DNA以负层面环的循环组织。所得的扭转和弯曲应变使DNA能够采用出人意料的3D形状。负超串联,循环和形状影响DNA之间的这种相互作用是如何存储,复制,转录,修复以及可能其他所有其他方面的DNA活性。为了理解负超串联和曲率对DNA的流体动力特性的后果,我们将336 bp和672 bp dna微圈提交给了分析性超速离心(AUC)。我们发现,分支系数,沉积系数和DNA水动力半径很大程度上取决于圆形,环长度和负超涂层的程度。由于AUC无法确定超出非全球性程度的形状,因此我们应用线性弹性理论来预测DNA形状,并将它们与流体动力计算相结合以解释AUC数据,并与理论与实验之间的合理一致。这些互补方法以及早期的电子冷冻学数据,提供了一个框架,以理解和预测超螺旋对DNA的形状和流体动力特性的影响。
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