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油菜（Brassica napus L.）子房胚珠数量的遗传基础及分子机制剖析
每子房胚珠数 (ONPO) 决定了每果种子数的最大潜力，而种子数是作物种子产量的直接组成部分。本研究旨在利用新开发的油菜双单倍体 (DH) 群体剖析 ONPO 的遗传基础和分子机制。在所有四个研究环境中，201 个 DH 品系的 ONPO 呈正态分布，变化范围从 22.6 到 41.8，表明数量遗传适合于 QTL 定位。开发了 19 个连锁群内 2111 个标记的骨架遗传图谱，总长度为 1715.71 cM，标记间平均为 0.82 cM。连锁图谱鉴定出 10 个 QTL，分布在 8 条染色体上，解释 7.0-15.9% 的表型变异。其中四个与报道的相同，两个被重复检测到且影响相对较大，凸显了它们在标记辅助选择中的潜力。高、低 ONPO 品系两库子房（胚珠起始阶段）的植物激素定量分析显示，九种亚型植物激素的水平存在显著差异，表明它们在调节胚珠数量方面发挥着重要作用。转录组分析鉴定出两库之间 7689 个差异表达基因 (DEG)，其中近一半富集到已报道的调控 ONPO 基因的功能类别中，包括蛋白质、RNA、信号传导、杂项、发育、激素代谢和四吡咯合成。整合连锁 QTL 作图、转录组测序和 BLAST 分析，鉴定出已报道的胚珠数基因的 15 个同源物和 QTL 区域中的 327 个 DEG，这些被视为直接和潜在的候选基因。这些发现进一步加深了对ONPO遗传基础和分子机制的认识，将有助于未来基因克隆和遗传改良，从而提高油菜种子产量。
2050年的植物育种可能（也可能不会）是什么样的？
也是在本世纪初，编辑们要求许多作者宣布他们对下一个植物育种的愿景。随着1990年代遗传学的许多突破，1998年我们一个人（Ortiz，1998）宣布，在下一世纪，植物育种将高度依赖于分子标记，GM和整个基因组测序。当时，双单倍体技术的激增以及计算能力不可否认的增加引起了该作者的注意。这当然并不是唯一对遗传学和基因组学最终将导致粮食安全世界的突破的评论（Borem＆Kothe Milach，1998年）。Bosemark（1995）和Lee（1998）建议，分子标记物的使用可能会导致选择强度的提高和探索更广泛的可变性的可能性。Cooper等。（1999）通过暗示如何使用分子标记来对特征和环境之间的复杂定量遗传相互作用进行统计学模型，并最终能够使用计算模型来采取更有效的繁殖决策，从而采取了略有不同的立场。与此相符，Hill等。（1998）在其定量遗传学书中定义了通过环境相互作用（G×E）采用最新生物识别方法来实现较高遗传增长的重要性（GGS，Safi＆Price，1998）。但是，遗传学并不是吸引作者的唯一方面。混合农作物的伟大成功也激发了几位作者在世纪之交，呼吁另一种尝试将更多的自授粉作物转化为混合系统（Ratnalikar＆Singh，1998）。植物生理学的一些创新还引发了对育种者可以部署的表型方法的新构想（Jackson等，1996），包括使用一些新型实验室设备来预测情节水平的工业适用性，例如近膜反射率光谱（NIRS）用于更换湿化学（Batten，1998年）。也是农艺师开始广泛促进零耕种和保护农业的时间（Avery，1997; Plucknett＆Winkelmann，1995）。
2021; 12(15): 4616-4625。doi: 10.7150/jca.56014 研究论文 RNF43 和 PWWP2B 抑制癌细胞增殖并具有预测或预后生物学
背景：基因的异常调控与胃癌密切相关。胃癌的表征需要开发新的治疗方法以及识别预后标志物以预测对新药的反应。在我们的研究中，我们使用 RNA 测序分析来显示胃癌组织中的胃癌预后标志物。我们特别选择研究 RNF43，因为它通过与 Wnt 受体相互作用来抑制胃癌相关的 Wnt/β-catenin 信号传导。选择 PWWP2B 是因为它是胃癌中下调的基因。方法：利用 RNA 测序分析，我们评估了胃癌患者的 mRNA 表达谱。此外，我们使用了 HAP1 细胞，这是一种源自男性慢性粒细胞白血病细胞系 KBM-7 的人类近单倍体细胞系。这些细胞系每个基因都有一个副本，确保编辑的等位基因不会被其他等位基因掩盖。