MPL exon 10 186 S1048-SP0405- L29871 B1 p.W515L=c.1544G>T MPL exon 10 181 S1048-SP0405-L29870 B1 p.W515K=c.1543_1544TG> AA KIT exon 17 200 17722-SP0542-L23707 B1 p.d816v = c.2447a> t jak2外显子12 * 167 16924-L21237 B1 p.n542_e543del = c.1624_1624_1629delaatgaa jak2 exon 12 * 172 16924-l21238 b1外显子14§24013190-L21572 B1 p.v617f = c.1849g> t Calr外显子9 124 S0999-L26702 B1 P.L367FS*46 = C.1092_1143DEL52 CALR EXON 9 130 S1001-L26517 B1 P.K3852 = C.1154_1155INstTGTC注意:请咨询相应的Probemix产品说明,以获取有关外显子编号,突变命名法和所使用的基因转录本的更多信息。
引言Illumina Trusight One临床外显子(TSO CE)于2015年12月引入了西米德兰兹区域遗传学实验室,以取代现有的下一代测序和Sanger测序服务。变化背后的驱动力是扩大测试组合并提高接送率,同时保持临床敏感性和特异性,并降低成本。在这里,我们介绍了从稀有疾病服务中选择的1604例案件的第一个队列的审查。
图1:具有外显子组2.5富集工作流程的Illumina®DNA准备以及完成每个步骤所需的时间。实心蓝色块表示甲板的孵化,白色块表示需要在Sciclone NGSX工作站上脱落热循环孵育的步骤。所有孵育均在Sciclone NGSX IQ Workstation上进行。手动完成(在固体绿色块中表示)。
7. 外显子图谱为何如此重要?RNA-seq 能否可靠地识别单核苷酸变异 (SNV),从而有可能在某些应用中取代全外显子组测序 (WES)?
核酸的选择性分裂一直是最具挑战性的主题之一,并且报道了许多优雅的人工核酸酶。1然而,它们中的大多数利用脱氧核糖在目标部位的氧化裂解,而自然核酸酶展示的水解分裂从未被模仿。最大的障碍是为此目的缺乏适当的催化残留物:尚未实现线性DNA的非酶促水解。2线性DNA是如此稳定,以至于催化剂必须表现出显着的加速度(pH 7,25oC的磷酸二酯连接的半衰期估计为2亿年)。3•4至少出于某些目的而言,比氧化性裂解是可取的,因为不涉及可扩散的物种,并且在必要时可以将所得的DNA片段酶上宗教。最近,作者发现灯笼金属离子有效地切割质粒超螺旋DNA。5这里我们表明,这些金属离子的催化成功地适用于单链和
简介:MET 外显子 14 (MET ex14) 跳跃是非小细胞肺癌 (NSCLC) 中一种罕见的致癌驱动因素,MET 酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 的靶向治疗最近已获批准。鉴于已发表的 MET ex14 跳跃 NSCLC 数据存在异质性,我们进行了系统的文献综述,以评估其频率、患者特征和结果。方法:2022 年 6 月 13 日,我们对报告 MET ex14 跳跃 NSCLC 患者频率、患者特征或结果的出版物和会议摘要进行了系统的文献综述。结果:我们纳入了 139 项报告频率或患者特征的研究(350,997 名患者)和 39 项报告临床结果的研究(3989 名患者)。在未经选择的 NSCLC 患者中,MET ex14 跳跃频率的中位数为 2.0%,地理差异很小。腺癌或非鳞状亚组中的中位频率为 2.4%,肉瘤样亚组中的中位频率为 12.0%,鳞状组织学中为 1.3%。MET ex14 跳跃 NSCLC 患者更有可能是老年人,具有腺癌组织学;性别或吸烟状况分布不明显。在一线治疗中,靶向治疗的中位客观缓解率为 50.7% 至 68.8%(两个值均对应于 MET TKI),免疫治疗的中位客观缓解率为 33.3%,化疗的中位客观缓解率为 23.1% 至 27.0%。结论:MET ex14 跳跃的患者更有可能具有某些特征,但不能排除任何患者亚组;因此,对所有 NSCLC 患者进行测试以确定适合 MET 抑制剂治疗的候选人至关重要。尽管没有发现与化疗或免疫治疗方案的直接比较,但 MET TKI 似乎具有更高的疗效结果。
摘要:具有致敏致癌驱动突变的非小细胞肺癌 (NSCLC) 患者已从靶向治疗中获得了临床益处。EGFR 突变组成性激活信号通路,导致促生存和抗凋亡信号。经典的致敏 EGFR 突变,例如外显子 19 缺失和外显子 21 L858R 点突变,对酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 反应良好。另一方面,在 4-12% 的 EGFR 突变 NSCLC 中观察到 EGFR 外显子 20 同框插入,并且对 TKI 靶向治疗具有耐药性。2021 年 5 月,美国联邦药品管理局 (FDA) 加速批准了阿米凡他单抗 (Rybrevant) 用于接受铂类化疗后 EGFR 外显子 20 插入突变的局部晚期或转移性 NSCLC 成人患者。在这里,我们讨论阿米凡他单抗的特性、临床试验结果以及 EGFR 外显子 20 插入突变 NSCLC 患者的治疗。关键词:阿米凡他单抗、表皮生长因子受体、间充质上皮转化因子、MET、非小细胞肺癌、酪氨酸激酶抑制剂
为了探测靶向治疗的肿瘤的基因组谱,对组织标本和相关的血液样本进行了NGS分析,并确定了Met Exon 14跳过突变(C.3026_3028+11DEL)(图1B和1C)。未发现其他驱动基因变体。突变等位基因频率为33.87%。同样,组织样品的放大片段小于18S rRNA,与Met Exon 14跳过H569细胞系相似,进一步证实了Met Exon 14跳过的出现(图1D)。根据这些发现,患者每天两次开始用250毫克Crizotinib治疗。最值得注意的是,经过一个月的治疗后成像显示肿瘤显着减少。他的肺肿瘤的大小为1.0 cm×0.8 ccm×0.4 cm,符合recist的部分反应标准(-98%,图1E)。这持续了4个月,直到他经历了与疾病无关的死亡。
图。有关外显子和内含子区域的符号DNA序列瞄准了外显子和内含子区域的DNA序列上的分类。在本研究中的设计和方法论,使用基于人工智能的系统进行了DNA序列中的外显子和内含子区域的分析。独创性通常首选用于评估文本数据的聚类方法在DNA序列上使用。这种情况降低了计算成本。的发现是解决生物信息学领域越来越多的数据的解决方案,建立了基于人工智能的结构,可提供低成本。因此,研究与遗传学有关的情况变得更加容易。结论DNA结构上的外显子和内含子区域的准确率为88.88%。宣布道德标准本文的作者宣布,本研究中使用的材料和方法不需要道德委员会许可和/或法律特殊许可。