光电反应 /紫外线 /光电反应酶 /环戊丁基嘧啶二聚体 / 4A,5还原的黄素< / div < / div < / div < / div < / div
5-氟尿嘧啶 (5FU) 转化为活性核苷酸类似物的代谢途径已被详细描述。4 二氢嘧啶脱氢酶使 80-90% 的 5FU (DPD,由 DPYD 基因编码) 失活为 5,6-二氢氟尿嘧啶 5。3 - 6% 的人口患有 DPD 缺乏症,并与严重毒性(腹泻、中性粒细胞减少症、粘膜炎)有关。6、7、8 DPYD 的多态性是与严重毒性相关的 DPD 原发性缺乏症的最常见原因。临床上最相关的多态性是 DPYD*2A(IVS14+1G>A、c.1905+1G>A 或 rs3918290)和 c.2846A>T(D949V 或 rs67376798)。 9、10 荟萃分析表明,其他 DPYD 变体 c.1679T>G 和 c.1236G>A/HapB3DPYD 是氟嘧啶毒性的临床相关预测因子。11
标题:靶向角蛋白 17 介导的从头嘧啶生物合成重编程以克服胰腺癌的化学耐药性 作者:Chun-Hao Pan 1,2*、Nina V. Chaika 3*、Robert Tseng 1*、Md Afjalus Siraj 4、Bo Chen 1、Katie L. Donnelly 1、Michael Horowitz 1、Cindy V. Leiton 1、Sumedha Chowdhury 4、Lucia Roa-Peña 1、Lyanne Oblein 1、Natalia Marchenko 1、Pankaj K. Singh 3¶、Kenneth R. Shroyer 1¶、Luisa F. Escobar-Hoyos 4¶ 附属机构:1. 美国纽约州石溪市石溪大学文艺复兴医学院病理学系 2. 分子和3. 内布拉斯加大学医学中心病理学和微生物学系,内布拉斯加州奥马哈,美国 4. 耶鲁大学治疗放射学和分子生物物理学和生物化学系,康涅狄格州纽黑文,美国 *这些作者对这项工作贡献相同¶ 通讯作者 标题:K17 诱导的嘧啶生物合成驱动 PDAC 化学耐药性 关键词:胰腺癌、角蛋白 17、代谢重编程、嘧啶生物合成、二氢乳清酸脱氢酶 附加信息 财政支持:这项工作得到了胰腺癌行动网络转化研究基金的资助;资助编号 18-65-SHRO(KRS)、NCI K99-R00 CA226342-01(LFE-H)、赫什伯格基金会(LFE-H)、达蒙·鲁尼恩基金会(创新者奖 - LFE-H)、为纪念露丝·巴德·金斯伯格 (Ruth Bader Ginsburg) 而颁发的 AACR 胰腺癌研究奖(LFE-H)、以及石溪大学颁发的 Bahl IDEA 奖(KRS)。通讯作者:1. Pankaj K. Singh, PhD 940 Stanton L. Young Blvd., Oklahoma City, OK 73104 (405)-271.8001, pankaj-singh@ouhsc.edu 2. Kenneth R. Shroyer, MD, PhD 101 Nicolls Road, Stony Brook, NY 11794 (631) 444-3000, Kenneth.Shroyer@stonybrookmedicine.edu 3. Luisa F. Escobar-Hoyos, PhD, MS 15 York Street, New Haven, CT 06513 (203) 737-2003, luisa.escobar-hoyos@yale.edu
储存和稳定性: 尿嘧啶 DNA 糖基酶采用干冰或蓝冰运输。到货后储存于 -20°C 下,以获得最佳稳定性。 有效期: 在外包装盒标签上的有效期内,在推荐条件下储存并正确处理时,试剂盒可保持完整活性。 单位定义: 一个单位是指每分钟催化含尿嘧啶双链 DNA 释放 60 pmol 尿嘧啶的酶量。通过 37°C 下 30 分钟内在含有 0.2 mg DNA ( 10 4 -10 5 cpm/mg )的 50 mL 反应预混液中释放 [ 3 H]- 脲嘧啶来测量活性。 安全预防措施: 处理试剂前请阅读并理解 SDS (安全数据表)。首次发货时提供 SDS 的纸质版文件,此后可应要求提 供。 质量控制: Meridian 遵守 ISO 13485 质量管理体系运行。尿嘧啶 DNA 糖基酶在放行前经过广泛的活性测试。
