神经发育认知障碍提供了对人脑发育机制的见解。在这里,我们报告了由APC7丢失引起的智障综合征,APC7是E3泛素连接酶后期促进复合物(APC)的核心成分。在机械研究中,我们在APC底物的募集和泛素化过程中发现了APC7的关键作用。在具有患者特异性APC7突变的小鼠的蛋白质组学分析中,我们识别与染色质相关的蛋白KI-67是神经元中APC的APC7依赖性底物。APC共激活因子蛋白CDH1而非CDC20的条件敲除导致Ki-67蛋白在体内的积累,这表明APC7对于大脑中CDH1-APC的功能是必需的。放松调节的神经元KI-67主要定位于本构异染色质。一起,我们的发现定义了APC7和CDH1-APC在神经元异染色质调节中的重要功能,这对理解人脑发育和疾病的意义。
图1 E3泛素连接酶和SCF型E3连接酶复合物的结构域结构:A,常见的结构是E3泛素连接酶复合酶配合物,介导许多细胞蛋白的靶向降解。In targeting substrate proteins for degradation, ubiquitin is passed from an E1 ubiquitin-activating enzyme to an E2 ubiquitin-conjugating enzyme to the protein substrate, with the final step (ligating ubiquitin to the substrate) catalyzed by an E3 ubiquitin ligase.b,已知SCF复合物是E3连接酶,而SCF型E3连接酶中的每个复合酶都与一组衔接蛋白相互作用,这些衔接蛋白通过特定的蛋白质 - 蛋白质相互作用域募集不同的结合伴侣,例如WD40 repots,例如重复(LRR)(LRR)(LRR),并在protitate sisstrate for Protiate Degradation degradation。这个数字是由作者(N.K.J.)创建的使用网站https://app.biorender.com [校正于2021年4月27日,在第一次在线出版物之后:图2中的一个错字]
1化学,双毛,药物和科学的问题,墨西哥大学,宫殿,宫殿,大学策略,98168,意大利墨西岛; raneate@unime.it(r.o.); illustry_adornate@hotmail.it(i.a.)2个Bimidian科学和临床,生化科学,Fireze大学,50,50134 Phydrals,50134 Phydrals,意大利; palo.paly@unifin); maxture.gnoves@student.it.it(m.g。); i.donsi2@students.it(I.N。)3比萨大学生物学系,PISA大学,通过S. Zeno,51,56123 Pisa,意大利; marry.car.it@unipip.it(m.c。); antonella.dcoss@unipi.it(a.d.c.); suck.emoscus@unipip.it(r.m.)4分子设计实验室,柏林自由大学的制药机构,科尼吉尼 - 卢塞斯特。2 + 4,14195柏林,耶利曼尼; gockeyy@zedat.fly.fly.destep(T.N.N。); Alexander.nass@stanson.no(N.N。); gerhard.wolber@fu-berlin.s(G.W。)*对应:souse@unime.it;称呼。: +39-090-67664646
修改,例如疾病突变建模或体细胞基因治疗中突变的校正。为了加强精确的基因编辑,需要工具或干预措施使 DSB 修复途径选择偏向 HDR,并通过将 DNA 修复模板靶向递送到 DSB 来促进 HDR 处理。特别是修复模板的可用性可能是 HDR 的限速因素。以前用于靶向递送修复模板的方法使用 Cas9 融合蛋白,其结构域与功能基团结合,该功能基团被掺入合成寡核苷酸或 PCR 片段中作为供体模板,并作为组合的 Cas9-sgRNA-供体复合物递送到细胞中 [3-5]。然而,目前尚不清楚修复模板分子与 Cas9 核酸酶的连接是否是共递送的最有效方式,因为模板在 DSB 修复的后续步骤中是必需的。以前促进 DSB 修复途径选择的方法有利于
目的:据报道,泛素特异性肽酶 5 (USP5) 可促进多种恶性肿瘤的进展。它可能通过调节细胞周期和集落形成来影响癌症的发展。在胰腺癌中,USP5 的生物学功能,特别是在迁移和侵袭方面的作用仍不清楚。方法:使用免疫组织化学 (IHC) 检测原发性胰腺癌和淋巴结转移组织中 USP5 蛋白的表达水平。使用 χ 2 检验、Kaplan-Meier 分析、单变量和多变量分析来评估 USP5 表达与临床病理特征之间的关系。进行 RT-qPCR 以定量胰腺癌细胞系中 USP5 的 mRNA 表达水平。进行 CCK8 和集落形成试验以证明 USP5 在增殖中的作用。通过 Transwell 和划痕愈合试验评估肿瘤转移。通过蛋白质印迹检测 EMT 和 STAT3 信号相关标志物。结果:(1)USP5蛋白表达水平与肿瘤分化程度、CEA及CA19-9水平相关。(2)单因素及多因素分析均显示USP5高表达是胰腺癌的不良预后因素,Kaplan–Meier分析直接表明USP5高表达患者总生存期较短。(3)USP5表达增高与胰腺癌的增殖和转移均相关。(4)USP5被证实介导胰腺癌细胞中的STAT3信号传导。结论:研究结果提示USP5在胰腺癌患者中高表达并可能具有临床意义。USP5高表达通过激活STAT3信号传导促进进展和转移。因此,USP5可能是胰腺癌治疗的潜在靶点。
