作者分支机构:1个国际分枝杆菌学实验室,丹麦哥本哈根Statens Serum Institut; 2英国诺丁汉诺丁汉特伦特大学生物科学系; 3罗斯基尔德大学科学与环境系,丹麦4000 Roskilde; 4丹麦哥本哈根大学公共卫生系全球卫生科。*通信:Xenia Emilie Sinding Iversen,Xesi@ssi。DK关键字:burgundiense sp。nov。;分枝杆菌Holstebronense sp。nov。;分枝杆菌kokjensenii sp。nov。;分枝杆菌Wendilense sp。nov。;非结核分枝杆菌;新物种;分类学描述。†共享的最后作者身份:这些作者对工作也同样贡献。在线补充材料中提供了补充数字和两个补充表。006620©2025作者缩写:ALRT,近似似然比测试; AMR,抗菌素耐药性; ANI,平均核苷酸身份; AST,抗菌敏感性测试; BIC,贝叶斯信息标准; CD,蛋白质编码序列; CLSI,临床和实验室标准研究所; GGD,基因组到基因组距离; HPLC,高性能液相色谱; IRLM,分枝杆菌国际参考实验室;它的内部转录垫片; LJ,Löwenstein -Jensen; LPA,线探测测定; MALDI-TOF,基质辅助激光解吸电离时间; MB7H10,Middlebrook 7H10; MBT,MALDIBIOTYPER®; MGIT,分枝杆菌生长指示灯管; MHB,Mueller – Hinton汤; MIC,最少抑制浓度; MS,质谱; NCBI,国家生物技术信息中心; NTM,无结核分枝杆菌; ONT,牛津纳米孔技术; PGAP,原核基因组注释管道; PPS,病原体概率评分; SSI,Statens Serum Institut;结核病,结核病; TES,N-三三(羟甲基)甲基-2-氨基乙磺酸; WGS,全基因组测序; Zn,Ziehl – Neelsen。
抽象的舌头拭子(TS)采样与定量PCR(QPCR)结合检测结核分枝杆菌(MTB)DNA是痰液测试结核病(TB)诊断的有希望的替代方法。在先前的研究中,擦拭舌头的敏感性通常低于痰液。在这项研究中,我们评估了两种提高灵敏度的策略。一方面,用于从2 ml悬浮液中浓缩舌头细菌,这些悬浮液从高容量的泡沫拭子样品中洗脱。将沉淀重悬于500 µL悬浮液中,然后在双目标qPCR之前机械裂解以检测MTB插入元件为6110,为1081。分级实验表明,可沉积分数中存在临床拭子样品中的大多数MTB DNA信号(99.22%±1.46%)。当适用于从124个具有推定性结核病的南非人收集的存档泡沫拭子时,该策略表现出83%的敏感性(71/86)和100%特异性(38/38),相对于痰液微生物学参考标准(MRS; Sputum; Sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum》;第二种策略使用了序列特异性磁捕获(SSMAC)来浓缩从MTB细胞释放的DNA。该方案是在存档的Copan floqswabs蜂拥而至的木材样品上进行了评估,这些拭子样品是从128个具有推定性结核病的南非参与者中收集的。将洗脱为500 µL缓冲液的材料机械裂解。通过蛋白酶K消化悬浮液,与生物素化的双靶寡核苷酸探针杂交,然后使用磁分离浓缩约20倍。在对浓缩物的双目标qPCR测试后,该策略相对于痰液MRS表现出90%的敏感性(83/92)和97%的特异性(35/36)。这些结果指向了用于检测TS中MTB DNA的可自动性高敏性方法的道路。
分枝杆菌属包括导致人类和动物结核病 (TB) 的结核分枝杆菌复合群 (MTBC) 的种、导致麻风病的麻风分枝杆菌,以及通常称为非典型或非结核分枝杆菌 (NTM) 的分枝杆菌种,其中包括导致布鲁里溃疡的溃疡分枝杆菌。与 MTBC 组成员不同,NTM 不是人类的专性寄生虫,而是土壤和水的正常居民,可以在天然水源和处理过的水源中找到 [1]。已正式确认的 NTM 有 200 多种 [2],其中已知约 25 种与人类疾病密切相关。一些种与引起类似 TB 症状的肺部疾病有关 [1]。由于它们的栖息地,人类每天都会接触到这些细菌。因此,必须将 NTM 病与简单的定植或临床样本污染(例如自来水)区分开来 [1,3]。与结核病不同,NTM 引起的疾病的全球流行病学尚不明确。从临床标本中分离 NTM 的病例主要见于工业化国家,患病率和发病率各不相同。基于肺部标本分离株的研究报告称,2004 年至 2006 年美国的患病率为每 100,000 人 1.4 至 6.6 人 [ 4 ],2010 年加拿大安大略省的患病率为每 100,000 人 9.8 人 [ 5 ],2020 年德国的患病率为每 100,000 人 5.8 人 [ 6 ]。也有报告称,2012 年英格兰的发病率为每 100,000 人 6.1 人 [ 7 ],2020 年德国的发病率为每 100,000 人 5.3 人 [ 6 ]。