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ALK 重排肺癌中通过 EGFR 信号对 Lorlatinib 产生适应性耐药性
重排的 NSCLC 细胞系，随后评估厄洛替尼的额外疗效。六株 ALK 重排的 NSCLC 细胞系根据基线时 EGFR 表达的高低分为两组（图 4D）。厄洛替尼加速了对几种 ALK-TKI（包括劳拉替尼）的敏感性，并降低了 EGFR 高表达细胞 A925L 和 H2228 的活力，但对低 EGFR 表达细胞（H3122、KTOR1、KTOR1 RE 和 CCL185IG）的活力仅显示出边际影响（图 4E，补充图 5、6）。劳拉替尼和厄洛替尼联合治疗后的组合指数值小于 1.0，表明在 A925L 和 H2228 细胞中具有协同作用（补充图 7）。这些发现表明，基线时 EGFR 高表达可能是 ALK-
![b'genation 的 C3 和 C2 位尚未开发。在此，我们报道了一种无催化剂获取 1-芳基 2,3-二碘咔唑 [7,8] 的方法，其中涉及碘转位（方案 1D）。值得注意的是，我们的方案允许在三个连续位置 [9] 即 C1、C2 和 C3 对咔唑核心进行可控官能化。环化前体 (碘吲哚基)炔醇 1a \xe2\x80\x93 n 是使用已知程序由适当的吲哚-2-甲醛制备的。[5] 我们的旅程始于研究苯基取代炔醇 1a 作为模型底物的反应（表 1）。 [10] 我们研究了 1a 与几种碘化试剂（如 I 2 、NIS、ICl 和 Ipy 2 BF 4 ）的反应。在碳酸钠存在下，在异丙醇中，在 15 °C 下使用 ICl [11] 可有效实现串联碘环化-碘移位。使用 1.1 倍过量的 ICl 可得到三环 2a ，产率为 50%（表 1，条目 5），而使用 2.5 倍过量的 ICl 可得到所需的杂环，产率为 60%（表 1，条目 3）。通过对粗反应混合物进行 TLC 和 1 H NMR 分析观察到总转化率，未检测到副产物或聚合反应。然而，在柱层析纯化 2,3-二碘-咔唑 2a 的过程中观察到一些分解，这可能是导致分离产率适中的原因。值得注意的是，重排的 1-苯基-2,3-二碘-咔唑 2a 是唯一的区域异构体。使用有机碱代替 K 2 CO 3 或不同的溶剂'](/simg/8/855f3c9598aa8a034e402cab16971aa1920b4ee4.webp)
b'genation 的 C3 和 C2 位尚未开发。在此，我们报道了一种无催化剂获取 1-芳基 2,3-二碘咔唑 [7,8] 的方法，其中涉及碘转位（方案 1D）。值得注意的是，我们的方案允许在三个连续位置 [9] 即 C1、C2 和 C3 对咔唑核心进行可控官能化。环化前体 (碘吲哚基)炔醇 1a \xe2\x80\x93 n 是使用已知程序由适当的吲哚-2-甲醛制备的。[5] 我们的旅程始于研究苯基取代炔醇 1a 作为模型底物的反应（表 1）。 [10] 我们研究了 1a 与几种碘化试剂（如 I 2 、NIS、ICl 和 Ipy 2 BF 4 ）的反应。在碳酸钠存在下，在异丙醇中，在 15 °C 下使用 ICl [11] 可有效实现串联碘环化-碘移位。使用 1.1 倍过量的 ICl 可得到三环 2a ，产率为 50%（表 1，条目 5），而使用 2.5 倍过量的 ICl 可得到所需的杂环，产率为 60%（表 1，条目 3）。通过对粗反应混合物进行 TLC 和 1 H NMR 分析观察到总转化率，未检测到副产物或聚合反应。然而，在柱层析纯化 2,3-二碘-咔唑 2a 的过程中观察到一些分解，这可能是导致分离产率适中的原因。值得注意的是，重排的 1-苯基-2,3-二碘-咔唑 2a 是唯一的区域异构体。使用有机碱代替 K 2 CO 3 或不同的溶剂'