以CRISPR-Cas9为代表的基因组编辑技术已广泛应用于基因功能分析、基因治疗、作物改良等多个生物领域。然而面对真核生物基因组的复杂性,CRISPR-Cas9基因组编辑工具表现出编辑效率不稳定、在不同靶位点差异性大等问题,进一步提高CRISPR-Cas9系统在全基因组范围内的编辑效率具有重要意义。本研究在前期单转录单元基因组编辑系统(STU-SpCas9)的基础上,利用泛素相关结构域(UBA)增强Cas9蛋白的稳定性,构建了三种Cas9-UBA融合系统(SpCas9-SD01、SpCas9-SD02、SpCas9-SD03)。选取水稻OsPDS、OsDEP1和OsROC5基因的4个不同靶位点,对水稻原生质体和稳定转化水稻植株的基因组编辑效率进行评价,结果表明UBA结构域的融合不影响Cas9蛋白的切割方式,且能有效提高STU-SpCas9在靶位点的编辑效率。该新型CRISPR-Cas9-UBA系统为提高CRISPR-Cas9在植物中的基因组编辑效率提供了新的策略和工具。
结果:在 54.1% (158/292) 的乳腺癌组织样本中检测到 Cbl-b 表达。Cbl-b 表达与 DFS 相关(p = 0.033),但与本研究中已知的临床病理因素无显著相关性。对数秩分析表明,Cbl-b 表达与更好的 OS(p = 0.013)和 DFS(p = 0.016)相关。多变量分析表明,Cbl-b 表达是乳腺癌的独立预后因素。我们构建的用于预测 OS 的列线图结合了 Cbl-b 表达、年龄、肿瘤大小、淋巴结转移和组织学分级。除肿瘤大小外,所有上述因素和诊断日期都用于构建 DFS 列线图。列线图的 C 指数分别为 0.735 和 0.678。我们的新临床模型在预测 OS 方面优于 TNM 分期。
A20 是一种与人类疾病密切相关的抗炎蛋白。我们发现,表达 A20 的 ZF7 泛素结合基序的三种不同靶向突变的小鼠一致地发展出与银屑病关节炎具有相同特征的指关节炎,而表达 A20 的 OTU 或 ZF4 基序点突变的小鼠则没有表现出这种表型。A20 ZF7 小鼠的关节炎需要 T 细胞和 MyD88,对肿瘤坏死因子 (TNF) 和白细胞介素 17A 极其敏感,并且在无菌条件下持续存在。A20 ZF7 细胞表现出延长的 IKK 激酶活性,这导致体外和体内患病前小鼠爪中晚期 NF- κ B 反应基因的过度转录。此外,在 A20 的 ZF4 和 ZF7 基序中表达双突变 A20 蛋白的小鼠在围产期死于多器官炎症。因此,A20 的 ZF4 和 ZF7 基序以非催化方式协同预防炎症性疾病。
泛素和泛素样 SUMO 与数千种蛋白质共价结合,以调节其功能和命运。参与其结合的许多酶在癌症中失调,并参与癌细胞对疗法的反应。我们在此描述了这些酶活性的生物标志物的鉴定及其用于预测急性髓系白血病 (AML) 对标准化疗(柔红霉素-DNR 和阿糖胞苷-Ara-C)反应的用途。我们比较了化学敏感和化学抗性的 AML 细胞提取物与蛋白质阵列上点缀的 9,000 种蛋白质上的泛素或 SUMO-1 结合的能力。我们鉴定了 122 种蛋白质,这些翻译后修饰物的结合标志着 AML 对 DNR 和/或 Ara-C 的抗性。基于此特征,我们定义了一个统计评分,用于预测 AML 患者对标准化疗的反应。我们最终开发了一种微型检测方法,可以轻松评估所选生物标志物的修饰水平,并在患者细胞提取物中对其进行了验证。因此,我们的工作确定了一种新型的泛素基生物标志物,可用于预测癌症患者对治疗的反应。
泛素化是一种重要的蛋白质翻译后修饰(PTM),在控制底物降解过程中起着至关重要的作用,进而介导各种蛋白质的“数量”和“质量”,确保细胞稳态并保证生命活动。泛素化的调控是多方面的,不仅在转录和翻译后水平(磷酸化、乙酰化、甲基化等)起作用,而且在蛋白质水平(激活剂或抑制剂)起作用。当调控机制异常时,改变的生物学过程可能随后诱发严重的人类疾病,特别是各种类型的癌症。在肿瘤发生中,改变的生物学过程涉及肿瘤代谢、免疫肿瘤微环境(TME)、癌症干细胞(CSC)干性等。在肿瘤代谢方面,一些关键蛋白如RagA、mTOR、PTEN、AKT、c-Myc和P53的泛素化显著调节mTORC1、AMPK和PTEN-AKT信号通路的活性。此外,TLR、RLR和STING依赖性信号通路的泛素化也调节TME。此外,核心干细胞调节三联体(Nanog、Oct4和Sox2)以及Wnt和Hippo-YAP信号通路成员的泛素化参与维持CSC的干性。基于改变的组分,包括蛋白酶体、E3连接酶、E1、E2和去泛素化酶(DUB),许多分子靶向药物已被开发用于对抗癌症。其中,针对蛋白酶体的小分子抑制剂如硼替佐米、卡菲佐米、奥普佐米和伊沙佐米等均取得了显著的成功。此外,针对E1酶的MLN7243和MLN4924,针对E2酶的Leucettamol A和CC0651,针对E3酶的nutlin和MI‐219,以及针对DUB活性的化合物G5和F6也在临床前癌症治疗中展现出潜力。本综述总结了泛素化底物的最新进展及其在肿瘤代谢调控、TME调控和CSC干性维持方面的特殊功能,并综述了癌症的潜在治疗靶点以及靶向药物的治疗效果。