在结核病流行国家,NTM 的报告频率较低,并且主要发生在高危人群中,特别是具有易感条件或免疫力低下的人群 [ 8 ]。然而,工业化国家的经验表明,结核病负担的下降也增加了发现的 NTM 病例数。随着另一种环境下结核病防治规划的加强,我们或许也会看到类似的情况,对中低收入国家而言,诊断和临床治疗的挑战将日益加大[9]。NTM 肺病的诊断基于临床、放射学和微生物学标准[1]。在大多数资源有限的国家,基本上无法进行以实验室为基础的 NTM 检测,无法与 MTBC 相区分并确定其菌种。显微镜检查是最容易获得的技术,它将 MTBC 和 NTM 识别为抗酸杆菌 (AFB),但无法区分它们。自 2010 年以来,世界卫生组织 (WHO) 已推荐使用 GeneXpert MTB/RIF(Xpert)等快速分子检测作为结核病诊断的初始检测,该检测具有更高的灵敏度和特异性 [10]。该检测仅可识别样本中是否存在 MTBC 菌种。如果 AFB 阳性痰液样本经 Xpert 检测呈 MTBC 阴性,则可能提示感染 NTM [11]。在马里,已报道过 NTM 感染病例,特别是在抗结核治疗失败或结核病治愈后复发的患者中 [ 12 ]。在该国引入 Xpert 后,AFB 涂片阳性而 Xpert 检测阴性的疑似 NTM 感染病例报告更频繁 [ 13 ]。
由于发现催化活性的改善与晶体162
品牌名称:Cobas 5800 系统 制造和销售通知编号:13 B 1 X 00201000086 品牌名称:Cobas 6800 系统 制造和销售通知编号:13 B 1 X 00201000063 品牌名称:Cobas 8800 系统 制造和销售通知编号:13 B 1 X 00201000061
摘要:结核分枝杆菌(MTB)是一种已知的细菌,可以靶向,感染和破坏肺部细胞以及体内的结缔组织。该细菌在全球范围内普遍存在,已感染了当前世界人口的四分之一,成为历史上最成功的病原体之一。由于其作为空降病原体的极端传播速率,MTB菌株已被抗生素(例如利福平和异念珠菌)处理,这些抗生素抑制了人体细菌感染。这些第一轮药物仍然是减慢病原体和杀死病原体的成功机制,特别是通过利福平抑制RNA - 聚合酶和以异oni氮的停止形成细菌细胞壁的能力。然而,由于最近发现了多药耐药性结核病菌株,TB已被证明是威胁,使这些第一轮药物无效。本研究的主要目标是1)回顾有关结核病的最新发表文献,2)检查突变对结核病菌株中抗生素耐药性的作用,3)分享我们关于全球结核病治疗的成功和挑战的综合。我们的研究是通过NCBI Genbank中可用的数据和文献综述的。为了实现这些目标,我们回顾了有关结核分枝杆菌的相关文献,以收集病理生理数据,结核病突变的趋势以及当今该疾病如何在全球范围内不断流行的应用。我们从国家医学图书馆的GenBank收集了抗生素响应式RPO B基因序列,以评估四个国家的特定结核病的突变。我们发现,随机突变引起了具有有效抗生素耐药性的结核病菌株的演变,并且药物的选择性可以鼓励这些抗生素耐药基因。新药,例如Bedaquiline,进行了大量研究,但有效地发现了针对这些耐药性分枝杆菌的新靶标。但是,尽管有一些新开发的药物,但MDR结核病仍然仍然是一个相当大的威胁。
其天然膜中内源性蛋白质复合物的抽象成像可以揭示在洗涤剂溶解后损失的蛋白质 - 蛋白质相互作用。为了研究分枝杆菌氧化磷酸化机制中的相互作用,我们准备了来自smegmatis分枝杆菌的倒膜囊泡,并富含通过亲和力色谱含有兴趣复合物的囊泡。电子冷冻显微镜(冷冻-EM)表明,来自克雷布斯循环的酶(MQO)(MQO)与电子传输链复合物III 2 IV 2 IV 2(CIII 2 CIX 2)superComplex物理相关。对MQO:CIII 2 CIV 2相互作用的分析表明,CIII 2 CIV 2对于苹果酸驱动的,但不是NADH驱动的电子传输链活动和氧气消耗所必需的。此外,MQO与CIII 2 CIV 2的关联使电子从苹果酸到CIII 2 CIV 2与毫秒动力学转移。一起,这些发现表明了Krebs循环与呼吸之间的联系,该呼吸将电子沿着分枝杆菌电子传输链的单个分支引导。引言生物能是通过包括糖酵解,三羧酸或克雷布斯循环以及脂肪酸氧化的代谢途径从营养物质中提取的。在大多数生物体中,克雷布斯循环提供减少的烟酰胺腺苷二核苷酸(NADH),并琥珀酸酯添加到膜结合的电子传输链(ETC)配合物,以驱动跨膜质子质子运动力(PMF)的产生。PMF反过来为二磷酸腺苷(ADP)和无机磷酸盐(P I)合成三磷酸腺苷(ATP)提供了能量。nadh被ETC的复合物I氧化,将泛氨基酮降低为泛醇。在克雷布斯循环中,琥珀酸酯氧化为富马酸盐是必不可少的反应,但通过ETC的复合物II发生,这也将泛氨基酮降低到泛醇。然后将来自泛醇的电子依次转移至复合物III,细胞色素C(Cyt。