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World File Search System核苷酸
靶向高通量测序可检测 CRISPR/Cas9 基因编辑生物中的单核苷酸变异
摘要：与传统基因工程产生的转基因生物 (GMO) 类似，在欧盟市场上销售的基因编辑 (GE) 生物及其衍生的食品/饲料产品属于欧盟指令 2001/18/EC 的范围。因此，主管当局要求转基因执法实验室在食品/饲料链中控制它们，以保证食品/饲料的安全性和可追溯性 (2003/1829/EC；2003/1830/EC)。然而，它们的检测在分析和解释层面都可能具有挑战性，因为这需要能够针对和检测引入 GE 生物的特定单核苷酸变异 (SNV) 的方法。在本研究中，我们提出了一种有针对性的高通量测序方法，包括 (i) 先前的基于 PCR 的富集步骤以扩增感兴趣的区域，(ii) 测序步骤，以及 (iii) 数据分析方法来识别感兴趣的 SNV。为了研究这种靶向高通量测序方法的性能是否与转基因检测领域中使用的性能标准兼容，我们准备并分析了几个含有不同百分比的转基因水稻品系（携带单个腺苷插入 OsMADS26）的样本。无论百分比高低，都可以成功检测出含有转基因水稻品系的样本中感兴趣的 SNV。未观察到与食品加工或其他作物物种存在相关的影响。本概念验证研究使我们能够提供第一个基于实验的证据，表明拟议的靶向高通量测序方法将来可能成为一种特定且灵敏的工具，用于支持携带 SNV 的转基因植物的食品/饲料链的安全性和可追溯性。
刺激循环二核苷酸 - 甲状腺纳米颗粒唤起急性髓样白血病的可靠免疫力
急性髓样白血病（AML）是成年人中最常见的白血病类型之一，5年生存率为30.5％。这些差的患者结局归因于肿瘤复发，这是由于无效的先天免疫激活，T细胞耐受性和缺乏免疫记忆的原因。因此，需要新的策略来激活先天和效应的免疫细胞并引起对AML的长期免疫力。一种解决这些问题的方法是通过干扰素基因（STING）途径激活的刺激剂，该途径会产生I型干扰素（I型IFN）对先天性和适应性免疫激活至关重要。在这里，我们报告说，带有Mn 2+的基于脂质的纳米颗粒平台（CMP）的系统性免疫疗法在传播AML的小鼠模型中表现出强大的抗肿瘤疗效。此外，CMP免疫疗法与免疫检查点结合了针对细胞毒性T-淋巴细胞相关蛋白4（抗CTLA-4）引起的强大先天和适应性免疫激活，并具有增强的细胞毒性免疫激活，并增强了对AML的细胞毒性潜能，从而在与Aml恢复后延伸了动物生存。总体而言，这种CMP组合免疫疗法可能是针对AML和其他传播癌症的有前途的方法。
Auto-Mag® DNA片段分选纯化回收试剂（磁珠法）
Auto-Mag® DNA 片段分选纯化回收试剂（磁珠法）是一款基于顺磁珠技术开发的高性能试剂，专为满足 下一代测序 (NGS) 文库构建中的 PCR 产物、DNA 片段和 RNA 的纯化需求而设计，同时支持 DNA 片段的大 小分选与高效回收。在 PCR 产物纯化方面，该试剂提供了单管和 96/384 孔板两种灵活格式，通过优化的缓 冲液选择性地结合 >100 bp 的 PCR 扩增产物，利用简便的清洗步骤去除多余引物、核苷酸、盐和酶，最终 使用低盐洗脱缓冲液或水进行温和高效的洗脱。在 DNA 片段大小分选中，用户可通过调整试剂与 DNA 样 本的体积比，精准选择目标 DNA 片段范围，并通过结合、洗涤和洗脱的简单操作回收分布均匀、符合实验 需求的目标 DNA 片段。
抑制4'-Cyano修饰的核苷酸类似物对原型呼吸道RNA病毒的不同RNA聚合酶的机制和光谱
未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本的版权持有人（此版本发布于2024年4月23日。; https：//doi.org/10.1101/2024.24.22.590607 doi：biorxiv Preprint
氧化二核苷酸lutetium用于治疗转移性或无法手术的胃肠道神经内分泌肿瘤（GEP-NETS）：