摘要Poly(嘧啶)植脂(嘌呤)裂纹已在许多嗜酸性基因的5'频乘区域中发现。它们可能参与表达的调节,因为它们可以映射到活性染色质的核酸酶敏感位点。我们发现聚(嘧啶).poly Spurine)DNA,其中含有5-甲基环肽(例如poly [d(tm c)]。poly [d(ga)])将在8个以下的pH下形成三元。相反,未甲基化的类似物,poly [d(tc)]合成5DNA包含重复的三核苷酸和poly [d(um c)]。poly [d(ga)]以类似的方式行为。因此,可以通过胞嘧啶的甲基化来控制三元的稳定性。这提出了一个基于在胞核基因5'侧的特定三边形形成的表达调节模型。
DNA双螺旋含有金属介导的DNA(mMDNA)碱基对由嘧啶:嘧啶对之间的Ag +和Hg 2 +离子构建,并具有纳米电子的承诺。MMDNA纳米材料的合理设计是不切实际的,没有完整的词汇和结构描述。在这里,探索了结构性DNA纳米技术的可编程性,探索了其自我组装的生物分子结构测定平台的自我组装的使命。使用X射线差异构建MMDNA对的全面结构库,并阐明了MMDNA构建的广义设计规则。发现了两种结合模式:N3-主导,中心对称对和由5位环修改驱动的主要凹槽粘合剂。能量差距计算显示了MMDNA结构的最低未居住的分子轨道(LUMO)中的额外水平,使它们具有吸引力的分子电子候选物。
摘要:含有金属介导的DNA(MMDNA)碱基对的DNA双螺旋已经由嘧啶:嘧啶对之间的Ag +和Hg 2+离子构建,并具有纳米电子学的承诺。MMDNA纳米材料的合理设计是不切实际的,没有完整的词汇和结构描述。在这里,我们探讨了结构性DNA纳米技术的可编程性,以使其成立的使命是为生物分子结构确定的衍射平台进行自组装。我们采用了张力三角形来通过X射线衍射和MMDNA构建的概括性设计规则来构建MMDNA对的全面结构库。我们发现了两种结合模式:N3-主导,中心对称对和由5位环修饰驱动的主要凹槽粘合剂。能量间隙计算显示,MMDNA结构的最低未居住的分子轨道(LUMO)中显示了额外的水平,使它们具有吸引力的分子电子候选物。
摘要 RNA 引导的 CRISPR/Cas9 系统是基因组编辑的强大工具,但其靶向范围受到原型间隔区相邻基序 (PAM) 的限制。为了扩大靶向范围,开发能够识别多种 PAM 的 CRISPR 工具箱至关重要。在这里,我们使用 GFP 激活分析测试了与 Nme1Cas9 密切相关的 29 种 II-C 型直系同源物的活性,其中 25 种在人类细胞中有活性。这些直系同源物识别具有不同长度和核苷酸偏好的多种 PAM,包括富含嘌呤、富含嘧啶以及混合嘌呤和嘧啶的 PAM。我们深入表征了 Nsp2Cas9 的活性和特异性。我们还生成了一种识别简单 N 4 C PAM 的嵌合 Cas9 核酸酶,这代表了迄今为止紧凑型 Cas9 最宽松的 PAM 偏好。这些 Cas9 核酸酶显著增强了我们进行等位基因特异性基因组编辑的能力。
为什么我们需要颠换碱基编辑器? CRISPR-Cas9 系统彻底改变了基因组工程领域。该系统通过在基因组中生成小的插入/缺失,可高效地引起靶向敲除。从一个核苷酸到另一个核苷酸的精确修改需要充足的供体模板供应和同源定向修复 (HDR) 途径的诱导 [1]。胞嘧啶碱基编辑器 (CBE) 和腺嘌呤碱基编辑器 (ABE) 的发明使我们能够在没有供体模板的情况下在 DNA 或 RNA 中进行靶向 C 到 T 和 A 到 G 的转换 [2-5]。CBE 和 ABE 都已广泛应用于各种生物体,以创建或纠正点突变,用于不同的应用 [5、6]。然而,CBE 和 ABE 仅催化碱基转换(嘌呤到嘌呤或嘧啶到嘧啶),并且只能用于实现 12 种可能的碱基替换中的 4 种。尽管如此,许多生物、治疗和作物改良应用都需要