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World File Search System端粒
利用遗传疾病中的端粒到端粒参考提高光学基因组图谱的分辨率
参考基因组是比较个人基因组以推断临床变异的基线标准。广泛使用的参考基因组 GRCh38 包含间隙和未解析的碱基，尤其是在复杂区域，这可能会影响变异的发现。相比之下，无间隙端粒到端粒 CHM13 (T2T-CHM13) 参考基因组可用于评估基因组的困难区域。光学基因组图谱 (OGM) 是一种用于结构变异识别的成像技术，与传统细胞遗传学方法相比，其分辨率有所提高。我们的研究展示了 T2T-CHM13 参考基因组在复杂区域中增强结构变异 (SV) 检测的实用性。我们通过两个临床病例说明了这一点，其中与 T2T-CHM13 的改进比对导致关键 SV 的置信度得分显著提高。我们展示了更新后的 T2T-CHM13 参考的临床诊断结果有所改善，并提倡采用它。
人类染色体的起源2：祖先端粒 -
摘要我们已经从人类2，C8.1和C29B的两个等位基因组宇宙中鉴定出了两个等位基因组宇宙，每个粘液均包含两个脊椎动物端粒重复的倒置阵列，并在头对头排列，5'（ttaggg）， - （ccctaa）， - （ccctaa），3'。序列fln g这个端粒重复是当今人类序列的特征。BAL-31核酸酶实验人造人造染色体的克隆和荧光原位杂交的荧光表明，这些倒置重复的序列均与2 Q13和不同但重叠的人类染色体末端的子集杂交。我们得出的结论是，克隆在宇宙中C8.1和C29B中的基因座是古老的端粒融合的遗物，标志着两个祖先猿染色体融合产生人类染色体的点。
端粒酶对端粒DNA复制的作用
简介：端粒代表染色体的末端，由Ttaggg核苷酸序列的重复形成。在DNA复制过程中，DNA聚合酶酶无法转录DNA分子3´胶带的末端，这可能会导致端粒缩短。避免了端粒酶的作用，端粒酶（一种逆转录酶）能够合成DNA胶带的末端，因为它在内部有一个模制的RNA色带，正在补充端粒序列。该酶有两个亚基；具有（端粒酶的逆转录酶）和RNP（活性端粒酶的核糖核蛋白颗粒）。目标：研究的主要目的是为Rasmol软件的脚本开发2.7.4.2，以摄入代表端粒酶，RNA和端粒DNA的图像。方法论：在蛋白质数据库上进行了一项调查，以选择端粒酶上的PDB文件。从6d6v.pdb文件中开发了Rasmol软件的脚本，以演示端粒酶，RNA和端粒DNA酶结构。结果：根据为6D6V.pdb文件开发的脚本，在端粒模式以表示端粒酶表示的位置产生了图像。也可以观察到用作模具的RNA拉伸对应于CAACCC序列和其余RNA分子。还观察到三个端粒DNA序列的合成：GTTGGG。结论：通过开发的脚本，可以观察端粒酶，RNA和端粒DNA的结构，以及与霉菌一起用于生产端粒DNA序列的RNA分子区域。
端粒及其在衰老途径中的作用
抽象衰老是一种生物过程特征 - 组织和器官的逐步功能下降，最终导致死亡率。端粒，在线性真核染色体末尾的重复DNA重复序列可保护铬铬，以免降解和非法推荐，在细胞命运和衰老中起着至关重要的作用。由于复制机制，随着细胞的增殖而端粒缩短，因此有助于细胞衰老和线粒体功能障碍。细胞是生物结构和功能的基本单位，线粒体是细胞的强大和代谢中心。因此，细胞衰减和线粒体功能障碍将导致组织或器官的变性和功能障碍，然后通过多种途径进行体细胞衰老。在这篇综述中，我们总结了细胞衰老，线粒体故障和
自然界中端粒相关序列的分布
关于端粒区的结构，一个共同的主题正在出现。染色体末端带有多个串联重复的简单卫星状 DNA（2）。除了染色体末端的简单序列外，端粒附近的区域通常还带有长段中间重复 DNA（1、10、13、15、18、24）。在酿酒酵母中，染色体以 200 到 600 个碱基对的不规则序列 C1_3A 结束（17、23；图 1）。此外，在 DNA 末端附近发现了两个中间重复元素，称为 X 和 Y'（8、9）。Y' 是一个高度保守的元素，长度为 6.7 千碱基（kb）（8、9）。 X 是一种比 Y' 保守性更低的元件，大小范围为 0.3 至 3.75 kb，位于 Y' 的着丝粒附近（8, 9）。C1_3A 重复序列的内部序列以及 DNA 复制的推定起点（自主复制序列）与 X 和 Y' 相关（7, 21）。这些特性与端粒相关序列在复制、重组或端粒区域修复中发挥作用相一致。已经开发出凝胶系统，可以分离完整的酵母染色体 DNA 分子（4, 16）。已记录了菌株 YNN281、A364a、DCO4 和 AB972（5）中每条染色体在一个系统（正交场交替凝胶电泳 [OFAGE]）中的行为。通过改良的凝胶插入法 (16) (5) 从这些菌株中制备 DNA，并进行 OFAGE 处理。将 DNA 转移到硝酸纤维素上并与 X 和 Y' 特异性探针杂交 (20)（图 2）。通过琼脂糖凝胶分离 1.7 kb NcoI 片段，从 YRp12O (9) 制备 X 特异性探针。通过分离 1.7 kb BglII 片段，从 YRpl31b (9) 制备 Y' 特异性探针，该片段被亚克隆到 BamHI 消化的 M13 mpl8 中。从 pYtl03 (17) 切下 125 碱基对 HaeIII-MnlI 片段，其中包含 82 碱基对 C1_3A 重复序列。杂交探针来自据报道不含 C1_3A 重复序列的 X 和 Y' 区域。这一点已通过以下事实得到证实：源自 pYtl03 的真正的 C1_3A DNA 既不与 X 也不与 Y' 探针杂交。为探针选择的 X 区域在不同的 X 元素中是保守的 (8, 9)。表 1 中显示的数据是从 17 种不同的凝胶中汇编而来的，这些凝胶的切换间隔范围为 20 到 80 秒。每个菌株的 X 和 Y' 分布模式不同（图 2 和 3）。每个菌株中至少有三条最小染色体中有一条不与 Y' 探针杂交，在三个菌株中，五条最小染色体中的两条不与 Y' 探针杂交
使用 Crispr-Cas9 进行端粒延长与年龄相关......