肽受体放射性核素疗法（PRRT）用lutetium（177 lu）氧化肽被许可作为胃肠道神经内分泌肿瘤（GEP-NETS）的治疗选择。由于迄今为止，爱尔兰尚未获得这种治疗方法，因此通常通过国外卫生服务主管（HSE）治疗方案将有资格的转移或无法使用的GEP-NET的患者转介给国外治疗。圣文森特大学医院与国家癌症控制计划（NCCP）合作，希望将此服务归还给爱尔兰共和国。 但是，这种做法首先需要通用理由来证明与可用替代方案相比，个人的健康有净收益，包括在爱尔兰通常采用的替代方案之前，包括涉及较少或没有电离辐射的替代方案。圣文森特大学医院与国家癌症控制计划（NCCP）合作，希望将此服务归还给爱尔兰共和国。但是，这种做法首先需要通用理由来证明与可用替代方案相比，个人的健康有净收益，包括在爱尔兰通常采用的替代方案之前，包括涉及较少或没有电离辐射的替代方案。
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶，葡萄糖稳态和糖尿病相关的内皮细胞功能障碍
摘要：由于活性氧（ROS）的过量产生，血管内皮内的氧化应激被认为是2型糖尿病的心脏血管并发症的起始和进展至关重要的。ROS一词包括多种化学物种，包括超氧化阴离子（O 2• - ），羟基自由基（OH - ）和过氧化氢（H 2 O 2）。虽然低浓度ROS的本构生成对于正常的细胞功能是必不可少的，但过量的O 2• - 可能导致不可逆的组织损伤。过量的ROS产生由黄嘌呤氧化酶，未偶联的一氧化氮合酶，线粒体电子传输链和烟酰胺腺苷二核苷酸磷酸（NADPH）氧化酶催化。在O 2• - - NADPH氧化酶的NOX2同工型中被认为对2型糖尿病中发现的氧化应激至关重要。 相比之下，转录调控的NOX4同工型产生H 2 O 2，可以发挥保护作用，并有助于正常的葡萄糖稳态。 本综述描述了NOX2和NOX4的关键作用，以及NOX1和NOX5在葡萄糖稳态，内皮功能和氧化应激中的关键作用，其关键重点侧重于它们在健康中的调节，并且在2型糖尿病中的调节失调。被认为对2型糖尿病中发现的氧化应激至关重要。相比之下，转录调控的NOX4同工型产生H 2 O 2，可以发挥保护作用，并有助于正常的葡萄糖稳态。本综述描述了NOX2和NOX4的关键作用，以及NOX1和NOX5在葡萄糖稳态，内皮功能和氧化应激中的关键作用，其关键重点侧重于它们在健康中的调节，并且在2型糖尿病中的调节失调。
核酸DNA和RNA
核苷酸的构造糖分子的碳原子在1'至5英寸处编号[B 4]。碱始终与1'-，磷酸盐残基与糖分子的5´碳原子结合[B 2]。DNA和RNA的核苷酸通常是结构的，但是它们在前面的有机碱和糖的使用方面有所不同。虽然DNA-核苷酸含有腺苷，胸腺嘧啶，鸟嘌呤和胞嘧啶[B 3]，但碱胸腺氨酸在RNA核酸中不发生。是由尿嘧啶基础制成的。核酸是通过逐渐将核苷酸添加到现有核苷酸链中而产生的。为此，核苷酸的磷酸盐其余部分与另一种核苷酸的糖分子有关。创建了所谓的糖磷酸骨链。所产生的分子链末端，无论其在一端的总长度如何，在3´-c原子（3´End）上的羟基和另一端，在5´-c原子（5´-end）上的磷酸盐[b 1，b 4]。
软组织肉瘤中核苷酸 - 分离修复（NER）途径的作用：综述和关注其作为治疗靶标的潜力
核苷酸切除修复（NER）途径涉及三十多个蛋白质 - 蛋白质相互作用，并去除化学疗法药物引起的DNA加合物。NER的关键基因通常在癌细胞中过度表达，该途径的改变负责增加或降低对特定治疗剂的敏感性。这在软组织肉瘤（STS）中特别相关，稀有间充质原始肿瘤的潜在机制仍然缺乏理解。完全可以是STS中潜在的治疗靶标。NER活性的微妙调节可能在临床上与替代预后标记或预测对化学疗法剂的敏感性有关。应进一步对NER进行进一步的预期评估以解决这个问题。摘要
微生物学年度回顾 CBASS、Pycsar、Thoeris 和 CRISPR 抗噬菌体防御中的核苷酸免疫信号传导
细菌编码了多种防御噬菌体感染的系统。许多流行的抗噬菌体防御系统有一个共同的主题，即使用专门的核苷酸信号作为第二信使来激活下游效应蛋白并抑制病毒传播。在本文中，我们回顾了控制四大抗噬菌体防御系统家族中核苷酸免疫信号的分子机制：CBASS、Pycsar、Thoeris 和 III 型 CRISPR 免疫。对连接噬菌体检测、核苷酸信号合成和下游效应功能的各个步骤的分析揭示了信号传导的共同核心原理，并揭示了用于增强免疫防御的系统特定策略。我们比较了最近发现的噬菌体用来逃避核苷酸免疫信号的机制，并强调了影响宿主-病毒相互作用的趋同策略。最后，我们解释细菌抗噬菌体防御和真核抗病毒免疫之间的进化联系如何定义支配所有生命界核苷酸免疫的基本规则。