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World File Search System肽聚糖
精神分裂症配偶诊断的酒精使用障碍
目的：这项研究利用综合的生物信息学来研究差异表达的基因（DEG）和与溃疡性结肠炎（UC）有关的途径。材料和方法：使用GSE13367和GSE134025数据集从UC患者的结肠粘膜样品和对照组中鉴定出差异表达的基因。使用差异表达的基因选择使用了GEO2R和Venn图，然后使用功能性注释，途径分析，通过字符串数据库确定PPI以及使用Metascape的GO/KEGG富集分析。结果和讨论：分析揭示了197摄氏度，有76个上调和121个下调基因。上调的基因富含体液免疫反应，肽聚糖的结合和NADPH氧化酶复合物，而下调的基因与无机阴离子转运，递质门控离子通道活性和整体质量质膜成分相关。在PPI网络中，上调的DEG形成了密集的网络（75个节点，190个边缘），表明显着相互作用，而下调的DEG形成了一个较小的密度网络（114个节点，63个边缘）。在197摄氏度中鉴定出五个集线器基因（CXCR4，CXCL13，CXCL1，MMP3）。这些发现为UC的原因提供了新的见解，并为更有效的治疗方法提供了希望。关键词：生物信息学分析，基因表达，炎症性肠病，途径富集分析，蛋白质相互作用
评论 - 人类和动物健康免疫反应和针对幽门螺杆菌的治疗性疫苗
摘要：幽门螺杆菌（H. pylori）是一种革兰氏阴性细菌，被认为是大约40年前的重大发现之一，它是从人胃中分离和培养出来的。H. pylori感染了超过一半的人类人口，使其成为最为人熟知的人类病原体之一。免疫反应的前线始于对H. pylori及其介质的先天识别以及胃上皮细胞的细胞内信号传导，在细胞内信号传导中，它们识别并响应细菌产物，例如鞭毛、脂多糖和肽聚糖。炎症反应之后是先天和适应性免疫系统各种细胞的募集。包括IL-12、IL-23和TGF-β在内的细胞因子分别引导CD4 + T辅助细胞向Th1、Th17和Treg极化。幽门螺杆菌感染可能出现的临床症状与细菌的毒力因子、宿主的遗传因素和免疫反应有关。已发现特定抗原是这些关键毒力因子的一部分。特定抗原可能在开发有效疫苗以根除幽门螺杆菌感染方面发挥作用。先天和适应性免疫以及遗传因素在理解宿主反应机制、阐明疾病的发病机制以及开发新的靶向药物方面具有重要地位
第56届中西部学生生物医学研究论坛
Background, Significance, Hypothesis: C. trachomatis (Ctr) is an obligate intracellular pathogen that employs several strategies to evade host immune responses while replicating within permissive cell types, such as epithelial cells.在保护性膜结合的液泡中被划分为隔离层被称为包含，被称为包含，以隔离衣原体病原体相关的分子模式（PAMP），并修饰其脂多糖（LPS）（LPS）通过各种病原体识别受体（PRR）来防止检测。病原体识别的新范式暗示了病原体诱导的误差（感染不忠），负责激活PRR。例如，释放细胞内病原体相关的分子模式（PAMP），例如核酸，环状二核苷酸，肽聚糖（PG）成分等。只有在细菌膜完整性因生化过程失调而损害时才会发生。我们提出转录失调可能是一种感染的形式，当表达不当时，某些蛋白质能够触发病原体识别。宿主 - 病原关系的一个有趣的方面是，在铁饥饿或氨基酸限制中遭受压力，这两个实体都会从两个实体中产生反应以改变权力平衡。在铁饥饿的情况下，同时影响宿主和病原体的铁饥饿，通过诱导代谢误差来削弱后者，并通过增强对这些病原体错误的认识来增强前者。
全基因组对大肠杆菌中替代性肽聚糖交联所需的基因的鉴定揭示了-lactams的意外影响多层网络中的遗传合作性暗示了亨廷顿氏病小鼠与症状同步的纹状体中的细胞存活和衰老
