图 2:(a) 在 SIXS 光束线 (SOLEIL) 进行实时研究的实验装置,(b) 入射角为 α i 的掠入射散射几何。指示了反射的 x 射线束。显示了布拉格角 2 θ 处主 Pd(111) 布拉格反射的指向几何。由于掠入射几何,动量转移 q = kf − ki 与表面法线 n 成角度 θ − α i 。ki 和 kf 分别是入射和散射 x 射线束的波矢。通过扫描探测器角度 δ 和 γ 获得 XRD 图。在沉积过程中,2D 探测器监测白色矩形指示的区域。
生物陶瓷领域已成为各种医疗和牙科应用的重要组成部分,磷酸钙 (CaP) 材料如磷酸三钙 (TCP) 引起了广泛关注。CaP 生物陶瓷因其出色的生物相容性、骨传导性和促进新骨形成的能力而受到重视,这使得它们在优化牙科植入物的整合和性能方面具有不可估量的价值。这项研究探索了一种开发多功能 CaP 基陶瓷的新方法,该方法可利用机器学习 (ML) 建模技术的强大功能,应用于制药、牙科甚至古代文物保存领域。磷酸三钙是一种被广泛研究的 CaP 陶瓷,是这项研究的重点,因为它可以制造出不同程度的结晶度和孔隙率,以定制其生物降解和骨再生特性。通过使用前馈人工神经网络 (FFANN),研究人员能够预测牙科陶瓷、生物相容性和组织反应在广泛的无毒性和骨骼生长参数范围内的变化。 FFANN 建模方法提供了有关这些关键属性之间关系的宝贵见解,从而可以优化基于 CaP 的陶瓷以用于特定的临床和保存应用。TCP 的多功能性不仅限于牙科植入物,还可用于牙周再生、牙根修复甚至直接牙髓封盖手术。通过操纵材料的成分和微观结构,研究人员和临床医生可以定制 CaP 生物陶瓷的性能,以满足医疗保健和文化遗产部门的不同需求。随着生物陶瓷领域的不断发展,先进的 ML 建模技术(例如本研究采用的 FFANN 方法)的集成有望为开发创新的、组织友好的陶瓷开辟新的可能性,从而彻底改变牙科、药物配方和珍贵古代文物的保存。
参加COP29的ICELEI领导人欢迎15年内的第一项气候财务协议,这是当前投资的三倍。但是,他们强调,它仍然没有全球气候行动和适应所需的东西。他们强调了城市在第三次有关城市化和气候变化的部长级会议上以及COP28的Champ Initiative上的重要性,这影响了巴西最新的气候目标。展望COP30,ICELI领导人呼吁城市和地区在波恩气候会谈中参加大胆的城市2025年,主持人市政厅警察与当地行动保持一致。尽管COP29面临挑战,ICELEI的网络仍致力于推进气候危机的雄心勃勃,多层次和多层次解决方案。
如今,围绕库仑势垒对聚变反应和准弹性散射的研究引起了广泛关注。通过这类重离子碰撞可以研究核-核相互作用势和核结构性质 [ 1 ]。碰撞伙伴的核结构性质可显著影响亚势垒域中的聚变产额。聚变对中不同内在自由度的参与降低了参与者之间的聚变势垒,并导致与一维势垒穿透模型 (BPM) 的预测相比大得多的聚变结果。文献中已充分证实,聚变伙伴的相对运动和内在通道之间的耦合会导致单个聚变势垒分裂为不同高度和重量的势垒分布。这被称为聚变势垒分布,聚变势垒分布的形状对聚变过程中涉及的耦合类型非常敏感。聚变势垒分布的概念由 Rowley 等人 [2] 提出,可通过对 𝐸 𝑐.𝑚. 𝜎 𝑓 对质心能量取二阶导数获得。此外,大角度准弹性散射函数可以产生与聚变势垒分布非常相似的势垒分布,并且聚变势垒分布和准弹性势垒分布的形状基本相同。准弹性势垒分布可通过对 𝐸 𝑐.𝑚. 的准弹性散射截面取一阶导数获得。众所周知,聚变过程可以用穿透概率来解释,基于量子力学隧穿,而准弹性散射与反射概率有关。重离子准