b'genation 的 C3 和 C2 位尚未开发。在此，我们报道了一种无催化剂获取 1-芳基 2,3-二碘咔唑 [7,8] 的方法，其中涉及碘转位（方案 1D）。值得注意的是，我们的方案允许在三个连续位置 [9] 即 C1、C2 和 C3 对咔唑核心进行可控官能化。环化前体 (碘吲哚基)炔醇 1a \xe2\x80\x93 n 是使用已知程序由适当的吲哚-2-甲醛制备的。[5] 我们的旅程始于研究苯基取代炔醇 1a 作为模型底物的反应（表 1）。 [10] 我们研究了 1a 与几种碘化试剂（如 I 2 、NIS、ICl 和 Ipy 2 BF 4 ）的反应。在碳酸钠存在下，在异丙醇中，在 15 °C 下使用 ICl [11] 可有效实现串联碘环化-碘移位。使用 1.1 倍过量的 ICl 可得到三环 2a ，产率为 50%（表 1，条目 5），而使用 2.5 倍过量的 ICl 可得到所需的杂环，产率为 60%（表 1，条目 3）。通过对粗反应混合物进行 TLC 和 1 H NMR 分析观察到总转化率，未检测到副产物或聚合反应。然而，在柱层析纯化 2,3-二碘-咔唑 2a 的过程中观察到一些分解，这可能是导致分离产率适中的原因。值得注意的是，重排的 1-苯基-2,3-二碘-咔唑 2a 是唯一的区域异构体。使用有机碱代替 K 2 CO 3 或不同的溶剂'
靶标富集纳米孔测序和从头组装揭示了 CRISPR-Cas9 在人类细胞中诱导的复杂靶标基因组重排同时发生
CRISPR-Cas9 系统被广泛用于通过双向导 RNA 永久删除基因组区域。CRISPR-Cas9 可能会引起基因组重排，但持续的技术发展使得表征复杂的靶向效应成为可能。我们将创新的基于液滴的靶向富集方法与长读测序相结合，并将其与定制的从头序列组装相结合。这种方法使我们能够在靶向基因组位点内以千碱基规模剖析序列内容。我们在此描述了 Cas9 造成的广泛基因组破坏，包括靶区域基因组重复和倒位的等位基因共存，以及外源 DNA 的整合和聚集的染色体间 DNA 片段重排。此外，我们发现这些基因组改变导致功能异常的 DNA 片段并可改变细胞增殖。我们的发现拓宽了 Cas9 删除系统的结果范围，强调了细致的基因组验证的必要性，并引入了一种数据驱动的工作流程，能够以更高的分辨率详细剖析目标序列内容。
ALK 重排 NSCLC 简介
非小细胞肺癌（NSCLC）中的致癌基因成瘾具有深远的诊断和治疗意义。在未经选择的 NSCLC 样本中，分别约有 2-7%、1-2% 和 0.2% 发现 ALK 、ROS1 和 NTRK 重排；然而，在组织学为腺癌的年轻和从不吸烟的患者中，它们的频率明显更高。此外，ALK 、ROS1 和 NTRK 重排通常与 NSCLC 中其他已知的驱动改变互相排斥。由于频率如此之低，使用免疫组织化学等准确而廉价的技术进行诊断筛查对于识别阳性病例很有用；然而，由于特异性更高，通常需要使用荧光原位杂交或下一代测序进行确认。在 ALK 重排的 NSCLC 中，使用第二代和第三代酪氨酸激酶抑制剂进行序贯治疗可实现持久的疾病控制，大多数患者在转移性疾病的情况下存活超过 5 年。对于 ROS1 重排的 NSCLC，一线治疗采用克唑替尼或恩曲替尼，后续治疗采用
靶标富集纳米孔测序和从头组装揭示了由 CRISPR-Cas9 诱导的 1 个复杂的靶基因组重排同时发生
靶标富集的纳米孔测序和从头组装揭示了 CRISPR-Cas9 在人类细胞中诱导的 1 个复杂的靶基因组重排的共现 2 3 4 5 Keyi Geng 1、Lara G. Merino 1、Linda Wedemann 1、Aniek Martens 1、Małgorzata Sobota 1、6 Yerma P. Sanchez 1、Jonas Nørskov Søndergaard 1、Robert J. White 2、Claudia Kutter 1 * 7 8 1 瑞典卡罗琳斯卡医学院生命科学实验室微生物学、肿瘤和细胞生物学系 10 2 约克大学生物系，英国约克 11 * 通讯作者。电话：+46 (0) 70 4933896。电子邮件：12 claudia.kutter@ki.se 13 14 15 标题：Xdrop-LRS 揭示 CRISPR-Cas9 的靶向效应 16 17 18 关键词 19 意外的 CRISPR-Cas9 编辑、组合基因组复制-倒置-整合、20 基于液滴的靶向富集、长读测序、从头序列组装 21 22 23 摘要 24 CRISPR-Cas9 系统被广泛用于通过双 25 向导 RNA 永久删除基因组区域。CRISPR-Cas9 可能会引起基因组重排，但持续的技术发展使得表征复杂的靶向效应成为可能。