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拷贝数畸变驱动激酶重新布线，导致癌症的遗传脆弱性
体细胞DNA拷贝数变化（CNV）在癌症中很普遍，并且可以驱动癌症进展，尽管在改变细胞信号状态下通常具有未表征的作用。在这里，我们整合了5,598个肿瘤样品的基因组和蛋白质组学数据，以鉴定导致异常信号转导的CNV。由此产生的关联概括了已知的激酶 - 基底关系，并进一步的网络分析优先考虑可能因果基因。在癌细胞系中复制了43％，包括在多种肿瘤类型中鉴定出的44种强大的基因磷材料。实验验证了几个预测的河马信号调节剂。使用RNAi，CRISPR和药物筛选数据，我们发现癌细胞系中激酶成瘾的证据，确定靶向激酶依赖性细胞系的抑制剂。我们建议基因的拷贝数状态，作为激酶抑制差异影响的有用预测指标，这是一种抗癌疗法的策略。
原发性鼻流感感染重新布线组织 - 尺度记忆...
塞缪尔·W·卡瑟（Samuel W. 1、2、4、8、9、11、12， * 1胃肠病学，肝病学和营养部，波士顿儿童医院，波士顿儿童医院，美国马萨诸塞州波士顿2号，美国马萨诸塞州剑桥市MIT和哈佛大学Broad Instute哈佛医学院和马萨诸塞州理工学院，美国马萨诸塞州，美国6 ABBVIE剑桥研究中心，美国马萨诸塞州剑桥，美国7 Abbvie Genomics研究中心，北芝加哥，伊利诺伊州，美国8号计划，哈佛医学院，波士顿，波士顿，马萨诸塞州，美国马萨诸塞州902115，美国9哈佛大学，美国9哈佛大学，哈佛大学，哈佛大学，哈佛大学，哈佛大学，cambr euttry，cambr euntry，cambr euttry，cambr euntbr，cambr，cambr euntbr，cambr euttry，cambr euttry，10. *通信：jose.ordovas-montanes@childrens.harvard.edu https://doi.org/10.1016/j.immuni.2024.06.005
空间电源系统布线系统安全性综述
当前航空航天飞行器线束中的电弧传播会导致线路系统故障。当电弧启动时绝缘层导电时，就会发生这些故障。在某些情况下，碳弧轨道的导电路径显示出足够高的电阻，以致电流受到限制，因此使用传统电路保护可能难以检测。通常，这种线路故障不仅仅是绝缘故障的结果，而是由多种线路系统因素造成的。电路保护不足、系统设计不当和维护程序粗心大意都可能导致线路系统故障。本文从整个线路系统的角度探讨该问题，以确定可以采取哪些措施来提高空间电力系统的可靠性、可维护性和安全性。本文将讨论过去导致线路系统故障的电力系统技术、系统设计和维护程序。本文将介绍可能提高线路系统安全性的新技术、设计流程和管理技术。
重新布线蛋白质序列和结构生成模型以增强蛋白质稳定性预测
快速增长的数据需要可靠且持久的存储解决方案。DNA由于其高信息密度和长期稳定性而成为一种有希望的媒介。但是，DNA存储是一个复杂的过程，每个阶段都会引入噪声和错误，包括合成错误，存储衰减和测序错误，它需要对错误校正的代码（ECC）才能获得可靠的数据恢复。要设计一种最佳数据恢复方法，对DNA数据存储通道中噪声结构的综合理解至关重要。由于在体外运行DNA数据存储实验仍然很昂贵且耗时，因此必须进行模拟模型，以模仿真实数据中的误差模式并模拟实验。现有的仿真工具通常依赖固定的误差概率或特定于某些技术。在这项研究中，我们提出了一个基于变压器的生成框架，用于模拟DNA数据存储通道中的错误。我们的模拟器将寡素（DNA序列写入）作为输入，并生成错误的输出DNA读取，与常见DNA数据存储管道的真实输出非常相似。它捕获了随机和有偏见的误差模式，例如K-MER和过渡错误，无论过程或技术如何。我们通过分析两个使用不同技术处理的数据集来证明模拟器的有效性。在第一种情况下，使用Illumina Miseq处理，由DDS-E-SIM模拟的序列显示出与原始数据集的总误率偏差仅为0.1％。第二次使用牛津纳米孔技术进行的偏差为0.7％。基本级别和K-MER错误与原始数据集紧密对齐。此外，我们的模拟器从35,329个序列中生成100,743个独特的橄榄岩，每个序列读取五次，证明了其同时模拟偏置错误和随机属性的能力。我们的模拟器以优越的精度和处理多种测序技术的能力优于现有的模拟器。
最初发表于：Leite, Vanessa RC；Su, Zhe；Whatley, Adrian M；Indiveri, Giacomo (2022)。皮质启发式布局和布线：最小化
摘要 — 受大脑启发的基于事件的神经形态处理系统已成为一种有前途的技术，特别是用于生物医学电路和系统。然而，神经网络的神经形态和生物实现都具有关键的能量和内存限制。为了最大限度地减少多核神经形态处理器中内存资源的使用，我们提出了一种从生物神经网络中汲取灵感的网络设计方法。我们使用这种方法设计了一种针对小世界网络优化的新路由方案，同时提出了一种硬件感知的布局算法，该算法优化了小世界网络模型的资源分配。我们用一个典型的小世界网络验证了该算法，并给出了从中衍生的其他网络的初步结果。索引术语 — 编译器、神经形态处理器、分层路由、小世界网络、多核、扩展、皮质网络
细胞结构、布线和信号流
默认模式网络 (DMN) 与复杂思维和行为的许多方面有关。在这里，我们利用尸检组织学和体内神经成像来描述 DMN 的解剖结构，以更好地了解其在信息处理和皮质通信中的作用。我们的结果表明，DMN 在细胞结构上是异质的，包含不同细胞结构类型，这些细胞结构类型可针对单模态、异模态和记忆相关处理进行不同程度的专门化。通过研究基于扩散的结构连接与细胞结构，我们发现 DMN 包含可接收来自感觉皮层输入的区域和相对与环境输入隔离的核心。最后，使用有效连接模型对信号流的分析表明，DMN 在平衡其在各个感觉层次之间的输出方面在皮质网络中是独一无二的。总之，我们的研究建立了解剖学基础，从中可以发展出 DMN 在人类大脑功能和认知中所起的广泛作用的机制解释。
癌症生物学的年度审查转移期间的代谢重新布线：环境与宿主之间的相互作用
从原发性肿瘤逃脱后，癌细胞在转移性级联过程中面临着不同的微环境。为了在遥远的部位生存并建立淘汰生长，癌细胞必须进行代谢重编程以适应不断变化的条件。然而，肿瘤生长的宿主也经历了代谢适应，以响应可以介导癌症进展的各种环境因素。在这篇综述中，我们强调了决定宿主代谢（特定器官或微生物组的营养可用性）的内源性因素，以及系统或本地影响宿主代谢的外源性因素（饮食，酒精，体育活动，空中污染和昼夜节律）。此外，我们详细介绍了这些环境诱导的代谢变化如何影响转移性进展。了解环境因素，宿主代谢和转移进展之间的相互作用可能会揭示未来治疗干预措施的潜在靶标。
旋转：介入心脏病学 - 高级导管旋转（级别-2）旋转主管：Jon Resar教师博士：Drs。布线，卡斯，米尔
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