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World File Search System抗结核
用于预测结核分枝杆菌的 TB27 转录组模型
引言世界卫生组织 (WHO) 估计，2023 年全球将有 1080 万人患上结核病 (TB)，120 万人死于该疾病 [1]。药物敏感 (DS) 结核病需要 4 至 6 个月的标准化联合疗法 [2]。对于对利福平和异烟肼产生耐药性的结核病（定义为耐多药 (MDR) 结核病）或单独对利福平耐药的结核病（RR-TB），目前建议大多数受影响患者采用 6 个月的二线抗结核药物联合疗法 [3,4]。无论结核分枝杆菌是否对药物产生耐药性，都应对治疗效果进行监测以确保充分的治疗反应，并评估患者对接触者的传染性 [5,6]。
Deeplex Myc-TB 技术说明
Deeplex® Myc-TB 检测依赖于与对一线和二线药物耐药性相关的 18 个主要 MTBC 基因靶点的深度测序（图 3）。根据在这些基因座中观察到的突变的存在或不存在以及对参考数据库*****的查询，预测样本中的 MTBC 菌株对每种抗生素敏感或耐药，或具有尚未表征的突变（图 1）。可以轻松查看单个靶点位置和突变及其序列覆盖深度。可通过超链接访问描述突变与耐药性关联的参考文献信息。总体而言，该检测可以预测对 15 种抗结核药物/药物类别的耐药性，包括最近推出的化合物，如贝达喹啉和利奈唑胺，使其成为迄今为止最详尽的可直接应用于样本的基因型检测。
引入新工具项目 (i NTP) 靶向下一代测序在药物依赖性检测中的应用
2022 年，icddr,b 开始使用 MiniSeq 测序系统（美国圣地亚哥 Illumina）和 Deeplex® Myc-TB 检测（法国里尔 GenoScreen），该检测可检测导致对 15 种抗结核药物产生耐药性的突变。到 2022 年 12 月，已对 icddr,b 的结核病筛查和治疗中心 (TBSTC)、国立胸科医院疾病研究所 (NIDCH) 和 Shaymoli 250 张床位的结核病医院登记的 310 名患者采集的痰液样本进行了 tNGS。同时，还使用固体（Löwenstein-Jensen）和液体培养（Bactec TM MGIT TM ）对样本进行表型药物敏感性测试 (pDST) 以及通过线探针测定（GenoType MTBDRplus 和 MTBDRsl）进行测试。
Deeplex® Myc-TB
Deeplex® Myc-TB 检测依赖于对 18 个主要 MTBC 基因靶点进行深度测序，这些靶点与对一线和二线药物的耐药性有关（图 3）。根据在这些基因座中观察到的突变的存在或不存在情况以及对参考数据库的查询，预测样本中的 MTBC 菌株对每种抗生素敏感或耐药，或具有尚未表征的突变（图 1）。可以轻松看到各个靶点位置和突变以及它们的序列覆盖深度。可通过超链接访问描述突变与耐药性关联的参考文献信息。总的来说，该检测可以预测对 15 种抗结核药物的耐药性，包括最近推出的贝达喹啉和利奈唑胺 4 等化合物，使其成为迄今为止最详尽的可直接应用于样本的基因型检测。
靶向 Clp 蛋白酶的 BacPROTAC：一种有前途的抗分枝杆菌药物研发策略