我们将创新的基于液滴的靶向富集方法与长读测序相结合，并将其与定制的从头序列组装相结合。这种方法使我们能够在靶基因组位点内以千碱基规模剖析序列内容。我们在此描述了 Cas9 造成的广泛基因组破坏，包括靶区域基因组重复和倒置的等位基因共现，以及外源 DNA 的整合和聚集的染色体间 DNA 片段重排。此外，我们发现这些基因组改变导致功能异常的 DNA 片段，并可能改变细胞增殖。我们的研究结果拓宽了 Cas9 删除系统的结果范围，强调了细致的基因组验证的必要性，并引入了数据驱动的工作流程，从而能够以卓越的分辨率详细剖析靶序列内容。
研究文章 NUT 中线癌：一种以染色体重排为特征的罕见实体肿瘤
目的 . 罕见低分化NUT中线癌（NMC）是一种高度恶性肿瘤。但由于NMC罕见，关于其临床、影像学和病理特征的报道仍然很少。方法 . 本研究以3例位于腮腺、肺和气管的NMC患者为例，总结NMC的临床病理特征。所有病例均通过双色FISH检测后检测NUT抗体核反应阳性进行诊断，结果均为阳性，提示NUT基因15q14发生染色体重排。结果 . 这3例患者均接受了手术治疗和放化疗等常规治疗。鉴于常规强化治疗效果不佳，建议使用两种新型疗法，即组蛋白去乙酰化酶抑制剂 (HDACi) 和溴结构域抑制剂 (BETi)，因为两者都可以抑制肿瘤细胞的生长，这些靶向疗法可能会延长患者的生存时间。结论。NMC 是一种容易误诊且预后不良的癌症；因此，提高临床医生的认识对于提高诊断准确性至关重要，选择有效的治疗方法是改善预后的主要方法。
碱基重排时的全氟辛烷磺酸盐和全氟辛酸
众议院报告 116-445 第 29 页，附带 HR 7609《2021 年军事建设、退伍军人事务和相关机构拨款法案》，要求国防部环境部副助理部长向国会国防委员会提交季度报告，介绍国防部 (DoD) 在基地重新调整和关闭 (BRAC) 地点识别和修复全氟辛烷磺酸 (PFOS) 和全氟辛酸 (PFOA) 方面取得的进展，以及提高透明度的建议。此外，众议院报告 117-81 第 22 页，附带 HR 4355《2022 年军事建设、退伍军人事务和相关机构拨款法案》和 HR 2471《2022 年综合拨款法案》的联合解释性声明，要求国防部环境和能源恢复副助理部长为国会国防委员会准备一份综合报告，建立有关 BRAC 地点 PFOS/PFOA 的信息基线。本报告涵盖 2021 财年要求的所有剩余季度报告和 2022 财年报告语言中要求的有关已关闭军事设施中 PFOS/PFOA 的信息基线。具体而言，本报告包括 (1) 清理过程的背景；(2) 提高国防部清理过程透明度的建议；(3) 所有 BRAC 地点的列表；(4) 指示是否在饮用水和地下水中检测到 PFOS/PFOA； (5) 检测到的 PFOS/PFOA 水平；(6) 有关 PFOS/PFOA 可能来源的信息；(7) 对当前缓解措施和拟议补救计划的说明；(8) 补救状态；(9) 清理时间表；以及 (10) 对调查和清理 BRAC 地点全氟和多氟烷基物质 (PFAS) 的当前和未来成本的估计。
针对 NSCLC 中的 ALK 重排
1 浙江省人民医院、杭州医学院附属人民医院肿瘤中心、肺部与危重症医学科，杭州，2 寿光市中医院肿瘤内科，寿光，3 英国伦敦帝国理工学院外科与癌症系肿瘤分部，伦敦，4 Xcovery Holdings，佛罗里达州棕榈滩花园，美国，5 湖南省肿瘤医院、湘雅医学院附属肿瘤医院肿瘤内科、肺癌与胃肠病科，长沙，6 国家癌症中心、国家肿瘤临床研究中心、中国医学科学院、北京协和医学院肿瘤医院、深圳医院胸外科，深圳，中国
IQ亚型，大脑体积和免疫标记 毒理学 - UCL发现 - 伦敦大学学院 在正常范围内HBA1C之间的关联... 在支持1型糖尿病决策中以人为中心的机器学习的共同设计机会 预测电池的稳定锂铁硫化物... 远程随机电路中的运输和纠缠增长 定量评估临床前铸造的原代基因编辑人干细胞中染色体重排的定量评估 Neuroml-DB：共享和表征数据驱动的神经科学模型 数据注释人群神经影像学：全面的生成 关于安迪·派克（Andy Pike）地理政治经济学的评论 终生并通过细胞改善欧洲医疗保健 - 社论：衰老神经科学的深度学习 2型糖尿病在患者症状归因中的作用... 基于挑战性髓鞘的深度学习分割 布鲁顿的酪氨酸激酶抑制剂：一种新的治疗疗法... 胆固醇酯转移蛋白作为心血管疾病的药物靶标 大脑通信 - UCL发现 热还原石墨烯/MXENE膜，用于增强的li- ... 第2章能源安全的定义
