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墨西哥利什曼原虫 MNYC/BZ/62/ 的基因组序列...
简介 墨西哥利什曼原虫是一种可感染人类的单细胞真核生物，是引起利什曼病的物种之一。由于其毒性较低（引起皮肤利什曼病而非内脏利什曼病）并且能够在适当的无菌培养中容易分化为无鞭毛体形式，它通常被用作分子细胞生物学的模型利什曼原虫物种。我们之前曾描述过表达 Cas9 和 T7 RNA 聚合酶的转基因墨西哥利什曼原虫 MNYC/BZ/62/M379 的生成，该菌株可进行快速反向遗传修饰 1 。由于这不是参考基因组菌株（参考基因组菌株为 MHOM/GT/2001/U1103） 2 并且可能在实验室培养和/或 Cas9 或 T7 表达的选择压力下积累了突变，因此我们对这种广泛使用的菌株的基因组进行了测序，作为设计反向遗传策略的高质量参考。
GeneTargeter：针对疟原虫恶性疟原虫进行基因组编辑的自动化计算机设计
摘要 对人类疟疾病原体恶性疟原虫中大量描述不详的蛋白质进行功能表征需要工具来实现基因组规模的扰动研究。在这里，我们介绍了 GeneTargeter (genetargeter.mit.edu)，这是一种软件工具，用于自动设计同源定向修复供体载体，以实现恶性疟原虫基因的基因敲除、条件性敲除和表位标记。我们展示了 GeneTargeter 辅助的六种不同类型的恶性疟原虫基因组敲除和条件性敲除构建体的基因组规模设计，并通过成功的供体载体组装和转染实验验证了计算设计过程。该软件的模块化特性可容纳任意目标载体，并允许定制设计，以扩展在疟原虫和其他生物体中可获得的基因组操作结果。
巴西七个州和整个南美洲的间日疟原虫疟疾人群基因组研究
伦敦卫生与热带医学学院感染与热带疾病的教职员工，英国B伦敦B寄生虫学院，生物医学科学研究所，圣保罗大学，巴西圣保罗大学，巴西C公共卫生，英国公共卫生型疟疾参考Mahidol University，Mae Sot，TAK，泰国E热带医学和全球健康中心的热带医学Onia，Port Velho，巴西I寄生虫疾病实验室，研究所Oswaldo Cruz -Fiocruz- Rio de Janeiro，巴西j，圣保罗大学医学院微生物 - CIM，巴西弗鲁米嫩塞联邦大学微生物学和寄生虫学系 l 英国伦敦卫生与热带医学院流行病学与人口健康学院
协调转录转换网络介导人类疟原虫的抗原变异
摘要 疟原虫通过系统地改变暴露在受感染红细胞表面的抗原来避免免疫清除。这是通过对大型多拷贝基因家族 var 的个体成员进行严格调控的转录控制来实现的，这是疟疾感染的毒性和慢性性质的关键。var 基因的表达是相互排斥的，并受表观遗传控制，然而，大量寄生虫如何协调 var 基因转换以避免抗原库过早暴露尚不清楚。在这里，我们为一个转录网络提供了证据，该网络由一个普遍保守的基因 var2csa 锚定，该基因协调转换过程。我们描述了一种结构化的转换偏差，它会随着时间的推移而发生变化，并可能在长期感染过程中塑造 var 表达的模式。我们的研究结果解释了疟疾感染的一个以前神秘的方面，并揭示了拥有相对较少的变异抗原编码基因库的寄生虫如何协调转换事件以限制抗原暴露，从而维持慢性感染。
AIM2传感器介导肝细胞中疟原虫感染的免疫力
由疟原虫引起的临床疟疾造成了世界各地数百万人的死亡和苦难。虽然人类在肝脏最初发育过程中已知人类对疟原虫的防护性免疫反应持续，但我们对此过程的机制知之甚少。这个知识差距阻碍了我们开发自然免疫反应对疟疾的能力。我们表明，宿主肝细胞中存在的AIM2受体检测到疟原虫的DNA分子，从而导致caspase-1的非常规加工和炎性途径的激活。这会导致肝细胞的编程细胞死亡，该细胞含有疟原虫和对肝脏本身感染的早期控制，可能会限制临床疟疾。
在地中海盆地（巴利阿里群岛）的一个地方性地区，由利什曼原虫造成的人皮肤利什曼病低估了人皮肤利什曼病