两千年来，结核病 (TB) 夺走的生命比世界上任何其他传染病都要多。2021 年，世界卫生组织 (WHO) 估计有 1060 万人被诊断出患有结核病，导致 140 万 HIV 阴性患者死亡。耐多药结核病 (MDR-TB)（定义为至少对利福平 (RIF) 和异烟肼 (INH) 具有耐药性）和广泛耐药结核病 (XDR-TB) 的出现是未来几年要克服的主要挑战。我们最近对该领域的投资和研究工作进行了广泛的分析，总体目标是到 2030 年实现消除结核病的既定里程碑。在过去几年中，在将多种有前景的化合物推进到临床开发阶段方面取得了显着进展，每种化合物都具有不同的作用机制。但值得注意的是，已经出现了对目前某些抗结核药物产生耐药性的分枝杆菌菌株。创新的蛋白水解靶标嵌合体 (PROTACs) 蛋白质降解方法的探索已成为发现新型抗菌药物的可行途径。虽然泛素系统是真核细胞独有的，但某些细菌使用类似的降解系统，该系统依赖于 ClpC:ClpP (ClpCP) 蛋白酶对磷酸化精氨酸残基 (pArg) 的识别，从而导致蛋白质降解。在这篇评论文章中，我们描述和分析了利用细菌蛋白水解机制 (BacPROTACs) 的 PROTACs 设计新型抗结核药物的进展。范围声明。由于耐药菌株的出现，开发用于治疗结核病的新型药物被认为迫切需要。在此背景下，引进能够减轻疾病并实现世界卫生组织所概述的目标的新技术势在必行。在创新策略中，降解对杆菌生存至关重要的蛋白质有望产生新药物，特别是那些对治疗潜伏（非复制性）结核分枝杆菌有效的药物。从这个角度来看，我们介绍了结核分枝杆菌治疗领域取得的进展和遇到的障碍
StrużykP，Szyszka D，Klatka，OlenderA。慢性颈部淋巴结炎 - 诊断肺内结核病的挑战。 Ann Agric Environ Me
抽象的颈部淋巴结受累在由各种微生物引起的感染中很常见，但是确定病因可能具有挑战性。案例研究详细介绍了一名58岁的男性，患有左侧宫颈淋巴结肿大，发烧和减肥持续了两年。尽管进行了广泛的测试和经验治疗，但原因仍然不明。CT扫描显示中枢性坏死的大量淋巴结肿大。组织病理学检查建议肉芽肿性淋巴结炎，尽管最初未检测到细菌。最终，通过Ziehl-Neelsen染色发现了酸性杆菌，并通过分子测试证实了结核分枝杆菌。该患者被诊断为结核病（TB），并通过抗结核治疗成功治疗。该案例强调了肺外结核病的诊断挑战，并强调了在非典型演示中考虑结核的重要性，尤其是考虑到多药耐药性菌株的增加。
在秘鲁耐多药结核病高发区常规条件下对结核分枝杆菌进行全基因组测序
全基因组测序 (WGS) 是全球抗击结核病 (TB) 的一个有前途的工具。本研究的目的是评估在秘鲁耐多药结核病热点地区常规使用 WGS 检测耐药标志物和传播簇的情况。为此，前瞻性地选择了来自利马和卡亚俄的 140 种耐药结核分枝杆菌菌株，并同时通过常规（GenoType MTBDR sl 和 BACTEC MGIT）和 WGS 工作流程进行处理。根据世界卫生组织突变目录确定耐药性。计算了利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、莫西沙星、左氧氟沙星、阿米卡星和卷曲霉素的 WGS 和 BACTEC 结果之间的一致性。使用不同的单核苷酸多态性差异截止值确定传播簇。 100% (140/140) 的菌株对 13 种抗结核药物具有有效的 WGS 结果。然而，最终确定的表型 BACTEC MGIT 结果的可用性因药物而异，七种比较药物的无效结果为 10-17%。获得全套药物 WGS 结果的中位时间为 11.5 天，而常规工作流程为 28.6-52.6 天。比较药物的 WGS 和 BACTEC MGIT 的总体分类一致性为 96.5%。除莫西沙星外，Kappa 指数良好 (0.65 k 1.00)，但所有病例的敏感性和特异性值都很高。 97.9% (137/140) 的菌株仅具有一个亚谱系（134 株属于“谱系 4”，3 株属于“谱系 2”），2.1% (3/ 140) 为混合菌株，呈现两个不同的亚谱系。5、10 和 12 个 SNP 截止值的聚类率分别为 3.6% (5/ 140)、17.9% (25/140) 和 22.1% (31/140)。综上所述，常规 WGS 对检测对当前主要抗结核药物的耐药性具有很高的诊断准确性，可通过一次分析获得结果，并有助于迅速切断秘鲁耐药结核病的传播链。
