XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System甲基化
原发性高血压患者血液整体DNA甲基化变化
许多疾病，包括心血管疾病、肿瘤和中枢神经系统疾病，都与氧化应激和活性氧 (ROS) 对基因组 DNA 的改变有关。5-甲基胞嘧啶 (5mC) 是细胞 DNA 中一种罕见但正常的成分（图 1A）[12–14]。它通常出现在二核苷酸序列 CpG 中，但情况并非总是如此。这种修饰仅发生在 3' 碳通过磷酸二酯键与鸟嘌呤 (CpG 二核苷酸) 5' 碳原子相连的胞嘧啶中。大多数 CpG 二核苷酸聚集在称为 CpG 岛的小段 DNA 中，正常细胞通过尚不清楚的机制保护这些 CpG 岛免于甲基化。CpG 岛位于启动子区，该区缺乏甲基化对于开启基因至关重要。然而，约...基因组其他位置的CpG双核苷酸有70%被甲基化，转录基因编码区内发现的CpG序列很少[14–17]。
CDH1甲基化和乳腺癌中E-钙粘蛋白和其他标记的表达
总统阿尔贝托·利马·德·莫拉伊斯·库蒂尼奥（1959–1961）乔治·德·马西拉克（Jorge de Marsillac）（1962–1963）爱德华多·桑托斯·马查多（Eduardo Santos Machado）（1964–1965） 71）1973）豪尔赫·德·马西拉克（Jorge de Marsillac）（1974–1975）Alberto Lima de Morais Coutinho（1976–1977）JoãoSampaioGóisJr。 （1978–1982）Hiram Silveira Lucas（1983–1986）JoséAntonioRibeiro Filho（1987-1989）Antonio S.Figueira Filho（1990-1992） –2001）Gio（2005–2007）Carlos Ricardo Chagas（2008–2010）Carlos Alberto Ruiz（2011–2013）Ruffo de FreitasJúnior（2014–2016）Antonio Luiz Frasson（2017–2019）
DNA甲基化在两个鸣禽及其天然发生的F1杂种
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年1月20日。 https://doi.org/10.1101/2024.01.17.576037 doi：Biorxiv Preprint
在阿尔茨海默氏病中揭示了DNA甲基化
摘要越来越多地通过探索表观遗传机制，尤其是DNA甲基化来阐明阿尔茨海默氏病发病机理的复杂性。本综述全面调查了最新以人为中心的研究，这些研究研究了整个基因组DNA甲基化在阿尔茨海默氏病神经病理学中。对各种大脑区域的检查揭示了与Braak阶段和阿尔茨海默氏病进展相关的独特DNA甲基化模式。内嗅皮层由于其早期的组织学改变以及随后对海马等下游区域的影响而成为焦点。值得注意的是，在内嗅皮层中复杂地鉴定出与神经纤维缠结形成有关的Ank1高甲基化。此外，颞中回和前额叶皮层显示出对Hoxa3，Rhbdf2和MCF2L等基因的显着高甲基化，这可能会影响神经炎症过程。BIN1在晚期阿尔茨海默氏病中的复杂作用与改变的甲基化模式相关。尽管在研究之间存在差异，但这些发现突出了表观遗传修饰与阿尔茨海默氏病病理学之间的复杂相互作用。未来的研究工作应解决方法论上的差异，结合多样的人群，并考虑环境因素，以揭示阿尔茨海默氏病进展的细微表观遗传景观。关键词：阿尔茨海默氏病； ank1; bin1; DNA甲基化；全基因组的关联研究； Hoxa3; MCF2L; RHBDF2
游离DNA羟甲基化谱分析显示抗PD
靶向程序性死亡-1（PD-1）的免疫检查点抑制剂（ICI）的抽象背景处理可以产生持久的抗肿瘤反应，但并非所有患者都对ICIS做出反应。当前可以从抗PD-1治疗中受益的患者的当前方法不足。血浆衍生的无细胞DNA（CFDNA）的5-羟基甲基化（5HMC）分析提出了一种鉴定治疗反应生物标志物的新型非侵入性方法，可以应对与肿瘤活检（如肿瘤异质性和序列样品收集）相关的挑战。方法在治疗开始之前，在治疗期间从多个时间点收集了31例非小细胞肺癌（NSCLC）患者的血液样本。血液样品以获得血浆来源的CFDNA，然后通过两步化学通过生物素化来富集5HMC-含有CfDNA片段，并与链霉亲蛋白涂层的珠结合。5HMC增强的CFDNA和整个基因组库是并行制备的，并测序分别获得整个羟基甲基甲基和整个基因组血浆谱。