端粒磨损被认为是衰老过程的标志 [1]。通过体外研究，人们在了解端粒功能的基本生物学方面取得了重大进展，但从体内角度进行此类研究的成果有限。尽管目前有许多技术可以标记端粒，但其中大多数对细胞有毒性，会导致 DNA 损伤或不适合体内应用 [2]。CRISPR-Cas 系统通过将 Cas9 与荧光蛋白融合，实现了这些区域的精细化，从而可以在活体生物体中可视化端粒 [3]。CRISPR Cas 9 技术的成功率是未来基因组编辑疗法的新希望。端粒长度和端粒缩短率与任何生物体的衰老和最终死亡直接相关。通过增加生物体的端粒长度可以逆转这种影响。CRISPR Cas 系统是一种有效的工具，可用于将端粒无误地插入任何给定生物体的 DNA 中 [4]。
端粒的结构基序及其在调节途径中的作用
摘要：端粒是专门的结构，在真核细胞中线性染色体的末端发现，在维持基因组的稳定性和完整性方面起着至关重要的作用。它们由重复的DNA序列，ssDNA悬垂和几种相关的蛋白质组成。端粒的长度与人类的细胞衰老有关，维持的缺陷与各种疾病有关。端粒的关键结构基序可保护脆弱的染色体末端。端粒DNA还具有形成各种复杂DNA高阶结构的能力，包括T环，D环，R环，G-Loops，G-Quadruplexes和I-Motifs，在互补的C-rich链中。虽然已经确定了许多端粒上的基本蛋白质，但它们的相互作用和结构细节的复杂性仍未完全了解。这种观点强调了在理解与人类端粒相关的结构方面的最新进步。它强调了端粒的意义，探索各种端粒结构基序，并深入研究端粒和端粒酶的结构生物学。还讨论了有助于保护端粒的端粒环，其拓扑结构和相关蛋白质。
可药物激酶和促炎细胞因子的可突变性，它们与端粒的距离和A+T含量
癌症化学疗法结合了多种药物，但是即使对于简单的体外系统，预测药物组合对癌细胞增殖的影响仍然具有挑战性。我们假设，通过将单一药物剂量反应和细胞状态过渡网络动态的知识结合在一起，我们可以预测癌细胞群体将如何对药物组合做出反应。我们在这里使用三个不同细胞周期态的靶向抑制剂在两个不同细胞系的体外测试了这一假设。我们制定了一个马尔可夫模型，以捕获不同细胞周期阶段之间的时间细胞状态过渡，单个药物数据限制了药物剂量如何影响过渡速率。该模型能够预测两个细胞系的所有剂量范围内所有三种不同的成对药物组合的景观，而没有其他数据。虽然在不同的细胞系，更多的药物，其他细胞状态网络以及更复杂的共培养或体内系统中仍有进一步应用，但这项工作表明了当前可用或可获得的信息如何足以预测体外单细胞系的药物组合反应。
适体的应用改善了基于 CRISPR 的植物端粒实时成像
开发活体成像技术以提供染色质在活细胞中如何组织的信息对于解释生物过程的调节至关重要。在这里，我们展示了基于 CRISPR/Cas9 的活体成像技术的改进。在这种方法中，sgRNA 支架与 RNA 适体融合，包括 MS2 和 PP7。当死 Cas9 (dCas9) 与嵌合 sgRNA 共表达时，标记 MS2 和 PP7 适体的荧光外壳蛋白 (tdMCP-FP 和 tdPCP-FP) 被招募到目标序列中。与之前使用 dCas9:GFP 的工作相比，我们表明，使用基于适体的 CRISPR 成像构建体，瞬时转化的本氏烟的端粒标记质量得到了改善。标记受适体拷贝数的影响，受启动子类型的影响较小。相同的结构不适用于稳定转化植物和根中的重复标记。RNP 复合物与其靶 DNA 的持续相互作用可能会干扰细胞过程。