动机：亨廷顿氏病（HD）可以通过基因放松来发展。然而，基因放松管制对HD遗传合作的动力学的影响仍然很差。在这里，我们在HD敲入小鼠的大脑（等位基因HDH小鼠）的大脑中建立了一个多层网络模型。为了增强生物学精度和基因优先序列，我们整合了三个源网络的互补家族，所有这些都从HDH小鼠中的相同RNA-SEQ时间序列数据推断为加权 - 边缘网络，在该网络中，Edge-Edge-Edge-lates跨源网络跨源网络跨源网络和时点的路径长度变化。结果：加权边缘网络识别出富含受管化基因（临界阶段）的紧密遗传合作性的连续波，在皮质中曾经久经术，与纹状体呈现，并与纹状体相关，与细胞的存活有关（例如hipk4）与细胞增殖相互缠绕（例如scn4b）和细胞衰老（例如CDKN2A产品）响应。顶部纹状体加权边缘在HD发病机理的无脊椎动物模型中富含有缺陷行为的调节剂，从而验证了它们与体内神经元功能障碍的相关性。共同揭示了HDH小鼠大脑中遗传合作的高度动态的时间特征，其中2步逻辑突出了症状小鼠纹状体中细胞维持和延伸的重要性，提供了高度优先的靶标。联系人：Christian.neri@inserm.fr补充信息：补充数据可在Online BioInformatics获得。可用性和实现：加权边缘网络分析（WENA）数据和源代码，用于执行信号（SDS）的光谱分解（SDS）和Wena分析，均为使用Python编写，可在http://www.broca.inserm.inserm.inserm.fr/hd-wena/上获得。
ld-肽对农杆菌的适应性和极性生长至关重要
肽聚糖（PG）是一种网状结构，是细菌细胞壁的主要成分，对于维持细胞完整性和形状至关重要。大多数细菌依靠青霉素结合蛋白（PBP）进行交联，但某些物种也采用LD-转肽酶（LDTS）。与PBP不同，LDT的本质和生物学功能在很大程度上不清楚。以其极性生长而闻名的字母细菌的杂种菌序，其PG异常富含LD-Crosslinks，这表明LDT在这些细菌中可能在PG合成中起更重要的作用。在这里，我们研究了植物病原体农杆菌tumefaciens中的LDT，发现该细菌中至少有14个假定的LDT中的14种引起的LD-肽对其存活至关重要。值得注意的是，缺乏独特的7个LDT的突变体在杂种菌中广泛保守的突变体表现出降低的LD互动和PG将PG束缚到外膜β-贝尔β-桶蛋白上的链接。因此，这种突变体遭受了严重的健身损失和细胞形状的圆形，强调了这些菌粒特异性LDT在维持细胞壁完整性和促进延伸方面所起的关键作用。tn-sequering屏幕表现出了a的非冗余功能。Tumefaciens LDTS。具体而言，连字符特异性LDTs与除法和细胞周期蛋白表现出合成的遗传相互作用，而来自另一组的单个LDT。此外，我们的发现表明，缺乏所有LDT的菌株表现出独特的表型特征和遗传相互作用。总体而言，我们的工作强调了ld-rosslinking在a中的关键作用。tume-faciens细胞壁完整性和生长，并为这些交联活动的功能专业化提供了见解。
阿莫西林 - 耐肺炎链球菌可以是...
重要的机会性人类病原体肺炎链球菌中的抽象抗生素抗性正在上升。在β-乳酰胺抗生素阿莫西林（这是一线疗法）的情况下，这尤其有问题。因此，发现杀死或对抗阿莫西林耐药性肺炎球菌的靶标至关重要。为此，我们使用称为Scrilecs-Seq的CRISPR干扰（CRISPR干扰库的亚集）开发了一个全基因组，基于单细胞的基因沉默屏幕，该筛选是由荧光激活的细胞分选提取的，耦合与下一代测序）。由于阿莫西林会影响生长和分裂，因此使用SCRILECS-SEQ来识别负责维持适当细胞大小的靶标。我们的屏幕表明，大甲酸酯途径的下调会导致广泛的细胞伸长。进一步研究这种现象，这表明它是由于细胞壁合成部位在细胞壁合成部位的可用性降低而引起的，这是由于未依赖磷酸盐（UND-P）的限制，这是脂质载体，该脂质载体负责将这些前体跨细胞膜运输。数据表明，即使肽聚糖的合成仍在继续，即使降低了UND-P水平，但细胞收缩也被专门停止。我们成功利用了这一知识，以创建一种组合治疗策略，其中FDA批准的药物氯米芬是一种UND-P合成的抑制剂，与阿莫西林配对。我们的结果表明，克罗米芬增强了阿莫西林蛋白的抗菌活性，并且联合疗法使耐肺炎链球菌恢复活力。这些发现可以提供一个起点，以开发越来越多的难以治疗的抗肺炎球菌感染的解决方案。
RAGE 轴是右侧结肠免疫逃避的基础......
