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World File Search System代谢物
代谢物：宿主和微生物的融合节点，以解释荟萃生物
涵盖宿主和常驻微生物群的元原则在对抗疾病和应对压力方面起着重要作用。 因此，越来越多的牵引力来建立有关该生态系统的知识基础，尤其是表征宿主与微生物群之间的双向关系。 在这种情况下，代谢组学已成为整个生态系统的主要融合节点。 对这种足智多谋的OMIC成分的系统理解可以阐明特定于生物的响应轨迹和整个生态系统上体现元有机体的通信网格。 将这种知识转化为设计营养素和下一代疗法的持续。 它的主要障碍是关于在本生态系统中保持微妙平衡的基本机制的重要知识差距。 为了弥合这一知识差距，已经提供了可用信息的整体图片，主要关注微生物群 - 代谢物关系动力学。 本文的中心主题是肠脑轴和影响大脑功能的参与的微生物代谢产物。涵盖宿主和常驻微生物群的元原则在对抗疾病和应对压力方面起着重要作用。因此，越来越多的牵引力来建立有关该生态系统的知识基础，尤其是表征宿主与微生物群之间的双向关系。在这种情况下，代谢组学已成为整个生态系统的主要融合节点。对这种足智多谋的OMIC成分的系统理解可以阐明特定于生物的响应轨迹和整个生态系统上体现元有机体的通信网格。将这种知识转化为设计营养素和下一代疗法的持续。它的主要障碍是关于在本生态系统中保持微妙平衡的基本机制的重要知识差距。为了弥合这一知识差距，已经提供了可用信息的整体图片，主要关注微生物群 - 代谢物关系动力学。本文的中心主题是肠脑轴和影响大脑功能的参与的微生物代谢产物。
抗代谢物在癌症治疗中的应用：靶向细胞增殖途径
抗代谢药通过干扰细胞增殖所必需的关键代谢途径发挥细胞毒性作用。这些药物在结构上类似于 DNA 和 RNA 合成所需的天然代谢物，允许它们被掺入核酸并破坏正常的细胞功能。通过与内源性底物竞争并抑制关键酶，抗代谢药会破坏 DNA 复制、RNA 转录和蛋白质合成，最终导致细胞死亡。抗代谢药的主要靶点之一是叶酸代谢途径，该途径在核苷酸生物合成和一碳代谢中起重要作用。甲氨蝶呤和培美曲塞等药物作为叶酸类似物，抑制二氢叶酸还原酶 (DHFR) 和胸苷酸合酶 (TS)，这是参与叶酸代谢的关键酶。
使用 CRISPR 激活剂定制设计本氏烟叶中的代谢物组成
摘要基于 CRISPR 结构的转录调控因子扩展了我们重新编程植物内源基因表达的能力。它们的潜在应用之一是通过激活给定代谢途径中的选定酶来定制植物代谢组。使用之前描述的可多路复用的 CRISPR 激活剂 dCasEV2.1，我们测定了烟草叶中四种不同黄酮类化合物（即柚皮素、圣草酚、山奈酚和槲皮素）的选择性富集。在仔细选择目标基因和引导 RNA 组合后，我们为这四种代谢物中的每一种创建了成功的激活程序，每个程序激活 3 到 7 个基因，单个基因激活水平范围为 4 到 1500 倍。对每个多基因激活程序的黄酮类化合物谱进行代谢分析显示，目标代谢物及其糖基化衍生物的富集明显且具有选择性。值得注意的是，非目标代谢谱的主成分分析根据其活化处理清楚地区分了样品，而层次聚类将样品分成五组，对应于预期的四个高度富集的代谢物组和一个未活化的对照。这些结果表明，dCasEV2.1 是一种强大的工具，可以重新引导代谢通量以积累感兴趣的代谢物，为植物中代谢内容的定制设计打开了大门。
菲律宾Allium sativum linn的分子表征和代谢物分析：Ilocos pink
Ilocos粉红色大蒜（IPG）是菲律宾北部Ilocos的当地大蒜品种。最近以其中等β-肾上腺素能受体抑制活性在体内而闻名，仍有有限的研究描述其遗传和代谢物谱，以将其与其他大蒜品种区分开。在这项研究中，使用与序列相关的扩增多态性（SRAP）分析鉴定了IPG的遗传标记。超高性能液相色谱 - 四极杆质谱质谱法，然后使用主成分分析（PCA）将IPG的代谢物与Ilocos天然大蒜区分开。基于其外皮肤上的棕色条纹色素沉着程度，IPG样品可以分为三个 - 轻质，中度和沉重的色素沉着。这些亚组被发现共享七个SRAP标记对 - 即ME1-EM1（300bp），ME1-EM4（400BP），ME2-EM3（500BP），ME3-EM1，ME3-EM1（300BP），ME3-EM2，ME3-EM2，ME3-EM2（400BP），ME3-EM4（AT 200BEM）（AT 200BPP）（在200B）（和200B）（和200B），以及MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES MES。在亚组之间还观察到了唯一的SRAP标记对。pca揭示了与IPG组区分的Ilocos天然大蒜，但是标记矩阵工具仅在RT 1.40时显示出浓度的差异仅仅是M/z 247.129。浓度，可以提出九个标记物，以区分IPG光与IPG中度和重型，其中七个被推定地鉴定为皂苷。这些发现表明SRAP标记可以有效地将IPG区分为亚组，而代谢物分析可能几乎没有洞察IPG和Ilocos天然大蒜之间的差异。
