氨是蛋白质代谢的废物。在水中,氨以两种形式存在:离子化氨(NH 4 +)和非离子化氨(NH 3 )。非离子化氨对大多数水生生物有毒,在高 pH 值和较高温度下出现的比例更大。非离子化氨的毒性在低至每升 0.05 毫克的水平下也是有害的。亚硝酸盐是氨生物氧化的副产品。大多数水生生物可以忍受一定量的亚硝酸盐,但随着亚硝酸盐水平的增加,生产力会下降。通常,硝酸盐对鱼无毒,植物会将其用作食物。亚硝酸盐是一个难以测量和控制的参数。氨也很难用传感器测量。但是,一旦生物过滤器的尺寸合适并确定了足够的流速,氨通常就不是问题。此外,氨水平往往变化缓慢,因此定期测量就足够了。