插入/缺失(Indels)和ACPDS靶点位置和周围的基于替代的突变而引起的白化表型。深度扩增子测序显示两个SGRNA之间的indel频率显着,范围从1.2%到63.4%,以及53.4%的替代频率。ACPDS基因的突变产生了可检测到的白化病表型,因此确定了ACPDS基因的成功编辑。这是第一次在洋葱中成功建立了CRISPR/CAS9介导的基因组编辑方案,而ACPD基因作为一个例子。这项研究将为研究人员提供进一步的洋葱基础研究和应用研究的必要动力。