氟奋乃静及其代谢物在大鼠脑区和其他组织中的分布
来自加州大学洛杉矶分校精神健康临床研究中心、西洛杉矶退伍军人医疗中心精神药理学部（MA、SRM、KKM）、加利福尼亚州洛杉矶威尔希尔和索特尔大道 BVMC-210；加州大学洛杉矶分校精神病学系神经生物化学实验室 (AY)，加利福尼亚州洛杉矶；萨斯喀彻温大学药学与营养学院 (KKM)，加拿大萨斯喀彻温省萨斯卡通；哈佛医学院精神病学和神经科学项目系 (NSK、RJB)，波士顿；以及马萨诸塞州贝尔蒙特马萨诸塞州总医院麦克莱恩分部梅尔曼研究中心双相情感障碍和精神障碍项目和精神病学研究实验室 (NSK、RJB)。通信地址：Manickam Aravagiri，博士，精神药理学部，西洛杉矶 V AMC，210 RM 4 号楼，11301-Wilshire 大道，洛杉矶，CA 90073。1994 年 12 月 20 日收到；1995 年 3 月 28 日修订；1995 年 4 月 5 日接受。
非目标是对药物的有针对性和可疑筛查在废水中的代谢物
化学物质和样品：目标分析物列表包括105种药物和3种替代物质内部标准。单个纯标准标准以制备甲醇中的库存溶液，从中校准标准（5-1000 ng/l）在milliq水中制备以进行半定量。的进水废水样品作为24小时复合材料。收集后，将1 L等分试样的复合废水转移到冷藏玻璃瓶中，并存储在-20°C下直至分析。样品制备：将100 mL废水样品以4000 rpm离心5分钟，并通过0.22 µm滤波器进行真空过滤。将30 ml等分试样的过滤废水施加了位替型内部标准，并使用Oasis HLB SPE墨盒提取（200 mg，6 cm 3，Waters，Waters，Milford，MA）。将每个墨盒用5 ml甲醇和5 ml的Milliq水预先加载，然后再加载样品，然后用真空干燥并用10 mL甲醇洗脱。蒸发干燥后，将残留物用50 µL甲醇重构进行LC-MS/MS分析。尖刺的Milliq水，以半定量检测限制（LOD）和提取回收率进行半定量评估。色谱法：使用现象Kinetex C18柱（100 x 2.1 mm，1.7 µm，p/n：00d-4475-an）在Sciex eotlc AC系统上进行LC分离。使用0.5 mL/min的流速，使用注射体积为5 µL，柱温度为45°C。所使用的LC条件如表1所示。表2显示了用于质谱仪的方法参数。质谱法：使用X500R QTOF系统以正面和负电喷雾电离模式进行分析。Swath DIA方法由16个可变窗户组成，覆盖M/Z 130–520的质量范围。
CRISPR/CAS9在丝状真菌中的二级代谢物合成中的应用
背景：医学教育是一个苛刻的终身学习过程，其中包括三个紧密联系的阶段：大学教育，研究生教育和持续教育。居住是大学教育后的第一年，这是一个合格的医生发展的关键时期。此外，居民是从事医院大部分临床工作的主要力量。因此，通过对居民医生（STRP）的标准化培训来确保和提高居民的临床技能和能力很重要。但是，与省省的其他医院相比，近年来，我们医院居民的STR评估结果并不令人满意。因此，这项研究的目的是找出导致性能不令人满意的问题，并确定“计划检查”（PDCA）计划在为将来培训提供宝贵框架方面的作用。
表观遗传突变的正向选择性清除调节植物中特殊代谢物
DNA 甲基化是调节生物体基因表达的重要因素。然而，DNA 甲基化是否在适应性进化中发挥关键作用尚不清楚。本文，我们展示了拟南芥中自然选择的 DNA 甲基化的证据。与单核苷酸多态性相比，三种类型的甲基化——甲基化 CG (mCG)、mCHG 和 mCHH——对拟南芥种群中基因表达水平的变化贡献很大。这些表达不稳定的基因在很大程度上影响了特化代谢量的巨大变化。在这三种类型的甲基化中，只有位于与特化代谢物相关的基因启动子区域的 mCG 在拟南芥种群中显示出选择性清除特征。因此，自然选择的 mCG 似乎是导致植物进化过程中与特化代谢物相关的表达多样性的关键突变。