摘要 背景 右侧和左侧结肠的肿瘤发生具有不同的特征。目的 我们旨在描述代表结肠肿瘤发生早期的左侧和右侧腺瘤 (AD) 之间的差异。设计 分析单细胞和空间转录组数据集以揭示右侧和左侧结肠 AD 之间的改变。使用细胞、动物实验和临床标本来验证结果。结果 单细胞分析显示，在右侧 AD 中，杯状细胞显著减少，并且这些杯状细胞功能失调，粘蛋白生物合成减弱，抗原呈递缺陷。粘液屏障受损导致隐窝中形成生物膜，随后细菌侵入右侧 AD。空间转录组学显示，在隐窝周围有生物膜占据的区域经历了脂多糖 (LPS) 的炎症反应和细胞凋亡过程。在右侧 AD 中发现了独特的 S100A11 + 上皮细胞群，其表达水平由细菌 LPS 和肽聚糖诱导。S100A11 表达促进了同基因免疫功能正常小鼠的肿瘤生长，髓系抑制细胞 (MDSC) 增加，但细胞毒性 CD8+ T 细胞减少。用耐受性良好的晚期糖基化终产物 (RAGE) 受体拮抗剂 (Azeliragon) 靶向 S100A11 可显著抑制肿瘤生长和 MDSC 浸润，从而提高抗程序性细胞死亡蛋白 1 治疗结肠癌的疗效。结论我们的研究结果表明，功能失调的杯状细胞和随之而来的细菌易位激活了右侧结肠 AD 中的 S100A11-RAGE 轴，从而募集 MDSC 来促进免疫逃避。Azeliragon 靶向该轴可提高结肠癌免疫治疗的疗效。
2021-hcpcs-申请摘要-第二季度-...
Kimyrsa 是一种单剂量抗菌药物，输注时间超过一 (1) 小时，用于治疗由某些细菌引起的急性细菌性皮肤和皮肤结构感染 (ABSSSI) 的成人患者。它是一种半合成脂糖肽抗菌药物，用于治疗由指定病原体引起的 ABSSSI 的成人患者。Kimyrsa 适用于治疗由指定革兰氏阳性微生物的易感分离株引起的 ABSSSI 的成人患者。奥利万星有三种作用机制：(i) 通过与肽聚糖前体的茎肽结合来抑制细胞壁生物合成的转糖基化 (聚合) 步骤；(ii) 通过与细胞壁的肽桥接片段结合来抑制细胞壁生物合成的转肽 (交联) 步骤；(iii) 破坏细菌膜的完整性，导致去极化、通透化和细胞死亡。这些多种机制促成了奥利万星的浓度依赖性杀菌活性。 Kimyrsa 的推荐剂量为 1,200 毫克，单剂量静脉输注，1 小时，适用于 18 岁及以上的患者。该药物以无菌冻干粉形式提供，每瓶含 1,200 毫克奥利万星（奥利万星二磷酸盐），装在单剂量透明玻璃瓶中，静脉注射前必须重新配制并进一步稀释。现有代码无法充分描述 Kimyrsa，因为它是一种独特的单一来源药物，需要为其提供新代码，以便根据其平均销售价格 (ASP) 数据进行报销。
氨苄西林* 类别：β-内酰胺概述
氨苄西林* 类别：β-内酰胺 概述 氨苄西林，俗称广谱青霉素，是一种氨基青霉素，是一类半合成的 β-内酰胺，专门用于对抗革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌。氨基青霉素是通过将青霉素与氨基或侧链连接而生成的。添加侧链会显著改变药物对某些细菌的活性。最初，这些抗菌药物对奇异变形杆菌、大肠杆菌、志贺氏菌、沙门氏菌、嗜血杆菌和奈瑟菌有效。然而由于易感性的变化，氨苄西林不再是治疗这些菌感染（如大肠杆菌尿路感染）的首选药物，除非培养和药敏结果表明易感。氨苄西林的作用机制是通过附着于青霉素结合蛋白 (PBP) 来干扰细胞壁合成，抑制细胞壁肽聚糖合成和使自溶酶抑制剂失活。耐药性 氨苄西林通常也被 β-内酰胺酶灭活（有关获得对 β-内酰胺的耐药性的信息，请参阅青霉素部分。）