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首先，对患者的病史进行了审查，并由风湿病学家以及专门从事干细胞移植的肿瘤学家评估患者。决定进行干细胞移植后，第一步是收集干细胞。虽然我们以前用来从骨髓中收集它们，但现在是从血液中完成的。导管（也称为“端口”，患者将接受一种增加血液中干细胞量的药物，这一过程称为动员。这可能是粒细胞落刺激因子（GCSF），环磷酰胺或plerixafor等剂的组合。一些中心进一步选择具有称为CD34的细胞表面制造剂的细胞，从理论上讲，该细胞可减少自身免疫细胞的数量。
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