我们研究了1,449种FDA批准药物在HAP1、HAP1 RNF43 KO和HAP1 PWWP2B KO细胞中的筛选。RNA测序数据显示，复发性胃癌患者中RNF43和PWWP2B表达下调。接下来，我们研究了选定药物在RNF43和PWWP2B下调的MKN45胃癌细胞和异种移植模型中的抗癌作用。结果：在这些FDA批准的药物中，三种药物（多西他赛三水合物、培利替尼和uprosertib）在RNF43 KO细胞和PWWP2B KO细胞中显示出强效的抑制作用。在MKN45异种移植模型中，多西他赛三水合物、uprosertib或培利替尼治疗组的肿瘤体积显著缩小。我们的数据表明RNF43和PWWP2B是预测胃癌复发的生物标志物。结论：我们的研究结果表明多西他赛三水合物、uprosertib 和培利替尼可作为预防和治疗 RNF43 和 PWWP2B 表达降低的胃癌的新型治疗药物。
请求提案基因治疗策略...
简介 NF1 是一种常染色体显性单基因疾病，全球每 3,000 人中约有 1 人患有此病。NF1 的典型特征包括皮肤上出现多个咖啡牛奶斑（浅棕色）、皮肤上或皮肤下的神经纤维瘤（小型良性肿瘤）以及神经肿瘤，这些肿瘤可导致毁容、失明和癌症。NF1 还可能导致认知障碍、骨骼畸形和心血管功能障碍。该病的病程既不可预测又因人而异。即使在同一个家庭中，患者的症状也可能大不相同，严重程度也各不相同。NF1 是由 NF1 基因突变或缺失引起的，该基因编码一种名为神经纤维蛋白的肿瘤抑制蛋白，它是 Ras 信号转导通路的负调节剂。NF1 是一个大基因，由 60 个外显子组成，跨越约 350 kb 的基因组 DNA。其转录本长度在 11 到 13 kb 之间，具有大约 8,500 bp 的开放阅读框，可编码 2,818 个氨基酸的蛋白质。NF1 患者已发现整个 NF1 基因中分布着数千种不同的致病突变。虽然单倍体不足是导致该疾病的必要条件，但肿瘤的形成需要 NF1 基因的两个拷贝都发生改变。体细胞突变（“第二次打击”）可发生在各种细胞类型中，并在个体一生中的不同时间点发生，并导致患者病理多变。GFF 是由慈善家 Dan 和 Jennifer Gilbert 创立的私人非营利基金会。GFF 的使命是开发有效的治疗方法并最终治愈 NF1。目前，其主要研究计划包括：(1) 基因治疗计划 (GTI)，旨在开发创新疗法，以解决 NF1 患者的潜在遗传异常；(2) 视力恢复计划，旨在推进 NF1 患者的视力增强和恢复疗法。2018 年 12 月，GTI 资助了九项团队科学奖，重点是开发基因靶向策略，例如基因编辑和替换、RNA 编辑、外显子跳跃、无义突变抑制和合成致死。
花粉自我消除 CRISPR-Cas 基因组编辑可防止玉米中转基因花粉的传播
利用成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)-CRISPR 相关核酸酶 (Cas) 介导的技术进行基因组编辑，彻底改变了基础植物科学和作物遗传改良 ( Chen et al., 2019 )。CRISPR-Cas 盒的稳定遗传转化是植物体内基因组编辑的主要方法。在许多有性生殖植物中，一个主要问题是转基因元件通过花粉传播 ( Devos et al., 2005 )。玉米 ( Zea mays L. ) 是一种典型的异交作物，每株植物可产生多达 200 万至 500 万个花粉粒 ( Goss, 1968 )，由于风传播，建议隔离距离为 200 米 ( Ma et al., 2004 )，甚至由于蜜蜂等昆虫的觅食，隔离距离可超过 3 公里 ( Danner et al., 2014 )。之前报道的使用自杀转基因的策略有效杀死了 T 0 植物产生的含有 Cas9 转基因的未成熟胚和花粉，并产生了无转基因的编辑 T 1 植物 ( He et al., 2018 )。特别是对于无性繁殖植物，该技术解决了去除转基因成分的难题，因为通过减数分裂重组和分离去除转基因成分是不可行的。然而，基因组编辑有许多有用的应用，这些应用需要将 Cas 转基因保留在植物中，包括 RNA 引导的 Cas9 作为体内靶标突变体（ Li 等人， 2017 ）和单倍体诱导偶联编辑（ Kelliher 等人， 2019 ； Wang 等人， 2019 ），通过使用 cenh3- 无效突变体作为雌配子体（ Ravi and Chan， 2010 ）。在本文中，我们提出了 PSEC，它可以防止花粉转基因从含有花粉自杀盒的 T-DNA 的植物中扩散，该 T-DNA 位于特定的单向导 RNA 和 Cas 盒旁边。同时，PSEC 仍然可以通过雌配子遗传到下一代，并且还保留 CRISPR-Cas 基因编辑活性。通过有性杂交，它以反式方式在杂交亲本基因组中诱导有效的靶突变，以用于育种应用。
