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在硅分子对接活跃的邦格叶化合物...
摘要前列腺癌是最常见的恶性疾病，是死亡的主要原因。已知Bungur叶（Arjunate酸，ASI酸，油酸，ursolic酸和染色酸）的活性化合物已知具有抑制雄激素受体的能力。这项研究的目的是确定雄激素受体抑制抗癌的活性，知道能量结合及其在雄激素受体上的相互作用的价值，了解对接化合物的药代动力学特征。本研究使用Bungur叶子的对接分子方法（Lagerstoremia speciosa（L。））作为测试化合物，1GS4作为前列腺癌中雄激素受体的靶蛋白。在计算机分子对接中使用AutoDockTools软件，DiscoveryStudioSlient，PubChem，Marvinsketch和ADMET预测使用AdmetLab 2.0 WebServer。基于以静态三萜的形式获得的结果，其中包括23个羟基酸盐酸，Asi-Acid，灰甲酸，灰核酸，阿朱酸酯酸，耐氧酸和荷尔酸是在Lagersstromia氏族中发现的几种化学化合物。染色酸，结肠酸，荷甲酸和β-位乙醇糖苷是一些三萜类化合物，这些三萜在通过扁平酸中发现的三萜类化合物，显示出抑制作用和其他活性化合物之间的最佳能量结合值。并且具有良好的药代动力学价值。关键字：灌木叶，雄激素受体，前列腺癌的活性化合物，在硅分子对接中。
选择性有机化合物与目标蛋白质的分子对接性能
近年来，将小分子“对接”到大分子靶标的内腔和结构中，并“评分”其与结合位点的预期互补性的计算方法通常用于命中识别和先导化合物优化。可以肯定的是，目前有多种药物的开发受到基于结构的设计和筛选技术的强烈影响或依赖该技术，例如 HIV 蛋白酶抑制剂 [1-6]。总而言之，根据当前的评分方案，这些方法的应用存在相当大的困难。从根本上讲，对接过程涉及预测靶向结合位点内的配体构象和方向（或姿势）。一般来说，对接研究有两个重要目标。第一个是准确的结构建模，另一个是准确预测活性。然而，识别负责特定生物识别及其应用的分子特征，或预测可用于增强能力的化合物的修饰/改变，通常会产生复杂的问题，这些问题通常非常棘手，难以轻松且频繁地理解 [7]。
抗抑郁药物的密度函数理论 (DFT)、光谱和分子对接研究
简介 在精神病学领域，三环类抗抑郁药被广泛用于治疗各种疾病，尤其用于治疗临床抑郁症 [1–3]。在大多数情况下，这些药物的主要目的是抑制突触前区域对去甲肾上腺素或血清素的吸收。然而，这些药物的效力各不相同，而且往往会引起不良的副作用。尽管有更新、更安全的替代品，但三环类抗抑郁药仍然被用作处方药，因为它们成本较低，而且是一类最突出的抗抑郁药。尽管还有其他选择，情况仍然如此。三环原子构成三环抗抑郁药的分子结构，这些药物的名称由此而来 [4–7]。在大多数情况下，核心环由七个原子组成，侧链由 N-烷基甲胺或 N-烷基二甲胺组成。丙咪嗪、地昔帕明、氯米帕明、阿米替林、去甲替林、多塞平和曲米帕明等药物是常用的三环类抗抑郁药的例子[8-10]。
药物发现中的分子对接：技术、应用和进展
目的：本研究的主要目的是全面回顾分子对接在药物发现领域的意义。这包括研究分子对接中使用的各种方法和方法，以及探索用于解释和验证对接结果的技术。方法：为了收集相关数据，使用 Web of Science、PubMed 和 Google Scholar 进行了系统搜索。搜索重点关注与分子对接方法及其在药物发现中的应用相关的文章。此外，还考虑了可用于更精确模拟配体-蛋白质相互作用的替代技术。结果：分子对接已被证明是药物发现领域中一个非常丰富和有价值的过程。它的灵活性允许结合先进的计算技术，从而提高药物发现过程的可靠性和效率。研究结果强调了分子对接领域取得的重大进展，展示了其彻底改变药物发现的潜力。结论：分子对接不断发展，定期取得新的进展。尽管面临挑战，这些进步极大地促进了分子对接的增强，巩固了其作为药物发现领域重要工具的地位。
比较抗癌的活性和基于伊萨替汀支架的分子对接
摘要。背景/目标：从抗癌活性方面确定三个基于伊萨蛋白的支架的最佳。材料和方法：基于伊萨蛋白的支架的合成是通过反应形成席夫碱的。由瑞士目标预测工具和Autodock Vina进行分子对接组成。使用WST1生存力测定法确定抗癌活性和细胞毒性。结果：合成了三个支架（IA，IB和IC），并以良好的反应产率确认。瑞士目标预测工具显示了激酶的趋势。分子对接测定法证明IC对CDK2的亲和力更高。抗癌活性测定法被认为是针对癌细胞系的最活跃的。细胞毒性导致非癌细胞的细胞毒性表明缺乏选择性。结论：在抗癌活性方面，支架IC被确定为最好的，这些作用可能是由于CDK2的抑制作用所致，如分子对接所证明的那样。
来自Tridax Procumbens的生物活性化合物的分子对接分析
Tridax Procumbens Linn是Asteraceae家族的成员。土著医学利用了几种Tridax Procumbens提取物来治疗人类和动物的一系列疾病和状况。它已在印度传统医学中广泛使用了多年，用于各种目的，包括免疫调节，抗凝剂，真菌感染，腹泻和痢疾。在民间医学中，叶提取物用于治疗感染性皮肤问题。此外，它被规定为“ Bhringraj”，这是一种众所周知的肝脏条件的阿育吠陀治疗。酚类或其氧取代的衍生物（主要是次级代谢产物）在植物中发现。至少有12,000人被排除在外。这些化合物充当植物对草食动物，昆虫和细菌的防御机制（2,3）。
首届RCEP商机对接会（中国-泰国）日程草案
Counselor Cashier 2 Wang Wenqing Chairman Taizhou Electrical Bicycle Association 3 Luo Jiangang General Manager International Division of AIMA Technology Group Co., Ltd. 4 Yu Xiangyun Supervisor Taizhou Jiayue Electrical Bike Industry Co., Ltd. 5 Chen hui Executive Director Taizhou Huangyan Jufeng LoComotive Co., Ltd. 6 Liang Ruihong Chairman Zhejiang Benbao Electrical Bike Industry Co., Ltd. 7 He Jinhui General Manager Huari Holding Group Co., Ltd. 8 Qiu Desheng General Manager Jiangmen City Huri Motor Spare Part Co., Ltd. 9 Wei Saijun Chairman Taizhou Best Automation Technology Co., Ltd. 10 Liang Jianguo Supervisor Taizhou Taijing Intellectual Property Agency Co., Ltd. 11 Yang Xiaofeng
用于筛选环氧合酶的分子对接分析...