RSC Advances 解决方案中的二维radial-π堆栈-RSC Publishing 自组装单层功能化的nio纳米线 金属 - 有机络合物的瞬态自组装 朝着电动汽车电池的互动管理 与疫苗辅助成分Tween 80和Triton X-100的羟丙基-β-环糊精的相互作用模式通过荧光增加了猝灭分析 阳离子苯乙染料，用于DNA标记和对癌细胞和革兰氏阴性细菌的选择性 RSC Advances 外排泵抑制剂与氧氟沙星结合通过调节Nora和fareum Sensing的基因表达，从而降低了MRSA生物膜的形成生物相容性且完全可侵蚀的导电聚合物可启用植入可充电的Zn电池
含氮的芳族杂环化合物已被研究在各种ELDS中具有很好的应用。Quinoxaline是一种芳族杂环化合物，其结构由苯环和吡嗪环组成，将其凝结在一起。已研究了4,5个喹啉衍生物具有许多生物学活性，包括抗结核，抗菌，抗癌，抗内部抗药性，抗疟疾和抗呼吸症活性。5二氧素衍生物作为T2DM处理具有很大的潜力，其中包括DPP -4抑制剂，GLP -1受体激动剂，PPAR G和SUR EMONIST，A淀粉酶抑制剂和 - 葡萄糖苷酶抑制剂。4 - 11此外，异氧唑是一类叠氮唑，其结构含有氮和氧原子，中有含元素的芳族环。12这类化合物已被证明在药物化学中起重要作用，
信息表：GenoScreen Deeplex Myc-TB 测试
GenoScreen 拥有基于新一代测序 (NGS) 的试剂盒，可同时识别分枝杆菌种类、进行基因分型并预测结核分枝杆菌复合群 (MTBC) 菌株的耐药性；该试剂盒 (Deeplex® Myc-TB) 可直接用于临床样本 (1) 。该检测依赖于单个 24 重扩增子混合物的深度测序，针对与一线和二线抗结核药物（利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、氟喹诺酮类、阿米卡星、卡那霉素、卷曲霉素、链霉素、乙硫异烟胺、贝达喹啉、氯法齐明和利奈唑胺）耐药性相关的 18 个主要 MTBC 基因区域。 hsp65 基因是分枝杆菌种属识别的靶标，而 spoligotyping 靶标（CRISPR/直接重复 [DR] 基因座）和耐药相关靶标中的系统发育单核苷酸多态性 (SNP) 用于 MTBC 菌株基因分型。
文章 第 11 卷，第 6 期，2021 年，14688 - 14696 https://doi.org/10.33263/BRIAC116.1468814696 FDA 批准的抗分枝杆菌药物的再利用
摘要：结核病 (TB) 是最可怕和最致命的疾病之一，每年导致数百万人死亡。其病原体是一种称为结核分枝杆菌的细菌，主要侵袭肺部。根据临床表现的存在与否，结核病可分为潜伏性和活动性结核病。肺结核也称为活动性结核病，其特征是极度感染，而潜伏性结核病则没有感染或症状。在这项计算机研究中，我们重点关注基于分子对接的虚拟筛选，这些药物已用于治疗针对甲氧基菌酸合酶 4 (MMA4) 和环丙烷菌酸合酶 (CmaA2) 的细菌感染。耐药性结核病是抗结核药物设计和配制中最具挑战性的因素。菌酸在结核病的发病机制中起着至关重要的作用，因此可以成为非常有价值的靶点。根据对小鼠进行的研究，通过使 hma 基因（MMA4 和 cmaA）失活，没有观察到分枝酸的合成。与靶标对接的每个配体的结合能得分显示了对结核病的亲和力。