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图 1 不同无花果树组之间的基因组变异图和分歧。a) 表示全基因组核苷酸多样性的圆环图。从外到内的层次分别为:i、基因密度;ii、田岛 D;iii、核苷酸多样性。每个组的颜色编码为:绿色代表中地中海 (MEMed)、蓝色代表东南地中海 (SEMed),深红色代表西地中海 (WMed)。b) 在 53 个无花果树品种及其相应组中检测到的 SNP 和 InDel 变异总数,按基因间、内含子和外显子分类。c) 按 CNG(拷贝数增加)、CNL(拷贝数丢失)和基因/周缘 SV(结构变异)分类的已识别全基因组拷贝数变异 (CNV) 总数。d) DEL 和 CNV 的富集分析(生物过程 (BP)、分子功能 (MF)、细胞成分 (CC))。 e) 三个指定组之间的核苷酸多样性(π 和 Tajima's D)和种群分化(固定指数-FST)概述。每个圆圈内的数字表示该组的核苷酸多样性,圆圈之间的数字反映种群发散(FST)。f) 不同组之间无花果树中连锁不平衡(LD)衰减的分析。

地中海无花果的基因嵌合体

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