非洲木薯基因组的单倍型分辨DNA甲基
胞嘧啶DNA甲基化参与了转座元件（TE）沉默，烙印和X染色体灭活。植物DNA甲基化由Met1（Mammalian DNMT1），DRM2（哺乳动物DNMT3）和两个植物特异性DNA甲基转移酶，CMT2和CMT3介导（Law and Jacobsen，2010年）。DRM2通过植物特异性RNA指导的DNA甲基化（RDDM）途径建立了植物中的从头DNA甲基化，依赖于两个DNA依赖性RNA聚合酶，POL IV和POL V（Gallego-Bartolome et al。木薯的DNA甲基团先前已根据其单倍体倒塌的基因组进行了记录（Wang等，2015）。由于木薯基因组是高度杂合的，因此单倍型折叠基因组的DNA甲基团错过了甲基体的许多特征。With the development of long-read sequencing and chromosomal conformation capture techniques, haplotype-resolved genomes are available for highly heterozygous genomes (Mansfeld et al., 2021 ; Qi et al., 2022 ; Sun et al., 2022 ; Zhou et al., 2020 ), which provides high-quality reference genomes facilitating studies of haplotype-resolved DNA甲基组。为了剖析木薯的单倍型分辨DNA甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基（TME7和TME204）在两个单倍型基因组分辨率（TME7和TME204）中进行了研究。 Al。，2021;测序读数分别映射到不同的单倍型，允许零不匹配和一个最佳命中，这允许分离属于不同单倍型的读数。总体而言，我们发现尽管使用了WGB和EM-SEQ方法，但两种单倍型具有相似的整体
COVID-19运动员的疫苗接种：准备，设定，GO… 对选定的南非国家拥有的案例研究... 在有风力涡轮机和PV 的情况下，通过PID控制器对岛微电网的最佳负载频率控制 研究文章利用动物固体废物在伊朗3E分析西北的一年模拟 通过双倍的单倍体繁殖（向日葵）加速繁殖：基因组编辑时代过去和未来前景的见解
在体育界，Covid-19大大削减了正常活动，并导致了许多国家和国际活动的推迟和取消。 在过去的一年中，在运动中发生的几项研究Covid-19的传播是在运动中发生的，而严格的感染控制程序在防止SARS-COV2传播方面是核心，但精英和竞争性的COVID-19疫苗接种问题，但休闲运动员正在迅速成为个人运动员，体育团队和组织的紧迫问题。 运动临床医生现在面临着几个重要的考虑因素，包括运动对疫苗功效的影响，潜在的副作用，给定运动员或一群运动员的最佳疫苗类型（如果选择变得相关），有关疫苗时间的建议，以及疫苗接种的时间，以及疫苗接种是否可以阻止SARS-COV-2传输。在体育界，Covid-19大大削减了正常活动，并导致了许多国家和国际活动的推迟和取消。在过去的一年中，在运动中发生的几项研究Covid-19的传播是在运动中发生的，而严格的感染控制程序在防止SARS-COV2传播方面是核心，但精英和竞争性的COVID-19疫苗接种问题，但休闲运动员正在迅速成为个人运动员，体育团队和组织的紧迫问题。运动临床医生现在面临着几个重要的考虑因素，包括运动对疫苗功效的影响，潜在的副作用，给定运动员或一群运动员的最佳疫苗类型（如果选择变得相关），有关疫苗时间的建议，以及疫苗接种的时间，以及疫苗接种是否可以阻止SARS-COV-2传输。
基于 CRISPR 的基因编辑增强 LDLR 表达...
