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World File Search System聚糖
真菌基因组学和进化中的巨大挑战
尽管健康的免疫系统能够识别和消除新兴的癌细胞，但已建立的肿瘤却擅长避免免疫监测。免疫抑制细胞表面碳水化合物的改变和特异性表达，也称为“肿瘤糖座”，是一种突出的机制，肿瘤可以逃避抗肿瘤免疫。鉴于它们持续且均匀的表达，肿瘤相关的聚糖是有望被利用为生物标志物和治疗靶标的靶标。然而，由于它们的免疫原性，免疫抑制特性以及在常规的主要组织相容性复合物（MHC）限制的方式中，对这些聚糖的剥削一直是一个挑战。尽管如此，表达T细胞受体（γδT细胞）的T表达伽马和三角洲链的T细胞的子集存在，具有MHC无限制的抗原识别和有效固有的抗肿瘤特性的能力。在这篇综述中，我们讨论了与肿瘤相关的聚糖在抗肿瘤免疫中的作用，并重点介绍了γδT细胞靶向肿瘤糖座的潜力。了解这种相互作用的许多方面具有解锁在新型治疗干预措施中使用肿瘤相关的聚糖和γδT细胞的新方法。
一种新兴的急性期量化技术......
人类血清和血浆的核磁共振 (NMR) 光谱除了代谢物和脂蛋白外，还显示两种特征信号 GlycA 和 B，它们来自急性期蛋白表面聚糖的乙酰基，是炎症过程的良好标志物。在这里，我们报告了在人类血清中观察到的糖蛋白聚糖 NMR 信号的全面分配，结果显示 GlycA 和 GlycB 信号分别来自 N -聚糖的 Neu5Ac 和 GlcNAc 部分。常规测定的急性期糖蛋白浓度与 NMR 光谱中的独特特征有很好的相关性（R 2 高达 0.9422，p 值 <0.001），可以在 10 – 20 分钟的采集时间内同时定量几种急性期炎症蛋白（图 1）。[1] 这在 COVID-19 和心源性休克患者的血清样本中得到了体现，与健康对照组相比，几种急性期蛋白发生了显着变化。
筛选小分子糖基化抑制剂并评估其对糖蛋白的影响
Bowdoin College生物化学系摘要：幽门螺杆菌是一种革兰氏阴性的，螺旋形的致病细菌，可在人类的胃中殖民。一旦建立了感染，还可能发生胃癌和消化性溃疡。抗生素一直是致病细菌治疗的强大工具。当前幽门螺杆菌的治疗方法是“三重治疗”，涉及至少两种不同的抗生素。第三种药物通常是质子泵抑制剂（PPI），以帮助胃愈合。但是，这尚未有效。过量使用广谱抗生素会导致细菌病原体中的抗生素耐药机制（Quintana，2022）。广谱抗生素也经常破坏正常的肠道微生物组（Quintana，2022）。需要替代方法来最大程度地减少负面副作用，并选择性地治疗关注的抗生素抗生素“优先病原体”。细菌聚糖由于其独特的单糖和在细菌致病性中的作用而引人注目的治疗靶标。先前的研究表明，细菌糖基化的破坏会导致对宿主细胞，生物膜形成，运动的粘附降低，从而降低了宿主定殖（Quintana，2022）。因此，杜贝实验室的研究重点是靶向覆盖细菌细胞表面的聚糖。伊莎贝拉·金塔纳（Isabella Quintana）最近的工作先前证明了基于稀有细菌单糖的S-糖苷抑制剂，可有效破坏聚糖生物合成和细菌适应性。我复制了一些实验以确认这些发现。我还使用碳水化合物结合蛋白探索了互补角，以确认S-糖苷抑制剂以浓度依赖性方式有效地阻碍了聚糖生物合成。总体而言，小分子抑制剂已证明可以选择性地靶向抗生素耐药性病原体，从而增加了我们治疗感染的工具。项目目标：这项研究旨在评估基于稀有细菌单糖的S-糖苷抑制剂在破坏聚糖生物合成中的有效性，通过测量糖蛋白生物合成和细胞表面聚糖结构的变化。使用的方法：小分子抑制剂 - 细菌单糖，BAC，DATDG和FUCNAC上的苄基 - 糖苷被用作细菌糖基转移酶的底物诱饵。这些细菌单糖是由于它们快速合成支架及其在优先病原体中的利用而选择的（Williams，2020）。目的是评估S-糖苷作为代谢抑制剂的有效性，以阻止细菌糖基化。这是通过1）确认抑制糖蛋白生物合成的抑制作用和2）确认细胞表面聚糖结构的变化。