使用高级LC/MS和GC/Q-Toftechnology 的Alangium salviifolium树皮的代谢物分析
1印度迈索尔大学的生物技术研究系，印度迈索尔570006； anilkumarbm0908@gmail.com 2 Agilent Technologies India Pvt。 Ltd.，印度班加罗尔560048； deepak_sa@agilent.com（S.A.D. ）; syed.lateef1@wipro.com（s.s.l. ）; saurabh_nagpal@agilent.com（s.n。） 3 Wipro Ltd.，SEZ，SARJAPURA，BANGALORE 560099，印度4卓越研究所，Vijnana Bhavan，迈索尔大学，Manasagangotri，Mysore 570006，Inida； rangappaks@gmail.com（K.S.R. ）; madan.mx@gmail.com（m.k.s.） 5印度迈索尔大学迈索尔大学分子生物学研究系，印度迈索尔570006； cd.mohan@yahoo.com 6 Adichunchanagiri分子医学研究所，AIMS校园，B。G。Nagar，Mandya 571448，印度； shobithrangappa@gmail.com 7印度喜马al尔邦Baru Sahib的阿卡尔农业学院食品技术系173101，印度； Minaxi86sharma@gmail.com 8安全和改良食品中心，苏格兰乡村学院（SRUC），国王大楼，西大马士路，爱丁堡EH9 EH9 3JG，UK 9 Biore Fifining and Advanced Firecting材料研究中心，苏格兰乡村学院（SRUC），SRUC） （C.S. ）; vijai.gupta@sruc.ac.uk（v.k.g。 ）;电话。 ： +91-988-664-0778（C.S. ）; +353-862-001-820（V.K.G.）1印度迈索尔大学的生物技术研究系，印度迈索尔570006； anilkumarbm0908@gmail.com 2 Agilent Technologies India Pvt。Ltd.，印度班加罗尔560048； deepak_sa@agilent.com（S.A.D. ）; syed.lateef1@wipro.com（s.s.l. ）; saurabh_nagpal@agilent.com（s.n。） 3 Wipro Ltd.，SEZ，SARJAPURA，BANGALORE 560099，印度4卓越研究所，Vijnana Bhavan，迈索尔大学，Manasagangotri，Mysore 570006，Inida； rangappaks@gmail.com（K.S.R. ）; madan.mx@gmail.com（m.k.s.） 5印度迈索尔大学迈索尔大学分子生物学研究系，印度迈索尔570006； cd.mohan@yahoo.com 6 Adichunchanagiri分子医学研究所，AIMS校园，B。G。Nagar，Mandya 571448，印度； shobithrangappa@gmail.com 7印度喜马al尔邦Baru Sahib的阿卡尔农业学院食品技术系173101，印度； Minaxi86sharma@gmail.com 8安全和改良食品中心，苏格兰乡村学院（SRUC），国王大楼，西大马士路，爱丁堡EH9 EH9 3JG，UK 9 Biore Fifining and Advanced Firecting材料研究中心，苏格兰乡村学院（SRUC），SRUC） （C.S. ）; vijai.gupta@sruc.ac.uk（v.k.g。 ）;电话。 ： +91-988-664-0778（C.S. ）; +353-862-001-820（V.K.G.）Ltd.，印度班加罗尔560048； deepak_sa@agilent.com（S.A.D.）; syed.lateef1@wipro.com（s.s.l.）; saurabh_nagpal@agilent.com（s.n。）3 Wipro Ltd.