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1 BRCA1二级剪接位点突变驱动外显子...
。cc-by-nd 4.0国际许可证可永久提供。是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以显示预印本（未经同行评审证明）预印版本的版权所有者此版本发布于2023年8月28日。 https://doi.org/10.1101/2023.03.20.23287465 doi：medrxiv preprint
NSCLC 中的 MET 外显子 14 跳跃：流行病学、临床特征和结果的系统文献综述
简介：MET 外显子 14 (MET ex14) 跳跃是非小细胞肺癌 (NSCLC) 中一种罕见的致癌驱动因素，MET 酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 的靶向治疗最近已获批准。鉴于已发表的 MET ex14 跳跃 NSCLC 数据存在异质性，我们进行了系统的文献综述，以评估其频率、患者特征和结果。方法：2022 年 6 月 13 日，我们对报告 MET ex14 跳跃 NSCLC 患者频率、患者特征或结果的出版物和会议摘要进行了系统的文献综述。结果：我们纳入了 139 项报告频率或患者特征的研究（350,997 名患者）和 39 项报告临床结果的研究（3989 名患者）。在未经选择的 NSCLC 患者中，MET ex14 跳跃频率的中位数为 2.0%，地理差异很小。腺癌或非鳞状亚组中的中位频率为 2.4%，肉瘤样亚组中的中位频率为 12.0%，鳞状组织学中为 1.3%。MET ex14 跳跃 NSCLC 患者更有可能是老年人，具有腺癌组织学；性别或吸烟状况分布不明显。在一线治疗中，靶向治疗的中位客观缓解率为 50.7% 至 68.8%（两个值均对应于 MET TKI），免疫治疗的中位客观缓解率为 33.3%，化疗的中位客观缓解率为 23.1% 至 27.0%。结论：MET ex14 跳跃的患者更有可能具有某些特征，但不能排除任何患者亚组；因此，对所有 NSCLC 患者进行测试以确定适合 MET 抑制剂治疗的候选人至关重要。尽管没有发现与化疗或免疫治疗方案的直接比较，但 MET TKI 似乎具有更高的疗效结果。
化学降低复合二氧化碳化学动力学 全原因和血管性痴呆的全基因组范围的荟萃分析 反义寡核苷酸调节与SCN1A相关的Dravet综合征中毒药外显子的异常包含 遗传性心律不齐的IPSC衍生的心肌细胞：病原力学发现和药物发育 大麻二酚和大脑功能：当前的知识和未来观点 多发性硬化症中的二甲双胍附加临床研究，以评估脑透明度和神经变性（MACSIMISE-BRAIN）：多中心随机安慰剂对照临床试验的研究方案 Auranofin通过触发突变体p53非小细胞肺癌的不同分子细胞死亡机制和先天免疫来揭示治疗性抗癌的潜力 KV7.2在神经发育中的作用 用于... 的新型FAP抑制剂同型二聚体 Akt在获得的西妥昔单抗抗颈部鳞状细胞癌中的作用：一项针对新型组合策略的体外研究 神经图像：临床 tepotinib的疗效和安全性外显子14 ... 的安全性 网状多样性在金属有机框架中的应用 基因组范围的DNA甲基化分析以及潜在泛癌和肿瘤特异性生物标志物的鉴定 机器学习检测出极端婴儿的脑室室内出血” 2279 KCNQ2-和KCNQ3相关癫痫 ctla4，sh2b3和clec16a多样化影响... 大脑行为和免疫力
参考：Sun S.R.，Wang H.X.，Bogaerts Annemie.-化学降低化学co₂化学动力学：应用于滑动弧等离子体等离子体的等离子体来源科学技术 /物理研究所[Londen] - ISSN 0963-0252-29-29：29：2（2020），0220），0250） https://doi.org/10.1088/1361-6595/ab540f引用此参考：https：//hdl.handle.net/10067/10067/1671350151166216621665141
介导 DMD 基因外显子跳跃的主要编辑策略
杜氏肌营养不良症是一种罕见且致命的遗传性疾病，因 DMD 基因突变导致进行性肌肉萎缩。我们使用 CRISPR-Cas9 Prime 编辑技术开发了不同的策略来纠正 DMD 基因中外显子 52 或外显子 45 至 52 缺失的移码突变。使用优化的 epegRNA，我们能够在高达 32% 的 HEK293T 细胞和 28% 的患者成肌细胞中诱导外显子 53 剪接供体位点的 GT 核苷酸的特异性替换。我们还分别在 HEK293T 细胞和人类成肌细胞中实现了外显子 53 的 GT 剪接位点的 G 核苷酸的缺失高达 44% 和 29%，以及在外显子 51 的 GT 剪接供体位点之间插入 17% 和 5.5% 的 GGG。修改外显子 51 和外显子 53 的剪接供体位点可引发它们的跳跃，从而分别允许外显子 50 连接到外显子 53 和外显子 44 连接到外显子 54。如蛋白质印迹所示，这些修正恢复了肌营养不良蛋白的表达。因此，使用 Prime 编辑在外显子 51 和 53 的剪接供体位点诱导特定的替换、插入和缺失，以分别纠正 DMD 基因中携带外显子 52 和外显子 45 至 52 缺失的移码突变。
