■Intellectual property rights: Japanese application 2023-175606 (application 2023-10-10) Name of the invention: Methods for labeling inosine bases, detection methods for detecting inosine bases, sequencing methods for sequencing nucleic acids containing inosine bases, inosine base labeling agents, and kits JST Patent application support system (PC T): S2023-0543-N0 Name of the invention: A Novel Technique to Explore Adenosine Deamination via Inosine Chemical Labeling and Affinity Molecular Purification ■Name of public funding projects utilized: AMED Bridge Research Promotion Project Seeds A (Main) 2022基础研究B(总统)(总裁)2022-2024基础研究B(总统)(总统)2019-2021支持研究活动开始(总统)2018年挑战研究(开发)(共享)(共享)2024-2026
Ikkoh Yasuda,Naomi Ruth D. Saludar,Ana Ria Sayo,Shuichi Suzuki,Akira Yokoyama,Yuriko Ozeki,Ikkoh Yasuda,Naomi Ruth D. Saludar,Ana Ria Sayo,Shuichi Suzuki,Akira Yokoyama,Yuriko Ozeki,
1。发展精神疾病的机制,重点是羰基胁迫Arai Makoto165。旨在治疗顽固性疾病Amaike amaike kazuma的生物聚合物DDS
在本研究中,使用了能够选择性地与被荧光染色的单链目标DNA(荧光DNA)结合的单链DNA修饰的2种大小和材质不同的探针粒子(金纳米粒子,Probe1;聚苯乙烯微粒,Probe2),尝试通过用激光照射含有这些粒子的溶液,利用光的力量(光诱导力)以及由该力引起的光诱导对流,使目标DNA和探针粒子局部集中,从而加速DNA双链的形成。结果发现,经过5分钟的光照,探针1和2的凝集物形成约数十μm大小,荧光DNA被聚集并捕获在凝集物的间隙中。还发现,与探针颗粒表面的DNA牢固结合的互补碱基序列(匹配DNA)越强,发出的荧光信号就越强(图2左)。特别地,本研究中使用的微粒经历了“米氏散射”,即当微粒的尺寸与激光波长相当时,光会发生强烈散射的现象。这种增加的光功率可用于提高浓缩效率。此外,由于光力增加时组装体变得更加稳定,因此人们认为可以实现迄今为止难以实现的固液界面光诱导双链形成的加速。通过利用该机制,我们实现了 7.37 fg/μL 的检测限,成功以比传统数字 PCR 方法(检测限:约 200 fg/μL)高一到两个数量级的灵敏度检测 DNA(图 2,右)。通常情况下,由于互补 DNA 分子之间碰撞的概率较低,在如此稀释的 DNA 溶液中形成双链需要很长时间。异探针光学浓缩法对 DNA 的检测之所以具有高灵敏度和快速性,被认为是由于通过显著增加聚集体内的局部 DNA 浓度,加速了这些极少量 DNA 双链的形成。此外,我们证明了通过用光照射金纳米粒子并利用产生的光的热量(光热效应)来松散双链键并增加键断裂的概率,来自聚集体的荧光信号表现出极高的碱基序列特异性,从而能够清楚地检测和识别24个碱基长的目标DNA中仅含有单个碱基的突变,包括位置依赖性(图3)。仅使用聚苯乙烯(Probe2)的情况,在所用激光的波长(1064nm)下几乎没有光热效应,因为与探针是同一类型,所以称为“同源探针”,否则称为异源探针。
x PANEL GENES □ 肉碱吸收缺乏症 SLC22A5 □ MCAD 缺乏症 ACADM(c.985A>G 常见突变和 del/dup +/- 反射测序) 点击此处查看直接测序 □ LCHAD/MTP 缺乏症 HADHA、HADHB(HADHA c.1528G>C + 反射测序) 点击此处查看直接测序 □ VLCAD 缺乏症 ACADVL □ MADD/戊二酸尿症 2 型 ETFA、ETFB、ETFDH、FLAD1、SLC52A2、SLC52A3、SLC52A1 □ CPT2 缺乏症 CPT2 □ CACT 缺乏症 SLC25A20 □ CPT1 缺乏症 CPT1A(p.Pro479Leu 常见突变 + 反射测序) 点击此处查看直接测序 □其他FAOD ACAA2、ACAD9、ACADL、ACADS、ECHS1、HADH
低温电子显微镜(冷冻)单个颗粒分析的进步通过促进了完全水合的大分子分子络合物的原子和近原子分辨率结构的体外确定,从而彻底改变了结构生物学,这些结构表现出了全面水合的巨大分子配合物,这些结构均具有跨大小范围的构成和构象异构性。低温电子断层扫描(冷冻)和亚图平均迅速发展,正在为原位提供类似的大分子复合物的见解,而无需标签或严厉的生化纯度。此外,冷冻物可以直接在分子,纳米分辨率下直接在没有化学固定或染色伪影的分子纳米分辨率下可视化细胞和组织表型。这项前瞻性评论涵盖了Cryoem/ET的最新发展以及相关技术,例如低温浓缩的离子束铣削扫描电子显微镜和相关光学显微镜,越来越多地增强和通过人工智能算法增强和支持。讨论了他们对新兴概念的潜在应用,主要是补充医学组织病理学分析的前景。机器学习解决方案有望解决组织,细胞和大分子冷冻中的“大数据”所带来的当前挑战,从而提供了对疾病过程的新颖,定量见解的希望,这些疾病可能会转化为诊所并导致改进的诊断和靶向治疗方法。