摘要：利什曼病是一种由利什曼原虫属的原生动物寄生虫引起的传染性人畜共患病。在地中海盆地中，利什曼病是由leishmania Invantum引起的，并由phlebotomus属的沙片叮咬传播，狗是主要的储层宿主。最常见的形式是皮肤利什曼病（CL），尽管也发生了内脏病例。这项研究的目的是评估中等地中海地区CL的低估。因此，对在Manacor医院（马略卡岛，巴利阿里群岛）的皮肤病学服务中诊断和治疗的所有CL病例进行了回顾性研究，并将获得的数据与同一时期的地方政府流行病学公告的数据进行了比较。编制了不同的临床表现，并分析了与性别，年龄和病变类型和数量有关的数据。结果显示出明确的亚通知，这表明该地区人类CL的实际发生率尚不清楚。
利什曼原虫的遗传多样性和基因组可塑性对治疗和寻找新型化疗靶点的影响
利什曼病是拉丁美洲、非洲、亚洲和欧洲的主要公共卫生问题之一。由于缺乏人用疫苗和有效的媒介控制计划，化疗成为控制所有形式该疾病的主要策略。然而，现有药物的高毒性、治疗药物的选择有限以及耐药性寄生虫菌株的出现是与化疗相关的主要挑战。目前，只有少数药物可用于利什曼病治疗，包括五价锑化合物 (SbV)、两性霉素B及其制剂、米替福新、硫酸巴龙霉素和羟乙基磺酸喷他脒。除了药物毒性之外，利什曼病的治疗失败也是一个严重的问题。耐药性寄生虫的出现是治疗失败的原因之一，并且与该属寄生虫的多样性密切相关。由于基因组具有巨大的可塑性，抗药性可以通过改变不同的代谢途径产生，这表明抗药性机制是多因素的，极其复杂。遗传变异和基因组可塑性不仅导致现有药物存在局限性，而且使寻找新药变得具有挑战性。在这里，我们研究了阻碍药物发现的寄生虫的生物学特性。
推出 CRISPR/Cas9 胞嘧啶碱基编辑器工具箱“LeishBASEedit”——无需 DNA 双链断裂、同源重组或供体 DNA 即可对利什曼原虫进行基因编辑和高通量筛选
。CC-BY-NC 4.0 国际许可证永久有效。它是在预印本（未经同行评审认证）下提供的，作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。此版本的版权持有者于 2022 年 12 月 8 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.12.08.519658 doi：bioRxiv 预印本
临床上无症状的间日疟原虫感染。......
50 毫升毛细血管血样（n = 295）在现场保存在液氮中，随后储存在 -20°C 下，用于在自动化 QIASymphony 平台（Qiagen）上使用 QIAsymphony DNA Investigator 试剂盒（德国希尔登 Qiagen）提取寄生虫 DNA。最终 DNA 洗脱体积为 100 µL。使用基于 SYBR Green 的属特异性定量 PCR 进行疟疾分子筛查。引物对（PCBF，5'-ATG CTT TAT TAT GGA TTG GAT GTC-3' 和 PCBR，5'-CAG ACC GTA AGG TTA TAA TTA TGT-3'）靶向人类感染疟原虫的细胞色素b（cytb）基因的保守序列（21），检测阈值为每微升 0.2 个扩增子拷贝（相当于每毫升约 4 个疟原虫，假设每个单核血液阶段疟原虫平均有 50 个线粒体基因组拷贝）。20 微升反应体系含有 5 微升 DNA 溶液、7.5 微升
瞄准蚊子体内的疟原虫 - Pure
概念验证研究表明，用于人类治疗的抗疟药物也可用于蚊子，以阻断疟疾传播。部署新的控制工具最好在管理计划内进行，该计划通过最大限度地降低抗药性进化的风险并减缓其一旦出现就传播的速度来最大限度地延长药物的使用寿命。我们要问：针对蚊子体内的寄生虫会产生什么流行病学和进化后果？我们的综合研究表明，针对蚊子体内的寄生虫 (i) 可以通过轻松扩展现有的流行病学框架来建模；(ii) 提供了一种功能新颖的控制方法，与针对人类寄生虫相比，它对抗药性进化的抵抗力更强；(iii) 可以延长专门用于治疗人类的抗疟药的寿命和临床效益。