目前,自闭症诊断没有可靠的生物标志物。自闭症的异质性和几个共同存在的条件是建立这些疾病的关键挑战。在这里,我们使用了基于质谱的未靶向尿液代谢组学来研究自闭症诊断的代谢差异和自闭症的双胞胎队列中的自闭症特征(n = 105)。我们在双胞胎的尿液样本中鉴定了208个代谢产物。在控制其他神经脱发状况时,未检测到自闭症诊断的明确代谢驱动因素。但是,我们确定了几种代谢产物的名义重大变化。例如,在自闭症组中,苯基丙酮酸(P = 0.019)和牛磺酸(P = 0.032)升高,而肉碱(P = 0.047)降低。我们还解释了共享因素,例如双对中的遗传学,并报告其他代谢物差异。基于自闭症诊断的名义显着代谢产物,富含九种和脯氨酸代谢途径(p = 0.024)。通过社会响应量表第二版和代谢物差异衡量,我们还研究了定量自闭症性状之间的关联,并确定了更多名义上有特殊的代谢物和途径。在双对中观察到吲哚-3-actate和自闭症性状之间的显着正相关(调整后的P = 0.031)。因此,尿液生物标志物在自闭症中的效用尚不清楚,来自不同研究人群的混合发现。