由原子集合组成的量子比特因其对原子损失的抵抗力而具有吸引力。在这项工作中,我们考虑了一种实验上可行的协议,以相干方式从空间重叠的玻色-爱因斯坦凝聚态中加载自旋相关光学晶格。将每个晶格位置标识为一个量子比特,以空或填充位置作为量子比特基础,我们讨论了如何执行高保真单量子比特操作、任意量子比特对之间的双量子比特门以及无损测量。在这种设置中,原子损失的影响得到了缓解,原子永远不需要从基态流形中移除,并且不需要为量子比特设置单独的存储和计算基础,所有这些都可能是许多其他类型原子量子比特中退相干的重要来源。