。近年来，屎肠球菌和肺炎链球菌开始通过突变表现出低亲和力 PBP，这是对氨基青霉素的耐药机制。有效性 氨苄西林和阿莫西林具有相同的活性谱，尽管阿莫西林的特点是生物利用度更高。对氨苄西林和阿莫西林普遍敏感的菌属包括葡萄球菌、链球菌、棒状杆菌、梭状芽孢杆菌、大肠杆菌、克雷伯氏菌、志贺氏菌、沙门氏菌、变形杆菌和巴氏杆菌，尽管其中许多细菌已获得耐药性。氨苄西林通常用于治疗革兰氏阴性肠道细菌引起的泌尿道感染。该药物还用于治疗呼吸道感染。此外，氨苄西林对 B 组链球菌均有效，但对肠杆菌、流感嗜血杆菌、假单胞菌和吲哚阳性变形杆菌感染无效。有关体液和脑脊液吸收的解释，请参阅青霉素部分。 *可根据要求提供参考资料。致电路易斯安那州卫生与医院部公共卫生办公室传染病流行病学科 (504-219-4563)
医学微生物学讲义ppt
微生物学基础：临床方法 - 第三版 由 Johana Meléndez 教授等编写 医学微生物学简介，作者：Andrew Dodgson 博士 本书是了解医学微生物学的综合资源，涵盖了基本概念和临床方法。 关键概念包括： - 研究导致人类疾病的微生物（病毒、细菌、真菌和寄生虫） - 正常菌群：人体皮肤和粘膜上有益微生物的存在 - 污染：培养物中存在在采集样本时不存在的生物 - 定植：生物在某个部位存在但没有引起疾病或症状 - 感染：生物侵入身体部位、繁殖并引起组织反应、症状或疾病 将生物分类为界、门、属、种对于理解医学微生物学也至关重要。其中包括： - 病毒：体型小，无法独立复制，难以治疗（例如流感、艾滋病毒/艾滋病） - 细菌：能够独立复制，导致医院中见到的大多数感染，并用抗生素治疗 - 真菌：复杂、大型生物，也会导致疾病（例如肺炎、尿路感染） 了解这些概念对于医疗保健专业人员有效地诊断、预防和治疗感染至关重要。 细菌可分为真菌和霉菌，导致一系列疾病，例如鹅口疮、足癣、侵袭性和过敏性曲霉病。许多疾病都是机会性的。 对细菌进行分类至关重要，因为不同类型的细菌会导致不同的疾病，并且对抗生素有不同的反应。为了对细菌进行分类，我们根据它们的微观外观对它们进行分组，然后根据生化反应等特性进一步将它们分为不同种类。 革兰氏染色法通过使用结晶紫和其他化学物质对载玻片进行染色来帮助区分细菌。这种方法可以确定细菌是革兰氏阳性还是革兰氏阴性，这会影响其抗生素耐药性。革兰氏染色还提供有关细菌细胞壁形状的信息，将它们分为四个主要类别：G+ 杆菌、G+ 球菌、G- 杆菌和 G- 球菌。这种初步鉴定对于诊断疾病和选择适当的抗生素很有用。 微生物学是研究微生物（包括细菌、病毒、真菌和其他微观生命形式）的科学分支。医学微生物学领域专门研究人类传染病的原因和影响。 微生物分类 ----------------------------- 微生物分为几类： * **原生生物**：包括原生动物等单细胞生物的群体。 * **病毒**：此类包括病毒，它们是可导致人类传染病的非细胞生命系统。 * **DNA 病毒和 RNA 病毒**：病毒类别的子类别，以其遗传物质（DNA 或 RNA）区分。 * **真核生物**：包括单细胞真核生物（如藻类和原生动物）的群体。 * **原核生物**：此类别包括细菌，即没有细胞核的原核细胞。 * **真菌**：一类微生物，包括对人类有致病性的真菌。 * **蓝藻**：蓝藻的一个子类别。 * **藻类**：一组光合真核生物。 * **细菌**：此类包括革兰氏阴性细菌，其具有特征性的细胞壁结构，由外膜和含有胞壁酸的薄内肽聚糖层组成。 * **原生动物**：原生生物的一个子类别，包括对人类有致病性的单细胞动物生物。细菌类内的分类 --------------------------- -- 细菌类进一步分为三个亚类： 1. **暗细菌**：此类细菌的细胞壁为革兰氏阴性，由外膜和含有胞壁酸的薄内肽聚糖层组成。 2. **无氧光合细菌和有氧光合细菌**：暗细菌亚类的子类别。 微生物命名法 ------------------------------ 在微生物学中，使用二名法来识别物种。该系统为每种物种分配一个通用名称和一个特定名称。例如，*炭疽芽孢杆菌* 和 *破伤风梭菌* 分别是炭疽杆菌和破伤风杆菌的科学名称。 细菌的大小 ------------------ 细菌的大小通常以微米 (μm) 或毫米 (mm) 为单位。大多数致病菌的尺寸在 0.1 到 10 μm 之间。用于测量微生物的其他单位包括纳米和埃。 细菌的形态 ------------------------- 细菌是通过二分裂繁殖的原核细胞，二分裂是一种无性繁殖，细胞分成两个相同的子细胞。它们同时具有 DNA 和 RNA，可根据形状进行分类： 1. **球形（球菌）**：此类细菌呈球形。 2. **杆状（细菌、杆菌和梭菌）**：细菌类的子类别，包括长度不一的杆状体。 3. **螺旋形（弧菌、螺旋体、螺旋体）**：杆状细菌的一个子类别。 淋病奈瑟菌的电子显微照片 ---------------------------------------------- 电子显微照片是使用电子显微镜拍摄的高分辨率图像。这张显微照片显示的是*淋病奈瑟菌*的形态，它是一种导致淋病的致病菌。杆状细菌的排列 -------------------------------------- 杆状细菌可以排列成不同的形状，包括： 1. **单杆**：单个杆状细菌。 2. **链杆菌**：一种具有特征形状的杆状细菌。螺旋形式 ---------- ---- 弧菌是一种螺旋状的细菌，外观类似逗号。细菌有各种形式，包括霍乱弧菌和螺旋体，它们都是盘绕的形状。致病菌种如小螺旋体会导致鼠咬热，而幽门螺杆菌会导致胃溃疡。螺旋体是一类细菌，包括密螺旋体、钩端螺旋体和伯氏疏螺旋体，其特征是细胞薄而柔韧，有规则的扭曲。细胞壁对于细菌的刚性和渗透保护至关重要，由革兰氏阳性菌中的肽聚糖组成。所讨论的细菌不能运动，也没有荚膜，属于革兰氏阴性。它们对各种抗生素高度敏感，需要活细胞才能在其中繁殖。从形态上看，这些立克次体与某些细菌有相似之处，具有包围原生质物质和致密颗粒的限制膜。另一方面，衣原体也是革兰氏阴性菌，缺乏必要的能量产生机制，因此是细胞内寄生虫。它们表现出两种不同的形态：原生体和初始体。实验室诊断采用多种方法：1. 细菌镜检 2. 常规细菌学检测 3. 抗生素敏感性检测，以检测细菌对药物的反应 4. 血清学评估抗体存在 5. 生物技术，用于识别特定的生物过程 6. DNA 技术检测，如 PCR（聚合酶链反应），可检测各种生物体的 DNA 或 RNA，例如 HIV。血清学评估抗体的存在 5. 用于识别特定生物过程的生物技术 6. DNA 技术测试，如 PCR（聚合酶链反应），可检测来自各种生物体（例如 HIV）的 DNA 或 RNA。血清学评估抗体的存在 5. 用于识别特定生物过程的生物技术 6. DNA 技术测试，如 PCR（聚合酶链反应），可检测来自各种生物体（例如 HIV）的 DNA 或 RNA。