摘要 DNA 结合蛋白 (DBP) 在生物学和生物技术中发挥着关键作用,人们对设计具有新功能或改变特异性的 DBP 产生了浓厚的兴趣。虽然使用选择方法重新编程和天然 DBP 的特异性已经取得了成功,但与 DNA 结合的新 DBP 的计算设计仍然是一项突出的挑战。解决这一挑战将为可编程识别和操纵 DNA 序列和结构带来新的解决方案;并最终为合成基因调控、DNA 修饰酶和许多其他应用提供新的可能性。在本次演讲中,我将描述一种计算方法的开发和实验验证,该方法用于设计通过与大沟中的碱基相互作用来识别特定目标序列的小 DBP。然后,我将描述深度学习支持的定制 DNA 结合蛋白设计的通用框架的进展。最后,我将总结我对这个新框架未来前景的看法。