家族性高胆固醇血症 (FH) 是一种常见的常染色体显性遗传病，其特征是低密度脂蛋白胆固醇 (LDL-C) 终生升高，导致早发性动脉粥样硬化和冠状动脉事件。约 85% 至 90% 经基因确诊的 FH 是由 LDLR 基因致病突变引起的，该基因的单倍体不足会导致 LDL-C 摄取降低 1,2 。目前可以使用他汀类药物和依折麦布等终生降脂药物，但有些患者往往无法耐受这些药物，无法达到理想的 LDL-C 水平 3 。一种较新的治疗方法是基于皮下注射单克隆抗体，这种抗体可以暂时抑制前蛋白转化酶枯草溶菌素/kexin 9 型 (PCSK9)，PCSK9 是一种促进 LDLR 溶酶体降解的蛋白质 4,5 。但这种方法作为单一疗法往往是不够的，因此需要与他汀类药物联合使用 6 。在这里，我们提出了一种新颖、直接且持久的治疗策略，通过基于 CRISPR 的基因编辑截断 LDLR 3' UTR 的一部分（其中包含负向调节 LDLR 表达的位点），以上调 LDLR 表达。在 HepG2 细胞系、FH 患者来源的淋巴母细胞系 (LCL) 和小鼠肝癌细胞系 Hepa1-6 中测试了编辑策略。通过 ddPCR 确认 3'UTR 的切除，并通过 qRT-PCR 量化 LDLR mRNA 水平。分别通过 Western Blot 和流式细胞术使用特异性抗体测定总 LDLR 水平和表面 LDLR 水平。最后，通过流式细胞术测量荧光标记的 LDL-C 的细胞摄入量来评估 3'UTR 切除对胆固醇摄取的影响。 HepG2 细胞中的切除效率约为 50%。与未经处理的细胞相比，切除的细胞显示 LDLR mRNA 水平上调 2 倍，表面 LDLR 增加 6 倍。3'UTR 切除导致 LDL-C 摄取增加 3 倍。患者来源的 LCL 显示出类似的结果，LDL-C 摄取增加 4 倍。此外，比较分析表明，我们的策略在增加 LDL-C 摄取方面优于 PCSK9 敲除 (KO) 和他汀类药物。这些发现支持我们基于 CRISPR 的基因编辑策略，即截断负责快速 LDLR mRNA 周转的区域以增强其表达并促进 LDL-C 摄取。这种独特的方法可能对多种高胆固醇血症相关疾病有用。
特定的TCR-T细胞用于治疗CMV感染后...