的结果比较了相同患者的治疗时间点与匹配的预处理样品的结果比较表明，抗PD-1治疗诱导了反应患者的血浆CFDNA 5HMC概况的明显变化，相对于非响应者，固体瘤的反应评估标准判断。在响应者中，5HMC积累了参与免疫激活的基因，例如Inteferon（IFN） - γ和IFN-α反应，炎症反应和肿瘤坏死因子（TNF） - α信号传导，而在非反应者中，5HMC在5HMC中的5HMC对膜层面上的质量增加了5HMC。分子对抗PD-1处理的反应，如第一个治疗周期，从初期观察到血浆CFDNA谱的5HMC变化。对预处理血浆样品的比较表明，抗PD-1治疗反应和耐药性相关基因可以通过5HMC的血浆衍生CFDNA分析来捕获。此外，预处理血浆样品的5HMC分析能够使用T细胞发炎的基因表达谱区将反应者与非反应者区分开，该基因表达谱是先前通过组织RNA分析鉴定的。
血液中 TCF7L2 基因 DNA 甲基化变化的鉴定
TCF7L2（转录因子7样2）基因与2型糖尿病风险增加密切相关，但TCF7L2与人类体重相关性状的关联尚不清楚（Li et al. 2020）。无论年龄大小，TCF7L2基因多态性和糖尿病家族史阳性与糖尿病患者的其他风险因素高度相关（Juttada et al. 2020）。TCF7L2基因编码转录因子，在脂肪、肝脏和胰腺胰岛等多种人体组织中表达。TCF7L2参与Wnt信号通路，TCF7L2基因中单核苷酸多态性的强相关性与2型糖尿病有关（Verma et al. 2020）。数据表明rs7908486单核苷酸多态性与肥胖密切相关。该基于基因分型的研究建议在伊拉克人口的早期肥胖检测中实施 TCF7L2 rs7908486-（Mohammed 等人，2021 年）。
DNA甲基化及其抑制剂在肝纤维化中的作用和机制
肝纤维化是对不断作用于肝脏的各种慢性刺激引起的损伤的修复反应。中，肝星状细胞（HSC）的激活及其转化为肌生成型表型是导致肝脏纤维化的关键事件，但是尚未阐明该机制。HSC激活的分子基础涉及基因表达的调节变化，而没有基因组序列的变化，即通过表观遗传调节。DNA甲基化是表观遗传研究的关键重点，因为它影响了与纤维化相关，与代谢相关的和肿瘤抑制基因的表达。越来越多的研究表明，DNA甲基化与包括HSC激活和肝纤维化在内的几个生理和病理过程密切相关。本综述旨在讨论DNA甲基化在肝纤维化的发病机理中的机制，探索DNA甲基化抑制剂作为肝纤维化的潜在疗法，并就肝脏纤毛的预防和临床治疗提供新的见解。
从全基因组 DNA 甲基化模式中获取见解
甲基化等表观遗传机制可以影响基因表达，并在适应当地环境条件方面发挥关键作用，从而引入物种内的非遗传变异性。在这里，我们使用简化表示亚硫酸氢盐测序方法 (RRBS)，比较了三个欧洲棕熊种群的血液和肌肉中的甲基化模式。我们的结果清楚地表明，除了组织驱动的分歧之外，三个种群的甲基化模式明显不同。差异甲基化位点可能与涉及发育和解剖分化的基因组特征有关，遍布整个熊基因组。这一发现支持了先前的研究，即改变发育途径在塑造具有潜在适应性意义的表型新颖性方面发挥着作用。我们的研究结果强调了在研究野生非模型生物时纳入表观遗传方法的重要性和有效性。研究表观基因组对于那些基因组多样性已严重丧失的濒危种群尤其重要。
通过双重抑制 HOTAIR 和 DNA 甲基化来靶向卵巢癌干细胞
卵巢癌是一种化学反应性肿瘤，对铂类/紫杉醇等标准疗法的初始反应率非常高。然而，大多数女性最终会出现复发，并迅速发展为化学耐药性疾病。治疗结束时卵巢癌干细胞 (OCSC) 的持续存在已被证明是导致肿瘤耐药的原因之一。在本研究中，我们证明长链非编码 RNA HOTAIR 在 HGSOC 细胞系中过表达。此外，与非 CSC 相比，OCSC 中的 HOTAIR 表达上调，HOTAIR 的异位过表达丰富了 ALDH + 细胞群，HOTAIR 过表达增加了球体形成和菌落形成能力。使用肽核酸-PNA3 ® 靶向 HOTAIR，通过破坏 HOTAIR 和 EZH2 之间的相互作用发挥作用，与 DNMT 抑制剂结合可抑制 OCSC 球体形成并降低 ALDH + 细胞的百分比。研究了使用 PNA3® 破坏 HOTAIR-EZH2 并结合 DNMTi 对 OCSC 作为异种移植体内启动肿瘤的能力的影响。HGSOC OVCAR3 细胞在体外用 PNA3® 处理，然后植入裸鼠体内。肿瘤生长、启动和干细胞频率受到抑制。总之，这些结果表明，阻断 HOTAIR-EZH2 相互作用并抑制 DNA 甲基化是根除 OCSC 和阻止疾病复发的潜在方法。