炎症反应在肿瘤发生和癌变中都起着重要作用。在这项研究中，乳酸乳球菌亚乳球菌的继发代谢产物化合物。乳酸（LAC3），并通过分子对接和分子动力学（MD）分析筛选对COX-2受体的潜在抑制活性。抗炎剂Mofezolac和布洛芬用作阳性对照配体。结果表明5--（（4-氨基-6-氨基-4-甲氧蛋白-4-基-1,3,5-三嗪-2-基）氨基）氨基] -2-甲基苯甲磺酸盐的甲基苯甲酸酯，该氢键在活性位点的Cox-2的Cox-2具有–9.0 kcal/mol/mol/mol/mol的亲和力的活性位点Tyr385。是COX-2抑制剂的另一个候选者，被指定为3-吲哚丙酸，在COX-2的重要残基Ser530上结合氢，亲和能量为–6.9 kcal/mol。确认结合特异性，还针对COX-1进行了分子对接分析。使用MD模拟确认结合稳定性和灵活性。此外，根据Lipinski的规则和煮熟的蛋型建模预测了潜在配体的毒性和溶解度。5- [（（4-氨基-6-甲酚-4-基-1,3,5-三嗪-2-基）氨基] -2-甲基苯甲磺酸盐磺酸盐表明，通过胃肠道无源吸收的倾向倾向，而三3- indolopropropropropropionic Acid a intolointestinal tract均表现出较高的血液中脑溶液的概率。总而言之，这项研究通过分子对接分析确定了潜在化合物，该分析可以作为COX-2抑制剂开发。
对设计的苯咪唑衍生物的分子对接分析为EGFR
摘要非小细胞肺（NSCL）和结直肠癌经常与表皮生长因子受体（EGFR）的致癌激活相关，这是受体酪氨酸激酶（RTK）家族的成员。当前的酪氨酸激酶抑制剂（TKI）容易受到耐药性突变的影响，并诱导了对正常EGFR S的细胞毒性作用。带嘌呤的苯咪唑的同余性质具有模仿基于嘌呤的ATP的结合模式并防止其与EGFR活性位点的接触的巨大潜力。在这里，我们报告了50种设计的苯咪唑衍生物以及Gefitinib和ATP的分子对接，以分析和比较EGFR WT和T790M活性位点的结合模式。配体的设计基于我们先前的研究，我们建议评估与双键接头的酮和氨基 - 苯并咪唑，以及在各个位置附有电子捐赠和电子撤回的苯基基团。对接模拟表明，酮苯并咪唑在两个EGFR配合物中占据了前十名最高结合亲和力。与其他具有-8.1（7C）和-7.8（11C）KCAL/MOL在EGFR WT中的结合能相比，具有更稳定的复合物的磺酰基取代基的存在，eGFR WT中的结合能，-8.3（7d）和-8.4（7d）和-8.4（1c）kcal/mol for t790m t790m for T790m。对苯咪唑的取代影响不仅有助于氢键和疏水相互作用，而且还对经常被转化的范德华力的力，这些力是负责苯并咪唑与EGFR结合口袋的形状互补性的负责。
脂黄酮类化合物在治疗癌症中的分子对接研究……
背景/目的：冠状病毒病 (COVID-19) 是一个全球性的健康问题，人们正在寻求治疗方案，对能够消除或减轻 SARS-CoV-2 影响的药物的需求日益增加。冠状病毒病会留下永久性的影响，甚至会对免疫系统较弱的患者造成致命影响。考虑到这一重要因素，本研究选择了天然脂类黄酮营养补充剂作为目标药物，该营养补充剂既可用于增强免疫系统，也可用于治疗耳鸣、嗅觉和味觉障碍。材料和方法：对脂类黄酮化合物进行分子对接分析，以了解 SARS-CoV-2、NMDAR 和 VKORC1 蛋白之间的分子相互作用机制。结果：特别是，发现 NSP16（-7.97 kcal/mol）和维生素 K 环氧化物还原酶（-7.13 kcal/mol）中的硝酸硫胺素的对接得分较高。核黄素在 K 环氧还原酶中的插入分数 (-8.66 kcal/mol) 也被发现较高。结论：这些对接结合分数表明这些化合物可用作潜在抑制剂。脂黄酮类化合物可在短时间内有效治疗 COVID-19 的常见症状嗅觉-味觉障碍和耳鸣，并可阻止冠状病毒的复制，这一假设已得到理论证实。