，SEZ，SARJAPURA，BANGALORE 560099，印度4卓越研究所，Vijnana Bhavan，迈索尔大学，Manasagangotri，Mysore 570006，Inida； rangappaks@gmail.com（K.S.R. ）; madan.mx@gmail.com（m.k.s.） 5印度迈索尔大学迈索尔大学分子生物学研究系，印度迈索尔570006； cd.mohan@yahoo.com 6 Adichunchanagiri分子医学研究所，AIMS校园，B。G。Nagar，Mandya 571448，印度； shobithrangappa@gmail.com 7印度喜马al尔邦Baru Sahib的阿卡尔农业学院食品技术系173101，印度； Minaxi86sharma@gmail.com 8安全和改良食品中心，苏格兰乡村学院（SRUC），国王大楼，西大马士路，爱丁堡EH9 EH9 3JG，UK 9 Biore Fifining and Advanced Firecting材料研究中心，苏格兰乡村学院（SRUC），SRUC） （C.S. ）; vijai.gupta@sruc.ac.uk（v.k.g。 ）;电话。 ： +91-988-664-0778（C.S. ）; +353-862-001-820（V.K.G.）3 Wipro Ltd.，SEZ，SARJAPURA，BANGALORE 560099，印度4卓越研究所，Vijnana Bhavan，迈索尔大学，Manasagangotri，Mysore 570006，Inida； rangappaks@gmail.com（K.S.R.）; madan.mx@gmail.com（m.k.s.）5印度迈索尔大学迈索尔大学分子生物学研究系，印度迈索尔570006； cd.mohan@yahoo.com 6 Adichunchanagiri分子医学研究所，AIMS校园，B。G。Nagar，Mandya 571448，印度； shobithrangappa@gmail.com 7印度喜马al尔邦Baru Sahib的阿卡尔农业学院食品技术系173101，印度； Minaxi86sharma@gmail.com 8安全和改良食品中心，苏格兰乡村学院（SRUC），国王大楼，西大马士路，爱丁堡EH9 EH9 3JG，UK 9 Biore Fifining and Advanced Firecting材料研究中心，苏格兰乡村学院（SRUC），SRUC） （C.S.）; vijai.gupta@sruc.ac.uk（v.k.g。）;电话。： +91-988-664-0778（C.S.）; +353-862-001-820（V.K.G.）
根部代谢物调节有益微生物的模式如何随着不同的放牧压力而变化？
放牧干扰可改变植物根际微生物群落结构，从而改变反馈机制，促进植物生长或诱导植物防御。然而，人们对这种变化在不同放牧压力下如何发生和变化，以及根部代谢物在改变根际微生物群落组成中的作用知之甚少。本研究研究了不同放牧压力对微生物群落组成的影响，并利用代谢组学方法探索了不同放牧压力改变根际微生物组的机制。放牧改变了微生物群落的组成、功能和共表达网络。在轻度放牧（LG）下，一些腐生真菌，如香菇属、Ramichloridium 属、Ascobolus 属。和 Hyphoderma sp. 显著富集，而在重度放牧 (HG) 下，潜在有益的根际细菌，如 Stenotrophomonas sp.、Microbacterium sp. 和 Lysobacter sp. 显著富集。有益的菌根真菌 Schizothecium sp. 在 LG 和 HG 中均显著富集。此外，所有富集的有益微生物都与根系代谢物呈正相关，包括氨基酸 (AA)、短链有机酸 (SCOA) 和生物碱。这表明这些显著富集的根际微生物变化可能是由这些差异性根系代谢物引起的。在放牧压力下，推测根系代谢物，尤其是氨基酸如L-组氨酸，可能调控特定的腐生真菌参与物质转化和能量循环，促进植物生长。此外，为了缓解高放牧压力，提高植物的防御能力，推测根系在放牧干扰下会主动调节这些根系代谢物如氨基酸、中链氨基酸和生物碱的合成，然后分泌它们来促进一些特定的促进植物生长的根际细菌和真菌的生长。总之，禾本科植物可以通过改变根系代谢物的组成来调控有益微生物，在典型的草原生态系统中，不同的放牧压力下，其响应策略也不同。