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摘要:微孢子虫有近 1700 个种,是一类专性胞内真核生物,对兽医、经济和医学有影响。为了帮助了解这些微生物的生物学功能,通常使用全基因组测序。然而,由于它们具有特定于分类单元的进化特征,因此很难正确预测它们的基因目录。由于需要创新的基因组注释策略来获得这些寄生虫整体生活方式的代表性快照,因此开发了 MicroAnnot 工具,这是一种专用的工作流程,使用来自精确注释的微孢子虫基因的精选数据库的数据进行微孢子虫序列注释。此外,还实施了特定模块来执行小基因(<300 bp)和转座因子识别。最后,使用基于签名的 InterProScan 软件进行功能注释。MicroAnnot 的准确性已通过对四个微孢子虫基因组的重新注释得到验证,这些基因组的结构注释之前已经得到验证。 MicroAnnot 通过比较方法和转录信号识别方法,可以准确预测翻译起始位点,有效识别转座因子,并对包括 300 bp 以下的微孢子虫基因具有高特异性和灵敏度。

MicroAnnot:用于精确注释微孢子虫基因组的专用工作流程

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