1 BRCA1二级剪接位点突变驱动外显子...
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。永久性。预印本（未经Peer Review认证）是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以在2023年3月21日发布此版本中显示此版本的版权所有者。 https://doi.org/10.1101/2023.03.20.23287465 doi：medrxiv preprint
引用Stamatiadis，P.，Cosemans，G.，Boel，A.，Menten，B.，Sutter，P。De，P. de，Stoop，D.，…Heindryckx，B。（2022）。 tead4调节滋养剂差异对外显子疗法的下一步进行Duchenne肌肉营养不良
摘要简介：确定外显子的方法可以恢复Duchenne肌肉营养不良（DMD）患者的肌营养不良蛋白。但是，肌营养不良蛋白的恢复水平较低，并且该领域正在发展以提供改善外显子跳过的解决方案。dmd是一种与慢性肌肉组织丧失相关的神经肌肉疾病，归因于缺乏肌营养不良蛋白，导致肌肉炎症，纤维化形成和再生受损。目前，美国食品和药物管理局批准了基于磷二次化的磷脂型化学（PMO）化学的四个反义寡核苷酸（AONS），用于对符合条件的DMD患者的外显子跳过疗法。涵盖的领域：本综述描述了临床前和临床经验，并在DMD上批准了新开发的AONS，概述了为提高AON效率的努力，审查了临床试验的挑战，并总结了DMD领域外显子跳过方法的当前状态。专家意见：DMD的外显子跳过方法正在开发中，并且（前）临床研究的几种化学修饰都在进行（预）范围内。尽管存在这些修改的现有优势，但必须在计划或正在进行的临床试验中检查其安全性和有效性。此外，我们提出使用自然历史控制的临床环境，以促进研究治疗的功能效应。
全外显子组测序线粒体 DNA 分析 + CNV
对于外显子组重新分析，无需收集或发送新样本，因为对于此项检查，使用已处理样本的原始数据获得的分析会进行重新处理，从而避免对样本进行新的技术处理。然而，有必要使用医疗请求中的当前信息，告知患者的临床状况、新的临床发现、诊断假设以及外显子组重新分析请求。
反义寡核苷酸调节与SCN1A相关的Dravet综合征中毒药外显子的异常包含
摘要：随着发现诱导的多能干细胞（IPSC），现在可以从无限的体细胞来源产生多种细胞类型，包括IPSC衍生的心肌细胞（IPSC-CM）。这些IPSC-CM用于不同目的，例如疾病建模，药物发现，心脏毒性测试和个性化医学。2D IPSC-CM模型已显示出令人鼓舞的结果，但与体内成人心肌细胞相比，它们更不成熟。新颖的方法创建3D模型，并可能正在开发其他（心脏）细胞类型。这不仅会改善细胞的成熟度，而且还会导致更与人心脏更相似的生理相关模型。在这篇综述中，我们着重于2D和3D中遗传性心律不齐的建模以及这些模型在治疗开发和药物测试中的使用。
使用新生的整个外显子组测序和MassArray基因分型的巴基斯坦Pashtun种族种族中的2型糖尿病遗传风险变异：病例对照协会研究
全基因组关联研究大大增加了T2DM相关风险变异的数量，但大多数都集中在欧洲起源的种群上。在包括巴基斯坦在内的发展中国家，此类研究缺乏。巴基斯坦人口中T2DM的高流行促使我们设计了这项研究。 我们已经在Pashtun种族人口中设计了一个两个阶段（发现阶段和验证阶段）病例对照研究，其中招募了500个T2DM病例和对照，以研究T2DM遗传风险变异。 在发现阶段的整个外显子组测序（WES）中用于基于SIFT和多phen评分，并建议T2DM致病性SNP。在验证阶段，使用Massar-Ray基因分型和适当的统计检验确认了所选变体的T2DM关联。 