方法在补充了10%FCS,1%谷歌补充剂(Gibco),100 U/ml青霉素和100μg/ml链霉菌素的IMDM(Gibco)中培养了衍生成近单倍型HAP1细胞的细胞培养。siRNA转染是根据制造商的指南使用Rnaimax(Invitrogen)进行的。在这项研究中使用了以下siRNA:Sinon-targetable(Dharmacon),Sipolg2(地平线,TargetPlus,SmartPool),SIMRPL23(Horizon,Targetplus,TargetPlus,Smartpool)。将所有药物(Aphidicolin,Hu,Olaparib,Rad51i(B02),DNA-PKI(NU74441)和寡霉素A)溶解在DMSO中,并以指示浓度使用。细胞使用具有137CS源的γ提取器(最佳疗法)进行γ辐射。生长测定HAP1细胞以1500个细胞/孔的密度将HAP1细胞铺在96孔板中,并被视为5天。5天后,使用100%甲醇固定细胞,并在室温下使用Crystal Violet染色2H。随后,将晶体紫溶解在10%乙酸中,并使用Biotek Epoch Epoch分光光度计在595 nm处测量强度。使用非线性拟合,sigmoidal,4pl,x是log(浓度),将这些测量值用于棱镜中的IC50计算。在9mm玻璃盖上生长免疫荧光细胞,并在室温下以4%甲醛和0.2%Triton X-100固定10分钟。使用了以下抗体:人类抗克雷斯特(Cortex Biochem,CS1058),兔抗PH3SER10(Campro,#07-081),小鼠抗ERCC6L(PICH)(ABNOVA,ABNOVA,000548421-B01P)。所有初级抗体在4°C的夜间孵育。使用固定缓冲液I(BD生物科学)固定细胞。细胞。二级抗体(分子探针,Invitrogen)和DAPI在室温下孵育2小时。使用延长金(Invitrogen)安装盖玻片。使用具有60倍1.40 Na油目标的Deltavision Deonvolution显微镜(Applied Precision)获取图像。SoftWorx(应用精度),ImageJ,Adobe Photoshop和Illustrator CS6用于处理获得的图像。单倍体插入诱变筛选基因对用APH或HU处理的HAP1细胞的存活至关重要,如先前所述35,使用单倍体插入诱变筛查鉴定。诱变的HAP1细胞是从Brummelkamp实验室获得的。简短地,获得HAP1细胞的诱变如下:在HEK293T细胞中产生了基因陷阱逆转录病毒。每天两次收获逆转录病毒至少三天,并通过离心(使用SW28转子进行2小时,21,000 rpm,4°C,4°C)进行沉淀。在8μg/ml硫酸素硫酸素的存在下,在T175烧瓶中至少连续两天,在8μg/ml硫酸素的存在下,将大约4000万个HAP1细胞通过浓缩基因陷阱病毒的转导而被诱变。在包含10%DMSO和10%FCS的IMDM培养基中冷冻诱变细胞。解冻后,在存在27.5 nm adphidicolin或100μmHu的情况下,将诱变的HAP1细胞转移了10天。传递后,通过胰蛋白酶-EDTA收集细胞,然后进行沉淀。为了最大程度地减少潜在地含有杂合突变的二倍体细胞的混杂,用DAPI染色固定的细胞,以允许使用Astrios Moflo对G1单倍体DNA含量进行分类。将3000万个排序的细胞在56°C下裂解过夜,以使使用DNA迷你试剂盒(QIAGEN)进行基因组DNA分离。插入位点映射基因陷阱插入位点通过LAM-PCR放大,然后进行捕获,ssDNA接头连接和指数放大,并在测序之前使用含有Illumina适配器的引物,如前所述,如前所述35。映射和插入位点的分析以前描述了78。简短地,在对HISEQ 2000或HISEQ 2500(Illumina)进行测序之后,将插入位点映射到人类基因组(H19),允许一个不匹配,并与RefSeq坐标相交,以将插入位点分配给基因。基因区域在相对链上重叠的基因区域没有考虑进行分析,而对于在相同链基因名称上重叠的基因是串联的。对于每种复制和两种药物治疗(APH或HU)基因的必要性都是通过二项式检验确定的。合成致死性。一个基因通过所有Fisher的测试,其p值截止为0.05,效应大小至少为0.12(减法比率wt sense比率 - 复制应力条件感官比率)。