c),复合物IV,然后氧气将其减少到水中。复合物I,III和IV对夫妇电子在整个膜上转移至质子易位,维持了为ATP合成的PMF。分枝杆菌等与典型的哺乳动物线粒体等不同的方式(在(Liang and Rubinstein,2023)中进行了多种方式)。首先,分枝杆菌等依赖于甲酸苯丙胺(MQ),而不是泛氨基酮。此外,与规范的etc,分枝杆菌等不同。在大多数分枝杆菌中,例如病原体分枝杆菌结核病和快速生长的腐生肉芽菌分枝杆菌Smegmatis,NADH:MQ氧化还原酶活性均由复合物I和一种或多种非腐蚀性泵送II型NADH脱氢酶(NDH-2S)催化。两种不同的酶SDH1和SDH2催化琥珀酸酯:MQ氧化还原酶活性。此外,结核分枝杆菌和Smegmatis均具有苹果酸:奎因酮氧化还原酶(MQO),将氧化剂氧化为Oxalo乙酸盐,这是KREBS循环的关键步骤,而将MQ降低到MQH 2(Harold等,202222)。在结核分枝杆菌中,除了苹果酸脱氢酶(MDH)之外,还发现了该MQO,它将电子从苹果酸转移到NAD +,而在Smegmatis M. smegmatis MQO中是唯一的苹果酸氧化酶(Harold等,2022)。c。也许最引人注目的是,分枝杆菌中MQH 2的氧化是由复合物III和IV(CIII 2 CIV 2)的超复合物催化的,并具有结合的细胞色素CC亚基,代替了可溶性细胞。MQH 2的氧化和将氧气还原为水还可以通过细胞色素BD复合物(在规范等中未发现)来实现,每种电子转移的质子比CIII 2 Civ 2易解的质子较少(Safiarian等,2021年)。
2024 年 6 月 28 日 尊敬的医疗专业人士, 根据 1989 年《治疗用品法》第 19A 条的规定,BCG 疫苗牛分枝杆菌 (BCG 菌株) 1.5mg 注射用粉末多剂量小瓶和稀释剂小瓶 (AUST R 53569) 停产,并停止提供替代供应安排。 由赛诺菲安万特澳大利亚公司赞助的澳大利亚注册药品 BCG 疫苗牛分枝杆菌 (BCG 菌株) 1.5mg 注射用粉末多剂量小瓶和稀释剂小瓶 (AUST R 53569) 已停产。 LINK 已能够安排临时供应替代产品 BCG 疫苗 AJV 注射用粉末,冻干 - 牛分枝杆菌 (BCG) 丹麦菌株 1331 和稀释的 Sauton AJV(新西兰)。
肺部和北美的肺化分枝杆菌(NTM)的患病率正在增加。大多数肺NTM是由鸟分枝杆菌(MAC)引起的。肺MAC的治疗是次优的,失败率范围从30%到40%,需要开发新的疫苗。在这项研究中,我们测试了两种全细胞疫苗,DAR-901(HEAD杀死M. Obuense)和BCG(Live Pive nive nive s. Bovis),通过首先对Balb/C小鼠进行免疫接种,然后进行过夜刺激过夜刺激,从而诱导MAC交叉反应免疫。研究这些疫苗预防MAC感染的能力,BALB/C小鼠以DAR-901(皮内)或BCG(皮下或鼻内内)接种疫苗,并在4周后用雾化的MAC挑战。一些通过饲料用克拉霉素治疗了接受BCG接种的小鼠。感染后4周对免疫小鼠和未接种疫苗的对照进行肺CFU。 Our results showed that i) DAR-901 induced cross-reactive immunity to MAC and the level of MAC cross-reactive immunity was similar to the level of immunity induced by BCG, ii) DAR-901 and BCG protect against aerosol MAC, iii) mucosal BCG vaccination provided the best protection against MAC challenge, and iv) BCG vaccination did not interfere with anti-MAC activities of克拉霉素。肺CFU。Our results showed that i) DAR-901 induced cross-reactive immunity to MAC and the level of MAC cross-reactive immunity was similar to the level of immunity induced by BCG, ii) DAR-901 and BCG protect against aerosol MAC, iii) mucosal BCG vaccination provided the best protection against MAC challenge, and iv) BCG vaccination did not interfere with anti-MAC activities of克拉霉素。