1。UCL皇后广场神经病学研究所，英国伦敦UCL皇后广场研究所2.心理医学学院，心理学和神经科学研究所，英国伦敦国王学院，英国伦敦国王学院3.大脑映射单元，精神病学系，剑桥大学Herchel Smith大脑和心理科学大楼。精神病学部，英国伦敦帝国学院帝国学院； 5。 英国曼彻斯特大学神经科学与实验心理学系； 6。 MAHSC，英国曼彻斯特曼彻斯特大学； 7。 Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。 剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。 英国伯明翰大学心理健康研究所。 10。 爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，精神病学部，英国伦敦帝国学院帝国学院； 5。英国曼彻斯特大学神经科学与实验心理学系； 6。 MAHSC，英国曼彻斯特曼彻斯特大学； 7。 Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。 剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。 英国伯明翰大学心理健康研究所。 10。 爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，英国曼彻斯特大学神经科学与实验心理学系； 6。MAHSC，英国曼彻斯特曼彻斯特大学； 7。 Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。 剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。 英国伯明翰大学心理健康研究所。 10。 爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，MAHSC，英国曼彻斯特曼彻斯特大学； 7。Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。 剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。 英国伯明翰大学心理健康研究所。 10。 爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，Lancashire和South Cumbria NHS基金会信托基金会，英国Accrington； 8。剑桥郡和彼得伯勒NHS基金会信托基金会，英国剑桥； 9。英国伯明翰大学心理健康研究所。10。爱丁堡大学临床脑科学中心精神病学系，
重新评估弓形虫和犬新孢子虫基因组，发现错误组装、核型差异和染色体重排
新孢子虫主要感染牛，导致牛流产，估计每年对全球经济造成 10 亿美元的损失。然而，对其生物学的研究一直被忽视，因为既定范式认为它与其近亲、广泛研究的人类病原体弓形虫几乎完全相同。通过使用第三代测序技术重新审视基因组序列、组装和注释，我们在此表明，新孢子虫基因组最初是在与弓形虫同源的假设下错误组装的。我们表明这些物种之间发生了重大染色体重排。重要的是，我们表明最初命名为 Chr VIIb 和 VIII 的染色体确实融合了，从而将新孢子虫和弓形虫的核型都减少到 13 条染色体。我们重新注释了新孢子虫基因组，揭示了 500 多个新基因。我们对非光合质体和线粒体基因组进行了测序和注释，并表明尽管顶质体基因组几乎相同，但物种和菌株之间存在高水平的基因碎片化和重组。我们的结果纠正了目前在 N. caninum 和 T. gondii 基因组数据库中广泛分布的组装伪影，更重要的是，突出了线粒体是以前被忽视的变异源，并为改变同源性范式铺平了道路，鼓励重新思考基因组作为这些病原体比较独特生物学的基础。