抽象背景巨细胞病毒（CMV）经常发生无操纵单倍性干细胞移植（SCT）后的重新激活，从而导致危及生命的病态和移植失败。使用抗病毒剂检测CMV病毒血症后，先发制体疗法目前是护理标准，但与显着毒性有关。CMV抗原特异性细胞毒性T淋巴细胞疗法受到耗时的制造过程和相对较低的成功率的限制。迫切需要使用单倍性SCT后治疗CMV重新激活的更有效，更安全的方法。方法将单臂，开放标签的临床试验评估，评估涉及CMV靶向T细胞受体工程T（CMV-TCR-T）细胞疗法的安全性和功效，作为一线预先疗法对CMV的一线预先治疗，对单次外周血液SCT（PBS CTCT）的CMV重新激活（PBS CTCT）是PLA的PLAA，是PLA的一经作用。单倍体SCT后的6例CMV重新激活患者被一到三剂SCT供体衍生的CMV-TCR-T细胞转移。这项试验是一项剂量升级研究，剂量范围从每剂量的1×10 3 CMV-TCR-T细胞/kg体重到每剂量的5×10 5 CMV-TCR-T细胞/kg。结果除了在一名患者中观察到的1级细胞因子释放综合征和两名患者的轻度发烧外，没有观察到其他不良事件。CMV-TCR-T细胞输注后一个月内有反应，而没有任何抗病毒药。输注后，CMV-TCR-T细胞在外周血中表现出整体稳健的膨胀和持久性。其他两名最初对CMV-TCR-T细胞疗法反应的患者具有抢救的Ganciclovir和Foscarnet给药，然后具有快速的CMV清除率。在第一次剂量的CMV-TCR-T输注后3-7天，在这些患者的外周血中首先检测到CMV-TCR-T细胞，迅速扩展并持续至少1-4个月，从而长期保护CMV反应。在一名患者中，即使仍使用抗植物抗宿主疾病疾病试剂，CMV-TCR-T细胞也开始扩展，进一步表明CMV-TCR-T细胞的增殖潜力。结论我们的研究首先表明CMV-TCR-T细胞是一种高度可行，安全有效的一线预先避免治疗，用于单倍性PBSCT后CMV重新激活。
微藻驯化面临的巨大挑战
“微藻”一词是指具有光合作用的单细胞细胞，包括来自两个生命领域的生物，即细菌（蓝藻）和来自初级（古藻体）或次级（例如，原生藻）内共生事件的各种真核生物演化支。尽管微藻在分类学上分布广泛，但它们具有一些共同的特征，使它们在某种程度上“相似”。产氧光合作用源自共同的起源，这使得微藻在营养网络中作为初级生产者占有重要地位。它们是单细胞的或形成非常小的菌落，其培养依赖于常见的方法，提供光、二氧化碳、水和营养物质。微藻可产生有价值的分子，如聚糖、脂质、色素、蛋白质等。因此，尽管“微藻”一词在植物学或分类学意义上并不恰当，但它在生态学和人类工业中有着其合法的含义。这既是将知识从一种生物体转移到另一种生物体时的弱点，也是解决类似生物技术问题时的优势。过去十年，发展以微藻为基础的产业已成为一项社会挑战。气候紧急情况和耕地压力使得每天对新型无碳和可持续生产的需求更加迫切。应用范围从食品、健康、绿色化学到生物燃料，有望利用从大气或碳排放行业捕获的二氧化碳生产生物分子。在这种背景下，“藻类行业”应运而生，聚集了专门从事藻类培养、收获、提取工艺和生物精炼的参与者。将野生藻类菌株转化为“藻类作物”，即“驯化”微藻，代表着一项艰巨的任务，因为可能存在感兴趣的初始特征，如相对较高的油、碳水化合物、色素等，但提高、可重复和可扩展产量的道路极具挑战性。农业领域可以吸取一些经验教训，为微藻领域的研究提供新的刺激。当人们在大自然中行走时，他或她会发现类似小麦、玉米、番茄、向日葵、油菜籽等的野生植物吗？与野生植物相比，农作物看起来又大又胖。此外，收获后，栽培种子很少逃逸并入侵未开垦地区。因此，植物驯化侧重于生产力和质量，而不是与野生群落竞争的适应性。野生植物和驯化植物之间的巨大差异表明，其他生命分支也应该可以获得产量的提高，请记住，栽培植物是二倍体，而目前大多数栽培的微藻是单倍体。