Loading...
机构名称:
¥ 1.0

噬菌体(噬菌体)是感染细菌的病毒。其中许多产生了称为解聚酶的特定酶,以分解外部多糖结构。由于其固有的序列多样性,这些解聚酶的准确注释和域的识别是具有挑战性的。因此,我们提出了Deposcope,这是一种机器学习工具,将微调的ESM-2模型与卷积神经网络相结合,以精确地识别分解序列及其酶促域。为了实现这一目标,我们从Inphared Phage基因组数据库中策划了一个数据集,创建了一个多糖 - 脱落域数据库,并应用了顺序过滤器来构建一个高质量的数据集,该数据集随后用于训练解镜。我们的工作是与氨基酸级预测进行序列级预测的第一种方法,以进行准确的去聚合物ASE检测和功能域鉴定。以这种方式,我们认为Deposcope可以极大地增强我们对噬菌体宿主相互作用的理解。

Deposcope:使用大语言模型

Deposcope:使用大语言模型PDF文件第1页

Deposcope:使用大语言模型PDF文件第2页

Deposcope:使用大语言模型PDF文件第3页

Deposcope:使用大语言模型PDF文件第4页

Deposcope:使用大语言模型PDF文件第5页