1 CRISPR屏幕和凝集素微阵列标识小说...
聚糖在细胞信号传导和功能中起关键作用。与蛋白质不同，聚糖结构不是从基因模板中，而是许多基因的一致活性，使它们在历史上挑战研究。在这里，我们提出了一种利用合并的CRISPR屏幕和凝集素微阵列来揭示和表征细胞表面糖基化调节剂的策略。我们应用了这种方法来研究高甘露糖糖的调节 - 所有天冬酰胺（n）连接 - 聚糖的起始结构。我们使用CRISPR屏幕揭示了控制高甘露糖表面水平的基因的扩展网络，然后是凝集素微阵列，以完全测量精选调节剂对全球糖基化的复杂作用。通过此，我们阐明了两个新型的高甘露糖调节剂-TM9SF3和CCC复合物如何通过调节高尔基形态和功能来控制复合物N-糖基化。值得注意的是，这种方法使我们能够深入审问高尔基功能，并揭示与高尔基形态的类似破坏可以导致巨大不同的糖基化结果。总的来说，这项工作展示了一种可系统地剖析糖基化的调节网络的可推广方法。
多糖在免疫中的关键作用
近年来，药理学和临床研究强调了多糖在免疫调节方面的巨大潜力。多糖可以通过分子识别、细胞内和细胞间通讯（通过与免疫系统直接或间接相互作用）引发免疫刺激反应。各种免疫刺激多糖或其衍生化合物在细胞水平上相互作用以增强免疫系统，包括阿拉伯半乳聚糖、岩藻聚糖、甘露聚糖、木聚糖、半乳聚糖、透明质酸、果聚糖、果胶和阿拉伯半乳聚糖等。这些天然多糖来源于各种植物、动物和微生物。多糖具有独特的结构多样性，而单糖和糖苷键主要赋予其不同的生物活性。这些天然多糖可提高抗氧化能力，减少促炎介质的产生，增强肠道屏障，影响肠道微生物群的组成并促进短链脂肪酸的合成。这些天然多糖还可以减少过度的炎症反应。开发可用于预防或治疗某些疾病的多糖基免疫调节剂至关重要。本综述通过阐明多糖和免疫之间的复杂关系，重点介绍了天然多糖的结构特征、免疫调节特性、潜在的免疫调节机制以及与免疫作用相关的活性。此外，还将强调这些分子作为潜在免疫调节成分的未来，它们可能会在临床层面改变药物应用。
福氏志贺氏菌 2a 合成聚糖疫苗可在成人中诱导持久免疫反应
志贺氏菌是全球中度至重度腹泻的主要原因，也是中低收入国家 5 岁以下儿童腹泻相关死亡的主要原因。针对志贺氏菌病的疫苗需求量很大。SF2a-TT15 是一种合成的碳水化合物结合疫苗，可对抗志贺氏菌 2a (SF2a)，经证实对成年志愿者安全且具有强免疫原性。本文表明，10 µg 寡糖 (OS) 疫苗剂量的 SF2a-TT15 可在接种疫苗后 2 年和 3 年随访的大多数志愿者中诱导持续的免疫反应，且免疫反应强度和功能均保持良好。接种疫苗 3 个月后确定的任一体液参数的高水平以及特异性 IgG 记忆 B 细胞的数量是免疫反应持久性的良好预测指标。这项研究首次检验了志贺氏菌候选疫苗诱导的抗体功能和记忆 B 细胞反应的长期持久性。
2023; 13（9）：3041-3063。 doi：10.7150/thno.80901审查较小的尺寸包装更强的打孔 - 针对tum的小抗体片段的最新进展
附着在蛋白质，脂质或形成长而复杂的链上，糖是在自然界中最通用的翻译后修饰，并围绕所有人类细胞。独特的聚糖结构由免疫系统监测，并将自我与非自身和健康与恶性细胞区分开。异常的糖基化，称为肿瘤相关的碳水化合物抗原（TACAS），是癌症的标志，与癌症生物学的各个方面相关。因此，塔卡斯（Tacas）代表了用于癌症诊断和治疗的单克隆抗体的有吸引力靶标。然而，由于较厚且密集的糖脂以及肿瘤微环境，常规抗体通常遭受限制的访问和体内有效性。为了克服这个问题，许多小型抗体片段已经出现，比全长的效率表现出相似的亲和力，其效率更高。在这里，我们回顾了针对肿瘤细胞上特定聚糖的小抗体片段，并强调了它们比常规抗体的优势。