研究结果表明，目标正相关rs1801282/ pPARG（OR = 1.24，95％Cl = 1.20–1.46，p = 0.010），rs745975/ hnf4a（OR = 1.30，95％cl = 1.06-1.38，p = 1.06–1.38，p = 0.004），或95％CLIS，RS RS RS rS rs rs = 1.252（rs rs rs rs glis） 1.07–1.66，p = 0.016），rs8192552/ mtnr1b（OR = 1.53，95％Cl = 0.56–1.95，p = 0.012）和rs1805097/ irs-2（OR = 1.27，95％cl = 1.36-1.36–1.92，p = 0.045）而RS6415788/ GLIS3，RS61788900/ NOTCH2，RS61788901/ NOTCH2和RS11810554/ NOTCH2（p> 0.05）均显示无显着关联。 识别遗传风险因素/变体可以用于定义高风险受试者评估和预防疾病。巴基斯坦人口中T2DM的高流行促使我们设计了这项研究。我们已经在Pashtun种族人口中设计了一个两个阶段（发现阶段和验证阶段）病例对照研究，其中招募了500个T2DM病例和对照，以研究T2DM遗传风险变异。在发现阶段的整个外显子组测序（WES）中用于基于SIFT和多phen评分，并建议T2DM致病性SNP。在验证阶段，使用Massar-Ray基因分型和适当的统计检验确认了所选变体的T2DM关联。研究结果表明，目标正相关rs1801282/ pPARG（OR = 1.24，95％Cl = 1.20–1.46，p = 0.010），rs745975/ hnf4a（OR = 1.30，95％cl = 1.06-1.38，p = 1.06–1.38，p = 0.004），或95％CLIS，RS RS RS rS rs rs = 1.252（rs rs rs rs glis） 1.07–1.66，p = 0.016），rs8192552/ mtnr1b（OR = 1.53，95％Cl = 0.56–1.95，p = 0.012）和rs1805097/ irs-2（OR = 1.27，95％cl = 1.36-1.36–1.92，p = 0.045）而RS6415788/ GLIS3，RS61788900/ NOTCH2，RS61788901/ NOTCH2和RS11810554/ NOTCH2（p> 0.05）均显示无显着关联。识别遗传风险因素/变体可以用于定义高风险受试者评估和预防疾病。
EGFR 或 HER2 外显子 20 插入突变的非小细胞肺癌：诊断和治疗方案
摘要 由于针对致癌突变的靶向治疗取得了巨大成功，因此在诊断出非小细胞肺癌 (NSCLC) 后便会进行分子检测。表皮生长因子受体 (EGFR) 突变是 NSCLC 中最常见的突变，EGFR 外显子 20 插入突变 (exon20ins) 是继 EGFR 外显子 19 缺失和外显子 21 L858R 突变之后的第三大 EGFR 突变。EGFR 外显子 20ins 通常对经典 EGFR 抑制表现出耐药性。mobocertinib 和 amivantamab 两种治疗方法最近成为美国食品药品监督管理局 (FDA) 批准用于治疗铂类疗法后出现这些突变的肺癌的首批药物。围绕这两种药物的研究表明其疗效强劲，但副作用很大。另一个可靶向的驱动突变是人表皮生长因子受体 2 (HER2) 外显子 20ins，约占 NSCLC 患者的 2-3%。这种突变已在体外和临床上得到大量研究，曲妥珠单抗德鲁替康最近刚刚获得 FDA 的加速批准，这是基于 Destiny-Lung01 研究中证明的高效性。然而，与 EGFR 抑制剂类似，HER2 抑制剂在临床研究中也有毒性证据。在本文中，我们讨论了 EGFR 和 HER2 外显子 20 对多种标准治疗方案（例如铂类化疗和经典 EGFR 酪氨酸激酶抑制剂）以及免疫疗法的有限反应。我们还回顾了最近批准和即将推出的靶向治疗方案，考虑了目前正在进行的关于疗效和减少副作用的研究，以及将这些药物纳入已获批准的治疗方案的风险和益处。