抽象背景。尽管在IDH-WildType胶质母细胞瘤的生物学上取得了进步,但它仍然是一种毁灭性的疾病,中位生存期不到2年。然而,对当前护理标准治疗方案的异质反应的分子基础包括最大安全切除,辅助辐射和替莫唑胺化学疗法的分子基础仍然未知。方法。对106名患者的配对初始和复发性胶质母细胞瘤试样进行了全面的组织病理学,基因组和表观依赖氏症评估,以研究分子进化和细胞表型,这些分子进化和细胞表型。结果。虽然TERT启动子突变和CDKN2A纯合缺失是通过初始肿瘤和复发性肿瘤共享的神经胶质作用期间的早期事件,但大多数其他复发性遗传改变(例如,EGFR,PTEN,PTEN和NF1)通常是私有的,属于初始或反复发生的肿瘤,表明后期在后球后期的摄取。此外,胶质母细胞瘤表现出异质的表观基因组进化,亚群在全球性高甲基化,低甲基化或保持稳定的情况下变得越来越稳定。进行肉瘤转化的胶质母细胞瘤的复发时间较短,并且在NF1,TP53和RB1改变以及间质表观遗传学类中显着富集。在替莫唑胺治疗后出现体细胞超突变的患者与疾病复发和长时间的总生存期间的间隔明显更长,并且在MGMT启动子区域的4个特定CpG位点上增加了甲基化,这与这种超孕期的发展显着相关。最后,开发了347个关键CpG位点的DNA甲基化水平变化的表观基因组进化特征,与临床结局显着相关。结论。胶质母细胞瘤经历异质的遗传,表观遗传和细胞进化,其基础是预后不同的治疗反应。
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虽然最近的空间生物学创新推动了对组织组织如何改变疾病的新见解,但以通用且可扩展的方式解释这些数据集仍然是一个挑战。用于发现组织组织中条件特定差异的计算工作流程通常依赖于成对比较或无监督的聚类。在许多情况下,这些方法在计算上是昂贵的,缺乏统计严格,并且对低流行的细胞壁细分市场不敏感,这些细胞壁细分市场仍然高度歧视和预测患者的结果。在这里,我们提出了乳蛋饼 - 一种自动化,可扩展性和统计上健壮的方法,可用于发现在空间区域,纵向样本或临床患者群体中差异富集的细胞壁细分市场。与现有方法相反,乳蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白原将局部利基检测与可解释的统计建模相结合,使用图形邻域来检测差异富集的细胞壁细分市场,即使在较低的患病率下也是如此。在人类组织的硅模型和空间蛋白质组学成像中,我们证明了乳蛋饼可以准确地检测出少于20%的患者样品的频率为0.5%的条件特异性细胞壁细分市场,从而超过了下一个最佳方法,该方法需要患者患者的患病率为60%才能进行检测。为了验证我们的方法并了解肿瘤结构如何影响三重阴性乳腺癌(TNBC)的复发风险,我们使用蛋饼全面介绍了多中心的空间蛋白质组学群体中的肿瘤微环境,这些蛋白质组学同类群体由原发性手术切除术组成,由314例患者分析了200万个细胞,分析了500万个患者。我们发现了始终富集在肿瘤微环境的关键区域的细胞壁细分市场,包括肿瘤免疫边界和细胞外基质重塑区域,以及与患者的统计相关的壁细分市场,包括复发状态和复发性无效生存。大多数差异壁ni(74.2%)是针对未复发并形成富含肿瘤和肿瘤细胞单核细胞,巨噬细胞,APC和CD8T细胞的强大互连网络的患者。相比之下,复发的患者的相互作用网络明显稀疏,并且在B细胞,CD68巨噬细胞和中性粒细胞中富集。我们使用两个独立人群验证了这些发现,观察了相似的细胞相互作用和预测能力。总的来说,这些结果表明,生产性抗肿瘤免疫反应的显着,普遍的特征是由与肿瘤和基质细胞的先天和适应性免疫之间的结构参与网络所定义的,而不是由任何特定的细胞群体。,我们已在https://github.com/jranek/quiche中免费提供作为用户友好的开源Python软件包。
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